Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7685
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7685, 348 aa
1>>>pF1KB7685 348 - 348 aa - 348 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7381+/-0.00109; mu= 6.0164+/- 0.064
mean_var=241.1763+/-50.237, 0's: 0 Z-trim(111.2): 889 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.082586
statistics sampled from 11213 (12222) to 11213 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.375), width: 16
Scan time: 2.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 ( 348) 2451 305.0 5.9e-83
CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 406) 1193 155.2 8.5e-38
CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 ( 389) 1160 151.3 1.3e-36
CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 394) 1139 148.8 7.2e-36
CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 368) 1098 143.9 2e-34
CCDS82247.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 335) 919 122.5 5.1e-28
CCDS56407.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 445) 824 111.3 1.6e-24
CCDS11913.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 333) 806 109.0 5.7e-24
CCDS56408.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 390) 660 91.7 1.1e-18
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 538) 660 91.9 1.3e-18
CCDS34355.1 ZBED9 gene_id:114821|Hs108|chr6 (1325) 646 90.7 7.5e-18
CCDS59001.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 247) 630 87.9 9.7e-18
CCDS32814.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 275) 627 87.6 1.3e-17
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 627 87.9 2e-17
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 625 87.7 2.4e-17
CCDS12939.1 ZNF444 gene_id:55311|Hs108|chr19 ( 327) 613 86.0 4.7e-17
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 589 83.5 4.9e-16
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 584 82.8 6.8e-16
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 574 81.5 1.4e-15
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 571 81.3 2.3e-15
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 571 81.4 2.4e-15
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 571 81.4 2.4e-15
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 571 81.4 2.4e-15
CCDS82246.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 210) 559 79.4 3.1e-15
CCDS75640.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 350) 562 80.0 3.3e-15
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19 ( 594) 566 80.7 3.3e-15
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 565 80.6 3.4e-15
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 561 80.0 4.2e-15
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 527) 562 80.2 4.3e-15
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 562 80.2 4.5e-15
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 561 80.0 4.5e-15
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 561 80.1 4.7e-15
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 563 80.5 4.9e-15
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 563 80.5 5e-15
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 561 80.2 5.5e-15
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 559 79.8 5.5e-15
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 559 79.9 5.6e-15
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 559 79.9 5.7e-15
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 558 79.7 5.9e-15
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 558 79.7 6e-15
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 558 79.7 6e-15
CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19 ( 610) 559 79.9 6.1e-15
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 556 79.4 6.6e-15
CCDS41300.1 ZSCAN20 gene_id:7579|Hs108|chr1 (1043) 562 80.6 6.7e-15
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 557 79.6 6.8e-15
CCDS10504.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 ( 407) 554 79.1 7.1e-15
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 557 79.7 7.1e-15
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 557 79.7 7.2e-15
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 557 79.7 7.8e-15
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 558 79.9 8e-15
>>CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 2451 init1: 2451 opt: 2451 Z-score: 1602.9 bits: 305.0 E(32554): 5.9e-83
Smith-Waterman score: 2451; 100.0% identity (100.0% similar) in 348 aa overlap (1-348:1-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREALT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAVTVLEDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAVTVLEDLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEAGKPQRNGDKTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEAGKPQRNGDKTR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRERRRYKCDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRERRRYKCDE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPYKCKECGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPYKCKECGKD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 FSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY
310 320 330 340
>>CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 (406 aa)
initn: 2760 init1: 561 opt: 1193 Z-score: 792.0 bits: 155.2 E(32554): 8.5e-38
Smith-Waterman score: 1193; 51.3% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (8-348:5-351)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MTTALEPEDQKGLLIIKAE-DHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREAL
:.: : :.:.: : : :.. . . .: :: ::..:::..:::::::
CCDS46 MASTEEQYDLKIVKVEEDPIWDQETHLRGNNFSGQEASRQLFRQFCYQETPGPREAL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAVTVLEDL
..: :::.:::::: :::::::.::::::::.:::..:::::: ::::.:::::.:.:::
CCDS46 SRLRELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPESGEEAVAVVEDL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ERELDEPGKQVPGNSE-RRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEA---GKPQRN
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CCDS46 EQELSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLRYESFCLHQFQEQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRE---
.. .:.:: .:... :. : ::. ..:..:. : .. . ....: :: .
CCDS46 DGESIPENQELASKQEILKEMEHLGD--SKLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQQAHSTG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVKPY
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CCDS46 ERRHRCNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSHTGEKPY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 KCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY
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CCDS46 QCKECGKAFSASNGLTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQHQRIHTGEKRYQCRE
300 310 320 330 340 350
CCDS46 CGKAFIQNAGLFQHLRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKIHTGERP
360 370 380 390 400
>>CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 (389 aa)
initn: 1796 init1: 564 opt: 1160 Z-score: 771.0 bits: 151.3 E(32554): 1.3e-36
Smith-Waterman score: 1160; 51.1% identity (75.3% similar) in 352 aa overlap (8-348:11-361)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MTTALEPEDQKGLLIIKA----EDHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAP
: :.::: .:. :.: : .:. .. .:: ::..:..::..:::..:
CCDS47 MAITLTLQTAEMQEGLLAVKVKEEEEEHSCGPESGLSRNNPHTREIFRRRFRQFCYQESP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 GPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETGEEAV
:::::: .: :::.:::::: :::::::.::::::::.:::..:::::: :.: .:::::
CCDS47 GPREALQRLQELCHQWLRPEMHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVRQHRPVSGEEAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB7 TVLEDLERELDEPGKQVPGNS-ERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLE---QEA
:::::::::::.::.:: ... :..... .: .: : :: . :.. . :: .:.
CCDS47 TVLEDLERELDDPGEQVLSHAHEQEEFVKEKATP-GAAQESSNDQFQTLEEQLGYNLREV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 GKPQRNGDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQ
:. :. : : :: :... .. . : .. . : . : :. : . ::: : :
CCDS47 CPVQEIDGKAGTWNVELAPKREISQEVKSLIQVLGKQNGNITQIPEYGDTCDREGRLEKQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 QRE---RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVH
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CCDS47 RVSSSVERPYICSECGKSFTQNSILIEHQRTHTGEKPYECDECGRAFSQRSGLFQHQRLH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 TGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANK
:: : :.:. ::: :: .::..: :::::::::.:..:.. : :.::.::::::...
CCDS47 TGEKRYQCSVCGKAFSQNAGLFHHLRIHTGEKPYQCNQCNKSFSRRSVLIKHQRIHTGER
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LY
:
CCDS47 PYECEECGKNFIYHCNLIQHRKVHPVAESS
360 370 380
>>CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 (394 aa)
initn: 2199 init1: 534 opt: 1139 Z-score: 757.4 bits: 148.8 E(32554): 7.2e-36
Smith-Waterman score: 1139; 50.3% identity (74.9% similar) in 350 aa overlap (7-346:16-364)
10 20 30 40
pF1KB7 MTTALEPEDQKGLLIIKAE--DHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCY
:: . :: .:.: .: :.: .. .: ::..:.:::.:::
CCDS46 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 QDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETG
:..::::::::.: ::: :::::. ::::::::::::::::::::.::.::: : ::.:
CCDS46 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 EEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQE-
:::: .::::::::::: ... .. .:...: ...::.. ::.: .::. :: .
CCDS46 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQ-TPLTLQSQPKEPQLTCDS
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 AGKPQRNGDK---TRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEI-NDRLNKDTPQHPKSKDIIENEG
: : . :. :.:...:: ..: :: : :.. :.. . . : :. .. :..
CCDS46 AQKCHSIGETDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEHKD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 RSEWQQRE---RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIG
: : : . . ..:::::::::..:: : .:.: ::::.::.:.:::::: . : :..
CCDS46 RIERQWGNLLGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGLFN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 HHRVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRI
:. .:. : :.:::::: :: .::::::::: :::::.:..:.. . : ::.:::
CCDS46 HRGIHNIQKRYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQRS
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 HTANKLY
::...
CCDS46 HTGERPHQCIECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
360 370 380 390
>>CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 (368 aa)
initn: 1246 init1: 533 opt: 1098 Z-score: 731.4 bits: 143.9 E(32554): 2e-34
Smith-Waterman score: 1098; 50.0% identity (71.0% similar) in 348 aa overlap (7-347:17-362)
10 20 30 40
pF1KB7 MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYWGQDSSS--QKCSPHRRELYRQHFRKLC
:.... .: .: :. :...:: . : :..::.::..
CCDS11 MSAQSVEEDSILIIPTPDEEEKILRVKLEEDPDGEEGSSIPWNHLPDP-EIFRQRFRQFG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 YQDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPET
:::.::::::..:: :::: ::::: :::::::.:.:::::..::::.::.::: ::::.
CCDS11 YQDSPGPREAVSQLRELCRLWLRPETHTKEQILELVVLEQFVAILPKELQTWVRDHHPEN
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GEEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQ-
:::::::::::: :::.::. : ..:..:.. .. . . .: ..::.
CCDS11 GEEAVTVLEDLESELDDPGQPVSLRRRKREVLVEDMVSQEEAQGLPSSELDAVENQLKWA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 --EAGKPQRNGDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGR
: . .. : ::.: : :...:. : :. :: .:: : . .::
CCDS11 SWELHSLRHCDDDGRTENGALAPKQELPSALES-HEVPGTLNMGVPQIFKYGETCFPKGR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 SEWQQRERRRYK--CDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHH
: .. :. . :::::: ::..: : :.: :.::::: : :::::: . : :. :.
CCDS11 FERKRNPSRKKQHICDECGKHFSQGSALILHQRIHSGEKPYGCVECGKAFSRSSILVQHQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 RVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHT
::::: ::::: :::: :: .:::.::::::::::::: .::. . :: :.:::: :.
CCDS11 RVHTGEKPYKCLECGKAFSQNSGLINHQRIHTGEKPYECVQCGKSYSQSSNLFRHQRRHN
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 ANKLY
:.::
CCDS11 AEKLLNVVKV
360
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10 20 30 40
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:. .:.: : :.. ::: . : . : .::.::.. :
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10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
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::.:::.:::..:::::. ::::: :::::::.::::::::.::::.:::::. ::::.:
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110 120 130 140 150 160
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::.::.:::.::::: : . : .:.:.. .:::: : . :: : : ::. .
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130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
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. : : :. .: : . ... :. .... :. . : . :..::
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180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 EWQQRE---RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHH
: .: . ... ::::::: ::.:: : :.: :.:.::: ::::.::: . . :: :.
CCDS82 EKRQGNPSWKKQQKCDECGKIFSQSSALILHQRIHSGKKPYACDECAKAFSRSAILIQHR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 RVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHT
:.::: :::::..::: :: ..:..:.. : .:
CCDS82 RTHTGEKPYKCHDCGKAFSQSSNLFRHRKRHIRKKVP
300 310 320 330
pF1KB7 ANKLY
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10 20 30 40
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:: . :: .:.: .: :.: .. .: ::..:.:::.:::
CCDS56 MNTNSKEVLSLGVQVPEAWEELLTMKVEAKSHLQWQESRLKRSNPLAREIFRRHFRQLCY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
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:..::::::::.: ::: :::::. ::::::::::::::::::::.::.::: : ::.:
CCDS56 QETPGPREALTRLQELCYQWLRPHVSTKEQILDLLVLEQFLSILPKELQGWVREHCPESG
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110 120 130 140 150 160
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:::: .::::::::::: ... .. .:...: ...::.. ::.: .::. :: ..
CCDS56 EEAVILLEDLERELDEPQHEMVAHRHRQEVLCKEMVPLAEQ-TPLTLQSQPKEPQLTCDS
130 140 150 160 170
170
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.. :: .:
CCDS56 AQKCHSIGETDLIRSLRRRAVLIPLGAHLFSTDTFLFSKPVVIPQLKGGGETWPNNRGVL
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 -DK-TRTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEI-NDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRE-
:. :.:...:: ..: :: : :.. :.. . . : :. .. :.. : : : .
CCDS56 RDEVTKTEDRELVLRKDCPKIVEPHGKMFNEQTWEVSQQDPSHGEVGEHKDRIERQWGNL
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 --RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHHRVHTGVK
. ..:::::::::..:: : .:.: ::::.::.:.:::::: . : :..:. .:. :
CCDS56 LGEGQHKCDECGKSFTQSSGLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFSRSSGLFNHRGIHNIQK
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340
pF1KB7 PYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY
:.:::::: :: .::::::::: :::::.:
CCDS56 RYHCKECGKVFSQSAGLIQHQRIHKGEKPYQCSQCSKSYSRRSFLIEHQRSHTGERPHQC
360 370 380 390 400 410
CCDS56 IECGKSFNRHCNLIRHQKIHTVAELV
420 430 440
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10 20 30 40
pF1KB7 MTTALEPEDQKGLLIIKAEDHYW--GQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCY
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CCDS11 MSAKLGKSSSLLTQTSEECNGILTEKMEEEEQTCDPDSSLHWSSSYSPETFRQQFRQFGY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 QDAPGPREALTQLWELCRQWLRPECHTKEQILDLLVLEQFLSILPKDLQAWVRAHHPETG
::.:::.:::..:::::. ::::: :::::::.::::::::.::::.:::::. ::::.:
CCDS11 QDSPGPHEALSRLWELCHLWLRPEVHTKEQILELLVLEQFLAILPKELQAWVQKHHPENG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 EEAVTVLEDLERELDEPGKQVPGNSERRDILMDKLAPLGRPYESLTVQLHPKKTQLEQEA
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CCDS11 EETVTMLEDVERELDGPKQIFFG--RRKDMIAEKLAPSEITEELPSSQLMPVKKQLQGAS
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 GKPQ--RNGDKT-RTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRS
. : : :. .: : . ... :. .... :. . : . :..::
CCDS11 WELQSLRPHDEDIKTTNVKSASRQKTSLGIELHCNVSNILHMNGSQSSTYRGTYEQDGRF
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 EWQQRE---RRRYKCDECGKSFSHSSDLSKHRRTHTGEKPYKCDECGKAFIQRSHLIGHH
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CCDS11 EKRQGNPSWKKQQKCDECGKIFSQSSALILHQRIHSGKKPYACDECAKAFSRSAILIQHR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 RVHTGVKPYKCKECGKDFSGRTGLIQHQRIHTGEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHT
:.:: :
CCDS11 RTHTDSKYEHAIAEAQKNMYFKTRLKCPRSLSGGR
300 310 320 330
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pF1KB7 AWVRAHHPETGEEAVTVLEDLERELDEPGKQVP----GNSERRD-ILMDKLAPLGR---P
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pF1KB7 YESLTVQLHPKKTQLEQEAG-----KPQRN-------GDKTRTKNEELFQKEDMPKDKEF
:.... : :. :: .. : . :.: ::. .::...: :..: .::
CCDS56 VEDVALTLTPEWTQQDSSQGNLCRDEKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELP-EKEH
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 LGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRER---RRYKCDECGKSFSHSSDLSKHR
:.:. .: .: : : . :.::: . .:.. ::. : ::::::..:: :::::
CCDS56 -GKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQEGRLQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHR
130 140 150 160 170 180
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: :::::::.:.::::::: : :. :.::::: :::.:.:::: :: . ::.::: ::
CCDS56 RIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHT
190 200 210 220 230 240
320 330 340
pF1KB7 GEKPYECDECGRPFRVSSALIRHQRIHTANKLY
::::::::.::. : : .:..:.::::..: :
CCDS56 GEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKN
250 260 270 280 290 300
CCDS56 VQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNAC
310 320 330 340 350 360
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20 30 40 50 60 70
pF1KB7 GLLIIKAEDHYWGQDSSSQKCSPHRRELYRQHFRKLCYQDAPGPREALTQLWELCRQWLR
..:: . : .: ::::::..: :::::::.
CCDS46 EDQMELLVIKVEEEEAGFPSSPDLGSEGSRERFRGFRYPEAAGPREALSRLRELCRQWLQ
20 30 40 50 60 70
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CCDS46 PEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGEEVVVLLEYLERQLDEPAPQVS
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pF1KB7 GNSERRDILMDKLAPL------------------------GRPYESLTVQ----------
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CCDS46 GVDQGQELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESVGSQPLQDRVLQVPVLAHGGCC
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pF1KB7 --------------------------LHPKKTQLEQEAG-----KPQRN-------GDKT
: :. :: .. : . :.: ::.
CCDS46 REDKVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDSSQGNLCRDEKQENHGSLVSLGDEK
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pF1KB7 RTKNEELFQKEDMPKDKEFLGEINDRLNKDTPQHPKSKDIIENEGRSEWQQRER---RRY
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CCDS46 QTKSRDLPPAEELP-EKEH-GKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQEGRLQRKQKNATGGRRH
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CCDS46 CGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIHTGEKPYQCSMCGKA
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CCDS46 FRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]