Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7214
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7214, 293 aa
1>>>pF1KB7214 293 - 293 aa - 293 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4815+/-0.000722; mu= 11.7228+/- 0.044
mean_var=112.0789+/-22.354, 0's: 0 Z-trim(114.1): 171 B-trim: 537 in 1/49
Lambda= 0.121147
statistics sampled from 14471 (14644) to 14471 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.45), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46816.1 PRSS42 gene_id:339906|Hs108|chr3 ( 293) 2063 370.5 8.5e-103
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CCDS42110.1 PRSS33 gene_id:260429|Hs108|chr16 ( 280) 577 110.7 1.2e-24
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CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 566 109.1 1.1e-23
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 552 106.4 2.9e-23
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CCDS10431.1 TPSAB1 gene_id:7177|Hs108|chr16 ( 275) 546 105.3 5.3e-23
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8 ( 352) 543 104.9 9.2e-23
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CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 543 104.9 1.1e-22
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 543 104.9 1.1e-22
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12 ( 348) 541 104.5 1.2e-22
CCDS1563.1 PRSS38 gene_id:339501|Hs108|chr1 ( 326) 537 103.8 1.8e-22
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CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 536 103.8 2.9e-22
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs108|chr16 ( 317) 525 101.7 7.5e-22
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 522 101.1 9.3e-22
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 521 101.1 1.8e-21
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 521 101.2 1.9e-21
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 521 101.2 1.9e-21
CCDS32489.1 CTRB2 gene_id:440387|Hs108|chr16 ( 263) 507 98.5 5.7e-21
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs108|chr16 ( 263) 507 98.5 5.7e-21
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 509 99.0 6.9e-21
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 506 98.3 7e-21
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CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 506 98.5 9.6e-21
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 506 98.5 9.6e-21
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 501 97.6 1.8e-20
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 505 98.5 2.1e-20
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 500 97.6 2.9e-20
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 496 96.7 3.1e-20
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CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 492 96.0 5.1e-20
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2 ( 603) 491 95.9 7.6e-20
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 ( 268) 463 90.8 1.2e-18
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 468 92.1 1.9e-18
CCDS10432.1 TPSD1 gene_id:23430|Hs108|chr16 ( 242) 456 89.5 2.6e-18
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 462 91.0 3.6e-18
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 (1042) 462 91.0 3.9e-18
CCDS2145.1 PROC gene_id:5624|Hs108|chr2 ( 461) 449 88.5 1e-17
CCDS30605.1 CELA2B gene_id:51032|Hs108|chr1 ( 269) 444 87.5 1.2e-17
CCDS10478.1 PRSS21 gene_id:10942|Hs108|chr16 ( 314) 445 87.7 1.2e-17
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 439 86.7 3.1e-17
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 ( 423) 439 86.7 3.1e-17
>>CCDS46816.1 PRSS42 gene_id:339906|Hs108|chr3 (293 aa)
initn: 2063 init1: 2063 opt: 2063 Z-score: 1959.0 bits: 370.5 E(32554): 8.5e-103
Smith-Waterman score: 2063; 100.0% identity (100.0% similar) in 293 aa overlap (1-293:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSSGGGSRGLLAWLLLLQPWPGQNWAGMAAPRLPSPLLSEEGGENPEASPAPGPEAGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MSSGGGSRGLLAWLLLLQPWPGQNWAGMAAPRLPSPLLSEEGGENPEASPAPGPEAGPPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NLFTSFPGDSLLCGRTPLRIVGGVDAEEGRWPWQVSVRTKGRHICGGTLVTATWVLTAGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NLFTSFPGDSLLCGRTPLRIVGGVDAEEGRWPWQVSVRTKGRHICGGTLVTATWVLTAGH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CISSRFHYSVKMGDRSVYNENTSVVVSVQRAFVHPKFSTVTTIRNDLALLQLQHPVNFTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CISSRFHYSVKMGDRSVYNENTSVVVSVQRAFVHPKFSTVTTIRNDLALLQLQHPVNFTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NIQPICIPQENFQVEGRTRCWVTGWGKTPEREKLASEILQDVDQYIMCYEECNKIIQKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NIQPICIPQENFQVEGRTRCWVTGWGKTPEREKLASEILQDVDQYIMCYEECNKIIQKAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB7 SSTKDVIIKGMVCGYKEQGKDSCQGDSGGRLACEYNDTWVQVGIVSWGIGCGR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSTKDVIIKGMVCGYKEQGKDSCQGDSGGRLACEYNDTWVQVGIVSWGIGCGR
250 260 270 280 290
>>CCDS45469.1 PRSS8 gene_id:5652|Hs108|chr16 (343 aa)
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Smith-Waterman score: 607; 40.8% identity (66.7% similar) in 228 aa overlap (73-292:37-263)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 GENPEASPAPGPEAGPPLNLFTSFPGDSLLCGRTPL-RIVGGVDAEEGRWPWQVSVRTKG
:: .: ::.:: .: :.::::::. .:
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pF1KB7 RHICGGTLVTATWVLTAGHCISSRFH---YSVKMGDRSVYNENTSVVVSVQRAFV-HPKF
:.:::.::. :::.:.::. :. : : ::.: ... . . .. ::. . .. ::..
CCDS45 VHVCGGSLVSEQWVLSAAHCFPSEHHKEAYEVKLGAHQLDSYSEDAKVSTLKDIIPHPSY
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pF1KB7 STVTTIRNDLALLQLQHPVNFTSNIQPICIPQENFQVEGRTRCWVTGWGKT-PEREKLAS
. ..:.:::::..:..:. :.:::.: : . . .: :::::.. : :.
CCDS45 LQEGS-QGDIALLQLSRPITFSRYIRPICLPAANASFPNGLHCTVTGWGHVAPSVSLLTP
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 EILQDVDQYIMCYEECNKIIQ-KALSSTKDVIIKGMVC-GYKEQGKDSCQGDSGGRLACE
. ::... .. : :: . . : . . ::: :: : :::.::::::: :.:
CCDS45 KPLQQLEVPLISRETCNCLYNIDAKPEEPHFVQEDMVCAGYVEGGKDACQGDSGGPLSCP
190 200 210 220 230 240
280 290
pF1KB7 YNDTWVQVGIVSWGIGCGR
. : .:::::: .::
CCDS45 VEGLWYLTGIVSWGDACGARNRPGVYTLASSYASWIQSKVTELQPRVVPQTQESQPDSNL
250 260 270 280 290 300
>>CCDS47145.1 PRSS48 gene_id:345062|Hs108|chr4 (328 aa)
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Smith-Waterman score: 601; 39.7% identity (65.1% similar) in 252 aa overlap (53-293:2-246)
30 40 50 60 70
pF1KB7 QNWAGMAAPRLPSPLLSEEGGENPEASPAPGPEAGPPLNLFTSFPGDSLLCGRTPL---R
:: :: ..:. . : :. ::. :. :
CCDS47 MGP-AGCAFTLLLLL-GISV-CGQ-PVYSSR
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 IVGGVDAEEGRWPWQVSVRTKGRHICGGTLVTATWVLTAGHCIS---SRFHYSVKMGDRS
.::: :: ::::::::.. ::::.::. .:::.:::. . : :.: .:. .
CCDS47 VVGGQDAAAGRWPWQVSLHFDHNFICGGSLVSERLILTAAHCIQPTWTTFSYTVWLGSIT
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 VYNENTSVVVSVQRAFVHPKFSTVTTIRNDLALLQLQHPVNFTSNIQPICIPQENFQVEG
: . : :.. .:::.. .:. :.:::.:. :.::: : :::.:. . :.
CCDS47 VGDSRKRVKYYVSKIVIHPKYQDTTA---DVALLKLSSQVTFTSAILPICLPSVTKQLAI
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pF1KB7 RTRCWVTGWGKTPER-EKLASEILQDVDQYIMCYEECNKIIQKA---LSSTKDVIIKGMV
::::::::. : .. ::... :. . :... . : . . :: . .
CCDS47 PPFCWVTGWGKVKESSDRDYHSALQEAEVPIIDRQACEQLYNPIGIFLPALEPVIKEDKI
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pF1KB7 C-GYKEQGKDSCQGDSGGRLACEYNDTWVQVGIVSWGIGCGR
: : .. ::::.::::: :.:. . .:.:.:.::::. ::.
CCDS47 CAGDTQNMKDSCKGDSGGPLSCHIDGVWIQTGVVSWGLECGKSLPGVYTNVIYYQKWINA
210 220 230 240 250 260
CCDS47 TISRANNLDFSDFLFPIVLLSLALLRPSCAFGPNTIHRVGTVAEAVACIQGWEENAWRFS
270 280 290 300 310 320
>>CCDS10476.1 PRSS27 gene_id:83886|Hs108|chr16 (290 aa)
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30 40 50 60 70
pF1KB7 AGMAAPRLPSPLLSEEGGENPEASPAPGPEAGPPLNLFTSFPGD----SLLCGRTPL--R
:. :: :. : .. . ::: . :
CCDS10 MRRPAAVPLLLLLCFGSQRAKAATACGRPRMLNR
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 IVGGVDAEEGRWPWQVSVRTKGRHICGGTLVTATWVLTAGHCI---SSRFHYSVKMGDRS
.::: :..::.::::::.. .: :.:::.:.. :::::.::. : :.: .: :.
CCDS10 MVGGQDTQEGEWPWQVSIQRNGSHFCGGSLIAEQWVLTAAHCFRNTSETSLYQVLLGARQ
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pF1KB7 VYNENTSVVVS-VQRAFVHPKFSTVTTIRNDLALLQLQHPVNFTSNIQPICIPQENFQVE
. . . .. . :... .: .. ... :.::..:. :: ::. : :.:.:. . :
CCDS10 LVQPGPHAMYARVRQVESNPLYQGTAS-SADVALVELEAPVPFTNYILPVCLPDPSVIFE
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 GRTRCWVTGWGKTPEREKLASE--ILQDVDQYIMCYEECNKIIQK--ALSSTKDVIIKGM
::::::: .: .: : : ::: . :. .:: . .: .. .: . :
CCDS10 TGMNCWVTGWG-SPSEEDLLPEPRILQKLAVPIIDTPKCNLLYSKDTEFGYQPKTIKNDM
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290
pF1KB7 VC-GYKEQGKDSCQGDSGGRLACEYNDTWVQVGIVSWGIGCGR
.: :..: ::.:.::::: :.: ...:.:.:..::: ::.:
CCDS10 LCAGFEEGKKDACKGDSGGPLVCLVGQSWLQAGVISWGEGCARQNRPGVYIRVTAHHNWI
220 230 240 250 260 270
CCDS10 HRIIPKLQFQPARLGGQK
280 290
>>CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 (638 aa)
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Smith-Waterman score: 596; 38.9% identity (64.9% similar) in 265 aa overlap (38-293:351-604)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 RGLLAWLLLLQPWPGQNWAGMAAPRLPSPLLSEEGGENPEASPAPGPEAGPPLNLFTSFP
:: .:. . : . : .: : : ..
CCDS34 TCTKMIRCQFFTYSLLPEDCKEEKCKCFLRLSMDGSPTRIAYGTQGS-SGYSLRLCNT--
330 340 350 360 370
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GDSLLCG-RTPLRIVGGVDAEEGRWPWQVSVRTK---GRHICGGTLVTATWVLTAGHCIS
::. .: .: :::::... :.::::::...: ::.:::.:. :::::.::..
CCDS34 GDNSVCTTKTSTRIVGGTNSSWGEWPWQVSLQVKLTAQRHLCGGSLIGHQWVLTAAHCFD
380 390 400 410 420 430
130 140 150 160 170
pF1KB7 SRFHYSVKMGDRSVYN----ENTSVVVSVQRAFVHPKFSTVTTIRNDLALLQLQHPVNFT
. .: .. : . . .... ..: ... :. .:.::..:: :.:.:
CCDS34 GLPLQDVWRIYSGILNLSDITKDTPFSQIKEIIIHQNYK-VSEGNHDIALIKLQAPLNYT
440 450 460 470 480 490
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SNIQPICIPQENFQVEGRTRCWVTGWGKTPEREKLASEILQDVDQYIMCYEECNKIIQKA
.:::.:... : ::::::: . :. .. ..::: :. .. ::: ::
CCDS34 EFQKPICLPSKGDTSTIYTNCWVTGWGFSKEKGEI-QNILQKVNIPLVTNEEC----QKR
500 510 520 530 540 550
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LSSTKDVIIKGMVC-GYKEQGKDSCQGDSGGRLACEYNDTWVQVGIVSWGIGCGR
.. : : . ::: :::: :::.:.::::: :.:..: : :::.::: ::.:
CCDS34 YQDYK--ITQRMVCAGYKEGGKDACKGDSGGPLVCKHNGMWRLVGITSWGEGCARREQPG
560 570 580 590 600
CCDS34 VYTKVAEYMDWILEKTQSSDGKAQMQSPA
610 620 630
>>CCDS42110.1 PRSS33 gene_id:260429|Hs108|chr16 (280 aa)
initn: 536 init1: 227 opt: 577 Z-score: 555.7 bits: 110.7 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 577; 38.4% identity (64.2% similar) in 232 aa overlap (70-291:25-255)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 EEGGENPEASPAPGPEAGPPLNLFTSFPGDSLLCG--RTPLRIVGGVDAEEGRWPWQVSV
: :: : ::::: :...:.::::.:.
CCDS42 MRGVSCLQVLLLLVLGAAGTQGRKSAACGQPRMSSRIVGGRDGRDGEWPWQASI
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100 110 120 130 140 150
pF1KB7 RTKGRHICGGTLVTATWVLTAGHCISSRF---HYSVKMGDRSVYNENT-SVVVSVQRAFV
. .: :.:::.:.. :::::.::. : .: :..: . . . .. : :.:...
CCDS42 QHRGAHVCGGSLIAPQWVLTAAHCFPRRALPAEYRVRLGALRLGSTSPRTLSVPVRRVLL
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 HPKFSTVTTIRNDLALLQLQHPVNFTSNIQPICIPQENFQVEGRTRCWVTGWGKTPEREK
: .: :.:::::::..:: ... .::.:.: . . : : :::::.
CCDS42 PPDYSE-DGARGDLALLQLRRPVPLSARVQPVCLPVPGARPPPGTPCRVTGWGSLRPGVP
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260
pF1KB7 LAS-EILQDVDQYIMCYEECNKI--IQKALSSTKDVIIKGMVC-GYKEQGKDSCQGDSGG
: . :: : .. . :. . . . ... ... : .: :: . ::.:::::::
CCDS42 LPEWRPLQGVRVPLLDSRTCDGLYHVGADVPQAERIVLPGSLCAGYPQGHKDACQGDSGG
180 190 200 210 220 230
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:.: . .:: ::.:::: ::
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50 60 70 80 90 100
pF1KB7 GENPEASPAPGPEAGPPLNLFTSFPGDSLLCG-RTPL-RIVGGVDAEEGRWPWQVSVRTK
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CCDS13 CEDRSCVKKPNPQCDGRPDCRDGSDEEHCDCGLQGPSSRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVR
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pF1KB7 GRHICGGTLVTATWVLTAGHC-----ISSRFHYSVKMGDRSVYNENT---SVVVSVQRAF
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CCDS13 GRHICGGALIADRWVITAAHCFQEDSMASTVLWTVFLG--KVWQNSRWPGEVSFKVSRLL
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CCDS13 LHP-YHEEDSHDYDVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGG
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CCDS13 PI-SNALQKVDVQLIPQDLCSEVYRYQVTPR-------MLCAGYRKGKKDACQGDSGGPL
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CCDS10 VGGHAAPAGAWPWQASLRLRRVHVCGGSLLSPQWVLTAAHCFSGSLNSSDYQVHLGELEI
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CCDS10 IRCWVTGWGYTREGEPLPPPYSLREVKVSVVDTETCRRDYPGPGGS---ILQPDMLCA-R
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]