Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6534
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6534, 390 aa
1>>>pF1KB6534 390 - 390 aa - 390 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7234+/-0.00122; mu= 15.0143+/- 0.073
mean_var=71.6909+/-14.222, 0's: 0 Z-trim(101.7): 51 B-trim: 54 in 1/50
Lambda= 0.151475
statistics sampled from 6574 (6625) to 6574 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.554), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 2.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 2520 560.3 1.1e-159
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 2289 509.8 1.7e-144
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 1516 340.9 1.2e-93
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 1321 298.3 8.2e-81
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 1111 252.4 5.3e-67
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 1021 232.7 4.2e-61
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 988 225.5 6.2e-59
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 988 225.5 6.3e-59
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 988 225.5 6.5e-59
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 967 220.9 1.5e-57
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 948 216.8 2.8e-56
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 947 216.6 3.5e-56
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 943 215.7 5.7e-56
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 924 211.5 1e-54
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 905 207.4 2e-53
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 834 191.8 8.2e-49
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 774 178.8 9e-45
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 753 174.1 1.8e-43
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 715 165.9 6.1e-41
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 715 165.9 6.2e-41
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 676 157.3 2.3e-38
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 611 143.1 4.4e-34
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 608 142.5 6.6e-34
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 602 141.2 1.7e-33
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 593 139.2 6.6e-33
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 570 134.1 1.6e-31
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 564 132.7 2.7e-31
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 557 131.3 1.5e-30
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 557 131.3 1.5e-30
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 556 131.1 1.7e-30
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 551 130.0 3.8e-30
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 550 129.8 4.3e-30
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 545 128.7 9.8e-30
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 542 128.1 1.5e-29
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 533 126.1 5.8e-29
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 523 123.9 3.1e-28
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 518 122.8 5.7e-28
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 507 120.3 2.2e-27
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 505 120.0 4e-27
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 488 116.2 3.3e-26
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 469 112.1 9.5e-25
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 453 108.6 1.1e-23
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 441 105.9 5.4e-23
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 395 95.9 7e-20
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 393 95.5 9.7e-20
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 393 95.5 1.1e-19
>>CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 (390 aa)
initn: 2520 init1: 2520 opt: 2520 Z-score: 2980.6 bits: 560.3 E(32554): 1.1e-159
Smith-Waterman score: 2520; 100.0% identity (100.0% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TMGMVDIFNGDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TMGMVDIFNGDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 EEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
370 380 390
>>CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 (390 aa)
initn: 2289 init1: 2289 opt: 2289 Z-score: 2707.8 bits: 509.8 E(32554): 1.7e-144
Smith-Waterman score: 2289; 91.8% identity (96.4% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS11 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQISKVLHFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEYL
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS11 QVTENTTEKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYQFLQEYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNAI
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:.:.::..:::::::::
CCDS11 DAIKKFYQTSVESTDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLFPDGTIGNDTTLVLVNAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 YFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGKD
:::::::.::.::.:::::::::::::::.::::::.::.:: :::::::::::::::::
CCDS11 YFKGQWENKFKKENTKEEKFWPNKNTYKSVQMMRQYNSFNFALLEDVQAKVLEIPYKGKD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTLR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::::::::::
CCDS11 LSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETCVDLHLPRFKMEESYDLKDTLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TMGMVDIFNGDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTSTN
:::::.:::::::::::: :.:: .: :::::::::::::.::::::::: : :::
CCDS11 TMGMVNIFNGDADLSGMTWSHGLSVSKVLHKAFVEVTEEGVEAAAATAVVVVELSSPSTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB6 EEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EEFCCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
370 380 390
>>CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 (391 aa)
initn: 1192 init1: 1192 opt: 1516 Z-score: 1794.8 bits: 340.9 E(32554): 1.2e-93
Smith-Waterman score: 1516; 58.2% identity (85.5% similar) in 392 aa overlap (1-390:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:.::. ..:.. ::::....:....:::.::..: .:.::::::.. ::.:...:.: .
CCDS11 MDSLGAVSTRLGFDLFKELKKTNDGNIFFSPVGILTAIGMVLLGTRGATASQLEEVFHSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHV-DRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEY
. :... :: .: . . ::.::::.:::..: :. :::.:.:.:::::::::::.:
CCDS11 KETKSSRIKAEEKEVIENTEAVHQQFQKFLTEISKLTNDYELNITNRLFGEKTYLFLQKY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNA
:: ..:.:..:.: :::.:: .::::::::::::.::::::.:.:.:.:.:.: :::::
CCDS11 LDYVEKYYHASLEPVDFVNAADESRKKINSWVESKTNEKIKDLFPDGSISSSTKLVLVNM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 IYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGK
.::::::...:.::.::::::: ::.: ::.::: : :: :. :::.:::.: ::::..
CCDS11 VYFKGQWDREFKKENTKEEKFWMNKSTSKSVQMMTQSHSFSFTFLEDLQAKILGIPYKNN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTL
::::.:::::.::::.:. .:.. :::.:::: .:.: .:.::::::.::..:::. .:
CCDS11 DLSMFVLLPNDIDGLEKIIDKISPEKLVEWTSPGHMEERKVNLHLPRFEVEDGYDLEAVL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 RTMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTS
.::: : :. :: :::... :: . ::..:: :::::.::::::.. :: . .
CCDS11 AAMGMGDAFSEHKADYSGMSSGSGLYAQKFLHSSFVAVTEEGTEAAAATGI-GFTVTSAP
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB6 TNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
.:. :::::::::::.:..:::::.::::::
CCDS11 GHENVHCNHPFLFFIRHNESNSILFFGRFSSP
360 370 380 390
>>CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 (400 aa)
initn: 1198 init1: 1198 opt: 1321 Z-score: 1564.3 bits: 298.3 E(32554): 8.2e-81
Smith-Waterman score: 1500; 57.1% identity (83.5% similar) in 401 aa overlap (1-390:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD
:.::. ..:.. ::::....:....:::.::..: .:.::::::.. ::.:...:.: .
CCDS77 MDSLGAVSTRLGFDLFKELKKTNDGNIFFSPVGILTAIGMVLLGTRGATASQLEEVFHSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB6 QVTENTTGKAATYHVDR----------SGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGE
. :... :: .: : . ::.::::.:::..: :. :::.:.:.::::
CCDS77 KETKSSRIKAEEKEVVRIKAEGKEIENTEAVHQQFQKFLTEISKLTNDYELNITNRLFGE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 KTYLFLQEYLDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGS
:::::::.::: ..:.:..:.: :::.:: .::::::::::::.::::::.:.:.:.:.:
CCDS77 KTYLFLQKYLDYVEKYYHASLEPVDFVNAADESRKKINSWVESKTNEKIKDLFPDGSISS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 NTTLVLVNAIYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAK
.: ::::: .::::::...:.::.::::::: ::.: ::.::: : :: :. :::.:::
CCDS77 STKLVLVNMVYFKGQWDREFKKENTKEEKFWMNKSTSKSVQMMTQSHSFSFTFLEDLQAK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VLEIPYKGKDLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVE
.: ::::..::::.:::::.::::.:. .:.. :::.:::: .:.: .:.::::::.::
CCDS77 ILGIPYKNNDLSMFVLLPNDIDGLEKIIDKISPEKLVEWTSPGHMEERKVNLHLPRFEVE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB6 ESYDLKDTLRTMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAV
..:::. .: .::: : :. :: :::... :: . ::..:: :::::.::::::..
CCDS77 DGYDLEAVLAAMGMGDAFSEHKADYSGMSSGSGLYAQKFLHSSFVAVTEEGTEAAAATGI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KB6 VGFGSSPTSTNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP
:: . . .:. :::::::::::.:..:::::.::::::
CCDS77 -GFTVTSAPGHENVHCNHPFLFFIRHNESNSILFFGRFSSP
370 380 390 400
>>CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 (397 aa)
initn: 946 init1: 847 opt: 1111 Z-score: 1316.4 bits: 252.4 E(32554): 5.3e-67
Smith-Waterman score: 1111; 45.2% identity (75.4% similar) in 398 aa overlap (1-390:1-397)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKEN-NIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHF
:.::. . ..: ..: ... .: .. :::.: ::...: .: :::: .:: :. .::.:
CCDS11 MDSLATSINQFALELSKKLAESAQGKNIFFSSWSISTSLTIVYLGAKGTTAAQMAQVLQF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 --DQVT----ENTTGKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTY
:: . :. . .... : ..: .:: :..:. : .: : :: :: ..:::::
CCDS11 NRDQGVKCDPESEKKRKMEFNLSNSEEIHSDFQTLISEILKPNDDYLLKTANAIYGEKTY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LFLQEYLDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTT
: ..::. .: .. . . :.:..: .. :: :::::: ::. ::.::.:. .. :.:
CCDS11 AFHNKYLEDMKTYFGAEPQPVNFVEASDQIRKDINSWVERQTEGKIQNLLPDDSVDSTTR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LVLVNAIYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLE
..::::.:::: ::..: ..: :. : :..: : .::: . ..:. .: .: :.
CCDS11 MILVNALYFKGIWEHQFLVQNTTEKPFRINETTSKPVQMMFMKKKLHIFHIEKPKAVGLQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 IPYKGKDLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESY
. ::..:::...:::..:.::..::. .: ::: :::: . :. .:.::::.::.:.::
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CCDS11 DLKSTLSSMGMSDAFSQSKADFSGMSSARNLFLSNVFHKAFVEINEQGTEAAAGSGSE-I
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CCDS11 DIRIRVPSIEFNANHPFLFFIRHNKTNTILFYGRLCSP
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CCDS44 -PRFCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
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CCDS11 N--TASGYGNSSN---SQSG-LQSQLKRVFSDINASHKDYDLSIVNGLFAEKVYGFHKDY
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CCDS11 IECAEKLYDAKVERVDFTNHLEDTRRNINKWVENETHGKIKNVIGEGGISSSAVMVLVNA
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CCDS11 VYFKGKWQSAFTKSETINCHFKSPKCSGKAVAMMHQERKFNLSVIEDPSMKILELRYNG-
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CCDS11 ST--LFRADHPFLFVIR--KDDIILFSGKVSCP
360 370 380
390 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 23:16:30 2016 done: Fri Nov 4 23:16:30 2016
Total Scan time: 2.020 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]