Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7856
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7856, 627 aa
1>>>pF1KB7856 627 - 627 aa - 627 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9488+/-0.00208; mu= 19.0520+/- 0.125
mean_var=320.3433+/-58.268, 0's: 0 Z-trim(105.0): 941 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.071658
statistics sampled from 7151 (8178) to 7151 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 4467 477.3 2.7e-134
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 2470 270.9 3.9e-72
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 2470 270.9 4e-72
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 2327 256.0 1e-67
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 2298 253.1 8.8e-67
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 2297 253.0 9.7e-67
CCDS74469.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 574) 2262 249.3 1.1e-65
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 2259 248.9 1.3e-65
CCDS56110.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 574) 2258 248.8 1.4e-65
CCDS12965.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 575) 2250 248.0 2.6e-65
CCDS12964.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 575) 2246 247.6 3.4e-65
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 2245 247.5 3.7e-65
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 2145 237.2 4.8e-62
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 2064 228.7 1.5e-59
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 2024 224.6 2.7e-58
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 2024 224.7 2.9e-58
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 2024 224.7 2.9e-58
CCDS12962.2 ZNF776 gene_id:284309|Hs108|chr19 ( 518) 1959 217.8 2.8e-56
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1960 218.2 2.9e-56
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1960 218.2 2.9e-56
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1852 206.9 6.4e-53
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1852 207.0 6.6e-53
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1852 207.0 6.7e-53
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1852 207.0 6.7e-53
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1849 206.8 8.7e-53
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1841 206.4 1.9e-52
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1835 205.2 2.3e-52
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19 ( 594) 1832 204.8 2.7e-52
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1834 205.3 2.7e-52
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 1828 204.2 3.1e-52
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1831 204.9 3.1e-52
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1829 204.6 3.5e-52
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1806 202.2 1.7e-51
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1806 202.2 1.8e-51
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1806 202.3 1.8e-51
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1805 202.1 1.9e-51
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1802 201.8 2.4e-51
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1795 201.3 4.3e-51
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1795 201.3 4.4e-51
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1795 201.3 4.4e-51
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1792 200.8 5e-51
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1787 200.2 6.6e-51
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1790 201.0 6.9e-51
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1787 200.2 6.9e-51
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1790 201.0 7e-51
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1776 199.0 1.4e-50
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1777 199.3 1.5e-50
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1774 198.7 1.6e-50
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1776 199.3 1.6e-50
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1772 198.8 2.1e-50
>>CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 (627 aa)
initn: 4467 init1: 4467 opt: 4467 Z-score: 2524.5 bits: 477.3 E(32554): 2.7e-134
Smith-Waterman score: 4467; 100.0% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGGSGAGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGGSGAGD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRFLQQQAAHTRKKSNRTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERSYM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCDEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGKSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 IHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYLIS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHRRS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 HTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHSGE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB7 RPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
610 620
>>CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (676 aa)
initn: 1918 init1: 1918 opt: 2470 Z-score: 1408.5 bits: 270.9 E(32554): 3.9e-72
Smith-Waterman score: 2470; 57.7% identity (76.8% similar) in 617 aa overlap (11-625:2-613)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLTLTTSLGG-SGAG
:: :.:::::: :: .::.::.:.:.:::::::::: .: .::: :.
CCDS42 MQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 DEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVEHQGTHHGQKLYT
::::: ..: : :::::: : : ::.:.. ::.:: .: .::::..:::::: :::.
CCDS42 DEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHR
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 DGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKPFTCKEVGKDFLV
: ..: . . . ::.:..:.: .::. . .:.. : :.:: . . :::::
CCDS42 CEAWGNKL-YDSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLP
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 RSRFLQQQAAHTRKKSN-RTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVRVQHQGDLIRERS
: .: :.:.:: .::: . . :. .::. :::.: : ::: ::.: ::.
CCDS42 SSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREEC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHRRIHTGVRPHQCD
: : ::::::: :.:.: ::::...:: :::::::. ...::. :.:.::: ::..:
CCDS42 Y-CWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECG
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 ECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHTGMRPYECSECGK
:::: :..: .:. :::::::::::.:.:::::::....:: :::.::: ::::: ::::
CCDS42 ECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHTGERPYECEECGK
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pF1KB7 SFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTY
: ....:: ::: ::. ::: : :::: :::. : .:.:.: : ::::.:::: :.
CCDS42 CFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERPYECGECGKSFSR
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pF1KB7 RSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECSECGKSFTCKSYL
.... .::: ::: : .:: :::: :::: .:: :.: ::::::::: :: : : ::.:
CCDS42 KGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECRECRKLFRGKSHL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 ISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGKFFSQSSSLIRHR
: : .:::: :::::.:::::: :: . ::::::::.:.::.:::: : :: ::.:::
CCDS42 IEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHR
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 RSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQSSNLTNHQRIHS
: :::::::::.:: ::: . :::..:...::.:::::: :::: :: .: .:.:.:.
CCDS42 RVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFFS---SLLEHRRVHT
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KB7 GERPYECSDCGKFFTFNSNLLKHQNVHKG
::::::: .::: :: : .::: .:
CCDS42 GERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSLTEHRRVHTGERP
590 600 610 620 630 640
>>CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 (697 aa)
initn: 1918 init1: 1918 opt: 2470 Z-score: 1408.4 bits: 270.9 E(32554): 4e-72
Smith-Waterman score: 2470; 57.7% identity (76.8% similar) in 617 aa overlap (11-625:23-634)
10 20 30 40
pF1KB7 MAAAELTAPAQGIVTFEDVAVYFSWKEWGLLDEAQKCLYHDVMLENLT
:: :.:::::: :: .::.::.:.:.:::::::::: .
CCDS82 MQEGLHRMTWDCIAIGSHENSVQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQRCLYHDVMLENWV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 LTTSLGG-SGAGDEEAPYQQSTSPQRVSQVRIPKALPSPQKTNPCEICGPVLRQILHLVE
: .::: :. ::::: ..: : :::::: : : ::.:.. ::.:: .: .::::..
CCDS82 LISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEMCGAILGDILHLAD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 HQGTHHGQKLYTDGACRKQLQFTAYLHQHQKQHVGQKHFRSNGGRDMFLSSCTFEVSGKP
:::::: :::. : ..: . . . ::.:..:.: .::. . .:.. : :.:: .
CCDS82 HQGTHHKQKLHRCEAWGNKL-YDSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALFVKRCKFHVSEES
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FTCKEVGKDFLVRSRFLQQQAAHTRKKSN-RTKSAVAFHSVKNHYNWGECVKAFSYKHVR
. ::::: : .: :.:.:: .::: . . :. .::. :::.: : :::
CCDS82 SIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCGECMKHSSTKHVF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 VQHQGDLIRERSYMCSECGKSFSTSCSLSDHLRVHTSEKPYTCGECGKSYRQSSSLITHR
::.: ::. : : ::::::: :.:.: ::::...:: :::::::. ...::. :.
CCDS82 VQQQRLPSREECY-CWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 RIHTGVRPHQCDECGKLFNRKYDLLIHQRVHTGERPYKCSECGKSFSHSSSLITHQRIHT
:.::: ::..: :::: :..: .:. :::::::::::.:.:::::::....:: :::.::
CCDS82 RVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 GMRPYECSECGKSFIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGP
: ::::: :::: : ....:: ::: ::. ::: : :::: :::. : .:.:.: : :
CCDS82 GERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERP
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 YECSECGKLFTYRSRFFQHQRVHTGVRSHECHECGKLFSRKFDLIVHERVHTGERPYECS
:::.:::: :. .... .::: ::: : .:: :::: :::: .:: :.: :::::::::
CCDS82 YECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 ECGKSFTCKSYLISHWKVHTGARPYECGECGKSFTHSSTLLQHQRVHTGERPYECNECGK
:: : : ::.:: : .:::: :::::.:::::: :: . ::::::::.:.::.::::
CCDS82 ECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGK
480 490 500 510 520 530
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pF1KB7 FFSQSSSLIRHRRSHTGERPYECSECWKSFSNHSSLVKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQ
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CCDS12 SFSRKSNLIRHRRVHTEERP
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CCDS12 VHTGERPYECSECGRAFNNNSNLAQHQKVHTGERPFECSECGRDFSQSSHLLRHQKVHTG
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CCDS74 DEEAPCKQRISVQRESQSRTPRAGVSPKKAHPCEMCGLILEDVFHFADHQETHHKQKLNR
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CCDS74 SGACGKNLDDTAYLHQHQKQHIGEKFYRKSVREASFVKKRKLRVSQEPFVFREFGKDVLP
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CCDS74 SSG-LCQEAAAVEKTDSETMHGPPFQEGKTNYSCGKRTKAFSTKHSVIPHQKLFTRDGCY
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CCDS74 VCSDCGKSFSRYVSFSNHQRDHTAKGPYDCGECGKSYSRKSSLIQHQRVHTGKTAYPCEE
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CCDS74 CGKSFSQKGSLISHQRVHTGERPYECREYGKSFGQKGNLIQHQQGHTGERAYHCGECGKS
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pF1KB7 FIHSSSLITHQRVHTGTRPYMCSECGKSFSQSCHLIKHRRLHIGEGPYECSECGKLFTYR
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CCDS74 FRQKFCFINHQRVHTGERPYKCGECGKSFGQKGNLVQHQRGHTGERPYECKECGKSFRYR
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CCDS74 SHLTEHQRLHTGERPYNCRECGKLFNRKYHLLVHERVHTGERPYACEVCGKLFGNKNCVT
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CCDS74 IHQRIHTGERPYECNECGKSFLSSSALHVHKRVHSGQKPYKCSECGKSFAECSSLIKHRR
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CCDS74 IHTGERPYECTKCGKTFQRSSTLLHHQSSHRRKAL
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CCDS12 MLGFPPGRPQLPVQLRPQTRMATA-LRDPASGSVTFEDVAVYFSWEEWDLLDEAQKHLYF
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CCDS12 RDILHLAEHQGTNCGQKLHT---CGKQFYISANLQQHQRQHITEAPFRSYVDTASFTQSC
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CCDS12 IVHVSEKPFTCREIRKDFLANMRFLHQDATQTGEKPNNSNKCAVAFYSGKSHHNWGKCSK
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CCDS12 AFSHIDTLVQDQRILTREGLFECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]