Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9746
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9746, 542 aa
1>>>pF1KB9746 542 - 542 aa - 542 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4772+/-0.0021; mu= 8.9890+/- 0.122
mean_var=257.3268+/-54.347, 0's: 0 Z-trim(101.4): 958 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.079952
statistics sampled from 5482 (6502) to 5482 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.482), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 2.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 3828 456.5 4.2e-128
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 3828 456.5 4.2e-128
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2394 291.1 2.8e-78
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2310 281.7 3e-75
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2310 281.7 3e-75
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2223 271.5 2.7e-72
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2223 271.5 2.7e-72
CCDS54260.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 577) 2195 268.1 2e-71
CCDS12508.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 607) 2195 268.1 2.1e-71
CCDS59381.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 665) 2195 268.2 2.2e-71
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2193 268.0 2.9e-71
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2193 268.0 2.9e-71
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2186 267.2 4.9e-71
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2183 266.8 5.8e-71
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2178 266.3 9.9e-71
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2178 266.3 9.9e-71
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 2166 264.9 2.6e-70
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 2159 264.0 3.9e-70
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 2159 264.0 3.9e-70
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2149 263.0 1e-69
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 2140 261.7 1.7e-69
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 2140 261.8 1.8e-69
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2143 262.4 1.9e-69
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 2137 261.5 2.3e-69
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 2137 261.5 2.3e-69
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2140 262.2 2.7e-69
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2114 259.1 2e-68
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2114 259.2 2e-68
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 2102 257.4 3.7e-68
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2097 257.1 6.9e-68
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 2090 256.0 9.4e-68
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2091 256.2 9.6e-68
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 2090 256.0 9.7e-68
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 2090 256.1 9.8e-68
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 2090 256.1 9.9e-68
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2090 256.2 1.1e-67
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2090 256.2 1.1e-67
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2090 256.2 1.1e-67
CCDS54258.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 628) 2088 255.8 1.1e-67
CCDS12506.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 660) 2088 255.8 1.1e-67
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2072 254.3 6e-67
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2068 253.6 6.3e-67
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2065 253.3 8.5e-67
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 2056 252.0 1.3e-66
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2056 252.1 1.5e-66
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 2051 251.5 2.1e-66
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2054 252.1 2.1e-66
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 2051 251.5 2.2e-66
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 2046 251.1 3.7e-66
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 2046 251.1 3.8e-66
>>CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 (623 aa)
initn: 3828 init1: 3828 opt: 3828 Z-score: 2413.3 bits: 456.5 E(32554): 4.2e-128
Smith-Waterman score: 3828; 99.4% identity (99.8% similar) in 538 aa overlap (5-542:86-623)
10 20 30
pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPSFALHQKIS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SRSKPHVIALLEQWKEPEVTVRKDGRRWCTDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPSFALHQKIS
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 RQKPRECREYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVGEKP
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQKPRECQEYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVGEKP
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 YKYEKCGKAFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPYECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKYEKCGKAFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPYECG
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 ECGKAFLVYGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ECGKAFLVYGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGK
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 AFSTSSPLAKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKAFRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AFSTSSPLAKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKAFRL
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SSFLHAHQRIHAEIKPYGCKECGKTFSRASYLVQHGRLHTGEKPCECKECGKAFSTGSYL
:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS46 SSFLHAHQRIHAEIKPYGCKECGRTFSRASYLVQHGRLHTGEKPYECKECGKAFSTGSYL
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VQHQRIHTGEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLTQHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VQHQRIHTGEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLTQHR
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 KIHTDVKPYECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KIHTDVKPYECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQRIHT
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 GEKPYECNKCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GEKPYECNKCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKP
540 550 560 570 580 590
520 530 540
pF1KB9 FKCKKCGKTFRYSSALKVHLRKHMSVIP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FKCKKCGKTFRYSSALKVHLRKHMSVIP
600 610 620
>>CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 (624 aa)
initn: 3828 init1: 3828 opt: 3828 Z-score: 2413.3 bits: 456.5 E(32554): 4.2e-128
Smith-Waterman score: 3828; 99.4% identity (99.8% similar) in 538 aa overlap (5-542:87-624)
10 20 30
pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPSFALHQKIS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SRSKPHVIALLEQWKEPEVTVRKDGRRWCTDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPSFALHQKIS
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 RQKPRECREYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVGEKP
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQKPRECQEYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVGEKP
120 130 140 150 160 170
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 YKYEKCGKAFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPYECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKYEKCGKAFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPYECG
180 190 200 210 220 230
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 ECGKAFLVYGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ECGKAFLVYGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGK
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 AFSTSSPLAKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKAFRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AFSTSSPLAKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKAFRL
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SSFLHAHQRIHAEIKPYGCKECGKTFSRASYLVQHGRLHTGEKPCECKECGKAFSTGSYL
:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS46 SSFLHAHQRIHAEIKPYGCKECGRTFSRASYLVQHGRLHTGEKPYECKECGKAFSTGSYL
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VQHQRIHTGEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLTQHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VQHQRIHTGEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLTQHR
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 KIHTDVKPYECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KIHTDVKPYECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQRIHT
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 GEKPYECNKCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GEKPYECNKCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKP
540 550 560 570 580 590
520 530 540
pF1KB9 FKCKKCGKTFRYSSALKVHLRKHMSVIP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FKCKKCGKTFRYSSALKVHLRKHMSVIP
600 610 620
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 9287 init1: 2379 opt: 2394 Z-score: 1518.9 bits: 291.1 E(32554): 2.8e-78
Smith-Waterman score: 2394; 61.3% identity (80.6% similar) in 527 aa overlap (15-539:141-667)
10 20 30 40
pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPS-FALHQKI-SRQKPRECR
::: . : .. ::.: . .:: ::.
CCDS12 MIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGEKPYECK
120 130 140 150 160 170
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 EYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVGEKPYKYEKCGK
. ::.. .::. :.:.:..::: :::::: :... :: .:.:.:.:::::: :.:::
CCDS12 QCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGK
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 AFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPYECGECGKAFLV
::: .: ...: ..:::::: .::.:::... . :::.:. .:::.: ::: :: :.:
CCDS12 AFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQ
240 250 260 270 280 290
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 YGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGKAFSTSSPL
..: :. ::::::. :.:::::: : : :::.::..::::::::::.:: .: :
CCDS12 LSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLL
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 AKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKAFRLSSFLHAHQ
.:::::::::::.:.::::.: .:::.:: :::.:::.::::::: : .: : ::
CCDS12 MQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQ
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 RIHAEIKPYGCKECGKTFSRASYLVQHGRLHTGEKPCECKECGKAFSTGSYLVQHQRIHT
:::. ::: ::::::.:.:.: :..: :.:::::: :::::::.:: :: :.::.::::
CCDS12 RIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHT
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 GEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLTQHRKIHTDVKP
::::::::::::.:: ::: :::.:::::::::::: :: ::.::...:: ::
CCDS12 GEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKP
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 YECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQRIHTGEKPYECN
: :.::::.:.:. :.::.:::::.:::.:::::::: :: :.::::::::::::::.
CCDS12 YVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECK
540 550 560 570 580 590
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 KCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKPFKCKKCGK
.:::::. .:: :: .::::::.::.:: ::: .: :..:::.::::::..::.:::
CCDS12 ECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGK
600 610 620 630 640 650
530 540
pF1KB9 TFRYSSALKVHLRKHMSVIP
.: .: : : : :.:
CCDS12 AFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
660 670 680
>>CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058 aa)
initn: 15581 init1: 2295 opt: 2310 Z-score: 1464.5 bits: 281.7 E(32554): 3e-75
Smith-Waterman score: 2310; 60.1% identity (79.7% similar) in 516 aa overlap (25-537:232-747)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPSFAL--HQKI-SRQKPRECREYGKTLCQD
:: : : .: . .:: ::.: ::.. .
CCDS74 FISGSHLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSG
210 220 230 240 250 260
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVGEKPYKYEKCGKAFISGSAFV
: ::..::..::: .::.:::.:. : : ::..:.::::: ..:::.: ::::..
CCDS74 STLNQHQQIHTGEKPYHCKQCGKSFTVGSTLIRHQQIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALI
270 280 290 300 310 320
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CCDS74 RHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQA
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CCDS74 IHTGEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTG
390 400 410 420 430 440
240 250 260 270 280 290
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CCDS74 EKPYCCKECGKSFTFRSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPY
450 460 470 480 490 500
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CCDS74 HCKECGKSFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKE
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360 370 380 390 400 410
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:::.: : ::..:::::::.:::::::::....::::..::: :::.:.::::.
CCDS74 CGKSFTVGSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKA
570 580 590 600 610 620
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: .: :.:: :::::.::::: .::::: . .:: ::.:::::::::::..:::.::
CCDS74 FVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFC
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CCDS74 SGLIQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLI
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540
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: . :
CCDS74 QHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRP
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:.:: :.::::::.:.. : : .:: .:::
CCDS74 IHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTG
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::::.:::::::::. . : .:. .::::: . ::::::.: : : :::::. :::
CCDS74 EKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPY
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CCDS74 HCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHTGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHE
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:::::. :: :. .:::::::::: :::.:: ..::: :..::: .:::::::::.
CCDS74 CGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKS
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:. .: :..:.: :::.:::.:::::::: : : ::.::::::: :.: .:::::
CCDS74 FTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYA
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. : ::::::::::.::: :::::. . ::.:::.:
CCDS74 SGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
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540
pF1KB9 VHLRKHMSVIP
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CCDS59 FISGSHLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSG
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CCDS59 STLNQHQQIHTGEKPYHCKQCGKSFTVGSTLIRHQQIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALI
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pF1KB9 KHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPYECGECGKAFLVYGKLTRHQS
.: :::::::: ::.:::... : :. ::::.:::.: ::::.: . : ::.
CCDS59 RHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQA
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pF1KB9 THTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGKAFSTSSPLAKHQRIHTG
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CCDS59 IHTGEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTG
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:::: ::::::::: . .::: :::::::..::::::.: .: : :::::. :::
CCDS59 EKPYCCKECGKSFTFRSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPY
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:::.: : ::..:::::::.:::::::::....::::..::: :::.:.::::.
CCDS59 CGKSFTVGSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKA
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: .: :.:: :::::.::::: .::::: . .:: ::.:::::::::::..:::.::
CCDS59 FVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFC
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. :: ::. :: :::.. :::::.: .: : .::..::::::. ::.:::.: :.:
CCDS59 SGLIQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLI
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540
pF1KB9 VHLRKHMSVIP
: . :
CCDS59 QHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRP
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180 190 200 210 220 230
pF1KB9 THTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGKAFSTSSPLAKHQRIHTG
:.:: :.::::::.:.. : : .:: .:::
CCDS59 IHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTG
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pF1KB9 EKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKAFRLSSFLHAHQRIHAEIKPY
::::.:::::::::. . : .:. .::::: . ::::::.: : : :::::. :::
CCDS59 EKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPY
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::::::.:. : ..:: :.:::::: .:::::::: : :.::::::::::::.:.:
CCDS59 HCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHTGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHE
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pF1KB9 CGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLTQHRKIHTDVKPYECKECGKT
:::::. :: :. .:::::::::: :::.:: ..::: :..::: .:::::::::.
CCDS59 CGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKS
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pF1KB9 FSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQRIHTGEKPYECNKCGKAFTVY
:. .: :..:.: :::.:::.:::::::: : : ::.::::::: :.: .:::::
CCDS59 FTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYA
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CCDS59 SGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
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540
pF1KB9 VHLRKHMSVIP
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CCDS77 YECKECGKAFRLHYHLTEHQRIHSGVKPYECKECGKAFSRVRDLRVHQTIHAGERPYECK
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pF1KB9 EYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVGEKPYKYEKCGK
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CCDS77 ECGKAFRLHYQLTEHQRIHTGERPYECKVCGKTFRVQRHISQHQKIHTGVKPYKCNECGK
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pF1KB9 AFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPYECGECGKAFLV
:: :: .:.: .::::::: .::.:::..: .:. :. ::::.::::: :::::: .
CCDS77 AFSHGSYLVQHQKIHTGEKPYECKECGKSFSFHAELARHRRIHTGEKPYECRECGKAFRL
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170 180 190 200 210 220
pF1KB9 YGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGKAFSTSSPL
.::::. :::::::. :.:::::: :. : : ::.: :::::::::.::. :
CCDS77 QTELTRHHRTHTGEKPYECKECGKAFICGYQLTLHLRTHTGEIPYECKECGKTFSSRYHL
430 440 450 460 470 480
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pF1KB9 AKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKAFRLSSFLHAHQ
..: ::::::::: :.::::.: . :.::::. ::: :::.::::::::: :. . .::
CCDS77 TQHYRIHTGEKPYICNECGKAFRLQGELTRHHRIHTCEKPYECKECGKAFIHSNQFISHQ
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pF1KB9 RIHAEIKPYGCKECGKTFSRASYLVQHGRLHTGEKPCECKECGKAFSTGSYLVQHQRIHT
:::. . : :::::: ::: :.:: ..:::::: :.:::::: . :.::.::::
CCDS77 RIHTSESTYICKECGKIFSRRYNLTQHFKIHTGEKPYICNECGKAFRFQTELTQHHRIHT
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pF1KB9 GEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLTQHRKIHTDVKP
:::::.: ::::::: .:: :.:.::::::::: ::::.: : :::::.. :: ::
CCDS77 GEKPYKCTECGKAFIRSTHLTQHHRIHTGEKPYECTECGKTFSRHYHLTQHHRGHTGEKP
610 620 630 640 650 660
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 YECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQRIHTGEKPYECN
: :.:::..: . :. :.:::::. :::::::::.:: .:.:: :.::::::: :.
CCDS77 YICNECGNAFICSYRLTLHQRIHTGELPYECKECGKTFSRRYHLTQHFRLHTGEKPYSCK
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pF1KB9 KCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKPFKCKKCGK
.::.:: . ..: :. :::::::..:::::::: .:: ::.:.:.::::::..::.:::
CCDS77 ECGNAFRLQAELTRHHIVHTGEKPYKCKECGKAFSVNSELTRHHRIHTGEKPYQCKECGK
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pF1KB9 TFRYSSALKVHLRKHMSVIP
.: :. : .: :.:.:
CCDS77 AFIRSDQLTLHQRNHISEEVLCIM
790 800 810
>>CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 (836 aa)
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Smith-Waterman score: 2223; 57.7% identity (78.2% similar) in 527 aa overlap (15-539:303-829)
10 20 30 40
pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSEN-CPSFALHQKI-SRQKPRECR
::: . . .. .:: : . ..: ::.
CCDS12 YECKECGKAFRLHYHLTEHQRIHSGVKPYECKECGKAFSRVRDLRVHQTIHAGERPYECK
280 290 300 310 320 330
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pF1KB9 EYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVGEKPYKYEKCGK
: ::.. . ..:.:::..:.: .:: :::.: .... ::..:.: :::: ..:::
CCDS12 ECGKAFRLHYQLTEHQRIHTGERPYECKVCGKTFRVQRHISQHQKIHTGVKPYKCNECGK
340 350 360 370 380 390
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 AFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPYECGECGKAFLV
:: :: .:.: .::::::: .::.:::..: .:. :. ::::.::::: :::::: .
CCDS12 AFSHGSYLVQHQKIHTGEKPYECKECGKSFSFHAELARHRRIHTGEKPYECRECGKAFRL
400 410 420 430 440 450
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 YGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKECGKAFSTSSPL
.::::. :::::::. :.:::::: :. : : ::.: :::::::::.::. :
CCDS12 QTELTRHHRTHTGEKPYECKECGKAFICGYQLTLHLRTHTGEIPYECKECGKTFSSRYHL
460 470 480 490 500 510
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 AKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKAFRLSSFLHAHQ
..: ::::::::: :.::::.: . :.::::. ::: :::.::::::::: :. . .::
CCDS12 TQHYRIHTGEKPYICNECGKAFRLQGELTRHHRIHTCEKPYECKECGKAFIHSNQFISHQ
520 530 540 550 560 570
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pF1KB9 RIHAEIKPYGCKECGKTFSRASYLVQHGRLHTGEKPCECKECGKAFSTGSYLVQHQRIHT
:::. . : :::::: ::: :.:: ..:::::: :.:::::: . :.::.::::
CCDS12 RIHTSESTYICKECGKIFSRRYNLTQHFKIHTGEKPYICNECGKAFRFQTELTQHHRIHT
580 590 600 610 620 630
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pF1KB9 GEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLTQHRKIHTDVKP
:::::.: ::::::: .:: :.:.::::::::: ::::.: : :::::.. :: ::
CCDS12 GEKPYKCTECGKAFIRSTHLTQHHRIHTGEKPYECTECGKTFSRHYHLTQHHRGHTGEKP
640 650 660 670 680 690
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 YECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQRIHTGEKPYECN
: :.:::..: . :. :.:::::. :::::::::.:: .:.:: :.::::::: :.
CCDS12 YICNECGNAFICSYRLTLHQRIHTGELPYECKECGKTFSRRYHLTQHFRLHTGEKPYSCK
700 710 720 730 740 750
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pF1KB9 KCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKPFKCKKCGK
.::.:: . ..: :. :::::::..:::::::: .:: ::.:.:.::::::..::.:::
CCDS12 ECGNAFRLQAELTRHHIVHTGEKPYKCKECGKAFSVNSELTRHHRIHTGEKPYQCKECGK
760 770 780 790 800 810
530 540
pF1KB9 TFRYSSALKVHLRKHMSVIP
.: :. : .: :.:.:
CCDS12 AFIRSDQLTLHQRNHISEEVLCIM
820 830
>>CCDS54260.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 (577 aa)
initn: 11509 init1: 2178 opt: 2195 Z-score: 1395.7 bits: 268.1 E(32554): 2e-71
Smith-Waterman score: 2195; 56.9% identity (79.7% similar) in 513 aa overlap (29-540:63-575)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPSFALHQKISR-QKPRECREYGKTLCQDSKPVQH
::... ..: ::.: ::.. . . . :
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60 70 80 90 100 110
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CCDS54 TGGKPYECQECGRAFSQGGHLRIHQRVHTGEKPYKCKECGKTFSRRSNLVEHGQFHTDEK
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CCDS54 PYICEKCGKAFRRGHQLTVHQRVHTGKKPYECKECGKGYTTASYFLLHQRIHKGGKPYEC
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420 430 440 450 460 470
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pF1KB9 QSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKPFKCKKCGKTFRYSSALKVHLRKH
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CCDS12 QKIHTGGKPYECKECGKAFSRASNLVQHERIHTGEKPYVCKQCGKTFRYGSALKAHQRIH
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pF1KB9 MSVIP
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CCDS12 RSIKV
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pF1KB9 MEPKDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPSFALHQKISR-QKPRECREYGKTLCQDSKPVQH
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CCDS59 STQLQSIYKREKLYECKKCQKKFSSGYQLILHHRFHVIERPYECKECGKNFRSGYQLTLH
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CCDS59 QRFHTGEKPYECTECGKNFRSGYQLTVHQRFHTGEKTYECRQCGKAFIYASHIVQHERIH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]