Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1808
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1808, 325 aa
1>>>pF1KE1808 325 - 325 aa - 325 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7908+/-0.00132; mu= 13.4161+/- 0.078
mean_var=119.8998+/-36.220, 0's: 0 Z-trim(100.6): 122 B-trim: 434 in 1/47
Lambda= 0.117129
statistics sampled from 6047 (6169) to 6047 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 2.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 2134 372.6 2.4e-103
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 617 116.3 3.4e-26
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 609 114.9 8.9e-26
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 605 114.2 1.4e-25
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 597 112.9 3.6e-25
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 580 110.0 2.6e-24
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 571 108.5 7.9e-24
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 563 107.2 2.1e-23
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 495 95.6 5.4e-20
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 369 74.3 1.3e-13
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 2134 init1: 2134 opt: 2134 Z-score: 1969.0 bits: 372.6 E(32554): 2.4e-103
Smith-Waterman score: 2134; 100.0% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (1-325:1-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFR
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CCDS52 MDGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 MRRNPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MRRNPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 YLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RNDCRAVIIFIAILSFLVFTPLMLVSSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 RNDCRAVIIFIAILSFLVFTPLMLVSSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 AMPMRLLYLLYYEYWSTFGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 AMPMRLLYLLYYEYWSTFGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLT
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE1 RAFKDEMQPRRQKDNCNTVTVETVV
:::::::::::::::::::::::::
CCDS52 RAFKDEMQPRRQKDNCNTVTVETVV
310 320
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 613 init1: 278 opt: 617 Z-score: 583.7 bits: 116.3 E(32554): 3.4e-26
Smith-Waterman score: 617; 38.3% identity (71.4% similar) in 269 aa overlap (42-305:37-297)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 EEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRRNPFTVYIT
.: ::.. :...::.: ::::: :..::
CCDS78 TLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNAFSIYIL
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 HLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLLTAISVERC
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CCDS78 NLAAADFLFLSGRLI----YSLLSFISIPHTISKILYPV-MMFSYFAGLSFLSAVSTERC
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 LSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSRNDCRAVIIFI
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CCDS78 LSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLC-GFLFSGADSAWCQTSD-FI
130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 AILSFLVFTPLMLV-SSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIFAMPMRLLYLL
.. ..:.: ..: :: .:...: .. ..::..:..:...::. ..:. . ..:
CCDS78 TV-AWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQFFL
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300
pF1KE1 YY----EYWSTFGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLTRAFKDE
. . : ..: .:...:..::::::.::::::: .... ...::.:: ::..:
CCDS78 FLWIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDA
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE1 MQPRRQKDNCNTVTVETVV
CCDS78 SEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
300 310 320
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 531 init1: 250 opt: 609 Z-score: 576.2 bits: 114.9 E(32554): 8.9e-26
Smith-Waterman score: 609; 37.7% identity (72.2% similar) in 281 aa overlap (32-305:32-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 DGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRM
::. ..:. :. ::.: ::..::.: :::
CCDS78 DPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPV--FLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RRNPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGLY
::: :.::. :. ::. :..:. :.. :. . : ..... .: .::
CCDS78 RRNAFSVYVLSLAGADF-LFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSR
.:...:.:::::::.::::::.::.. ::.::.:::::: :.. .: .: .. :
CCDS78 MLSTVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDS-
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NDCRAVIIFIAILSFLVFTPLMLVSSTI-LVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIF
. :.. .. : ..:.: ..: .:.. :.:.: .. . ..::..:..:...::.
CCDS78 GWCQTFDFITA--AWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE1 AMPMRLLYLLYYEYWST----FGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKK-RFKES-
..:. . ..: :. : ..: .:...:..::::::.::::::: .:. :...
CCDS78 GLPFGIQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPI
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KE1 LKVVLTRAFKDEMQPRRQKDNCNTVTVETVV
::..: ::..:
CCDS78 LKLALQRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
300 310 320 330
>>CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 603 init1: 261 opt: 605 Z-score: 572.7 bits: 114.2 E(32554): 1.4e-25
Smith-Waterman score: 605; 37.3% identity (69.3% similar) in 306 aa overlap (13-306:2-298)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MDGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIP----IVHWVIMS--ISPVGFVENGILL
.:: : . . :.... : . ..... :: ::.. :...:
CCDS78 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 WFLCFRMRRNPFTVYITHLSIADISLLFCIF-ILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFL
:.: .::::: ..:: .:. :: .:: : :. . : .. .: . .:: .
CCDS78 WLLGYRMRRNAVSIYILNLAAAD--FLFLSFQIIRLPLRL---INISHLIRKILVSV-MT
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 FGYNTGLYLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCID
: : ::: .:.:::.:::::::.::::::.:: . ::.::.:::.:: : . .:. .: :
CCDS78 FPYFTGLSMLSAISTERCLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFC-D
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 REEESHSRNDCRAVIIFIAILSFLVFTPLML-VSSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMV
. . . :.. :: . ..:.: ..: ::: .:.:.: .. ..::..:..
CCDS78 FLFSGADSSWCETSD-FIPV-AWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE1 TIIIFLIFAMPMRLLYLLYYEYWSTFGNLH-HISLL---FSTINSSANPFIYFFVGSSKK
:...::. ..:. .: : :.. .. :. :. :. .:..::::::.::::::: ..
CCDS78 TVLVFLLCGLPFGILGALIYRMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQ
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320
pF1KE1 KRFKESLKVVLTRAFKDEMQPRRQKDNCNTVTVETVV
.. ...::.:: ::..:.
CCDS78 RQNRQNLKLVLQRALQDKPEVDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
290 300 310 320
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 480 init1: 325 opt: 597 Z-score: 565.4 bits: 112.9 E(32554): 3.6e-25
Smith-Waterman score: 597; 34.0% identity (65.1% similar) in 315 aa overlap (1-306:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFR
:. . .: .:: : : : ...: .. . : :.. :....:.: ::
CCDS31 MNQTLNSSGTVESALNYSRG-----STVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 MRRNPFTVYITHLSIADISLLFCIF-ILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTG
:.:::: .:: .:. ::. .:: . ::.. . .. . . : . :.:..:
CCDS31 MHRNPFCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRL---MYFAYTVG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LYLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESH
: ::::::..::::::.:::..::::.. :: ::.:::.: :.. . .: . ..
CCDS31 LSLLTAISTQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SRNDCRAVIIFIAILSFLVFTPLMLVSSTILVVKIRKNT--WASHSSKLYIVIMVTIIIF
.: : : . : : . :.::.: .:: : : .:... : . ..:..:.......:
CCDS31 DR--CFRVDMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQPTRLFVVVLASVLVF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LIFAMPMRLLYLLYYEYWSTFGNLHHI-----SLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFK
:: ..:. . ... : : .. .. : : :...::::: :::.::: ...:.
CCDS31 LICSLPLSIYWFVLY--WLSLPPEMQVLCFSLSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLP
240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE1 -ESLKVVLTRAFKDEMQPRRQKDNCNTVTVETVV
.:: .:: .:...:
CCDS31 TRSLGTVLQQALREEPELEGGETPTVGTNEMGA
290 300 310 320
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 552 init1: 262 opt: 580 Z-score: 549.9 bits: 110.0 E(32554): 2.6e-24
Smith-Waterman score: 580; 37.9% identity (71.4% similar) in 269 aa overlap (42-305:37-297)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 EEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRRNPFTVYIT
.: :... :...::.: ::::: ..::
CCDS78 VLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNAVSIYIL
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 HLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLLTAISVERC
.: ::. .: .: : .. . : . . :: .. : : :: .:.:::.:::
CCDS78 NLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIR----HPISKI-LSPVMTFPYFIGLSMLSAISTERC
70 80 90 100 110 120
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pF1KE1 LSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSRNDCRAVIIFI
::.:.::::.:.::.: :...:.:::::: : . .:...: : . . :.. ::
CCDS78 LSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFC-DFLFSGANSVWCETSD-FI
130 140 150 160 170
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pF1KE1 AILSFLVFTPLMLV-SSTILVVKIRKNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIFAMPMRLLYLL
.: ..::: ..: :: .:.:.: .. ..::..:..:...::. ..:. . . :
CCDS78 TI-AWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFGIQWAL
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300
pF1KE1 YYEY---WST-FGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLTRAFKDE
. . :.. : ..: .:...:..::::::.::::::: .... ...::.:: ::..:
CCDS78 FSRIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQNLKLVLQRALQDT
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE1 MQPRRQKDNCNTVTVETVV
CCDS78 PEVDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
300 310 320
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
initn: 559 init1: 343 opt: 571 Z-score: 541.3 bits: 108.5 E(32554): 7.9e-24
Smith-Waterman score: 571; 34.4% identity (65.6% similar) in 291 aa overlap (34-322:46-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 SNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRR
....... . :.: ::..:::. : ..:
CCDS81 KMCPGLSEAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKR
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLL
:::..:. ::. ::.. :: ..:: . . . . : : : : . ::. ::
CCDS81 NPFSIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVC-RVLGLCMFLTGVSLL
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSRND
:.:.::: ::..: :: .::: ::.::::::.:: ::: .. .:. ..
CCDS81 PAVSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCV-FLGRGAPGAA
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CRAVIIFIAILSFLVFTPLMLVSSTILVVKIR-KNTWASHSSKLYIVIMVTIIIFLIFAM
:: . ::..:: ::. :::.. :..... . ..:.:: ::.. . .::. ..
CCDS81 CRHMDIFLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSI
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PMRLLYLLYYEYWSTFGNLHHISLLFSTINSSANPFIYFFVGSSKKKRFKESLKVVLTRA
. . ..:.. . .... : :::::.:..::..: .:..:. : :.::. ::
CCDS81 YLGIDWFLFWVFQIPAPFPEYVTDLCICINSSAKPIVYFLAGRDKSQRLWEPLRVVFQRA
260 270 280 290 300 310
310 320
pF1KE1 FKDEMQPRRQKDNC-NTVTVETVV
..: . . . ::::.:
CCDS81 LRDGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
320 330 340
>>CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 (378 aa)
initn: 502 init1: 224 opt: 563 Z-score: 533.5 bits: 107.2 E(32554): 2.1e-23
Smith-Waterman score: 563; 32.5% identity (64.4% similar) in 317 aa overlap (4-313:45-347)
10 20 30
pF1KE1 MDGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIP
:.. . ... :: . . :.. ... .:
CCDS46 WTVFAESQISLSCSLCLHSGDQEAQNPNLVSQLCGVFLQNETNETIHMQMSMAVGQQALP
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 --IVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRMRRNPFTVYITHLSIADISLLFCIFILSIDY
:. . .: : . :: ..:.:: ::. ::: :: ::. : : .. .
CCDS46 LNIIAPKAVLVSLCGVLLNGTVFWLLCCGAT-NPYMVYILHLVAADVIYLCCS---AVGF
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KE1 ALDYELSSGH---YYTIVTLSVTFLFGYNTGLYLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQ
:. : . : .. :.. :.... : ::.:::.:::. ::.:::::::::::
CCDS46 -LQVTLLTYHGVVFFIPDFLAILSPFSFEVCLCLLVAISTERCVCVLFPIWYRCHRPKYT
140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 SALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESHSRNDCRAVIIFIAILSFL--VFTPLMLVS
: .::.:.:.: .. .. .. .. .. .: .::. . ... ... .: ::
CCDS46 SNVVCTLIWGLPFCINIVKSLFL------TYWKH-VKACVIFLKLSGLFHAILSLVMCVS
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210 220 230 240 250 260
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]