FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3907, 421 aa 1>>>pF1KE3907 421 - 421 aa - 421 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8615+/-0.00105; mu= 8.8619+/- 0.062 mean_var=102.1658+/-21.507, 0's: 0 Z-trim(105.5): 102 B-trim: 5 in 1/51 Lambda= 0.126888 statistics sampled from 8335 (8453) to 8335 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16 Scan time: 2.820 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 ( 709) 2738 512.3 5.8e-145 CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 871) 1435 273.8 4.4e-73 CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 791) 1169 225.1 1.9e-58 CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 618) 978 190.1 5e-48 CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 710) 978 190.1 5.7e-48 CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 ( 802) 843 165.4 1.7e-40 CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597) 835 164.1 8.7e-40 CCDS11139.1 ARHGEF15 gene_id:22899|Hs108|chr17 ( 841) 649 129.9 8.8e-30 CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1670) 320 69.8 2.2e-11 CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1697) 320 69.8 2.2e-11 >>CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 (709 aa) initn: 2738 init1: 2738 opt: 2738 Z-score: 2716.0 bits: 512.3 E(32554): 5.8e-145 Smith-Waterman score: 2738; 99.5% identity (100.0% similar) in 421 aa overlap (1-421:289-709) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 AQVTWSQLPEVVELGILDQLSTEERKRQEAMFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA 260 270 280 290 300 310 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: CCDS46 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKHFHPYIAYC 320 330 340 350 360 370 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC 380 390 400 410 420 430 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA 440 450 460 470 480 490 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMNHIQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS46 SRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVVTKKKSEESYMVQDYAQMNHIQ 500 510 520 530 540 550 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 VEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVALTHS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 VEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVALTHS 560 570 580 590 600 610 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 ERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDGWLYGERLRDGETGW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 ERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDGWLYGERLRDGETGW 620 630 640 650 660 670 400 410 420 pF1KE3 FPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 FPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV 680 690 700 >>CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 (871 aa) initn: 1217 init1: 955 opt: 1435 Z-score: 1425.5 bits: 273.8 E(32554): 4.4e-73 Smith-Waterman score: 1435; 53.1% identity (77.3% similar) in 431 aa overlap (1-421:444-871) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA .::...:: :: :: ::.. : .:::: CCDS46 LRSTWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSD 420 430 440 450 460 470 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC :.:. :.::::::: :: ::..:: .:: ::. .....:::::.:.:. . : ::. :: CCDS46 TMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYC 480 490 500 510 520 530 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC .::::::::::::...: .:.:.: .:: . : .:::.:::::::::::::::::::.: CCDS46 TNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTIC 540 550 560 570 580 590 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA :: : .:.. .:::: .::::: :::::..::: :.:::...::.: :.: .::.:. CCDS46 QKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEF-KIKPFPLVSS 600 610 620 630 640 650 220 230 240 250 260 pF1KE3 SRWLLKRGELF-LVEETGLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMNHI ::::.::::: ::.: :: . .:. :.:::::::. ::::::::: :.::. ... CCDS46 SRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQL 660 670 680 690 700 710 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 QVEKIEPSELPLPGGGN-------RSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRAR ::. . :: : : :.::. : : .:.: : ... ..::.... :.::: CCDS46 LVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERAR 720 730 740 750 760 770 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 WIVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGWLYGE ::.:: :: . . ... .: ::::...: ::: ::..:: :::::. :. ::: :: CCDS46 WITALGHS--SGKPPADRTSLTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGE 780 790 800 810 820 830 390 400 410 420 pF1KE3 RLRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLR-VETDV :::::: :::: . :. :: ..... ::.:: :: .::.: CCDS46 RLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV 840 850 860 870 >>CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 (791 aa) initn: 1063 init1: 944 opt: 1169 Z-score: 1163.0 bits: 225.1 E(32554): 1.9e-58 Smith-Waterman score: 1169; 54.1% identity (78.1% similar) in 338 aa overlap (1-330:444-780) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA .::...:: :: :: ::.. : .:::: CCDS58 LRSTWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIRMFKNSKELSD 420 430 440 450 460 470 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC :.:. :.::::::: :: ::..:: .:: ::. .....:::::.:.:. . : ::. :: CCDS58 TMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTASTFDPYVKYC 480 490 500 510 520 530 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC .::::::::::::...: .:.:.: .:: . : .:::.:::::::::::::::::::.: CCDS58 TNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVTRLPLLMDTIC 540 550 560 570 580 590 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA :: : .:.. .:::: .::::: :::::..::: :.:::...::.: :.: .::.:. CCDS58 QKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEF-KIKPFPLVSS 600 610 620 630 640 650 220 230 240 250 260 pF1KE3 SRWLLKRGELF-LVEETGLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMNHI ::::.::::: ::.: :: . .:. :.:::::::. ::::::::: :.::. ... CCDS58 SRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLIITKKKSEESYNVNDYSLRDQL 660 670 680 690 700 710 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 QVEKIEPSELPLPGGGN-------RSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRAR ::. . :: : : :.::. : : .:.: : ... ..::.... :.::: CCDS58 LVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEMLLGAETQSERAR 720 730 740 750 760 770 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 WIVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDGWLYGER ::.:: :: CCDS58 WITALGHSSGKPPADRTCG 780 790 >>CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 (618 aa) initn: 928 init1: 574 opt: 978 Z-score: 975.7 bits: 190.1 E(32554): 5e-48 Smith-Waterman score: 978; 37.8% identity (70.7% similar) in 426 aa overlap (1-420:186-600) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA :::..::: :: .::..:: .:......: CCDS46 RFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRK 160 170 180 190 200 210 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC . : : ::::.::::..:.::. .::.: . .... :. ::. ..: .: ::.: CCDS46 ILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYV 220 230 240 250 260 270 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC ::..::.:: ..:.. .::::: . ..: : : :::. ::::::.::.::: ::.... CCDS46 SNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNIL 280 290 300 310 320 330 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA ... .::: .: : : . .:. ::::...: : ::: ... ...: :.::.:.:: CCDS46 KRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISH 340 350 360 370 380 390 220 230 240 250 260 pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTC---YLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMN ::::::.::: . : . .. :::::::.:: .. ..:.: : : . CCDS46 SRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRG 400 410 420 430 440 450 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 HIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVAL ..::..: ...... . : . ::.:.. :. .:...: :. ::...: CCDS46 LLRVEELE----------DQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL 460 470 480 490 500 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 THSER-QWQGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGWLYGERLR . ..: .. ...:. : :::. .. . :.: ::.::. ::.. .:.. .:::..::::. CCDS46 APNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLH 510 520 530 540 550 560 390 400 410 420 pF1KE3 DGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV : : :::: .... : . :... :.. : CCDS46 DQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ 570 580 590 600 610 >>CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 (710 aa) initn: 928 init1: 574 opt: 978 Z-score: 974.8 bits: 190.1 E(32554): 5.7e-48 Smith-Waterman score: 978; 37.8% identity (70.7% similar) in 426 aa overlap (1-420:278-692) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA :::..::: :: .::..:: .:......: CCDS25 RFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRK 250 260 270 280 290 300 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC . : : ::::.::::..:.::. .::.: . .... :. ::. ..: .: ::.: CCDS25 ILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYV 310 320 330 340 350 360 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC ::..::.:: ..:.. .::::: . ..: : : :::. ::::::.::.::: ::.... CCDS25 SNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNIL 370 380 390 400 410 420 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA ... .::: .: : : . .:. ::::...: : ::: ... ...: :.::.:.:: CCDS25 KRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISH 430 440 450 460 470 480 220 230 240 250 260 pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTC---YLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMN ::::::.::: . : . .. :::::::.:: .. ..:.: : : . CCDS25 SRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRG 490 500 510 520 530 540 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 HIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVAL ..::..: ...... . : . ::.:.. :. .:...: :. ::...: CCDS25 LLRVEELE----------DQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL 550 560 570 580 590 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 THSER-QWQGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGWLYGERLR . ..: .. ...:. : :::. .. . :.: ::.::. ::.. .:.. .:::..::::. CCDS25 APNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLH 600 610 620 630 640 650 390 400 410 420 pF1KE3 DGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV : : :::: .... : . :... :.. : CCDS25 DQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ 660 670 680 690 700 710 >>CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 (802 aa) initn: 837 init1: 494 opt: 843 Z-score: 840.4 bits: 165.4 E(32554): 1.7e-40 Smith-Waterman score: 843; 36.8% identity (65.3% similar) in 427 aa overlap (2-419:382-794) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRAT ::..::: :: ::::. : .:: : :: CCDS17 FSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSEC 360 370 380 390 400 410 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 VTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYCS . .... :::.. .: ..:.::..::::: .:.:: .. :.. .: . . :. : . CCDS17 LGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVT 420 430 440 450 460 470 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 NEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLCL :..::.:: :.:. : : : ..:. :.: ::. ::::::.::.::: .:.... CCDS17 NQAYQERTYQRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILK 480 490 500 510 520 530 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 KTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISAS .: :: :..:..:...::..:: ... :.: :.. : .. : : .:::: . CCDS17 RTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEG-KIFPLISQA 540 550 560 570 580 590 220 230 240 250 260 pF1KE3 RWLLKRGELFLVEETGLFR------KIASRPTCYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQ :::...:: ::: . : :..:. . :: :::: :. ...: .. : .:. CCDS17 RWLVRHGE--LVELAPLPAAPPAKLKLSSK-AVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAK 600 610 620 630 640 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 MNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIV : ..::. . . .:: : : . :: ... ..:.:: . . :.. ::: CCDS17 MAELQVRDLSLKLQGIPG---------HVFLLQLL-HGQHMKHQFLLRARTESEKQRWIS 650 660 670 680 690 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 ALTHSERQW-QGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLV-LQQEDGWLYGER :: : : . . :.: : :::. .... : . ::.::...:.. : :::: : : CCDS17 ALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQVQCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVR 700 710 720 730 740 750 390 400 410 420 pF1KE3 LRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV : ::: :: :. ... :.: : :.:. .:. : CCDS17 LADGEKGWVPQAYVEEISSLSARLRNLRENKRVTSATSKLGEAPV 760 770 780 790 800 >>CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597 aa) initn: 812 init1: 509 opt: 835 Z-score: 827.8 bits: 164.1 E(32554): 8.7e-40 Smith-Waterman score: 944; 38.2% identity (68.2% similar) in 421 aa overlap (2-416:1180-1586) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRAT ::...:: :: .::.: :..: : :::: CCDS34 GSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRAT 1150 1160 1170 1180 1190 1200 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 VTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYCS ....::. ::: . :: .: :. :::. . ... .. :.. .:: . . :. : . CCDS34 LSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVT 1210 1220 1230 1240 1250 1260 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 NEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLCL :..::.::.:.:..::. :::.:...: :.: : . ::::::.::.::: ::.... CCDS34 NQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILK 1270 1280 1290 1300 1310 1320 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 KTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISAS .:: : . :..: .:. .:.:.::.... :.: :.. : ...: . : .:::: : CCDS34 RTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEF-ECKIFPLISQS 1330 1340 1350 1360 1370 1380 220 230 240 250 260 pF1KE3 RWLLKRGELFLVEET---GLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMNH :::.: ::: .: . :: ::. .::. .: :::: :. .. . ..: :.: .. CCDS34 RWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPV-HLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSS 1390 1400 1410 1420 1430 1440 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 IQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHP--FQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVA :. :: :. : : :: :.. : .:..: : ..:. ... :.. ::: : CCDS34 IRGEK---CEMKLHG--------PHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISA 1450 1460 1470 1480 1490 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 LTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQE-DGWLYGERLRD :. :. : . :::. .:. .. ::..:..::::.: :: :::: : :: : CCDS34 LAMP-REELDLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSD 1500 1510 1520 1530 1540 1550 390 400 410 420 pF1KE3 GETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV :: :::: . ..::.. . :... .:.. CCDS34 GERGWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA 1560 1570 1580 1590 >>CCDS11139.1 ARHGEF15 gene_id:22899|Hs108|chr17 (841 aa) initn: 704 init1: 564 opt: 649 Z-score: 648.1 bits: 129.9 E(32554): 8.8e-30 Smith-Waterman score: 718; 38.3% identity (65.9% similar) in 334 aa overlap (1-327:422-739) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA .::..::: :: .:: .:.. :. :. :: CCDS11 RNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRD 400 410 420 430 440 450 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC :.: .:: ::::. : :.:.::. : .: ... . :. :... :: : :. : CCDS11 TLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYV 460 470 480 490 500 510 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC :. ::..: ..:...:. : ::... : : ::. :::.::.::.::: .:.... CCDS11 RNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNIL 520 530 540 550 560 570 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA .:. : : . :..:: :.::....:. . ::.. :.. : .: : :::.:::.: CCDS11 RQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSW 580 590 600 610 620 630 220 230 240 250 260 pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRK---IASRPT----CYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDY :: : .::: : : : .:::: : :.::.:.:. :. :: . .: :: CCDS11 SRRLEFQGEL---TELGCRRGGVLFASRPRFTPLC-LLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDY 640 650 660 670 680 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 AQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARW :. . .:.... : :.: : :...:: : .:: . ::...: :: :: CCDS11 AHRSLVQAQQV-----PDPSG-------PPTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRW 690 700 710 720 730 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 IVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDGWLYGERL . :. CCDS11 LGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLK 740 750 760 770 780 790 >>CCDS1711.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1670 aa) initn: 247 init1: 217 opt: 320 Z-score: 318.0 bits: 69.8 E(32554): 2.2e-11 Smith-Waterman score: 320; 25.0% identity (56.9% similar) in 348 aa overlap (1-334:1187-1519) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA . :.. .: :. .:...:: : . . CCDS17 TTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESG 1160 1170 1180 1190 1200 1210 40 50 60 70 80 pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKA---QVLVEDISDILEEHAEKYFHPYI .:. : .: : ... .. .... :. :.:. .. :. :.::: . .... :: CCDS17 FLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAEL-SHMQAYI 1220 1230 1240 1250 1260 1270 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 AYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMD .:: .. ::. . .. :.: :... : : :.:. :::. ::::.:: :::. CCDS17 RFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIR 1280 1290 1300 1310 1320 1330 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 TLCLKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRME---RMEQMYTLHTQLDFSKVKS .. .: ... . ::. .: : :::... : :.: . . :.: . . ... CCDS17 SILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQA-HVQCE-GLAEQ 1340 1350 1360 1370 1380 1390 210 220 230 240 250 pF1KE3 LPLISASRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTCYLFLFNDVLV--------ATKKKSEE : . : . : : : ..: . : : . ::::: :. :... ::. CCDS17 LIFNSLTNCLGPRKLL----HSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEK 1400 1410 1420 1430 1440 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 SYMVQDYAQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDS . .. ::.. .. : .:. . . ::. : :... . .. : .:. CCDS17 LFSSKSNAQFKMYKTP-IFLNEVLVKLPTDPSSDEP-VFHISHI------DRVYTLRTDN 1450 1460 1470 1480 1490 1500 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 ASDRARWIVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDG ..:. :. . . .:. CCDS17 INERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNG 1510 1520 1530 1540 1550 1560 >>CCDS1710.2 ITSN2 gene_id:50618|Hs108|chr2 (1697 aa) initn: 275 init1: 217 opt: 320 Z-score: 317.9 bits: 69.8 E(32554): 2.2e-11 Smith-Waterman score: 320; 25.0% identity (56.9% similar) in 348 aa overlap (1-334:1214-1546) 10 20 30 pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA . :.. .: :. .:...:: : . . CCDS17 TTDSDPSQQWCADLQTLDTMQPIERKRQGYIHELIQTEERYMADLQLVVEVFQKRMAESG 1190 1200 1210 1220 1230 1240 40 50 60 70 80 pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKA---QVLVEDISDILEEHAEKYFHPYI .:. : .: : ... .. .... :. :.:. .. :. :.::: . .... :: CCDS17 FLTEGEMALIFVNWKELIMSNTKLLKALRVRKKTGGEKMPVQMIGDILAAEL-SHMQAYI 1250 1260 1270 1280 1290 1300 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 AYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMD .:: .. ::. . .. :.: :... : : :.:. :::. ::::.:: :::. CCDS17 RFCSCQLNGAALLQQKTDEDTDFKEFLKKLASDPRCKGMPLSSFLLKPMQRITRYPLLIR 1310 1320 1330 1340 1350 1360 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 TLCLKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRME---RMEQMYTLHTQLDFSKVKS .. .: ... . ::. .: : :::... : :.: . . :.: . . ... CCDS17 SILENTPESHADHSSLKLALERAEELCSQVNEGVREKENSDRLEWIQA-HVQCE-GLAEQ 1370 1380 1390 1400 1410 1420 210 220 230 240 250 pF1KE3 LPLISASRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTCYLFLFNDVLV--------ATKKKSEE : . : . : : : ..: . : : . ::::: :. :... ::. CCDS17 LIFNSLTNCLGPRKLL----HSGKLYKTKSNKELHGFLFNDFLLLTYMVKQFAVSSGSEK 1430 1440 1450 1460 1470 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 SYMVQDYAQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDS . .. ::.. .. : .:. . . ::. : :... . .. : .:. CCDS17 LFSSKSNAQFKMYKTP-IFLNEVLVKLPTDPSSDEP-VFHISHI------DRVYTLRTDN 1480 1490 1500 1510 1520 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 ASDRARWIVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDG ..:. :. . . .:. CCDS17 INERTAWVQKIKAASEQYIDTEKKKREKAYQARSQKTSGIGRLMVHVIEATELKACKPNG 1530 1540 1550 1560 1570 1580 421 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 09:04:17 2016 done: Sun Nov 6 09:04:17 2016 Total Scan time: 2.820 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]