Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3256
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3256, 597 aa
  1>>>pF1KE3256 597 - 597 aa - 597 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5210+/-0.000781; mu= 18.0464+/- 0.047
 mean_var=76.4450+/-15.236, 0's: 0 Z-trim(109.2): 171  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.146690
 statistics sampled from 10516 (10700) to 10516 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.329), width:  16
 Scan time:  3.280

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597) 4142 886.2       0
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2       ( 578) 1203 264.2 3.4e-70
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600) 1096 241.5 2.3e-63
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642)  862 192.0 1.9e-48
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609)  848 189.1 1.4e-47
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568)  802 179.3 1.2e-44
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709)  802 179.4 1.4e-44
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755)  802 179.4 1.5e-44
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574)  789 176.6 7.9e-44
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11      ( 583)  787 176.1 1.1e-43
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568)  784 175.5 1.6e-43
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587)  781 174.9 2.6e-43
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2       ( 875)  781 175.0 3.6e-43
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593)  772 173.0 9.8e-43
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597)  772 173.0 9.9e-43
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555)  761 170.6 4.7e-42
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694)  749 168.1 3.3e-41
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718)  746 167.5 5.2e-41
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720)  746 167.5 5.2e-41
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3          ( 621)  745 167.3 5.4e-41
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748)  717 161.4 3.8e-39
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8       ( 581)  697 157.1 5.8e-38
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624)  690 155.6 1.7e-37
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586)  686 154.8 2.9e-37
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5            ( 589)  685 154.6 3.4e-37
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  670 151.4 2.9e-36
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687)  671 151.6   3e-36
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589)  657 148.6 2.1e-35
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505)  647 146.5 7.9e-35
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17      ( 608)  634 143.8 6.2e-34
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505)  629 142.7 1.1e-33
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19       ( 615)  626 142.1   2e-33
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620)  625 141.9 2.4e-33
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2        ( 558)  610 138.7   2e-32
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9          ( 617)  607 138.1 3.3e-32
CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17       ( 708)  599 136.4 1.2e-31
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571)  594 135.3 2.1e-31
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585)  594 135.3 2.1e-31
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 613)  583 133.0 1.1e-30
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 639)  583 133.0 1.1e-30
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 655)  583 133.0 1.2e-30
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 658)  583 133.0 1.2e-30
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  573 130.8 4.6e-30
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  573 130.9 4.6e-30
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496)  540 123.8 5.1e-28
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5           ( 516)  535 122.8 1.1e-27
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16           ( 597)  513 118.2 3.1e-26
CCDS9376.1 KBTBD6 gene_id:89890|Hs108|chr13        ( 674)  509 117.3 6.2e-26
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6       ( 634)  505 116.5 1.1e-25
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 553)  499 115.2 2.3e-25


>>CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1              (597 aa)
 initn: 4142 init1: 4142 opt: 4142  Z-score: 4735.0  bits: 886.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4142; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-597)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAEQLERLPLAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAEQLERLPLAR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 LLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 EPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCDE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 EWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADSTERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADSTERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTAC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 RGRLYAIGSLAGKETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RGRLYAIGSLAGKETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 EVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAW
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       
pF1KE3 SVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH
              550       560       570       580       590       

>>CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2            (578 aa)
 initn: 1169 init1: 387 opt: 1203  Z-score: 1373.8  bits: 264.2 E(32554): 3.4e-70
Smith-Waterman score: 1245; 39.1% identity (63.9% similar) in 573 aa overlap (10-559:8-562)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
                : :  :.:: ..: ::..::.. :. ::::  .:::..: ::..:: .:::
CCDS46   MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTL-LVGGRELPCHRGLLALSSPY
                 10        20        30         40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
       :.:::::.. :: . ::.:. : : ..  :.:: ::::....  :.: : :.:  :.::.
CCDS46 FHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVEALTRTAARLHFPS
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170          
pF1KE3 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAEQLE--RLPL
       :...:: .:::::: :::: . .:.:  .  :.:. :  : ::.  :  :.. :  .:: 
CCDS46 VQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAF-LRENFEAVAREDEFLQLPR
       120       130       140       150        160       170      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE3 ARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHV
        ::.  :  : : :  :..  .  .:::: ::  :::: :.::  :.:  : :  .   .
CCDS46 ERLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAAHLPELLSLVHLDAVPRPCVQQLL
        180       190       200       210       220       230      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE3 EAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDC
        .:::. .   :          .::  . :: .:   ..      : :.::.:::   . 
CCDS46 ASEPLIQESEAC----------RAALSQGHDGAPLALQQK-----LEEVLVVVGGQALEE
        240                 250       260            270       280 

      300               310       320       330       340          
pF1KE3 DE--------LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRL--
       .:        : .   :: .. .:  : .:::.   :.:..::.:.::::::: :..   
CCDS46 EEAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYVTGGSRGTKTDT
             290       300       310       320       330       340 

        350       360       370       380       390            400 
pF1KE3 --YDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADS-----TERYDHTTDS
            .: .  .   :  :::::: :  :.:..:.: .::... .     .: ::  :::
CCDS46 WSTTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGTTLDVVEVESYDPYTDS
             350       360       370       380       390       400 

             410       420       430        440       450       460
pF1KE3 WEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGK-ETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWS
       :  ..:    ..: :...:::::: .:: : : .....:::.: :: ::..    :: . 
CCDS46 WTPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGSSACKYNALALQCYNPVTDAWSVIASPFLPKYL
             410       420       430       440       450       460 

              470       480       490       500       510       520
pF1KE3 FAPKTATLNGLMYFVRDDSAEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGY
        .:. :.:.: .:.. :.. .: ::.:  : :.:. :....: .:.:. ::  :::.:: 
CCDS46 SSPRCAALHGELYLIGDNTKKVYVYDPGANLWQKVQSQHSLHENGALVPLGDALYVTGGR
             470       480       490       500       510       520 

                 530       540       550       560       570       
pF1KE3 DNTFELSDV---VEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDS
        . .: .:    .::::    .:.  : ::.  ..::. ..:                  
CCDS46 WQGME-GDYHVEMEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGASTVFLDVSKWTQPSGPTQEH  
              530       540       550       560       570          

       580       590       
pF1KE3 GSDDMDPGRPRPPRDPDELH

>>CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3              (600 aa)
 initn: 1018 init1: 319 opt: 1096  Z-score: 1251.2  bits: 241.5 E(32554): 2.3e-63
Smith-Waterman score: 1096; 34.3% identity (65.0% similar) in 560 aa overlap (13-560:44-592)

                                 10        20        30        40  
pF1KE3                   MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAA
                                     :  .:: ..:. ....:  : : :: .  .
CCDS32 LGVRDSPATKRKVFEMDPKSLTGHEFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVII-CV
            20        30        40        50        60        70   

             50        60        70        80        90       100  
pF1KE3 GGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVS
        :..:: :::::.: : :::::: .. ::::   :...:.  . .. .:.. :::.: ..
CCDS32 EGKEFPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKIT
             80        90       100       110       120       130  

            110       120       130       140       150       160  
pF1KE3 GDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFIL
        .:.. :.....:.:. ....::. ::..:::  ::: .: ::.. : . : .  . : :
CCDS32 TENVQYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFAL
            140       150       160       170       180       190  

            170        180       190       200        210       220
pF1KE3 RHVGELGA-EQLERLPLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWV-RADPPRRAAHWPQL
       .   ...  :.. .:   .:. :. .: : . ::: ... ..::: ::   ::     .:
CCDS32 QTFEDVSQHEEFLELDKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLRRPL-LHEL
            200       210       220       230       240        250 

              230       240       250       260       270       280
pF1KE3 LEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRP
       :  ::::...  :..  ::.. :.   : : .::.::: ..    .  .    :: ::: 
CCDS32 LTHVRLPLLHPNYFVQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHILGNEMMS----PRTRPRR
             260       270       280       290       300           

              290        300       310       320       330         
pF1KE3 STGLAEILVLVGGCDQDCD-ELVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYV
       ::: .:..:.::::..    .:  ..::.: ::.:. ::..:.   . :.. :: ::: :
CCDS32 STGYSEVIVVVGGCERVGGFNLPYTECYDPVTGEWKSLAKLPEFTKSEYAVCALRNDILV
       310       320       330       340       350       360       

     340       350       360       370       380              390  
pF1KE3 TGGSDGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA-------DST
       .::  .::  : :: :::..: : .:: . :.:  :. .:: : .:::..       .:.
CCDS32 SGGRINSR--D-VWIYNSQLNIWIRVASLNKGRWRHKMAVLLGKVYVVGGYDGQNRLSSV
       370          380       390       400       410       420    

            400       410       420       430         440       450
pF1KE3 ERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGKETMV--MQCYDPDTDLWSL
       : ::  .. :  . :.   ... ..:.: :.:..::.    .:    .: :::.:. : :
CCDS32 ECYDSFSNRWTEVAPLKEAVSSPAVTSCVGKLFVIGGGPDDNTCSDKVQSYDPETNSWLL
          430       440       450       460       470       480    

              460       470       480       490       500       510
pF1KE3 VDCGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSAEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVL
          . .:  .    ...::.:.: .   .  .  :.:... : .. .  . . . ...: 
CCDS32 R--AAIPIAKRCITAVSLNNLIYVAGGLTKAIYCYDPVEDYWMHVQNTFSRQENCGMSVC
            490       500       510       520       530       540  

              520       530       540       550       560       570
pF1KE3 GGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGG
       .::.:. ::  .. : .:..  ::: :   . :. .:.:. .:: :.: :          
CCDS32 NGKIYILGGRRENGEATDTILCYDPATSIITGVAAMPRPVSYHGCVTIHRYNEKCFKL  
            550       560       570       580       590       600  

              580       590       
pF1KE3 RGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH

>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1            (642 aa)
 initn: 1024 init1: 377 opt: 862  Z-score: 983.1  bits: 192.0 E(32554): 1.9e-48
Smith-Waterman score: 962; 33.9% identity (63.7% similar) in 540 aa overlap (17-540:74-604)

                             10        20        30        40      
pF1KE3               MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRD
                                     :  . . ..:..: .  . :..:..:. ..
CCDS30 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAA-KE
            50        60        70        80        90       100   

         50        60        70        80        90       100      
pF1KE3 FPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNA
       . ::..:::. ::::.:::.... :::  .: :: . :. :. :..:.::....:.  :.
CCDS30 IRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNV
            110       120       130       140       150       160  

        110       120       130       140       150       160      
pF1KE3 EPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVG
       . :: ::.:::. .:..::  :: .::: .::: .. ::.: ::: : .::.:..:.:  
CCDS30 QTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFV
            170       180       190       200       210       220  

         170       180       190       200       210       220     
pF1KE3 ELG-AEQLERLPLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVR
       ... .:..  ::: ..:. . .:.: ::.:: .:. .: ::. :   :  : :.:.. ::
CCDS30 DVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVR
            230       240       250       260       270       280  

         230       240       250       260       270       280     
pF1KE3 LPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLA
       ::.. : .::.::.:: :: . : :  :: ::  :.    .:   :   : :::   : .
CCDS30 LPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTS-RTRPRRCEGAG
            290       300       310       320       330        340 

         290       300         310       320       330       340   
pF1KE3 EILVLVGGCDQDCDELVTVDC--YNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGS
        .:  ::: .      .  ::  :. .: .:. .: .  . .   ...:.:: .:..:: 
CCDS30 PVLFAVGGGSL---FAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRAR-VGVAAVGNRLYAVGGY
             350          360       370       380        390       

           350       360       370       380              390      
pF1KE3 DGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA-------DSTERYD
       ::.     :  :.  .: :   . :   :   . ..: :::: ...       .:.::::
CCDS30 DGTSDLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYD
       400       410       420       430       440       450       

        400       410       420       430        440       450     
pF1KE3 HTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSL-AGKETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQ
         : .: ..  :.       ...  : :::.:.  ....  ... :.:....:: :  ..
CCDS30 PLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPV-ASM
       460       470       480       490       500       510       

         460       470         480          490       500       510
pF1KE3 LPPWSFAPKTATLNGLMYFV--RDDSA---EVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVL
       :   : :  .:.:.: .: .   : ..    :. :.:  . :...  ::  .   .:...
CCDS30 LSRRSSAG-VAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAM
        520        530       540       550       560       570     

              520       530       540       550       560       570
pF1KE3 GGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGG
        : ::. :: :..  :... : :.:.:  :                              
CCDS30 DGWLYAVGGNDGSSSLNSI-EKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPT
         580       590        600       610       620       630    

>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 781 init1: 352 opt: 848  Z-score: 967.4  bits: 189.1 E(32554): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 991; 33.0% identity (62.9% similar) in 561 aa overlap (4-544:38-585)

                                          10        20        30   
pF1KE3                            MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERK
                                     : : : .:. .  :  . :. .. :: .:.
CCDS13 RCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQP-ARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRE
        10        20        30        40         50        60      

            40        50        60        70        80        90   
pF1KE3 FLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDF
       . ::.: ..:.. . :::..:.: ::::::::.:.: :::  .: .. .    ..::.::
CCDS13 LCDVVL-VVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDF
         70         80        90       100       110       120     

           100       110       120       130       140       150   
pF1KE3 SYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGL
       .::....:   :.. :: :: :::.  ..:::  ::..::: .::: .. ::.. ::  :
CCDS13 AYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCREL
         130       140       150       160       170       180     

           160        170       180       190       200       210  
pF1KE3 ASAAQRFILRHVGE-LGAEQLERLPLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPR
          :..:  ..  : . .:..  ::  .:.  . .: : : .:: ... .. ::. .  .
CCDS13 LRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQE
         190       200       210       220       230       240     

            220       230       240       250       260       270  
pF1KE3 RAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGP
       :  . ::.:. ::::..   .:.. : ..::.     :  :. ::...     .:     
CCDS13 RRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQER-PLMQ
         250       260       270       280       290       300     

            280       290        300       310       320        330
pF1KE3 CPRMRPRPSTGLAEILVLVGG-CDQDCDELVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGG-GYSI
        :: :::     .:.:  ::: :. :   . .:. :.:::..::..: .  .  : : :.
CCDS13 GPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGD--AISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSV
          310       320       330         340       350       360  

              340       350       360        370       380         
pF1KE3 VALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVNEWA-EVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA
         : . .:..:: :::   . : ::. ..:.:. .:::    :   . .:: :.::.:..
CCDS13 --LDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGG
              370       380       390       400       410       420

     390              400       410       420       430        440 
pF1KE3 DS-------TERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGKETM-VMQCY
       ..       .::::   ..:  .  :.    . ....  : :::.:.  :   . ... :
CCDS13 QDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERY
              430       440       450       460       470       480

             450       460          470         480          490   
pF1KE3 DPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPK---TATLNGLMYFV--RDDSAEV---DVYNPTRNEWD
       .:. . :  .      : .   :    :. . ..: :  :::..:.   . :::  :.:.
CCDS13 NPQENRWHTI-----APMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWS
              490            500       510       520       530     

           500       510       520       530       540       550   
pF1KE3 KIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWH
        . .:.. . : .:::..:.:.. ::.:.:  :. ..:..::.. .: . :         
CCDS13 PVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLK-TIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGG
         540       550       560        570       580       590    

           560       570       580       590       
pF1KE3 GSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH
                                                   
CCDS13 GVGVIKMTHCESHIW                             
          600                                      

>>CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4              (568 aa)
 initn: 723 init1: 367 opt: 802  Z-score: 915.3  bits: 179.3 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 926; 31.7% identity (61.4% similar) in 555 aa overlap (12-546:10-554)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
                  :.   :: . .. . .   .... :: : .:: : .:::: ::...: :
CCDS54   MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVIL-VAGDRRIPAHRLVLSSVSDY
                 10        20        30         40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
       : :::....::.: :.....:: :. :  :....::::. .. :: : :: .: :::.  
CCDS54 FAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQ
        60        70        80        90       100       110       

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pF1KE3 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAEQ-LERLPLA
       : :::  ::..::  .::: ...::.: .:. : ..:. . ..:  :.  .: .  :: .
CCDS54 VVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPAS
       120       130       140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KE3 RLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVE
       .. . : .: . .:.::.  .  : ::: :  .:     .::  .:::..   .: : .:
CCDS54 EIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFL-ADME
       180       190       200       210       220       230       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KE3 AEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCD
        . :      : .:. ::  ..    .:.     :: .:: ::  .  :  ::: :.   
CCDS54 NNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLP-ERRPMLQSPRTKPRKST--VGTLFAVGGMDSTKG
        240       250       260        270         280       290   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KE3 ELVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSV
         .... :. .:..:  .:..  .    .....: . .::.:: :: .  . :  :: ..
CCDS54 A-TSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQ-FGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTVECYNPKT
            300       310        320       330       340       350 

     360       370       380              390       400       410  
pF1KE3 NEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA-------DSTERYDHTTDSWEALQPMTYPM
       . :. . ::   :.  . .::.: .:.:..       ...::.:  . .:. .  :. : 
CCDS54 KTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQWNFVATMSTPR
             360       370       380       390       400       410 

            420       430        440       450       460       470 
pF1KE3 DNCSTTACRGRLYAIGSLAGKETM-VMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKTATLNGL
       .. ....  :.:::.:.  :.  .  ..:.:: :. :.:  :.:.     .  ..: :::
CCDS54 STVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTL--CAQMSKRRGGVGVTTWNGL
             420       430       440       450         460         

             480                  490       500       510       520
pF1KE3 MYFVRDDSAE-----------VDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGY
       .: .   .:            :. :.:  . :  . ::.  . . .. .:: :::. :::
CCDS54 LYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLGDKLYAVGGY
     470       480       490       500       510       520         

              530       540       550       560       570       580
pF1KE3 DNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGSD
       :.   : ..::::::.:  :. :. :                                  
CCDS54 DGQAYL-NTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL                    
     530        540       550       560                            

>>CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4              (709 aa)
 initn: 720 init1: 367 opt: 802  Z-score: 913.9  bits: 179.4 E(32554): 1.4e-44
Smith-Waterman score: 926; 31.7% identity (61.4% similar) in 555 aa overlap (12-546:151-695)

                                  10        20        30        40 
pF1KE3                    MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEA
                                     :.   :: . .. . .   .... :: : .
CCDS33 ESDSSSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVIL-V
              130       140       150       160       170          

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pF1KE3 AGGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAV
       :: : .:::: ::...: :: :::....::.: :.....:: :. :  :....::::. .
CCDS33 AGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLEL
     180       190       200       210       220       230         

             110       120       130       140       150       160 
pF1KE3 SGDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFI
       . :: : :: .: :::.  : :::  ::..::  .::: ...::.: .:. : ..:. . 
CCDS33 KEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYT
     240       250       260       270       280       290         

             170        180       190       200       210       220
pF1KE3 LRHVGELGAEQ-LERLPLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQL
       ..:  :.  .: .  :: ... . : .: . .:.::.  .  : ::: :  .:     .:
CCDS33 MEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKL
     300       310       320       330       340       350         

              230       240       250       260       270       280
pF1KE3 LEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRP
       :  .:::..   .: : .: . :      : .:. ::  ..    .:.     :: .:: 
CCDS33 LAYIRLPLLAPQFL-ADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLP-ERRPMLQSPRTKPRK
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              290       300       310       320       330       340
pF1KE3 STGLAEILVLVGGCDQDCDELVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVT
       ::  .  :  ::: :.     .... :. .:..:  .:..  .    .....: . .::.
CCDS33 ST--VGTLFAVGGMDSTKGA-TSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQ-FGVAVLDDKLYVV
         420       430        440       450       460        470   

              350       360       370       380              390   
pF1KE3 GGSDGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA-------DSTE
       :: :: .  . :  :: ... :. . ::   :.  . .::.: .:.:..       ...:
CCDS33 GGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVE
           480       490       500       510       520       530   

           400       410       420       430        440       450  
pF1KE3 RYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGKETM-VMQCYDPDTDLWSLVD
       :.:  . .:. .  :. : .. ....  :.:::.:.  :.  .  ..:.:: :. :.:  
CCDS33 RWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTL--
           540       550       560       570       580       590   

            460       470       480                  490       500 
pF1KE3 CGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSAE-----------VDVYNPTRNEWDKIPSMNQV
       :.:.     .  ..: :::.: .   .:            :. :.:  . :  . ::.  
CCDS33 CAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSIS
             600       610       620       630       640       650 

             510       520       530       540       550       560 
pF1KE3 HVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQ
       . . .. .:: :::. ::::.   : ..::::::.:  :. :. :               
CCDS33 RDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYL-NTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL 
             660       670        680       690       700          

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pF1KE3 FMPQTFSGGRGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH

>>CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4              (755 aa)
 initn: 720 init1: 367 opt: 802  Z-score: 913.5  bits: 179.4 E(32554): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 926; 31.7% identity (61.4% similar) in 555 aa overlap (12-546:197-741)

                                  10        20        30        40 
pF1KE3                    MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEA
                                     :.   :: . .. . .   .... :: : .
CCDS33 ESDSSSCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVIL-V
        170       180       190       200       210       220      

              50        60        70        80        90       100 
pF1KE3 AGGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAV
       :: : .:::: ::...: :: :::....::.: :.....:: :. :  :....::::. .
CCDS33 AGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLEL
         230       240       250       260       270       280     

             110       120       130       140       150       160 
pF1KE3 SGDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFI
       . :: : :: .: :::.  : :::  ::..::  .::: ...::.: .:. : ..:. . 
CCDS33 KEDNIECLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYT
         290       300       310       320       330       340     

             170        180       190       200       210       220
pF1KE3 LRHVGELGAEQ-LERLPLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQL
       ..:  :.  .: .  :: ... . : .: . .:.::.  .  : ::: :  .:     .:
CCDS33 MEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKL
         350       360       370       380       390       400     

              230       240       250       260       270       280
pF1KE3 LEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRP
       :  .:::..   .: : .: . :      : .:. ::  ..    .:.     :: .:: 
CCDS33 LAYIRLPLLAPQFL-ADMENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLP-ERRPMLQSPRTKPRK
         410        420       430       440        450       460   

              290       300       310       320       330       340
pF1KE3 STGLAEILVLVGGCDQDCDELVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVT
       ::  .  :  ::: :.     .... :. .:..:  .:..  .    .....: . .::.
CCDS33 ST--VGTLFAVGGMDSTKGA-TSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQ-FGVAVLDDKLYVV
             470       480        490       500        510         

              350       360       370       380              390   
pF1KE3 GGSDGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA-------DSTE
       :: :: .  . :  :: ... :. . ::   :.  . .::.: .:.:..       ...:
CCDS33 GGRDGLKTLNTVECYNPKTKTWSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVE
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           400       410       420       430        440       450  
pF1KE3 RYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGKETM-VMQCYDPDTDLWSLVD
       :.:  . .:. .  :. : .. ....  :.:::.:.  :.  .  ..:.:: :. :.:  
CCDS33 RWDPQARQWNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTL--
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pF1KE3 CGQLPPWSFAPKTATLNGLMYFVRDDSAE-----------VDVYNPTRNEWDKIPSMNQV
       :.:.     .  ..: :::.: .   .:            :. :.:  . :  . ::.  
CCDS33 CAQMSKRRGGVGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSIS
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pF1KE3 HVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQ
       . . .. .:: :::. ::::.   : ..::::::.:  :. :. :               
CCDS33 RDAVGVCLLGDKLYAVGGYDGQAYL-NTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL 
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             570       580       590       
pF1KE3 FMPQTFSGGRGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH

>>CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3             (574 aa)
 initn: 641 init1: 353 opt: 789  Z-score: 900.3  bits: 176.6 E(32554): 7.9e-44
Smith-Waterman score: 888; 32.2% identity (62.9% similar) in 534 aa overlap (25-541:28-552)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE3    MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAA
                                  . ..: . :. ::::.  : . : ::: ::::.
CCDS33 MVEDGAEELEDLVHFSVSELPSRGYGVMEEIRRQGKLCDVTLKI-GDHKFSAHRIVLAAS
               10        20        30        40         50         

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pF1KE3 SPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQ
        :::.:::.... : . ... ..:. :. :. :..:.:.: .:.. .:.. :: .:..::
CCDS33 IPYFHAMFTNDMMECKQDEIVMQGMDPSALEALINFAYNGNLAIDQQNVQSLLMGASFLQ
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pF1KE3 FPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELG-AEQLERL
       . ..:.:: .::...:   ::: ...:::.. :. : .::. :: .:  :.. .:..  :
CCDS33 LQSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLAL
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pF1KE3 PLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLA
       ::  .:. .  : : : .:: ... :: ::: :  .:. . :.::  .:::. :  .:  
CCDS33 PLEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSD
     180       190       200       210       220       230         

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pF1KE3 HVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQ
       .:. . ::  :  :  :. ::.:..    .:. . :  : :::  :..: ..  ::: ..
CCDS33 RVQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMP-ERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNS
     240       250       260        270       280       290        

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pF1KE3 DCDELVTVDCYNPQTGQW---RYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVW
         : : .:. ..: .. :   : ..   ...:    ...... .:. :: ::.   . : 
CCDS33 AGDSLNVVEVFDPIANCWERCRPMTTARSRVG----VAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVE
      300       310       320       330           340       350    

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pF1KE3 RYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA-------DSTERYDHTTDSWEALQ
        ::  .. :..:. : . :   .. :::: .:: ..       .:.: :.  ::.: .. 
CCDS33 AYNPETDTWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVT
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pF1KE3 PMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGKETMV-MQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSFAPKT
        :.   .  ..:. .::.:. :.  : . .  .. :.  :  :  .  :.:        .
CCDS33 SMSSNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPA-AGMLNK-RCRHGA
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pF1KE3 ATLNGLMYFV--RDDSAEVDV---YNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGY
       :.:.. :.     : :. ...   :. . ..:  :  :.  .   ::..  :.::. :::
CCDS33 ASLGSKMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGY
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pF1KE3 DNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGSD
       :.  .::.: : :::::  :.                                       
CCDS33 DGQSNLSSV-EMYDPETDCWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI                 
            540        550       560       570                     

>>CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11           (583 aa)
 initn: 745 init1: 207 opt: 787  Z-score: 897.9  bits: 176.1 E(32554): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 936; 32.9% identity (58.6% similar) in 589 aa overlap (2-562:8-581)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE3       MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVL
              :.  :    : . : ::  .:..:.  :    . ::.:.: :::::: :::.:
CCDS44 MRQGHAPEESEPGCEAPCAGPCHAQRVLQALNAYRRSGTLTDVVLRA-GGRDFPCHRAAL
               10        20        30        40         50         

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pF1KE3 AAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDM-----------LQLLLDFSYTGRVAVSG
       .:.: :::..::.   :     : .  : :.            : ..::. : . : . .
CCDS44 SAGSAYFRSLFAAGRPERGPAVVPVVPVAPEAPGTSPAGAAAALAVVLDYVYGAGVRLRA
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KE3 -DNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFIL
        :.:  .:  :. :   ...:::  ::. .:  :: : ..  : ::: . ::    : .:
CCDS44 EDEAAAVLALAERLGVAGLREACVRFLEGRLRAANSLALRRVAAAFSLAPLAERCGR-VL
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pF1KE3 RHVGELGAEQLERLPLA--RLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQL
       :..    :.. . : ::  ...  : : .: : .:::... :.:::: : : : ..  .:
CCDS44 RQAFAEVARHADFLELAPDEVVALLADPALGVAREEAVFEAAMRWVRHDAPARRGQLRRL
      180       190       200       210       220       230        

              230       240       250        260       270         
pF1KE3 LEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARD-FQAARYDRHDRGPCPRMRPR
       :: ::::..   :.: .:::. :.  :  :  :: :::  :  .:    . :   : :::
CCDS44 LEHVRLPLLAPAYFLEKVEADELLQACGECRPLLLEARACFILGR----EAGAL-RTRPR
      240       250       260       270       280            290   

     280       290        300       310       320       330        
pF1KE3 PSTGLAEILVLVGGCD-QDCDELVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIY
           :::..:..:::: .   .:  .: :.:.. .:  :  .: .  . ..  :: ::.:
CCDS44 RFMDLAEVIVVIGGCDRKGLLKLPFADAYHPESQRWTPLPSLPGYTRSEFAACALRNDVY
           300       310       320       330       340       350   

      340       350       360       370       380              390 
pF1KE3 VTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAA-------DS
       :.::  .:  .: :: ..: .. : .:: . :.:  :. .:..: :..:..        :
CCDS44 VSGGHINS--HD-VWMFSSHLHTWIKVASLHKGRWRHKMAVVQGQLFAVGGFDGLRRLHS
           360          370       380       390       400       410

             400       410       420       430         440         
pF1KE3 TERYDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSL--AGKETMVMQCYDPDTDLWS
       .::::  ...: :  :.   ... ....: :.:..::.   .: .:  .::.::  : ::
CCDS44 VERYDPFSNTWAAAAPLPEAVSSAAVASCAGKLFVIGGARQGGVNTDKVQCFDPKEDRWS
              420       430       440       450       460       470

     450       460          470       480       490       500      
pF1KE3 LVDCGQLPPWSFAPK---TATLNGLMYFVRDDSAEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGS
       : .     :  :. .   ...:.  .: .    ... .:.:  . : .   . .   . .
CCDS44 LRS-----PAPFSQRCLEAVSLEDTIYVMGGLMSKIFTYDPGTDVWGEAAVLPSPVESCG
                   480       490       500       510       520     

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pF1KE3 LAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVVEAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQT
       ..:  ::... :: :.  : .: : ..:: .    :   : . :  :: :.:....    
CCDS44 VTVCDGKVHILGGRDDRGESTDKVFTFDPSSGQVEVQPSLQRCTSSHGCVTIIQSLGR  
         530       540       550       560       570       580     

        570       580       590       
pF1KE3 FSGGRGFELDSGSDDMDPGRPRPPRDPDELH




597 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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