Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7836
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7836, 612 aa
1>>>pF1KB7836 612 - 612 aa - 612 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4654+/-0.000725; mu= 23.6906+/- 0.046
mean_var=370.5448+/-75.955, 0's: 0 Z-trim(112.0): 2002 B-trim: 100 in 1/53
Lambda= 0.066628
statistics sampled from 18462 (20764) to 18462 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.563), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 9.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005640 (OMIM: 602444) zinc finger protein 354A ( 605) 3548 356.8 1.3e-97
XP_016865280 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger ( 605) 3548 356.8 1.3e-97
NP_001311268 (OMIM: 602444) zinc finger protein 35 ( 563) 3281 331.0 6.5e-90
XP_011532947 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger ( 563) 3281 331.0 6.5e-90
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1990 207.1 1.6e-52
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1990 207.1 1.6e-52
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1983 206.4 2.5e-52
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 1891 197.5 1.1e-49
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1853 193.9 1.4e-48
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1812 189.9 2.2e-47
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1776 187.0 2.9e-46
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1776 187.0 2.9e-46
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 1776 187.0 3e-46
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1776 187.0 3e-46
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1776 187.0 3e-46
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1776 187.0 3e-46
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 1776 187.1 3e-46
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1769 185.8 3.8e-46
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1769 185.9 3.9e-46
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1769 185.9 3.9e-46
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1769 185.9 3.9e-46
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1769 185.9 3.9e-46
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1762 185.1 6.1e-46
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1752 184.2 1.2e-45
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1752 184.2 1.2e-45
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1752 184.3 1.3e-45
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1752 184.3 1.3e-45
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1752 184.3 1.3e-45
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1749 184.1 1.6e-45
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 1749 184.1 1.6e-45
NP_001007089 (OMIM: 314993) zinc finger protein 18 ( 620) 1741 183.1 2.5e-45
NP_009069 (OMIM: 603973) zinc finger protein 90 [H ( 601) 1740 183.0 2.6e-45
NP_001171570 (OMIM: 314993) zinc finger protein 18 ( 639) 1737 182.7 3.3e-45
NP_008893 (OMIM: 314993) zinc finger protein 182 i ( 639) 1737 182.7 3.3e-45
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1729 182.1 5.9e-45
>>NP_005640 (OMIM: 602444) zinc finger protein 354A isof (605 aa)
initn: 3104 init1: 3104 opt: 3548 Z-score: 1873.7 bits: 356.8 E(85289): 1.3e-97
Smith-Waterman score: 3548; 86.1% identity (93.4% similar) in 605 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: ::::
NP_005 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDS-FQEQIRKRLKRDEPWNF
::::::::::::::::::.::::::: ::. : ::::::::: :: : :: .:. ::..
NP_005 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISERSCIYEEKLKKQQDKNENLQIISVAHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRF
:. ::: .:.:.:::. ..::.:..: :: :..:::::.:..::: :::.:.:: .
NP_005 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 AKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGE
.:::: ::::: ::.::::.:::: :: ::.:::::: :::.::..::::::.:::.::
NP_005 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKI-TADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYR
:::::::: ::::::::::::: :::::::::::::::::. :.:: :::::::::: ::
NP_005 KLFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 CKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNEC
::::::::::::::::::::::.::: :::::::::: :::::: :.:: ::::::::::
NP_005 CKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNEC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 GNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSS
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TSISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 ALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQ
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: :::.:::::.::::
NP_005 ALIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 HQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKI
:.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:::::..::::::::::
NP_005 HRRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKI
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KB7 HIEEDSLKADLHV
:::::
NP_005 HIEEDP
600
>>XP_016865280 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger pro (605 aa)
initn: 3104 init1: 3104 opt: 3548 Z-score: 1873.7 bits: 356.8 E(85289): 1.3e-97
Smith-Waterman score: 3548; 86.1% identity (93.4% similar) in 605 aa overlap (1-604:1-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: ::::
XP_016 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTRDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLPFTKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDS-FQEQIRKRLKRDEPWNF
::::::::::::::::::.::::::: ::. : ::::::::: :: : :: .:. ::..
XP_016 KVISLLQQGEDPWEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISERSCIYEEKLKKQQDKNENLQIISVAHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRF
:. ::: .:.:.:::. ..::.:..: :: :..:::::.:..::: :::.:.:: .
XP_016 KLEKPYIYEGRLEKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQIL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 AKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGE
.:::: ::::: ::.::::.:::: :: ::.:::::: :::.::..::::::.:::.::
XP_016 PREKTPPKCEIQGNSLKQNSQLLNQPKI-TADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYR
:::::::: ::::::::::::: :::::::::::::::::. :.:: :::::::::: ::
XP_016 KLFKCKECSKAFSQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 CKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNEC
::::::::::::::::::::::.::: :::::::::: :::::: :.:: ::::::::::
XP_016 CKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNEC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 GNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSS
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSISRLNRHRIIHTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 ALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQ
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::: :::.:::::.::::
XP_016 ALIQHQRMHTGERPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 HQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKI
:.::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:::::..::::::::::
XP_016 HRRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKI
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KB7 HIEEDSLKADLHV
:::::
XP_016 HIEEDP
600
>>NP_001311268 (OMIM: 602444) zinc finger protein 354A i (563 aa)
initn: 2837 init1: 2837 opt: 3281 Z-score: 1735.2 bits: 331.0 E(85289): 6.5e-90
Smith-Waterman score: 3281; 85.3% identity (93.1% similar) in 563 aa overlap (43-604:1-562)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 SLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKPKVISLLQQGEDP
::::::::::::: ::::::::::::::::
NP_001 MLENYRNLVSLGLPFTKPKVISLLQQGEDP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 WEVEKDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDS-FQEQIRKRLKRDEPWNFISERSCIYEEKL
::::::.::::::: ::. : ::::::::: :: : :: .:. ::.. :. ::: .:
NP_001 WEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIYEGRL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 KKQQDKNENLQIISVAHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRFAKEKTPSKCEIQ
.:.:::. ..::.:..: :: :..:::::.:..::: :::.:.:: . .:::: :::::
NP_001 EKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQILPREKTPPKCEIQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 RNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGEKLFKCKECLKAF
::.::::.:::: :: ::.:::::: :::.::..::::::.:::.:::::::::: :::
NP_001 GNSLKQNSQLLNQPKI-TADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEKLFKCKECSKAF
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 SQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYRCKECGKSFSRRS
:::::::::: :::::::::::::::::. :.:: :::::::::: ::::::::::::::
NP_001 SQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRCKECGKSFSRRS
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 GLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRY
::::::::::.::: :::::::::: :::::: :.:: ::::::::::::::::::::::
NP_001 GLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRY
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 HQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRII
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 HTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGE
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 RPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQHQRIHTGEKPFK
:::::::: :::::::::::::::::::::::: :::.:::::.:::::.::::::::::
NP_001 RPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQHRRIHTGEKPFK
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 CNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKIHIEEDSLKADLH
::::::::::::: ::::::::::::::::.:::::..:::::::::::::::
NP_001 CNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIHIEEDP
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 V
>>XP_011532947 (OMIM: 602444) PREDICTED: zinc finger pro (563 aa)
initn: 2837 init1: 2837 opt: 3281 Z-score: 1735.2 bits: 331.0 E(85289): 6.5e-90
Smith-Waterman score: 3281; 85.3% identity (93.1% similar) in 563 aa overlap (43-604:1-562)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 SLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKPKVISLLQQGEDP
::::::::::::: ::::::::::::::::
XP_011 MLENYRNLVSLGLPFTKPKVISLLQQGEDP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 WEVEKDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDS-FQEQIRKRLKRDEPWNFISERSCIYEEKL
::::::.::::::: ::. : ::::::::: :: : :: .:. ::.. :. ::: .:
XP_011 WEVEKDGSGVSSLGSKSSHKTTKSTQTQDSSFQGLILKRSNRNVPWDLKLEKPYIYEGRL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 KKQQDKNENLQIISVAHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRFAKEKTPSKCEIQ
.:.:::. ..::.:..: :: :..:::::.:..::: :::.:.:: . .:::: :::::
XP_011 EKKQDKKGSFQIVSATHKKIPTIERSHKNTELSQNFSPKSVLIRQQILPREKTPPKCEIQ
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 RNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGEKLFKCKECLKAF
::.::::.:::: :: ::.:::::: :::.::..::::::.:::.:::::::::: :::
XP_011 GNSLKQNSQLLNQPKI-TADKRYKCSLCEKTFINTSSLRKHEKNHSGEKLFKCKECSKAF
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 SQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYRCKECGKSFSRRS
:::::::::: :::::::::::::::::. :.:: :::::::::: ::::::::::::::
XP_011 SQSSALIQHQITHTGEKPYICKECGKAFTLSTSLYKHLRTHTVEKSYRCKECGKSFSRRS
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 GLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRY
::::::::::.::: :::::::::: :::::: :.:: ::::::::::::::::::::::
XP_011 GLFIHQKIHAEENPCKYNPGRKASSCSTSLSGCQRIHSRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRY
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 HQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRII
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 HTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HTGEKFYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGE
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 RPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQHQRIHTGEKPFK
:::::::: :::::::::::::::::::::::: :::.:::::.:::::.::::::::::
XP_011 RPYKCNECGKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCEECGISFGQSSALIQHRRIHTGEKPFK
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 CNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKIHIEEDSLKADLH
::::::::::::: ::::::::::::::::.:::::..:::::::::::::::
XP_011 CNTCGKTFRQSSSRIAHQRIHTGEKPYECNTCGKLFNHRSSLTNHYKIHIEEDP
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 V
>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (658 aa)
initn: 3458 init1: 1835 opt: 1990 Z-score: 1064.1 bits: 207.1 E(85289): 1.6e-52
Smith-Waterman score: 1990; 49.8% identity (73.2% similar) in 608 aa overlap (1-603:1-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
:. : : . ..:::::.: :. .:: .: :.::.:::::::...: :::.: . ::
NP_001 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVE-KDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDSFQEQIRKRLKRDEPWNF
.:::::.: . : :: . .:: .. ::. :. : ...:.: . . : . .
NP_001 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYP-DLETRPKVKLSVLKQ-GISEEISNSVILVERFLW
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISERSCIYEEKLKKQQDKNENLQ--IISVAHTKILT--VDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIK
. : :. . . . :.:. . :: : . : ... ..: ::.:. :. . .
NP_001 DGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRN-GFGENISLNPDLPH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QQRFAKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKN
: ....: . . : . :.:... .: :: :::. : ::: :.:.: .:...
NP_001 QPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HTGEKLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVE
::::. ..:.::::.: .:::: .::: ::::::: : .::..:.. : : .: :::: :
NP_001 HTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KCYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYL
: :.:.::::::: ::.. :.. :. :.:.. . :: : :. .:: .: :
NP_001 KPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 CNECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNEC
:.:::..:. :::: ::::::::::..: :::.::.: . ::::.: :::::::.:.::
NP_001 CGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGEC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 GKGFTSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAF
::.:.. . :..:: :::::: :.::::::..: :.: ::: :::::: .:. :::::
NP_001 GKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 RQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSA
:::. : ::::.::::.::.::.: :.: .:::..:::::::::::.: .:: .:.: :
NP_001 RQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 ALIQHQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTN
:::::::::::::..:: ::..: ::: :: :::::: :::: :: ::: ::. :::..
NP_001 PLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQ
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KB7 HYKIHIEEDSLKADLHV
: . : :
NP_001 HERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRT
600 610 620 630 640 650
>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (658 aa)
initn: 3458 init1: 1835 opt: 1990 Z-score: 1064.1 bits: 207.1 E(85289): 1.6e-52
Smith-Waterman score: 1990; 49.8% identity (73.2% similar) in 608 aa overlap (1-603:1-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
:. : : . ..:::::.: :. .:: .: :.::.:::::::...: :::.: . ::
XP_016 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVE-KDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDSFQEQIRKRLKRDEPWNF
.:::::.: . : :: . .:: .. ::. :. : ...:.: . . : . .
XP_016 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYP-DLETRPKVKLSVLKQ-GISEEISNSVILVERFLW
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISERSCIYEEKLKKQQDKNENLQ--IISVAHTKILT--VDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIK
. : :. . . . :.:. . :: : . : ... ..: ::.:. :. . .
XP_016 DGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRN-GFGENISLNPDLPH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QQRFAKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKN
: ....: . . : . :.:... .: :: :::. : ::: :.:.: .:...
XP_016 QPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HTGEKLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVE
::::. ..:.::::.: .:::: .::: ::::::: : .::..:.. : : .: :::: :
XP_016 HTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KCYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYL
: :.:.::::::: ::.. :.. :. :.:.. . :: : :. .:: .: :
XP_016 KPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 CNECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNEC
:.:::..:. :::: ::::::::::..: :::.::.: . ::::.: :::::::.:.::
XP_016 CGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGEC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 GKGFTSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAF
::.:.. . :..:: :::::: :.::::::..: :.: ::: :::::: .:. :::::
XP_016 GKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 RQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSA
:::. : ::::.::::.::.::.: :.: .:::..:::::::::::.: .:: .:.: :
XP_016 RQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 ALIQHQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTN
:::::::::::::..:: ::..: ::: :: :::::: :::: :: ::: ::. :::..
XP_016 PLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQ
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KB7 HYKIHIEEDSLKADLHV
: . : :
XP_016 HERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRT
600 610 620 630 640 650
>>XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
initn: 3458 init1: 1835 opt: 1983 Z-score: 1060.4 bits: 206.4 E(85289): 2.5e-52
Smith-Waterman score: 1983; 50.5% identity (73.5% similar) in 600 aa overlap (9-603:23-615)
10 20 30 40
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLEN
: :: :::::.: :. .:: .: :.::.:::::::..
XP_005 MELGSRRRSVGCRCRGLCLAVRREQV--TFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDT
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 YRNLVSLGLSFTKPKVISLLQQGEDPWEVE-KDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDSFQE
.: :::.: . ::.:::::.: . : :: . .:: .. ::. :. : ...:
XP_005 FRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYP-DLETRPKVKLSVLKQ-GISE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 QIRKRLKRDEPWNFISERSCIYEEKLKKQQDKNENLQ--IISVAHTKILT--VDRSHKNV
.: . . : . . . : :. . . . :.:. . :: : . : ... ..:
XP_005 EISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRN-
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 EFGQNFYLKSVFIKQQRFAKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEK
::.:. :. . .: ....: . . : . :.:... .: :: :::. : :
XP_005 GFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 AFIHNSSLRKHQKNHTGEKLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSH
:: :.:.: .:...::::. ..:.::::.: .:::: .::: ::::::: : .::..:..
XP_005 AFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 SASLCKHLRTHTVEKCYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSL
: : .: :::: :: :.:.::::::: ::.. :.. :. :.:.. . :: : :
XP_005 IAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SGSQKIHLRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHE
. .:: .: : :.:::..:. :::: ::::::::::..: :::.::.: . ::::.
XP_005 TQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 RIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHT
: :::::::.:.::::.:.. . :..:: :::::: :.::::::..: :.: ::: ::
XP_005 RTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHT
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 GEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKP
:::: .:. ::::::::. : ::::.::::.::.::.: :.: .:::..::::::::::
XP_005 GEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 YRCLECGMSFGQSAALIQHQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECN
:.: .:: .:.: : :::::::::::::..:: ::..: ::: :: :::::: :::: ::
XP_005 YECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCN
540 550 560 570 580 590
590 600 610
pF1KB7 ACGKLFSQRSSLTNHYKIHIEEDSLKADLHV
::: ::. :::..: . : :
XP_005 ECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGK
600 610 620 630 640 650
>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa)
initn: 4669 init1: 1604 opt: 1891 Z-score: 1012.9 bits: 197.5 E(85289): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 1891; 47.6% identity (72.2% similar) in 594 aa overlap (14-603:4-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
:::.:::. :. ::. : .::::::.:::::::::: ::.. .::
NP_003 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSGVS--SLGCKSTPKMTKSTQT-QDSFQEQIRKRLKRDEPW
.:. :.::.. : ... :. .. :. . :. .::::. :: . .
NP_003 DLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NFISERSCIYEEKLKKQQDKNENL-QIISVAHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQ
:. ...: .. : .. ..: : ......::. : : :. ...: .. ..
NP_003 NLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCD---KYVKVAHKFSNSNR--HE
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QRFAKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNH
: .:.: : :: .:: . : : ..:.:.: . ::: : ::: .:.: ::.. :
NP_003 IRHTKKK-PFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TGEKLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEK
:::: .::.:: :::.::: ::.:.. ::::::: :.::::.:.. ..: : :: ::
NP_003 TGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 CYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLC
:.::::::.:.: : : :.:::. :.:.: . :: . :..:. . :: .: : :
NP_003 PYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKC
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 NECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECG
..::..:..:. : :. :::::::.:: .::.::.. . : :. ::::::::.:.:::
NP_003 KKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 KGFTSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFR
:.: : :..:.::::::: :.:.:: ::... : : :..::::::: .:. :::::
NP_003 KAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 QSSALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAA
::: : .:.. :: :.::::.:: : :. :.:. :. ::::::::.: ::: .:.::.
NP_003 QSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSK
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 LIQHQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNH
: .:..:::::::. :. :::.: :::.: :.:::::::::.:. : : :. : ::.:
NP_003 LTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKH
530 540 550 560 570 580
600 610
pF1KB7 YKIHIEEDSLKADLHV
:: :
NP_003 KIIHTGEKLQI
590
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 3349 init1: 1726 opt: 1853 Z-score: 993.1 bits: 193.9 E(85289): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 1853; 49.8% identity (73.1% similar) in 566 aa overlap (43-603:1-561)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 SLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKPKVISLLQQGEDP
::...: :::.: . ::.:::::.: .
NP_001 MLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAEL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 WEVE-KDSSGVSSLGCKSTPKMTKSTQTQDSFQEQIRKRLKRDEPWNFISERSCIYEEKL
: :: . .:: .. ::. :. : ...:.: . . : . . . : :.
NP_001 WAVESRLPQGVYP-DLETRPKVKLSVLKQ-GISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTE
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180
pF1KB7 KKQQDKNENLQ--IISVAHTKILT--VDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRFAKEKTPSK
. . . :.:. . :: : . : ... ..: ::.:. :. . .: ....:
NP_001 GHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRN-GFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHT
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CEIQRNSFKQNSNLLNQSKIKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGEKLFKCKEC
. . : . :.:... .: :: :::. : ::: :.:.: .:...::::. ..:.::
NP_001 WGTRGKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHEC
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LKAFSQSSALIQHQRTHTGEKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYRCKECGKSF
::.: .:::: .::: ::::::: : .::..:.. : : .: :::: :: :.:.::::::
NP_001 LKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSF
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SRRSGLFIHQKIHAQENPHKYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNECGNTFKSSS
: ::.. :.. :. :.:.. . :: : :. .:: .: : :.:::..:. ::
NP_001 SFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSS
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SLRYHQRIHTGEKPFKCSECGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNR
:: ::::::::::..: :::.::.: . ::::.: :::::::.:.::::.:.. . :..
NP_001 SLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTE
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 HRIIHTGEKLYNCNECGKALSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRM
:: :::::: :.::::::..: :.: ::: :::::: .:. ::::::::. : ::::.
NP_001 HRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRI
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HTGERPYKCNECDKTFRCNSSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQHQRIHTGE
::::.::.::.: :.: .:::..:::::::::::.: .:: .:.: : :::::::::::
NP_001 HTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGE
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KPFKCNTCGKTFRQSSSLIAHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKIHIEEDSLK
::..:: ::..: ::: :: :::::: :::: :: ::: ::. :::..: . : :
NP_001 KPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYE
510 520 530 540 550 560
610
pF1KB7 ADLHV
NP_001 CHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
570 580 590 600 610
>>NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (625 aa)
initn: 4862 init1: 1790 opt: 1812 Z-score: 971.8 bits: 189.9 E(85289): 2.2e-47
Smith-Waterman score: 1839; 45.5% identity (69.4% similar) in 624 aa overlap (14-603:4-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAGQREARPQVSLTFEDVAVLFTWDEWRKLAPSQRNLYRDVMLENYRNLVSLGLSFTKP
:::.:::. :. ::. : .::::::.:::::::::: ::.. .::
NP_001 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKP
10 20 30 40 50
70 80 90
pF1KB7 KVISLLQQGEDPWEVEKDSSGVSS-LGCKS---TPKMTKST-------------------
.:. :.::.. : ... :.. :: : . .. ...
NP_001 DLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTGCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB7 ----------QTQDSFQEQIRKRLKRDEPWNFISERSCIYEEKLKKQQDKNENL-QIISV
. .::::. :: . . :. ...: .. : .. ..: : ...
NP_001 HFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTA
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 AHTKILTVDRSHKNVEFGQNFYLKSVFIKQQRFAKEKTPSKCEIQRNSFKQNSNLLNQSK
...::. : : :. ...: .. .. : .:.: : :: .:: . : : ..:.
NP_001 TQSKIFQCD---KYVKVAHKFSNSNR--HEIRHTKKK-PFKCTKCGKSFGMISCLTEHSR
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 IKTAEKRYKCSTCEKAFIHNSSLRKHQKNHTGEKLFKCKECLKAFSQSSALIQHQRTHTG
:.: . ::: : ::: .:.: ::.. ::::: .::.:: :::.::: ::.:.. :::
NP_001 IHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTG
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 EKPYICKECGKAFSHSASLCKHLRTHTVEKCYRCKECGKSFSRRSGLFIHQKIHAQENPH
:::: :.::::.:.. ..: : :: :: :.::::::.:.: : : :.:::. :.:.
NP_001 EKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPY
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 KYNPGRKASSYSTSLSGSQKIHLRKKSYLCNECGNTFKSSSSLRYHQRIHTGEKPFKCSE
: . :: . :..:. . :: .: : :..::..:..:. : :. :::::::.:: .
NP_001 KCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEK
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 CGRAFSQSASLIQHERIHTGEKPYRCNECGKGFTSISRLNRHRIIHTGEKLYNCNECGKA
::.::.. . : :. ::::::::.:.::::.: : :..:.::::::: :.:.:: ::
NP_001 CGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKA
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 LSSHSTLIIHERIHTGEKPCKCKVCGKAFRQSSALIQHQRMHTGERPYKCNECDKTFRCN
... : : :..::::::: .:. ::::: ::: : .:.. :: :.::::.:: : :.
NP_001 FNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWP
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 SSLSNHQRIHTGEKPYRCLECGMSFGQSAALIQHQRIHTGEKPFKCNTCGKTFRQSSSLI
:.:. :. ::::::::.: ::: .:.::. : .:..:::::::. :. :::.: :::.:
NP_001 STLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLT
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KB7 AHQRIHTGEKPYECNACGKLFSQRSSLTNHYKIHIEEDSLKADLHV
:.:::::::::.:. : : :. : ::.: :: :
NP_001 KHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
590 600 610 620
612 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 22:33:40 2016 done: Fri Nov 4 22:33:41 2016
Total Scan time: 9.180 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]