Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7856
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7856, 627 aa
1>>>pF1KB7856 627 - 627 aa - 627 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2371+/-0.000781; mu= 17.8805+/- 0.048
mean_var=347.4817+/-68.476, 0's: 0 Z-trim(112.0): 2021 B-trim: 77 in 1/53
Lambda= 0.068803
statistics sampled from 18507 (20787) to 18507 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 9.440
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005764 (OMIM: 606956) zinc finger protein 256 [ ( 627) 4467 459.1 2.1e-128
XP_016881627 (OMIM: 606956) PREDICTED: zinc finger ( 474) 3410 353.9 7.2e-97
NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 2297 243.8 1.5e-63
NP_942152 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 i ( 564) 2259 239.8 1.9e-62
NP_006376 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 i ( 577) 2245 238.5 5.1e-62
NP_001252529 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 503) 2064 220.4 1.2e-56
NP_001252528 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 555) 2024 216.5 2e-55
NP_001252527 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 616) 2024 216.6 2.1e-55
NP_001309235 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 627) 2024 216.6 2.1e-55
NP_001252526 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 629) 2024 216.6 2.1e-55
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1852 199.5 2.9e-50
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1852 199.5 2.9e-50
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1852 199.5 2.9e-50
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1852 199.6 3e-50
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1852 199.6 3e-50
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1852 199.6 3e-50
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1852 199.6 3e-50
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1852 199.6 3e-50
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1852 199.6 3e-50
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1852 199.6 3e-50
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1849 199.4 3.9e-50
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1849 199.4 3.9e-50
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1849 199.4 3.9e-50
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1844 198.7 5e-50
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 1841 198.9 8.1e-50
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 1841 199.0 8.4e-50
NP_001078853 (OMIM: 604085) zinc finger protein 15 ( 437) 1828 196.8 1.3e-49
XP_005272399 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 542) 1829 197.1 1.3e-49
XP_005272398 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1829 197.3 1.5e-49
NP_008889 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 [H ( 682) 1829 197.3 1.5e-49
XP_011515600 (OMIM: 601262) PREDICTED: zinc finger ( 682) 1829 197.3 1.5e-49
NP_001025147 (OMIM: 601262) zinc finger protein 16 ( 682) 1829 197.3 1.5e-49
NP_001316385 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 567) 1806 194.9 6.6e-49
NP_001277248 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 617) 1806 194.9 6.8e-49
NP_065708 (OMIM: 613840) zinc finger protein 304 i ( 659) 1806 195.0 7e-49
XP_011525447 (OMIM: 613840) PREDICTED: zinc finger ( 664) 1806 195.0 7e-49
NP_001277247 (OMIM: 613840) zinc finger protein 30 ( 706) 1806 195.1 7.2e-49
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1787 193.0 2.5e-48
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1787 193.0 2.5e-48
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1787 193.1 2.6e-48
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1787 193.1 2.6e-48
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1777 192.1 5.1e-48
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1777 192.2 5.3e-48
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1777 192.2 5.3e-48
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1777 192.2 5.3e-48
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1777 192.2 5.3e-48
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1777 192.2 5.3e-48
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1777 192.2 5.3e-48
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1777 192.2 5.3e-48
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1777 192.2 5.3e-48
>>NP_005764 (OMIM: 606956) zinc finger protein 256 [Homo (627 aa)
initn: 4467 init1: 4467 opt: 4467 Z-score: 2426.2 bits: 459.1 E(85289): 2.1e-128
Smith-Waterman score: 4467; 100.0% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGGSGAGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGGSGAGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 IHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLIS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 HTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB7 RPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
:::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
610 620
>>XP_016881627 (OMIM: 606956) PREDICTED: zinc finger pro (474 aa)
initn: 3410 init1: 3410 opt: 3410 Z-score: 1860.1 bits: 353.9 E(85289): 7.2e-97
Smith-Waterman score: 3410; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (154-627:1-474)
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRF
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRF
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSE
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKL
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHS
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFF
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWK
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTG
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 ERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPY
400 410 420 430 440 450
610 620
pF1KB7 ECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
::::::::::::::::::::::::
XP_016 ECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
460 470
>>NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [Homo (706 aa)
initn: 2245 init1: 2245 opt: 2297 Z-score: 1261.7 bits: 243.8 E(85289): 1.5e-63
Smith-Waterman score: 2373; 52.2% identity (76.2% similar) in 644 aa overlap (11-625:35-677)
10 20 30 40
pF1KB7 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYH
...::::::::::: .:: ::: ::. :::
NP_003 SPQVLMGLPALLMGPAQHTSWPCGSAVPTLKSMVTFEDVAVYFSQEEWELLDAAQRHLYH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB7 DVMLENLTLTTSLGG-SGAGDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVL
.:::::: :.::::. :. : : .:..: . : :::::.: :: .:.: :..::: :
NP_003 SVMLENLELVTSLGSWHGVEGEGAHPKQNVSVE-VLQVRIPNADPSTKKANSCDMCGPFL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 RQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSC
..::::.:::::. .: :: ::: ... ..: ::::::.: : : :: :: ...:
NP_003 KDILHLAEHQGTQSEEKPYTCGACGRDFWLNANLHQHQKEHSGGKPFRWYKDRDALMKSS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 TFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVA-FHSVKNHYNWGECVK
..: .::::.: :: .: .:: ::. . .: . . . .... .. ..: :
NP_003 KVHLSENPFTCREGGKVILGSCDLLQLQAVDSGQKPYSNLGQLPEVCTTQKLFECSNCGK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250
pF1KB7 AFSYK-----HVRVQHQ---------GDLIRERS-------------YMCSECGKSFSTS
:: . :.:.. . :....:.: ..:.::::.:: :
NP_003 AFLKSSTLPNHLRTHSEEIPFTCPTGGNFLEEKSILGNKKFHTGEIPHVCKECGKAFSHS
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 CSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLL
.: : . :: : : : :::.. .. ... :.:::.: ::..:::::: :. . :.
NP_003 SKLRKHQKFHTEVKYYECIACGKTFNHKLTFVHHQRIHSGERPYECDECGKAFSNRSHLI
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 IHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQR
:..:::::::..: .::..::.::... ::..:: .::::::.::::: .::.:: : :
NP_003 RHEKVHTGERPFECLKCGRAFSQSSNFLRHQKVHTQVRPYECSQCGKSFSRSSALIQHWR
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 VHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTG
:::: ::: :::::..:... .: .:...: :: :.::::::. :. :....::.::::
NP_003 VHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQSSHLLRHQKVHTG
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 VRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPY
: :: .::: :: . :: :..::::.:::::::: :::. .: ::.::..::: .::
NP_003 ERPFECCDCGKAFSNSSTLIQHQKVHTGQRPYECSECRKSFSRSSSLIQHWRIHTGEKPY
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 ECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSE
::.::::.:.:::::..: :::: :::::::::::::::.: ::.:.. ::::.::.:::
NP_003 ECSECGKAFAHSSTLIEHWRVHTKERPYECNECGKFFSQNSILIKHQKVHTGEKPYKCSE
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 CWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGKF
: : :: .:::. : :::::::::::::::..::..:.:. :::.:. :::::: .:::
NP_003 CGKFFSRKSSLICHWRVHTGERPYECSECGRAFSSNSHLVRHQRVHTQERPYECIQCGKA
610 620 630 640 650 660
620
pF1KB7 FTFNSNLLKHQNVHKG
:. :.:..::.::
NP_003 FSERSTLVRHQKVHTRERTYECSQCGKLFSHLCNLAQHKKIHT
670 680 690 700
>>NP_942152 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 isofo (564 aa)
initn: 5155 init1: 1594 opt: 2259 Z-score: 1242.1 bits: 239.8 E(85289): 1.9e-62
Smith-Waterman score: 2259; 59.3% identity (78.1% similar) in 548 aa overlap (1-546:21-564)
10 20 30 40
pF1KB7 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYH
::.: : ::.: ::::::::::::.:: ::::::: ::
NP_942 MLGFPPGRPQLPVQLRPQTRMATA-LRDPASGSVTFEDVAVYFSWEEWDLLDEAQKHLYF
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB7 DVMLENLTLTTSLGG-SGAGDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVL
::::::..::.::: :. ::.: .: : .:: : : : : :... :::: ::
NP_942 DVMLENFALTSSLGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSSQNADSCEICCLVL
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100 110 120 130 140 150
pF1KB7 RQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSC
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120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 TFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHT-RKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVK
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NP_942 IVHVSEKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 AFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQ
:::. . :: : : :: . ::.:::. . :.: .: .::. :.:: :.:::: .
NP_942 AFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 SSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSL
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NP_942 YSSFIIHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNL
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 ITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHR
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NP_942 MQHRRVHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHR
360 370 380 390 400 410
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pF1KB7 RLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHT
::: :: :::::.::: : : : .:..:::: : . : :::: ::.. .: :.::::
NP_942 RLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHT
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460 470 480 490 500 510
pF1KB7 GERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERP
:::: :::::.:::.::: ::.: .:::: :::::.::::::..::.:.::.:::::.::
NP_942 GERPVECSECSKSFSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRP
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pF1KB7 YECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECS
:.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:
NP_942 YQCSQCGKSFGCKSVLIQHQRVHIGEKP
540 550 560
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10 20 30
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.:. : .:: ::::::::::::.:: :
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40 50 60 70 80
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:::::: :: ::::::..::.::: :. ::.: .: : .:: : : : : :..
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90 100 110 120 130 140
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. :::: :::.::::.:::::. ::::.: : ::. ..: :.:::.::. . :::
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: .:: .:: :::::.:. ::::. :::.:.:..: .: .: .: ::::.: :
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pF1KB7 NHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYT
.:.:::.: ::::. . :: : : :: . ::.:::. . :.: .: .::. :.::
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:.:::: . ::.: :.:.::: ::. : :::: :.. :.: :..::::::::.:.::
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:::::. :.:. :.:.::: :::::::::::: .. ::: ::::::: ::. :.::::::
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:.: ::.::::: :: :::::.::: : : : .:..:::: : . : :::: ::..
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:.:::::.:::.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:
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pF1KB7 HTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
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pF1KB7 IVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGG-SGAGDEEAPYQQSTSP
::::..::.::: :. ::.: .: :
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pF1KB7 QRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTA
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pF1KB7 YLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHT
:.:::.::. . ::: : .:: .:: :::::.:. ::::. :::.:.:..:
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pF1KB7 -RKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFST
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:.: .: .::. :.:: :.:::: . ::.: :.:.::: ::. : :::: :.. :.:
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pF1KB7 LIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQ
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pF1KB7 RVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHT
::::: ::. :.:::::::.: ::.::::: :: :::::.::: : : : .:..:::
NP_001 RVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHT
330 340 350 360 370 380
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pF1KB7 GVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARP
: : . : :::: ::.. .: :.:::::::: :::::.:::.::: ::.: .:::: ::
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pF1KB7 YECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECS
:::.::::::..::.:.::.:::::.:::.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:
NP_001 YECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLIQHQRVHIGEKP
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pF1KB7 ECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGK
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pF1KB7 EWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGGSGAGDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSP
:. ::.: .: : .:: : : : :
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40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 QKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHF
:... :::: :::.::::.:::::. ::::.: : ::. ..: :.:::.::. . :
NP_001 QNADSCEICCLVLRDILHLAEHQGTNCGQKLHT---CGKQFYISANLQQHQRQHITEAPF
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 RSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHT-RKKSNRTKSAVAFH
:: : .:: .:: :::::.:. ::::. :::.:.:..: .: .: .: ::::.
NP_001 RSYVDTASFTQSCIVHVSEKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFY
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 SVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEK
: :.:.:::.: ::::. . :: : : :: . ::.:::. . :.: .: .::. :.
NP_001 SGKSHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEER
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 PYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKC
:: :.:::: . ::.: :.:.::: ::. : :::: :.. :.: :..::::::::.:
NP_001 PYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPYACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYEC
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 SECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECG
.:::::::. :.:. :.:.::: :::::::::::: .. ::: ::::::: ::. :.:::
NP_001 GECGKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPYECSECGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECG
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 KSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFS
::::.: ::.::::: :: :::::.::: : : : .:..:::: : . : :::: ::
NP_001 KSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKSFKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFS
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450 460 470 480 490 500
pF1KB7 RKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSST
.. .: :.:::::::: :::::.:::.::: ::.: .:::: :::::.::::::..::.
NP_001 HSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKSFSCKSNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSS
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pF1KB7 LLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKH
:.::.:::::.:::.:..::: :. .: ::.:.: : ::.:
NP_001 LIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLIQHQRVHIGEKP
520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 RRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVH
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10 20 30 40
pF1KB7 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTL
::::::.:: ::::::: :: ::::::..:
NP_001 PQLPVQLRPQTRMATALRDPASGSVTFEDVAVYFSWEEWDLLDEAQKHLYFDVMLENFAL
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50 60
pF1KB7 TTSLG---------------------------------------------GSGAGD----
:.::: :.: ..
NP_001 TSSLGLISSWSHVVAQLGLGEVPSVLHRMFMTPASARWDQRGPGLHEWHLGKGMSSGCWC
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70 80 90 100 110
pF1KB7 ----EEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQK
::.: .: : .:: : : : : :... :::: :::.::::.:::::. :::
NP_001 GVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSSQNADSCEICCLVLRDILHLAEHQGTNCGQK
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pF1KB7 LYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKD
:.: : ::. ..: :.:::.::. . ::: : .:: .:: :::::.:. ::
NP_001 LHT---CGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSCIVHVSEKPFTCREIRKD
190 200 210 220 230 240
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FLVRSRFLQQQAAHT-RKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIR
::. :::.:.:..: .: .: .: ::::.: :.:.:::.: ::::. . :: : : :
NP_001 FLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSKAFSHIDTLVQDQRILTR
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPH
: . ::.:::. . :.: .: .::. :.:: :.:::: . ::.: :.:.::: ::.
NP_001 EGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPY
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSE
: :::: :.. :.: :..::::::::.:.:::::::. :.:. :.:.::: :::::::
NP_001 ACPECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPYECSE
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 CGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKL
::::: .. ::: ::::::: ::. :.:::::::.: ::.::::: :: :::::.:::
NP_001 CGKSFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKS
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 FTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCK
: : : .:..:::: : . : :::: ::.. .: :.:::::::: :::::.:::.::
NP_001 FKQSSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKSFSCK
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 SYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLI
: ::.: .:::: :::::.::::::..::.:.::.:::::.:::.:..::: :. .: ::
NP_001 SNLIKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLI
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 RHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQR
.:.: : ::.:
NP_001 QHQRVHIGEKP
610
>>NP_001309235 (OMIM: 601856) zinc finger protein 211 [H (627 aa)
initn: 5155 init1: 1594 opt: 2024 Z-score: 1115.7 bits: 216.6 E(85289): 2.1e-55
Smith-Waterman score: 2024; 57.8% identity (77.6% similar) in 491 aa overlap (57-546:140-627)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 EWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGGSGAGDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSP
:. ::.: .: : .:: : : : :
NP_001 MTPASARWDQRGPGLHEWHLGKGMSSGCWCGVEHEETPSEQRISGERVPQFRTSKEGSSS
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 QKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHF
:... :::: :::.::::.:::::. ::::.: : ::. ..: :.:::.::. . :
NP_001 QNADSCEICCLVLRDILHLAEHQGTNCGQKLHT---CGKQFYISANLQQHQRQHITEAPF
170 180 190 200 210 220
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]