Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6016
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6016, 941 aa
1>>>pF1KB6016 941 - 941 aa - 941 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1083+/-0.000851; mu= 14.3456+/- 0.052
mean_var=134.8576+/-27.262, 0's: 0 Z-trim(111.5): 44 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.110443
statistics sampled from 12399 (12437) to 12399 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.382), width: 16
Scan time: 4.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43658.1 KDM7A gene_id:80853|Hs108|chr7 ( 941) 6384 1029.1 0
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CCDS55420.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (1060) 2044 337.7 7.4e-92
CCDS35069.1 PHF2 gene_id:5253|Hs108|chr9 (1096) 1934 320.1 1.4e-86
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CCDS41850.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1336) 620 110.8 1.8e-23
CCDS44657.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 (1162) 615 110.0 2.8e-23
>>CCDS43658.1 KDM7A gene_id:80853|Hs108|chr7 (941 aa)
initn: 6384 init1: 6384 opt: 6384 Z-score: 5500.6 bits: 1029.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6384; 99.9% identity (99.9% similar) in 941 aa overlap (1-941:1-941)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAGAAAAVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKD
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CCDS43 MAGAAAAVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 WFHGSCVGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHRHDYTEIDDGSKPVQAGTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WFHGSCVGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHRHDYTEIDDGSKPVQAGTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TFIKELRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DVERYVGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DVERYVGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VPDIAKKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 FYLIKPTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FYLIKPTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 DCMAFGGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DCMAFGGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELRED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 GFQPQTYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFQPQTYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 KPVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRRKMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KPVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRRKMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLE
490 500 510 520 530 540
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pF1KB6 MCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDIS
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CCDS43 TADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNGFFTRVKSELRSRSSGYSDIS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNFLQKSQKPSRSEIPI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 KRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHGSNHEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHGSNHEVR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB6 QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB6 QSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSFSVPLHPTKRPASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSFSVPLHPTKRPASN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KB6 PPPISNQATKGKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPPISNQATKGKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV
910 920 930 940
>>CCDS55419.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (878 aa)
initn: 2089 init1: 1635 opt: 2065 Z-score: 1781.9 bits: 340.9 E(32554): 6.3e-93
Smith-Waterman score: 2080; 44.2% identity (69.3% similar) in 796 aa overlap (37-813:5-787)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
CCDS55 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
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CCDS55 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
::::.: :.::.:.: :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
CCDS55 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
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CCDS55 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
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CCDS55 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.:::::::::: ::.::
CCDS55 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::. .:
CCDS55 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEE---EN-GK
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CCDS55 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQQNVGK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PVKSQGIPIVCPVSRSSNEATSPYHSRR-KMRKLRDHNVRTPSNLDILELHTREVLKRLE
. :. . :. .: : : :: .: .: .. . .. :. .:..:. :
CCDS55 TSNIFGLQRIFPA--GSIPLTRPAHSTSVSMSRL---SLPSKNGSKKKGLKPKELFKKAE
460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 MCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEWRAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFADQSLY
: . :. :... .:. . . .. . . . .: ..: . : .:
CCDS55 RKGKESSALGPA--GQLSYNLMDTYSHQALKTGSFQKAKFNITGACLNDSDDDSPDLDLD
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 TADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGVEHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSSGYSDIS
.: . ..: .: . .. .. : . ...:. :. .:.
CCDS55 GNESPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAE-QVMEDEFDLDSDDELQID
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710
pF1KB6 ESEDSGPECTALKSIFTTE--ESESSGDEKK----QEITSNFKEESNVMRNFLQKSQK-P
: . .. : . ... .: .. :. ...:. .. ..... .
CCDS55 ERLGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPNRVREPGEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGYQ
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KB6 SRSEIPIK--RECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTC--LQRQIQSTDCSGERNSLQDP
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CCDS55 TATPAPAQGASEAPASPSTQE-AIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KB6 SSCHG--SNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKC
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CCDS55 SSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPS
750 760 770 780 790 800
830 840 850 860 870 880
pF1KB6 IRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSNLTSGACQISNGSLSPERPVGETSF
CCDS55 LESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAAA
810 820 830 840 850 860
>>CCDS55418.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (948 aa)
initn: 2243 init1: 1633 opt: 2051 Z-score: 1769.3 bits: 338.7 E(32554): 3.1e-92
Smith-Waterman score: 2165; 42.0% identity (67.4% similar) in 955 aa overlap (37-935:5-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
::::.:: ::::.:::::::.:.:::::::
CCDS55 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSC
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 VGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHR-HDYTEIDDGSKPVQAGTRTFIKE
:::::..:.:::::::::: :::: :.:::::. . :: . .:::..:. ::..:
CCDS55 VGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHK----GKPVKTGSPTFVRE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LRSRVFPSADEIIIKMHGSQLTQRYLEKHGFDVPIMVPKLDDLGLRLPSPTFSVMDVERY
::::.: :.::.:.: :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
CCDS55 LRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VGGDKVIDVIDVARQADSKMTLHNYVKYFMNPNRPKVLNVISLEFSDTKMSELVEVPDIA
::.:: ::::::.:::: :: : ..:::... .: :::::::::::::..:.:::.: :.
CCDS55 VGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KKLSWVENYWPDDSVFPKPFVQKYCLMGVQDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLWGEKIFYLIK
.::::::: ::.. :: .: :::::::.:.:::::::::::::::::::: ::::::::.
CCDS55 RKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 PTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLFVPTGWIHAVLTSQDCMAF
::. ::. .: :::: .:.:.::::.::::::: ::::.:::.:::::::::: ::.::
CCDS55 PTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GGNFLHNLNIGMQLRCYEMEKRLKTPDLFKFPFFEAICWFVAKNLLETLKELREDGFQPQ
::::::.::: :::. ::.::::.: :::.:: ::.:::.:.:..:. .. :::. .:
CCDS55 GGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPA
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 TYLVQGVKALHTALKLWMKKELVSEHAFEIPDNVRPGHLIKELSKVIRAIEEENGKPVKS
.:::.: :::. :.. : .:: . .: :::..:: .:::.:.. :: .: . .
CCDS55 SYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEFNITGACLN
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530
pF1KB6 QGIPIVCPVSRSSNEATSPYH------SRRKMRKL-RDHNVRTPSNLDILELHTREVLK-
.. .. ..:: :: : .....: ... .. ...: .: ...:..
CCDS55 DSDDDSPDLDLDGNE--SPLALLMSNGSTKRVKSLSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVMED
460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 RLEMCPWEEDILSSKLNGKFNKHLQPSSTVPEW--RAKDNDLRLLLTNGRIIKDERQPFA
.... .: .. .: :: . : :. ::: . .:. :.:
CCDS55 EFDLDSDDELQIDERL-GKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCS-----DPNRV----REP--
510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 DQSLYTADSENEEDKRRTKKAKMKIEESSGVEGV-EHEESQKPLNGFFTSVKSELRSRSS
. . . . :. .. .. :. ..::. :. . .... ..: .. .: . :
CCDS55 GEVEFDIEEDYTTDEDMVEGVEGKLGNGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPS
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700
pF1KB6 GYSDIS--------ESEDSGPECTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEESNVMRNF
:. .: .:.: ..:.. .: ...:::. .:.. ::
CCDS55 TQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSS-----SSGLGTVSNS----
620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KB6 LQKSQK-PSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYSTCLQRQ---IQSTDCSGE
::. :.. :::: : .::: .. :. ..:.. : . . .
CCDS55 -PASQRTPGKR--PIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQD-SLGACFKDAEYIYPSLESDDD
670 680 690 700 710 720
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pF1KB6 RNSLQD-PSSCHGSNH-----EVR---QLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSWIKQFDT
.:.. :.. ..:. ..: : . :.::. : .: . . : ...
CCDS55 DPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAA-------
730 740 750 760 770
820 830 840 850 860
pF1KB6 SRFHPQDLSRSQKC--IRKEGS-SEISQ-RVQSRNY---VDSSGSSLQNGKYMQNSNLTS
... :.:...:: :.:. .:. : : :. : : . . ..: :
CCDS55 AKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPRPQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVTSSSPLPP
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910
pF1KB6 GA--CQISNGSLSPE----RP----VGETSFSV-PLHP-----TKRPASNPPPISNQATK
. .:::. . :: ..... :. :. : .::. . :::: .
CCDS55 PEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGSQ--SNQAGQ
840 850 860 870 880 890
920 930 940
pF1KB6 GKRPKKGMATAKQRLGKILKLNRNGHARFFV
:::::::.::::::::.:::..:::
CCDS55 GKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLKRRDAHP
900 910 920 930 940
>>CCDS14355.1 PHF8 gene_id:23133|Hs108|chrX (1024 aa)
initn: 2245 init1: 1635 opt: 2044 Z-score: 1762.8 bits: 337.6 E(32554): 7.2e-92
Smith-Waterman score: 2107; 45.6% identity (68.5% similar) in 820 aa overlap (37-813:5-804)
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pF1KB6 AVAAGAAAGAAAAAVSVAAPGRASAPPPPPPVYCVCRQPYDVNRFMIECDICKDWFHGSC
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::::.: :.::.:.: :.::: ..::...:.:::.: : : ::. ::::.:.: :::.:
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.:::.: :::. :.. : .:: . .: :::..:: .:::.:.. :: .:. .: ::
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. :. . :. .: : : :: .: .: ..: ..: :: . :
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: . : . : : . .:.:.: :. :. :. :.
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: ::..:: :. :..: .: :.. :.. :.. . ...:.: :
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.:.. . : .: :.. :: .. .. : .. .::.:. : :
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.. . . :.
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. :. . :. .: : : :: .: .: ..: ..: :: . :
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: .: . .... ..:. :.. . . : :.: ::.: :::::: ::.:. :
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. ..:. .:. : . :: : :: . : .:.. . .::. . .
CCDS55 SSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEE
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pF1KB6 TSSWIKQFDTSRFHPQDLSRSQKCIRKEGSSEISQRVQSRNYVDSSGSSLQNGKYMQNSN
.. . . :.
CCDS55 ENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLP
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CCDS35 GPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDYYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVK
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CCDS35 KLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLICVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRP
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CCDS35 HLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHEDELPEHFKPSQLIKDLAKEIR-LSENASKAVRPE
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. :: .: ..: :: ..
CCDS35 VNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATPPQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPP
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CCDS35 KPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASPTIPNLDLLEAHTKEALTKME--PPKKGKATKS
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. . :: :.: :.. .:. :.. :: . : :..:.: .
CCDS35 VLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSEAKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGN
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. . : . .:. . .. : :: :. . :.. ::. . :.. ::
CCDS35 K-DNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFGALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKID
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pF1KB6 -----RSRSSGYSDISESEDSG---PE-CTALKSIFTTEESESSGDEKKQEITSNFKEES
:.... :.: :. : : : .. .:..:.:: . .: .. :
CCDS35 EFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTKPKLDSAAYKSDDSSDEGSLHIDTDTKPGR
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pF1KB6 NV------------MRNFLQKSQKPSRSEIPIKRECPTSTSTEEEAIQGMLSMAGLHYS-
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CCDS35 NARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEYNPSSQPPASPSTQE-AIQGMLSMANLQASD
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750 760 770 780 790 800
pF1KB6 TCLQRQIQSTDCSGERNSLQDPSSCHGSNHEVRQLYRYDKPVECGYHVKTEDPDLRTSSW
.:::
CCDS35 SCLQTTWGAGQAKGSSLAAHGARKNGGGSGKSAGKRLLKRAAKNSVDLDDYEEEQDHLDA
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pF1KB6 SCVGVEEHHAVDIDLYHCPNCAVLHGSSLMKKRRNWHRHDYTEIDDGSKPVQ-AGTRTFI
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CCDS41 MEAEKDSGRRLRPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFS
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CCDS41 LEEKLRSQLYQG--DFVHAMEGKDFNYEYVQREALRVPLIFREKDGLGIKMPDPDFTVRD
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CCDS41 VKLLVGSRRLVDVMDVNTQKGTEMSMSQFVRYYETPEAQRDKLYNVISLEFSHTKLEHLV
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. : .. ..::.:.::. ... . : :.:::::.:. .:::::::::
CCDS41 KRPTVVDLVDWVDNMWPQHLKEKQTEATNAIAEMKYPKVKKYCLMSVKGCFTDFHIDFGG
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pF1KB6 TSVWYHVLWGEKIFYLIKPTDENLARYESWSSSVTQSEVFFGDKVDKCYKCVVKQGHTLF
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CCDS41 TSVWYHVFRGGKIFWLIPPTLHNLALYEEWVLSGKQSDIFLGDRVERCQRIELKQGYTFF
220 230 240 250 260 270
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CCDS41 IPSGWIHAVYTPVDSLVFGGNILHSFNVPMQLRIYEIEDRTRVQPKFRYPFYYEMCWYVL
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CCDS41 ERYVYCVTQRSHLTQEYQRESMLIDAPRKPSIDGFSSDSWLEMEEEACDQQPQEEEEKDE
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CCDS41 RHAAEKQKKKTVIYTKCFEFESATQRPIDRQRYDENEDLSDVEEIVSVRGFSLEEKLRSQ
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