Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3256
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3256, 597 aa
1>>>pF1KE3256 597 - 597 aa - 597 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5329+/-0.000359; mu= 18.0435+/- 0.022
mean_var=90.9822+/-18.996, 0's: 0 Z-trim(115.7): 369 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.134461
statistics sampled from 25994 (26411) to 25994 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 11.090
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 4142 814.1 0
NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 3453 680.4 3.9e-195
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 1096 223.2 1.9e-57
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 826 170.7 9.5e-42
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 826 170.8 1e-41
XP_016862143 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
XP_016862142 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
XP_016862139 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
XP_016862145 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
XP_016862140 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
XP_016862146 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
XP_016862141 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
XP_016862144 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
XP_016862147 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 815 168.7 5.2e-41
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 802 166.2 2.8e-40
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 802 166.2 3.3e-40
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 802 166.3 3.4e-40
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 802 166.3 3.5e-40
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 802 166.3 3.5e-40
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 802 166.3 3.5e-40
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 802 166.3 3.5e-40
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 802 166.3 3.5e-40
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 802 166.3 3.6e-40
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 802 166.3 3.6e-40
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 802 166.3 3.6e-40
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 783 162.4 3.1e-39
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 784 162.7 3.1e-39
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 784 162.7 3.3e-39
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 784 162.7 3.3e-39
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 783 162.5 3.4e-39
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 781 162.1 4.8e-39
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 772 160.4 1.6e-38
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 772 160.4 1.6e-38
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 761 158.2 6.7e-38
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 755 157.0 1.5e-37
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 749 156.0 4e-37
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 746 155.4 6.1e-37
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 746 155.4 6.1e-37
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 745 155.1 6.3e-37
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 739 154.0 1.4e-36
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 717 149.7 2.6e-35
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 717 149.8 3.1e-35
>>NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 isoform (597 aa)
initn: 4142 init1: 4142 opt: 4142 Z-score: 4345.6 bits: 814.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4142; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-597)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAEQLERLPLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAEQLERLPLAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADSTERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADSTERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTAC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RGRLYAIGSLAGKETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RGRLYAIGSLAGKETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE3 SVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH
550 560 570 580 590
>>NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 isof (500 aa)
initn: 3453 init1: 3453 opt: 3453 Z-score: 3624.3 bits: 680.4 E(85289): 3.9e-195
Smith-Waterman score: 3453; 100.0% identity (100.0% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAEQLERLPLAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAEQLERLPLAR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADSTERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADSTERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTAC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RGRLYAIGSLAGKETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGRLYAIGSLAGKETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAW
::::::::::::::::::::
NP_001 EVDVYNPTRNEWDKIPSMNQ
490 500
>>XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like prot (600 aa)
initn: 1018 init1: 319 opt: 1096 Z-score: 1152.1 bits: 223.2 E(85289): 1.9e-57
Smith-Waterman score: 1096; 34.3% identity (65.0% similar) in 560 aa overlap (13-560:44-592)
10 20 30 40
pF1KE3 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAA
: .:: ..:. ....: : : :: . .
XP_016 LGVRDSPATKRKVFEMDPKSLTGHEFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVII-CV
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 GGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVS
:..:: :::::.: : :::::: .. :::: :...:. . .. .:.. :::.: ..
XP_016 EGKEFPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKIT
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 GDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFIL
.:.. :.....:.:. ....::. ::..::: ::: .: ::.. : . : . . : :
XP_016 TENVQYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFAL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 RHVGELGA-EQLERLPLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWV-RADPPRRAAHWPQL
. ... :.. .: .:. :. .: : . ::: ... ..::: :: :: .:
XP_016 QTFEDVSQHEEFLELDKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLRRPL-LHEL
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 LEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRP
: ::::... :.. ::.. :. : : .::.::: .. . . :: :::
XP_016 LTHVRLPLLHPNYFVQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHILGNEMMS----PRTRPRR
260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KE3 STGLAEILVLVGGCDQDCD-ELVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYV
::: .:..:.::::.. .: ..::.: ::.:. ::..:. . :.. :: ::: :
XP_016 STGYSEVIVVVGGCERVGGFNLPYTECYDPVTGEWKSLAKLPEFTKSEYAVCALRNDILV
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 TGGSDGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA-------DST
.:: .:: : :: :::..: : .:: . :.: :. .:: : .:::.. .:.
XP_016 SGGRINSR--D-VWIYNSQLNIWIRVASLNKGRWRHKMAVLLGKVYVVGGYDGQNRLSSV
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 ERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGKETMV--MQCYDPDTDLWSL
: :: .. : . :. ... ..:.: :.:..::. .: .: :::.:. : :
XP_016 ECYDSFSNRWTEVAPLKEAVSSPAVTSCVGKLFVIGGGPDDNTCSDKVQSYDPETNSWLL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 VDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSAEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVL
. .: . ...::.:.: . . . :.:... : .. . . . . ...:
XP_016 R--AAIPIAKRCITAVSLNNLIYVAGGLTKAIYCYDPVEDYWMHVQNTFSRQENCGMSVC
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 GGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGG
.::.:. :: .. : .:.. ::: : . :. .:.:. .:: :.: :
XP_016 NGKIYILGGRRENGEATDTILCYDPATSIITGVAAMPRPVSYHGCVTIHRYNEKCFKL
550 560 570 580 590 600
580 590
pF1KE3 RGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH
>>XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like prot (600 aa)
initn: 1018 init1: 319 opt: 1096 Z-score: 1152.1 bits: 223.2 E(85289): 1.9e-57
Smith-Waterman score: 1096; 34.3% identity (65.0% similar) in 560 aa overlap (13-560:44-592)
10 20 30 40
pF1KE3 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAA
: .:: ..:. ....: : : :: . .
XP_005 LGVRDSPATKRKVFEMDPKSLTGHEFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVII-CV
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 GGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVS
:..:: :::::.: : :::::: .. :::: :...:. . .. .:.. :::.: ..
XP_005 EGKEFPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKIT
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 GDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFIL
.:.. :.....:.:. ....::. ::..::: ::: .: ::.. : . : . . : :
XP_005 TENVQYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFAL
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