Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0364
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0364, 690 aa
1>>>pF1KE0364 690 - 690 aa - 690 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3822+/-0.000884; mu= 20.0175+/- 0.053
mean_var=77.8126+/-16.031, 0's: 0 Z-trim(107.9): 50 B-trim: 370 in 1/51
Lambda= 0.145395
statistics sampled from 9849 (9892) to 9849 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 3.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12983.1 SLC27A5 gene_id:10998|Hs108|chr19 ( 690) 4726 1001.2 0
CCDS82415.1 SLC27A5 gene_id:10998|Hs108|chr19 ( 606) 3167 674.1 1.6e-193
CCDS10133.1 SLC27A2 gene_id:11001|Hs108|chr15 ( 620) 1819 391.4 2.2e-108
CCDS4145.1 SLC27A6 gene_id:28965|Hs108|chr5 ( 619) 1637 353.2 6.7e-97
CCDS1053.1 SLC27A3 gene_id:11000|Hs108|chr1 ( 730) 1629 351.6 2.4e-96
CCDS32953.1 SLC27A1 gene_id:376497|Hs108|chr19 ( 646) 1306 283.8 5.5e-76
CCDS53943.1 SLC27A2 gene_id:11001|Hs108|chr15 ( 567) 1283 278.9 1.4e-74
CCDS6899.1 SLC27A4 gene_id:10999|Hs108|chr9 ( 643) 1283 278.9 1.6e-74
>>CCDS12983.1 SLC27A5 gene_id:10998|Hs108|chr19 (690 aa)
initn: 4726 init1: 4726 opt: 4726 Z-score: 5354.3 bits: 1001.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4726; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGVRQQLALLLLLLLLLWGLGQPVWPVAVALTLRWLLGDPTCCVLLGLAMLARPWLGPWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGVRQQLALLLLLLLLLWGLGQPVWPVAVALTLRWLLGDPTCCVLLGLAMLARPWLGPWV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PHGLSLAAAALALTLLPARLPPGLRWLPADVIFLAKILHLGLKIRGCLSRQPPDTFVDAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PHGLSLAAAALALTLLPARLPPGLRWLPADVIFLAKILHLGLKIRGCLSRQPPDTFVDAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ERRARAQPGRALLVWTGPGAGSVTFGELDARACQAAWALKAELGDPASLCAGEPTALLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ERRARAQPGRALLVWTGPGAGSVTFGELDARACQAAWALKAELGDPASLCAGEPTALLVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASQAVPALCMWLGLAKLGCPTAWINPHGRGMPLAHSVLSSGARVLVVDPDLRESLEEILP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KLQAENIRCFYLSHTSPTPGVGALGAALDAAPSHPVPADLRAGITWRSPALFIYTSGTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLQAENIRCFYLSHTSPTPGVGALGAALDAAPSHPVPADLRAGITWRSPALFIYTSGTTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LPKPAILTHERVLQMSKMLSLSGATADDVVYTVLPLYHVMGLVVGILGCLDLGATCVLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LPKPAILTHERVLQMSKMLSLSGATADDVVYTVLPLYHVMGLVVGILGCLDLGATCVLAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KFSTSCFWDDCRQHGVTVILYVGELLRYLCNIPQQPEDRTHTVRLAMGNGLRADVWETFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KFSTSCFWDDCRQHGVTVILYVGELLRYLCNIPQQPEDRTHTVRLAMGNGLRADVWETFQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 QRFGPIRIWEVYGSTEGNMGLVNYVGRCGALGKMSCLLRMLSPFELVQFDMEAAEPVRDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QRFGPIRIWEVYGSTEGNMGLVNYVGRCGALGKMSCLLRMLSPFELVQFDMEAAEPVRDN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QGFCIPVGLGEPGLLLTKVVSQQPFVGYRGPRELSERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QGFCIPVGLGEPGLLLTKVVSQQPFVGYRGPRELSERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 REGFLYFRDRLGDTFRWKGENVSTHEVEGVLSQVDFLQQVNVYGVCVPGCEGKVGMAAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 REGFLYFRDRLGDTFRWKGENVSTHEVEGVLSQVDFLQQVNVYGVCVPGCEGKVGMAAVQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LAPGQTFDGEKLYQHVRAWLPAYATPHFIRIQDAMEVTSTFKLMKTRLVREGFNVGIVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LAPGQTFDGEKLYQHVRAWLPAYATPHFIRIQDAMEVTSTFKLMKTRLVREGFNVGIVVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE0 PLFVLDNRAQSFRPLTAEMYQAVCEGTWRL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PLFVLDNRAQSFRPLTAEMYQAVCEGTWRL
670 680 690
>>CCDS82415.1 SLC27A5 gene_id:10998|Hs108|chr19 (606 aa)
initn: 4131 init1: 3141 opt: 3167 Z-score: 3587.7 bits: 674.1 E(32554): 1.6e-193
Smith-Waterman score: 3967; 87.8% identity (87.8% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGVRQQLALLLLLLLLLWGLGQPVWPVAVALTLRWLLGDPTCCVLLGLAMLARPWLGPWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGVRQQLALLLLLLLLLWGLGQPVWPVAVALTLRWLLGDPTCCVLLGLAMLARPWLGPWV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 PHGLSLAAAALALTLLPARLPPGLRWLPADVIFLAKILHLGLKIRGCLSRQPPDTFVDAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PHGLSLAAAALALTLLPARLPPGLRWLPADVIFLAKILHLGLKIRGCLSRQPPDTFVDAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ERRARAQPGRALLVWTGPGAGSVTFGELDARACQAAWALKAELGDPASLCAGEPTALLVL
:::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ERRARAQPGRALLVWTGPGAGSVTF-----------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ASQAVPALCMWLGLAKLGCPTAWINPHGRGMPLAHSVLSSGARVLVVDPDLRESLEEILP
:::::::::::
CCDS82 -------------------------------------------------DLRESLEEILP
150
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KLQAENIRCFYLSHTSPTPGVGALGAALDAAPSHPVPADLRAGITWRSPALFIYTSGTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KLQAENIRCFYLSHTSPTPGVGALGAALDAAPSHPVPADLRAGITWRSPALFIYTSGTTG
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LPKPAILTHERVLQMSKMLSLSGATADDVVYTVLPLYHVMGLVVGILGCLDLGATCVLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LPKPAILTHERVLQMSKMLSLSGATADDVVYTVLPLYHVMGLVVGILGCLDLGATCVLAP
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 KFSTSCFWDDCRQHGVTVILYVGELLRYLCNIPQQPEDRTHTVRLAMGNGLRADVWETFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KFSTSCFWDDCRQHGVTVILYVGELLRYLCNIPQQPEDRTHTVRLAMGNGLRADVWETFQ
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 QRFGPIRIWEVYGSTEGNMGLVNYVGRCGALGKMSCLLRMLSPFELVQFDMEAAEPVRDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QRFGPIRIWEVYGSTEGNMGLVNYVGRCGALGKMSCLLRMLSPFELVQFDMEAAEPVRDN
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 QGFCIPVGLGEPGLLLTKVVSQQPFVGYRGPRELSERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QGFCIPVGLGEPGLLLTKVVSQQPFVGYRGPRELSERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMD
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 REGFLYFRDRLGDTFRWKGENVSTHEVEGVLSQVDFLQQVNVYGVCVPGCEGKVGMAAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 REGFLYFRDRLGDTFRWKGENVSTHEVEGVLSQVDFLQQVNVYGVCVPGCEGKVGMAAVQ
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LAPGQTFDGEKLYQHVRAWLPAYATPHFIRIQDAMEVTSTFKLMKTRLVREGFNVGIVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LAPGQTFDGEKLYQHVRAWLPAYATPHFIRIQDAMEVTSTFKLMKTRLVREGFNVGIVVD
520 530 540 550 560 570
670 680 690
pF1KE0 PLFVLDNRAQSFRPLTAEMYQAVCEGTWRL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PLFVLDNRAQSFRPLTAEMYQAVCEGTWRL
580 590 600
>>CCDS10133.1 SLC27A2 gene_id:11001|Hs108|chr15 (620 aa)
initn: 1775 init1: 1775 opt: 1819 Z-score: 2059.5 bits: 391.4 E(32554): 2.2e-108
Smith-Waterman score: 1893; 45.0% identity (74.2% similar) in 629 aa overlap (64-690:2-620)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 RWLLGDPTCCVLLGLAMLARPWLGPWVPHGLSLAAAALA-LTLLPARLPPGLRWLPADVI
:: ..:: : .:: . .. :.
CCDS10 MLSAIYTVLAGLLFLPLLVNLCCPYFFQDIG
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 FLAKILHLGLKIRGCLSRQPPDTFVDAFERRARAQPGRALLVWTGPGAGSVTFGELDARA
.. :. .: ..:. .:.: :.. :: ..:: : . .:.. ..:....: :.
CCDS10 YFLKVAAVGRRVRSYGKRRPARTILRAFLEKARQTPHKPFLLFRDE---TLTYAQVDRRS
40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 CQAAWALKAELGDPASLCAGEPTALLVLASQAVPALC-MWLGLAKLGCPTAWINPHGRGM
:.: ::. .:: : :. .::: .... :: .::::.:::: : .: . :.
CCDS10 NQVARALHDHLG----LRQGDCVALL-MGNE--PAYVWLWLGLVKLGCAMACLNYNIRAK
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 PLAHSVLSSGARVLVVDPDLRESLEEILPKLQAENIRCFYLSHTSPTPGVGALGAALDAA
: : ::.::.:.:.:. ..:::::.:. ... .:.:.:: : :. .. .: .
CCDS10 SLLHCFQCCGAKVLLVSPELQAAVEEILPSLKKDDVSIYYVSRTSNTDGIDSFLDKVDEV
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 PSHPVPADLRAGITWRSPALFIYTSGTTGLPKPAILTHERVLQMSKMLSLSGATADDVVY
..:.: . :. .:. .:::.::::::::::: :..::.:. . . .:: ::::.:
CCDS10 STEPIPESWRSEVTFSTPALYIYTSGTTGLPKAAMITHQRIWYGTGLTFVSGLKADDVIY
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 TVLPLYHVMGLVVGILGCLDLGATCVLAPKFSTSCFWDDCRQHGVTVILYVGELLRYLCN
.::.:: .:..:: ::. ::: .: :::.: ::::::...:::: :.:::::::::
CCDS10 ITLPFYHSAALLIGIHGCIVAGATLALRTKFSASQFWDDCRKYNVTVIQYIGELLRYLCN
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 IPQQPEDRTHTVRLAMGNGLRADVWETFQQRFGPIRIWEVYGSTEGNMGLVNYVGRCGAL
::.:.:: : ::::.:::::.:::. : .::: : :.: :..::::.:..::. . ::.
CCDS10 SPQKPNDRDHKVRLALGNGLRGDVWRQFVKRFGDICIYEFYAATEGNIGFMNYARKVGAV
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 GKMSCLLRMLSPFELVQFDMEAAEPVRDNQGFCIPVGLGEPGLLLTKVVSQQPFVGYRGP
:... : . . ..:...:.: :::::..:.:. : :: :::. :... :: :: :
CCDS10 GRVNYLQKKIITYDLIKYDVEKDEPVRDENGYCVRVPKGEVGLLVCKITQLTPFNGYAGA
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 RELSERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMDREGFLYFRDRLGDTFRWKGENVSTHEVEGVL
. .:.: .:.: ..::.:.:.::.: .:.:.:.::.::.:::::::::::.: :: ..
CCDS10 KAQTEKKKLRDVFKKGDLYFNSGDLLMVDHENFIYFHDRVGDTFRWKGENVATTEVADTV
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 SQVDFLQQVNVYGVCVPGCEGKVGMAAVQLAPGQTFDGEKLYQHVRAWLPAYATPHFIRI
. :::.:.:::::: :: ::..:::.... .. :::.::.::. .::.:: :.:.::
CCDS10 GLVDFVQEVNVYGVHVPDHEGRIGMASIKMKENHEFDGKKLFQHIADYLPSYARPRFLRI
510 520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 QDAMEVTSTFKLMKTRLVREGFNVGIVVDPLFVLDNRAQSFRPLTAEMYQAVCEGTWRL
::..:.:.::: : ::.:::: ... : :. ::. :. . :.: ..:.:. : .:
CCDS10 QDTIEITGTFKHRKMTLVEEGFNPAVIKDALYFLDDTAKMYVPMTEDIYNAISAKTLKL
570 580 590 600 610 620
>>CCDS4145.1 SLC27A6 gene_id:28965|Hs108|chr5 (619 aa)
initn: 1577 init1: 1451 opt: 1637 Z-score: 1853.1 bits: 353.2 E(32554): 6.7e-97
Smith-Waterman score: 1695; 42.6% identity (72.6% similar) in 625 aa overlap (66-690:9-619)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 LLGDPTCCVLLGLAMLARPWLGPWVPHGLSLAAAALALTLLPARLPPGLRWLPADVIFLA
:.:. ..: .: : : . : : :.
CCDS41 MLLSWLTVLGAGMVVLHFLQKLLFPYF-W--DDFWFVL
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 KILHLGLKIRGCLSRQPPDTFVDAFERRARAQPGRALLVWTGPGAGSVTFGELDARACQA
:.. . .... .: : .: : .:. :: . .... : :. ..: :. ..
CCDS41 KVVLIIIRLKKYEKRGELVTVLDKFLSHAKRQPRKPFIIYEGD---IYTYQDVDKRSSRV
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AWALKAELGDPASLCAGEPTALLVLASQAVPALCMWLGLAKLGCPTAWINPHGRGMPLAH
: .. . .:: :. .:::. :. . .:.::::::: .:..: . :. : .
CCDS41 AHVFL----NHSSLKKGDTVALLM--SNEPDFVHVWFGLAKLGCVVAFLNTNIRSNSLLN
100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SVLSSGARVLVVDPDLRESLEEILPKLQAENIRCFYLSHTSPTPGVGALGAALDAAPSHP
. . : :.::: :: ..:::::.: .::: . .. . : :: .: :...:..:
CCDS41 CIRACGPRALVVGADLLGTVEEILPSL-SENISVWGMKDSVPQ-GVISLKEKLSTSPDEP
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 VPADLRAGITWRSPALFIYTSGTTGLPKPAILTHERVLQMSKMLSLSGATADDVVYTVLP
:: . .. .: :.:.::::::::: :.... .::. : .: : :: :.:: .::
CCDS41 VPRSHHVVSLLKSTCLYIFTSGTTGLPKAAVISQLQVLRGSAVLWAFGCTAHDIVYITLP
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 LYHVMGLVVGILGCLDLGATCVLAPKFSTSCFWDDCRQHGVTVILYVGELLRYLCNIPQQ
::: . ..:: ::..::::::: :::.: ::.::... :::. :.::: ::::. ..
CCDS41 LYHSSAAILGISGCVELGATCVLKKKFSASQFWSDCKKYDVTVFQYIGELCRYLCKQSKR
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 PEDRTHTVRLAMGNGLRADVWETFQQRFGPIRIWEVYGSTEGNMGLVNYVGRCGALGKMS
.. : ::::.:::.:.:::. : .::: :.. :.:..::......::.:: ::.:. .
CCDS41 EGEKDHKVRLAIGNGIRSDVWREFLDRFGNIKVCELYAATESSISFMNYTGRIGAIGRTN
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 CLLRMLSPFELVQFDMEAAEPVRDNQGFCIPVGLGEPGLLLTKVVSQQPFVGYRGPRELS
. ..:: :.:...:.. ::.:..::.:: : ::::::...: ...:: :: :: . .
CCDS41 LFYKLLSTFDLIKYDFQKDEPMRNEQGWCIHVKKGEPGLLISRVNAKNPFFGYAGPYKHT
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 ERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMDREGFLYFRDRLGDTFRWKGENVSTHEVEGVLSQVD
. ::. .: ..:::: ::::....:...:::: :: :::::::::::.: :: :....:
CCDS41 KDKLLCDVFKKGDVYLNTGDLIVQDQDNFLYFWDRTGDTFRWKGENVATTEVADVIGMLD
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 FLQQVNVYGVCVPGCEGKVGMAAVQLAPGQTFDGEKLYQHVRAWLPAYATPHFIRIQDAM
:.:..::::: . : ::..:::.. : :. ..: ::.:..: ..::::: :.:.:::. :
CCDS41 FIQEANVYGVAISGYEGRAGMASIILKPNTSLDLEKVYEQVVTFLPAYACPRFLRIQEKM
510 520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KE0 EVTSTFKLMKTRLVREGFNVGIVVDPLFVLDNRAQSFRPLTAEMYQAVCEGTWRL
:.:.::::.: .::..::: . .::. .:: .:. :: :.:. . : .:
CCDS41 EATGTFKLLKHQLVEDGFNPLKISEPLYFMDNLKKSYVLLTRELYDQIMLGEIKL
570 580 590 600 610
>>CCDS1053.1 SLC27A3 gene_id:11000|Hs108|chr1 (730 aa)
initn: 1762 init1: 1585 opt: 1629 Z-score: 1843.1 bits: 351.6 E(32554): 2.4e-96
Smith-Waterman score: 1667; 42.9% identity (65.3% similar) in 704 aa overlap (47-690:28-730)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 LWGLGQPVWPVAVALTLRWLLGDPTCCVLLGLAMLARPWLGPWVP--HGLSLAAAALA--
: .:.: : . :: .. :.:: :
CCDS10 MGVCQRTRAPWKEKSQLERAALGFRKGGSGMFASGW-NQTVPIEEAGSMAALLLLPL
10 20 30 40 50
80 90 100
pF1KE0 LTLLPA-----RLPPGLRWLPADVIFLAKIL--HLGLKIR--------------GC----
: ::: .: : :::::::. : .. : . .:. : ::
CCDS10 LLLLPLLLLKLHLWPQLRWLPADLAFAVRALCCKRALRARALAAAAADPEGPEGGCSLAW
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KE0 ----LSRQ-PPDTFVDAFERR-----ARAQPGRAL------LVWT-GP-----GAGSVTF
:..: ::. :: :. . .:: : : :: : ::.
CCDS10 RLAELAQQRAAHTFLIHGSRRFSYSEAERESNRAARAFLRALGWDWGPDGGDSGEGSAGE
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
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CCDS10 GERAAPGAGDAAAGSGAEFAGGDGAARGGGAAAPLSPGATVALLLPAGPEFLWLWFGLAK
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LGCPTAWINPHGRGMPLAHSVLSSGARVLVVDPDLRESLEEILPKLQAENIRCFYLSHTS
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CCDS10 AGLRTAFVPTALRRGPLLHCLRSCGARALVLAPEFLESLEPDLPALRAMGLHLWAAGPGT
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260 270 280 290 300 310
pF1KE0 PTPGVGALGAALDAAPSHPVPADLRAGITWRSPALFIYTSGTTGLPKPAILTHERVLQMS
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CCDS10 HPAGISDLLAEVSAEVDGPVPGYLSSPQSITDTCLYIFTSGTTGLPKAARISHLKILQCQ
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320 330 340 350 360 370
pF1KE0 KMLSLSGATADDVVYTVLPLYHVMGLVVGILGCLDLGATCVLAPKFSTSCFWDDCRQHGV
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CCDS10 GFYQLCGVHQEDVIYLALPLYHMSGSLLGIVGCMGIGATVVLKSKFSAGQFWEDCQQHRV
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380 390 400 410 420 430
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CCDS10 TVFQYIGELCRYLVNQPPSKAERGHKVRLAVGSGLRPDTWERFVRRFGPLQVLETYGLTE
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440 450 460 470 480 490
pF1KE0 GNMGLVNYVGRCGALGKMSCLLRMLSPFELVQFDMEAAEPVRDNQGFCIPVGLGEPGLLL
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CCDS10 GNVATINYTGQRGAVGRASWLYKHIFPFSLIRYDVTTGEPIRDPQGHCMATSPGEPGLLV
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500 510 520 530 540 550
pF1KE0 TKVVSQQPFVGYRGPRELSERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMDREGFLYFRDRLGDTFR
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CCDS10 APVSQQSPFLGYAGGPELAQGKLLKDVFRPGDVFFNTGDLLVCDDQGFLRFHDRTGDTFR
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560 570 580 590 600 610
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CCDS10 WKGENVATTEVAEVFEALDFLQEVNVYGVTVPGHEGRAGMAALVLRPPHALDLMQLYTHV
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pF1KE0 RAWLPAYATPHFIRIQDAMEVTSTFKLMKTRLVREGFNVGIVVDPLFVLDNRAQSFRPLT
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CCDS10 SENLPPYARPRFLRLQESLATTETFKQQKVRMANEGFDPSTLSDPLYVLDQAVGAYLPLT
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680 690
pF1KE0 AEMYQAVCEGTWRL
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CCDS10 TARYSALLAGNLRI
720 730
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CCDS32 VYVGSG----GWRFLRIVCKTARRDLFGLSVLIRVRLELRR--HQRAGHTIPRIFQAVVQ
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CCDS32 RQPERLALVDAGTGE-CWTFAQLDAYS-NAVANLFRQLG----FAPGDVVAIFL---EGR
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CCDS32 PEFVGLWLGLAKAGMEAALLNVNLRREPLAFCLGTSGAKALIFGGEMVAAVAEVSGHLGK
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CCDS32 SLIK-FCSGDLGPEGILPDTHLLDPLLKEASTAPLAQIPSKGMDDR--LFYIYTSGTTGL
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CCDS32 PKAAIVVHSRYYRMAAFGHHAYRMQAADVLYDCLPLYHSAGNIIGVGQCLIYGLTVVLRK
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CCDS32 KFSASRFWDDCIKYNCTVVQYIGEICRYLLKQPVREAERRHRVRLAVGNGLRPAIWEEFT
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pF1KE0 QRFGPIRIWEVYGSTEGNMGLVNYVGRCGALGKMSCLLRMLSPFELVQFDMEAAEPVRDN
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CCDS32 ERFGVRQIGEFYGATECNCSIANMDGKVGSCGFNSRILPHVYPIRLVKVNEDTMELLRDA
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CCDS32 QGLCIPCQAGEPGLLVGQINQQDPLRRFDGYVSESATS-KKIAHSVFSKGDSAYLSGDVL
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CCDS32 VMDELGYMYFRDRSGDTFRWRGENVSTTEVEGVLSRLLGQTDVAVYGVAVPGVEGKAGMA
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CCDS32 AVA-DPHSLLDPNAIYQELQKVLAPYARPIFLRLLPQVDTTGTFKIQKTRLQREGFDPRQ
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CCDS32 TSDRLFFLDLKQGHYLPLNEAVYTRICSGAFAL
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CCDS53 YFLKVAAVGRRVRSYGKRRPARTILRAFLEKARQTPHKPFLLFRDE---TLTYAQVDRRS
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CCDS53 NQVARALHDHLG----LRQGDCVALL-MGNE--PAYVWLWLGLVKLGCAMACLNYNIRAK
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CCDS53 SLLHCFQCCGAKVLLVSPELQAAVEEILPSLKKDDVSIYYVSRTSNTDGIDSFLDKVDEV
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CCDS53 STEPIPESWRSEVTFSTPALYIYTSGTTG-------------------------------
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pF1KE0 TVLPLYHVMGLVVGILGCLDLGATCVLAPKFSTSCFWDDCRQHGVTVILYVGELLRYLCN
:: .: :::.: ::::::...:::: :.:::::::::
CCDS53 ----------------------ATLALRTKFSASQFWDDCRKYNVTVIQYIGELLRYLCN
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::.:.:: : ::::.:::::.:::. : .::: : :.: :..::::.:..::. . ::.
CCDS53 SPQKPNDRDHKVRLALGNGLRGDVWRQFVKRFGDICIYEFYAATEGNIGFMNYARKVGAV
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CCDS53 GRVNYLQKKIITYDLIKYDVEKDEPVRDENGYCVRVPKGEVGLLVCKITQLTPFNGYAGA
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pF1KE0 RELSERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMDREGFLYFRDRLGDTFRWKGENVSTHEVEGVL
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CCDS53 KAQTEKKKLRDVFKKGDLYFNSGDLLMVDHENFIYFHDRVGDTFRWKGENVATTEVADTV
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. :::.:.:::::: :: ::..:::.... .. :::.::.::. .::.:: :.:.::
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::..:.:.::: : ::.:::: ... : :. ::. :. . :.: ..:.:. : .:
CCDS53 QDTIEITGTFKHRKMTLVEEGFNPAVIKDALYFLDDTAKMYVPMTEDIYNAISAKTLKL
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CCDS68 MLLGASLVGVLLFSKLVLKLPWTQVGFSLL--FLYL
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CCDS68 GSGGWRFIRVFIKTIRRDIFGGLVLLKVKAKVRQCL--QERRTVPILFASTVRRHPDKTA
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:.. : . :: .:: . ..: :.:. .: .:. .:... . .: ::
CCDS68 LIFEGTDT-HWTFRQLDEYSSSVANFLQAR-----GLASGDVAAIFMENRNEFVGL--WL
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:.:::: .: :: . : : : . .: ::.:: .. .. :. .:. .. :
CCDS68 GMAKLGVEAALINTNLRRDALLHCLTTSRARALVFGSEMASAICEVHASLDP-SLSLFCS
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. : :.. : : ::.: .:. :.: . ..::::::::::: ::..:
CCDS68 GSWEPGAVPPSTEHLDPLLKDAPKH-LPSCPDKGFT--DKLFYIYTSGTTGLPKAAIVVH
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: .:. .. . .:.:: ::::: : .::: :: : : :. :::.: ::
CCDS68 SRYYRMAALVYYGFRMRPNDIVYDCLPLYHSAGNIVGIGQCLLHGMTVVIRKKFSASRFW
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CCDS68 DDCIKYNCTIVQYIGELCRYLLNQPPREAENQHQVRMALGNGLRQSIWTNFSSRFHIPQV
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CCDS68 AEFYGATECNCSLGNFDSQVGACGFNSRILSFVYPIRLVRVNEDTMELIRGPDGVCIPCQ
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pF1KE0 LGEPGLLLTKVVSQQPFVGYRG--PRELSERKLVRNVRQSGDVYYNTGDVLAMDREGFLY
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CCDS68 PGEPGQLVGRIIQKDPLRRFDGYLNQGANNKKIAKDVFKKGDQAYLTGDVLVMDELGYLY
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CCDS68 FRDRTGDTFRWKGENVSTTEVEGTLSRLLDMADVAVYGVEVPGTEGRAGMAAVA-SPTGN
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CCDS68 CDLERFAQVLEKELPLYARPIFLRLLPELHKTGTYKFQKTELRKEGFDPAIVKDPLFYLD
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690 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]