Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1063
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1063, 525 aa
1>>>pF1KA1063 525 - 525 aa - 525 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4708+/-0.000896; mu= 17.6408+/- 0.054
mean_var=72.5788+/-14.428, 0's: 0 Z-trim(106.7): 101 B-trim: 40 in 1/49
Lambda= 0.150546
statistics sampled from 8999 (9110) to 8999 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 3.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42285.1 USP22 gene_id:23326|Hs108|chr17 ( 525) 3694 811.8 0
CCDS65260.1 USP27X gene_id:389856|Hs108|chrX ( 438) 2348 519.4 3.3e-147
CCDS14370.1 USP51 gene_id:158880|Hs108|chrX ( 711) 1944 431.8 1.3e-120
CCDS69111.1 USP49 gene_id:25862|Hs108|chr6 ( 688) 400 96.4 1.1e-19
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 605) 393 94.9 2.9e-19
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 362) 378 91.5 1.8e-18
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 ( 396) 372 90.2 4.8e-18
CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 361 87.9 2.9e-17
CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 361 87.9 3.1e-17
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 358 87.4 8.5e-17
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 358 87.4 9.3e-17
CCDS78300.1 USP17L8 gene_id:392188|Hs108|chr8 ( 530) 353 86.1 1.1e-16
CCDS32755.1 USP36 gene_id:57602|Hs108|chr17 (1123) 355 86.8 1.5e-16
CCDS47535.1 USP42 gene_id:84132|Hs108|chr7 (1316) 348 85.3 4.8e-16
CCDS4861.1 USP49 gene_id:25862|Hs108|chr6 ( 640) 335 82.3 1.9e-15
CCDS78298.1 USP17L1 gene_id:401447|Hs108|chr8 ( 530) 329 80.9 3.9e-15
CCDS78299.1 USP17L4 gene_id:645402|Hs108|chr8 ( 530) 326 80.3 6.2e-15
CCDS78301.1 USP17L3 gene_id:645836|Hs108|chr8 ( 530) 324 79.8 8.4e-15
CCDS9053.1 USP44 gene_id:84101|Hs108|chr12 ( 712) 315 78.0 4.1e-14
CCDS43892.1 USP20 gene_id:10868|Hs108|chr9 ( 914) 313 77.6 6.9e-14
CCDS10607.1 USP31 gene_id:57478|Hs108|chr16 (1352) 285 71.6 6.4e-12
>>CCDS42285.1 USP22 gene_id:23326|Hs108|chr17 (525 aa)
initn: 3694 init1: 3694 opt: 3694 Z-score: 4335.0 bits: 811.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3694; 100.0% identity (100.0% similar) in 525 aa overlap (1-525:1-525)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MVSRPEPEGEAMDAELAVAPPGCSHLGSFKVDNWKQNLRAIYQCFVWSGTAEARKRKAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MVSRPEPEGEAMDAELAVAPPGCSHLGSFKVDNWKQNLRAIYQCFVWSGTAEARKRKAKS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 CICHVCGVHLNRLHSCLYCVFFGCFTKKHIHEHAKAKRHNLAIDLMYGGIYCFLCQDYIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CICHVCGVHLNRLHSCLYCVFFGCFTKKHIHEHAKAKRHNLAIDLMYGGIYCFLCQDYIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DKDMEIIAKEEQRKAWKMQGVGEKFSTWEPTKRELELLKHNPKRRKITSNCTIGLRGLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DKDMEIIAKEEQRKAWKMQGVGEKFSTWEPTKRELELLKHNPKRRKITSNCTIGLRGLIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LGNTCFMNCIVQALTHTPLLRDFFLSDRHRCEMQSPSSCLVCEMSSLFQEFYSGHRSPHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LGNTCFMNCIVQALTHTPLLRDFFLSDRHRCEMQSPSSCLVCEMSSLFQEFYSGHRSPHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 PYKLLHLVWTHARHLAGYEQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGDDNGKKANNPNHCNCIIDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PYKLLHLVWTHARHLAGYEQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGDDNGKKANNPNHCNCIIDQI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 FTGGLQSDVTCQVCHGVSTTIDPFWDISLDLPGSSTPFWPLSPGSEGNVVNGESHVSGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FTGGLQSDVTCQVCHGVSTTIDPFWDISLDLPGSSTPFWPLSPGSEGNVVNGESHVSGTT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 TLTDCLRRFTRPEHLGSSAKIKCSGCHSYQESTKQLTMKKLPIVACFHLKRFEHSAKLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TLTDCLRRFTRPEHLGSSAKIKCSGCHSYQESTKQLTMKKLPIVACFHLKRFEHSAKLRR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 KITTYVSFPLELDMTPFMASSKESRMNGQYQQPTDSLNNDNKYSLFAVVNHQGTLESGHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KITTYVSFPLELDMTPFMASSKESRMNGQYQQPTDSLNNDNKYSLFAVVNHQGTLESGHY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KA1 TSFIRQHKDQWFKCDDAIITKASIKDVLDSEGYLLFYHKQFLEYE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TSFIRQHKDQWFKCDDAIITKASIKDVLDSEGYLLFYHKQFLEYE
490 500 510 520
>>CCDS65260.1 USP27X gene_id:389856|Hs108|chrX (438 aa)
initn: 2444 init1: 1296 opt: 2348 Z-score: 2756.3 bits: 519.4 E(32554): 3.3e-147
Smith-Waterman score: 2433; 82.4% identity (90.2% similar) in 427 aa overlap (114-525:1-426)
90 100 110 120 130
pF1KA1 CFTKKHIHEHAKAKRHNLAIDLMYGGIYCFLCQDYIYDKDMEIIAKEEQRKAWKMQ----
.:.::.::::.: :::::: .: :.:
CCDS65 MCKDYVYDKDIEQIAKEEQGEALKLQASTS
10 20 30
140 150 160 170 180
pF1KA1 -----------GVGEKFSTWEPTKRELELLKHNPKRRKITSNCTIGLRGLINLGNTCFMN
:.:::: ::: :: ::::: :::.::.:::. :::::::::::::::::
CCDS65 TEVSHQQCSVPGLGEKFPTWETTKPELELLGHNPRRRRITSSFTIGLRGLINLGNTCFMN
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 CIVQALTHTPLLRDFFLSDRHRCEMQSPSSCLVCEMSSLFQEFYSGHRSPHIPYKLLHLV
::::::::::.:::::::::::::: :: ::::::::::.:.:::. :::.::::::::
CCDS65 CIVQALTHTPILRDFFLSDRHRCEMPSPELCLVCEMSSLFRELYSGNPSPHVPYKLLHLV
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 WTHARHLAGYEQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGDDNGKKANNPNHCNCIIDQIFTGGLQSD
: ::::::::.::::::::::::::::::::::: :: ::::::::::::::::::::::
CCDS65 WIHARHLAGYRQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGDDVGKAANNPNHCNCIIDQIFTGGLQSD
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 VTCQVCHGVSTTIDPFWDISLDLPGSSTPFWPLSPGSEGNVVNGESHVSGTTTLTDCLRR
::::.:::::::::: :::::::::: : :::.::: :..: :::::. : :::::::::
CCDS65 VTCQACHGVSTTIDPCWDISLDLPGSCTSFWPMSPGRESSV-NGESHIPGITTLTDCLRR
220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 FTRPEHLGSSAKIKCSGCHSYQESTKQLTMKKLPIVACFHLKRFEHSAKLRRKITTYVSF
:::::::::::::::..:.:::::::::::.:::.:::::.:::::::: :::::::.::
CCDS65 FTRPEHLGSSAKIKCGSCQSYQESTKQLTMNKLPVVACFHFKRFEHSAKQRRKITTYISF
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 PLELDMTPFMASSKESRMNGQYQQPTDSLNNDNKYSLFAVVNHQGTLESGHYTSFIRQHK
::::::::::::::::::::: : ::.: ::.:::::::::::::::::::::::::.::
CCDS65 PLELDMTPFMASSKESRMNGQLQLPTNSGNNENKYSLFAVVNHQGTLESGHYTSFIRHHK
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520
pF1KA1 DQWFKCDDAIITKASIKDVLDSEGYLLFYHKQFLEYE
:::::::::.:::::::::::::::::::::: ::.:
CCDS65 DQWFKCDDAVITKASIKDVLDSEGYLLFYHKQVLEHESEKVKEMNTQAY
390 400 410 420 430
>>CCDS14370.1 USP51 gene_id:158880|Hs108|chrX (711 aa)
initn: 2548 init1: 1527 opt: 1944 Z-score: 2278.9 bits: 431.8 E(32554): 1.3e-120
Smith-Waterman score: 2548; 69.7% identity (85.4% similar) in 528 aa overlap (12-523:184-709)
10 20 30 40
pF1KA1 MVSRPEPEGEAMDAELAVAPPGCSHLGSFKVD-NWKQNLRA
...:.. .: ::::. :::: ::..:::
CCDS14 SRPGSRPQTRRSCSGDLDGSGDPGGLGDWLLEVEFGQGPTGCSHVESFKVGKNWQKNLRL
160 170 180 190 200 210
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 IYQCFVWSGTAEARKRKAKSCICHVCGVHLNRLHSCLYCVFFGCFTKKHIHEHAKAKRHN
::: :::::: :.:::::::::::::..:.::::::: ::::::::.::::.::..:.:.
CCDS14 IYQRFVWSGTPETRKRKAKSCICHVCSTHMNRLHSCLSCVFFGCFTEKHIHKHAETKQHH
220 230 240 250 260 270
110 120 130 140
pF1KA1 LAIDLMYGGIYCFLCQDYIYDKDMEIIAKEEQRKAWKM---------------QGVGEKF
::.::..: ::::.:.::.::::.: :::: ..: .. .: .:
CCDS14 LAVDLYHGVIYCFMCKDYVYDKDIEQIAKETKEKILRLLTSTSTDVSHQQFMTSGFEDKQ
280 290 300 310 320 330
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 STWEPTKRELELLKHNPKRRKITSNCTIGLRGLINLGNTCFMNCIVQALTHTPLLRDFFL
:: : ..: .:.: . :::: : :.::::::::::::::::::::::: :::.::::
CCDS14 STCETKEQEPKLVKPKKKRRK-KSVYTVGLRGLINLGNTCFMNCIVQALTHIPLLKDFFL
340 350 360 370 380 390
210 220 230 240 250 260
pF1KA1 SDRHRCEMQSPSSCLVCEMSSLFQEFYSGHRSPHIPYKLLHLVWTHARHLAGYEQQDAHE
::.:.: : ::: ::::::::::. .::: :.::::::::::.: ::.:::::.::::::
CCDS14 SDKHKCIMTSPSLCLVCEMSSLFHAMYSGSRTPHIPYKLLHLIWIHAEHLAGYRQQDAHE
400 410 420 430 440 450
270 280 290 300 310 320
pF1KA1 FLIAALDVLHRHCKGDDNGKKANNPNHCNCIIDQIFTGGLQSDVTCQVCHGVSTTIDPFW
:::: ::::::: : :..:..::::: ::::::::::::::::::::.::.::::::: :
CCDS14 FLIAILDVLHRHSKDDSGGQEANNPNCCNCIIDQIFTGGLQSDVTCQACHSVSTTIDPCW
460 470 480 490 500 510
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 DISLDLPGSSTPFWPLSPGSEGNVVNGESHVSGTTTLTDCLRRFTRPEHLGSSAKIKCSG
::::::::: . : .: ..:. ..:. : .:::::. :::::::::::::::..
CCDS14 DISLDLPGSCATFDSQNPERADSTVSRDDHIPGIPSLTDCLQWFTRPEHLGSSAKIKCNS
520 530 540 550 560 570
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 CHSYQESTKQLTMKKLPIVACFHLKRFEHSAKLRRKITTYVSFPLELDMTPFMASSKESR
:.::::::::::::::::::::::::::: .: ::::.:..:::::::::::.::.::::
CCDS14 CQSYQESTKQLTMKKLPIVACFHLKRFEHVGKQRRKINTFISFPLELDMTPFLASTKESR
580 590 600 610 620 630
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 MNGQYQQPTDSLNNDNKYSLFAVVNHQGTLESGHYTSFIRQHKDQWFKCDDAIITKASIK
:. . : ::: . :.::::::::.::.::::::::::::::.:::::.:::::::::.:.
CCDS14 MK-EGQPPTDCVPNENKYSLFAVINHHGTLESGHYTSFIRQQKDQWFSCDDAIITKATIE
640 650 660 670 680 690
510 520
pF1KA1 DVLDSEGYLLFYHKQFLEYE
:.: ::::::::::: ::
CCDS14 DLLYSEGYLLFYHKQGLEKD
700 710
>>CCDS69111.1 USP49 gene_id:25862|Hs108|chr6 (688 aa)
initn: 487 init1: 147 opt: 400 Z-score: 466.8 bits: 96.4 E(32554): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 441; 27.9% identity (51.1% similar) in 456 aa overlap (150-523:230-660)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 YDKDMEIIAKEEQRKAWKMQGVGEKFSTWEPTKRELELLKHNPKRRKITSNCTIGLRGLI
::.:.. . .:. . :. ::
CCDS69 LASTPPRKSARLLLHTPRDAGPAASRPAALPTSRRVPAATLKLRRQPAMAP---GVTGLR
200 210 220 230 240 250
180 190 200
pF1KA1 NLGNTCFMNCIVQALTHTPLLRDFFLS---------------------------------
::::::.:: :.:.:.: .:. ::.
CCDS69 NLGNTCYMNSILQVLSHLQKFRECFLNLDPSKTEHLFPKATNGKTQLSGKPTNSSATELS
260 270 280 290 300 310
210 220 230
pF1KA1 ---DRHR-CEMQS--------------------PSSCLV--C-EMSSLFQEFYSGHRSPH
:: . :: .. ::: . : :. .::. ..::. .
CCDS69 LRNDRAEACEREGFCWNGRASISRSLELIQNKEPSSKHISLCRELHTLFRVMWSGKWALV
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 IPYKLLHLVWTHARHLAGYEQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGDDNGKKANNP-------NH
:. .:: ::. . ::.::::.::: : .... ... . .. : ..
CCDS69 SPFAMLHSVWSLIPAFRGYDQQDAQEFLCELLHKVQQELESEGTTRRILIPFSQRKLTKQ
380 390 400 410 420 430
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 CNCIIDQIFTGGLQSDVTCQVCHGVSTTIDPFWDISLDLPGSSTPFWPLSPGSEGNVVNG
... :: : : :.::: :. :.::.::::.::..: . .: : .
CCDS69 VLKVVNTIFHGQLLSQVTCISCNYKSNTIEPFWDLSLEFPERYHCI------EKGFVPLN
440 450 460 470 480 490
360 370 380 390 400
pF1KA1 ESHVSGTTTLTDCLRRFTRPEHLGSSAKIKCSGCHSYQ-----------ESTKQLTMKKL
... ::. : .::. : : . :. :.: . :. ::: . .:
CCDS69 QTE----CLLTEMLAKFTETEALEGRI-YACDQCNSKRRKSNPKPLVLSEARKQLMIYRL
500 510 520 530 540
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 PIVACFHLKRFEHSAK-LRRKITTYVSFPLELDMTPFMASSKESRMNGQYQQPTDSLNND
: : .:::::. :.. :.:: ..: : : : :. . : ::...
CCDS69 PQVLRLHLKRFRWSGRNHREKIGVHVVFDQVLTMEPYCCRDMLS-----------SLDKE
550 560 570 580 590
470 480 490 500 510
pF1KA1 N-KYSLFAVVNHQGT-LESGHYTSFIRQHKDQ-WFKCDDAIITKASIKDVLDSEGYLLFY
. :.: ::: :.: . :::::.. . . : .:.:. .. :...: ...:.:::
CCDS69 TFAYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNTEGGFWVHCNDSKLNVCSVEEVCKTQAYILFY
600 610 620 630 640 650
520
pF1KA1 HKQFLEYE
.. ..
CCDS69 TQRTVQGNARISETHLQAQVQSSNNDEGRPQTFS
660 670 680
>>CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (605 aa)
initn: 609 init1: 185 opt: 393 Z-score: 459.4 bits: 94.9 E(32554): 2.9e-19
Smith-Waterman score: 579; 30.7% identity (55.6% similar) in 401 aa overlap (144-517:233-596)
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LCQDYIYDKDMEIIAKEEQRKAWKMQGVGEKFSTWEPTKRELE--LLKHNPKRRKITSNC
... :: : . . .: : ..:.
CCDS84 GRKGSASQVPSQAPPSRVPEIISPTYRPIGRYTLWETGKGQAPGPSRSSSPGRDGMNSKS
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220
pF1KA1 TIGLRGLINLGNTCFMNCIVQALTHTPLLRDFFLSDRHRCEMQSPS---SCLVCEMSSLF
. :: :: ::::::::: :.: :..: :::. :. . ... : . :: :...:.
CCDS84 AQGLAGLRNLGNTCFMNSILQCLSNTRELRDYCLQRLYMRDLHHGSNAHTALVEEFAKLI
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270
pF1KA1 QEFYSGHRSPHI-PYKLLHLVWTHARHLAGYEQQDAHEFLIAALDVLHR-----------
: .... . . : .. . .: ...::.::::.::: :: ::
CCDS84 QTIWTSSPNDVVSPSEFKTQIQRYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTLRPKS
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320
pF1KA1 ------HCKGDDNGKKANNP--NHCNCIIDQIFTGGLQSDVTCQVCHGVSTTIDPFWDIS
: :..:.. .. . : ..:.: :.:..:: : ::..:::::.:
CCDS84 NPENLDHLPDDEKGRQMWRKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDPFWDLS
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360 370 380
pF1KA1 LDLPGSSTPFWPLSPGSEGNVVNGESHVSGTTTLTDCLRRFTRPEHLGSSAKIKCSGCHS
: . . : .:: ::.: ::. . : .. : : :..
CCDS84 LPIAKRGYP---------------------EVTLMDCMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRG
450 460 470 480
390 400 410 420 430 440
pF1KA1 YQESTKQLTMKKLPIVACFHLKRFEHSAKLRRKITTYVSFPL-ELDMTPFMASSKESRMN
.. :.......: . .::::: .: :.::.:.::: .::. : . .
CCDS84 RKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPLRDLDLREFASEN------
490 500 510 520 530
450 460 470 480 490 500
pF1KA1 GQYQQPTDSLNNDNKYSLFAVVNHQGTLESGHYTSFIRQH-KDQWFKCDDAIITKASIKD
.: :.:.:: ::.:: .::::.. :. .: .:. .: : ..
CCDS84 ----------TNHAVYNLYAVSNHSGTTMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQ
540 550 560 570 580
510 520
pF1KA1 VLDSEGYLLFYHKQFLEYE
: :..:::::
CCDS84 VRTSDAYLLFYELASPPSRM
590 600
>>CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11 (362 aa)
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Smith-Waterman score: 564; 31.1% identity (56.5% similar) in 379 aa overlap (164-517:12-353)
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10 20 30 40
200 210 220 230 240
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:..: :::. :. . ... : . :: :...:.: .... . . : .. .
CCDS58 LSNTRELRDYCLQRLYMRDLHHGSNAHTALVEEFAKLIQTIWTSSPNDVVSPSEFKTQIQ
50 60 70 80 90 100
250 260 270 280 290
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.: ...::.::::.::: :: :: : :..:..
CCDS58 RYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTLRPKSNPENLDHLPDDEKGRQMWRKYL
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.. . : ..:.: :.:..:: : ::..:::::.:: . . :
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.:: ::.: ::. . : .. : : :.. .. :.......: . .:::
CCDS58 --------EVTLMDCMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKILVLHLK
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::.:: .::::.. :. .: .:. .: : ..: :..:::::
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.:: ::.: ::. . : .. : : :.. .. :.......: . .::::: .:
CCDS84 ---EVTLMDCMRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSES
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:.::.:.::: .::. : . . .: :.:.:: ::.::
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.::::.. :. .: .:. .: : ..: :..:::::
CCDS84 TMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMSSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
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CCDS58 EH----LQNLENSAFTADRHKKRKLLENSTLNSKLLKVNGSTTAICATGLRNLGNTCFMN
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:.:.:.. : ::. . :. . .: .. :: :. . . ...
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: .. : .:...:: .. ::.:::::::. :: :: . .: :: ..:
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. :.: :: . :: : ::..:.: .: : .::: :.:::.: .
CCDS58 NSTLSASNKC-CINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIP---SQ
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: : :. : :: . .: :::: :: :.: . : :.. :.:::..
CCDS58 FR--SKRSK-NQENGP-----VCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQKSTKKFW
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..::: : :.:::::. .: :: :. ::: :::. ::: .. .: .:
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.. :.: ::: :.:. . :::::.. :. .::. .:. .: .. . :. ...:.:
CCDS58 GPESCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAYAT-HEGRWFHFNDSTVTLTDEETVVKAKAYIL
410 420 430 440 450 460
520
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::
CCDS58 FYVEHQAKAGSDKL
470
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.::: .. : :... :.. .: . ::. :.:.. : . .. : .
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: .. : .:...:: .. ::.:::::::. :: :: . .: :: ..:
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. :.: :: . :: : ::..:.: .: : .::: :.:::.:..
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. : :: . .: :::: :: :.: . : :.. :.:::..
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::
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510 520
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. :. . : . .. .: :: ::::::.:: :.: : ..: : :.: .:
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. .: ::. . :: : : .: .: . :: .: : ..:
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]