Result of FASTA (ccds) for pFN21AB6411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6411, 307 aa
  1>>>pF1KB6411 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0022+/-0.000858; mu= 16.9039+/- 0.052
 mean_var=59.8295+/-12.020, 0's: 0 Z-trim(105.6): 30  B-trim: 413 in 1/50
 Lambda= 0.165812
 statistics sampled from 8485 (8512) to 8485 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.261), width:  16
 Scan time:  2.340

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16         ( 307) 2106 512.2  2e-145
CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8          ( 309) 1470 360.0 1.3e-99
CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5          ( 309) 1465 358.8 2.9e-99
CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9           ( 305) 1373 336.8 1.2e-92
CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9          ( 342) 1312 322.3 3.3e-88
CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9          ( 283) 1046 258.6   4e-69
CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12         ( 323)  994 246.2 2.5e-65
CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12        ( 337)  994 246.2 2.6e-65
CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11         ( 330)  982 243.3 1.9e-64
CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11        ( 341)  982 243.3 1.9e-64
CCDS33169.1 PPP1CB gene_id:5500|Hs108|chr2         ( 327)  977 242.1 4.2e-64
CCDS8161.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11         ( 286)  891 221.5 5.9e-58
CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19         ( 499)  758 189.8 3.5e-48
CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10        ( 515)  703 176.7 3.3e-44
CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10         ( 524)  703 176.7 3.4e-44
CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10        ( 525)  703 176.7 3.4e-44
CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4         ( 469)  698 175.5 7.1e-44
CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4         ( 511)  698 175.5 7.6e-44
CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4         ( 521)  698 175.5 7.7e-44
CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8         ( 502)  671 169.0 6.6e-42
CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8         ( 512)  671 169.0 6.7e-42
CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8         ( 521)  671 169.0 6.8e-42
CCDS34013.1 PPEF2 gene_id:5470|Hs108|chr4          ( 753)  373 97.8 2.6e-20
CCDS43920.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX          ( 591)  338 89.4 7.2e-18
CCDS14188.1 PPEF1 gene_id:5475|Hs108|chrX          ( 653)  338 89.4 7.8e-18


>>CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16              (307 aa)
 initn: 2106 init1: 2106 opt: 2106  Z-score: 2724.3  bits: 512.2 E(32554): 2e-145
Smith-Waterman score: 2106; 100.0% identity (100.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 DLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 DRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKK
              250       260       270       280       290       300

              
pF1KB6 PVADYFL
       :::::::
CCDS10 PVADYFL
              

>>CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8               (309 aa)
 initn: 1468 init1: 1446 opt: 1470  Z-score: 1902.0  bits: 360.0 E(32554): 1.3e-99
Smith-Waterman score: 1470; 65.5% identity (86.6% similar) in 307 aa overlap (2-307:5-309)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB6    MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHG
           :  ..::. .::: .:. ..:..:..:: ::.:::..:::::.:  :::::::.::
CCDS60 MDDKAFTKELDQWVEQLNECKQLNENQVRTLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB6 QFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHES
       ::.:: ::::.::  :.::::::::.::::.:::::  ::.:::::::.:::..::::::
CCDS60 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYPERITILRGNHES
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB6 RQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQI
       ::::::::::::::::::...::.: :..:::: :.:..::.:::.::::::::.:::.:
CCDS60 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 RTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRA
       :..:: :::::.:::::::::::.:  :::.::::::: ::.:.   :: :: . .. ::
CCDS60 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 HQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIP
       ::::::::.:  ...:.:..::::::::::: :::.:::. :. .:. :. ::.  :: :
CCDS60 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPR--RGEP
              250       260       270       280       290          

        300       
pF1KB6 S-KKPVADYFL
          . . ::::
CCDS60 HVTRRTPDYFL
      300         

>>CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5               (309 aa)
 initn: 1464 init1: 1442 opt: 1465  Z-score: 1895.5  bits: 358.8 E(32554): 2.9e-99
Smith-Waterman score: 1465; 66.7% identity (86.8% similar) in 303 aa overlap (6-307:9-309)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB6    MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHG
               .::. :::: .:. ..::.::.:: ::.:::..:::::.:  :::::::.::
CCDS41 MDEKVFTKELDQWIEQLNECKQLSESQVKSLCEKAKEILTKESNVQEVRCPVTVCGDVHG
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB6 QFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHES
       ::.:: ::::.::  :.::::::::.::::.:::::  ::.:::::: .:::..::::::
CCDS41 QFHDLMELFRIGGKSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRERITILRGNHES
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB6 RQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQI
       ::::::::::::::::::...::.: :..:::: :.:..::.:::.::::::::.:::.:
CCDS41 RQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVDGQIFCLHGGLSPSIDTLDHI
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 RTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRA
       :..:: :::::.:::::::::::.:  :::.::::::: ::.:.   :: :: . .. ::
CCDS41 RALDRLQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRGGWGISPRGAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSRA
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 HQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIP
       ::::::::.:  ...:.:..::::::::::: :::.:::. :. .:. :. ::.  :: :
CCDS41 HQLVMEGYNWCHDRNVVTIFSAPNYCYRCGNQAAIMELDDTLKYSFLQFDPAPR--RGEP
              250       260       270       280       290          

        300       
pF1KB6 S-KKPVADYFL
          . . ::::
CCDS41 HVTRRTPDYFL
      300         

>>CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9                (305 aa)
 initn: 1404 init1: 1365 opt: 1373  Z-score: 1776.7  bits: 336.8 E(32554): 1.2e-92
Smith-Waterman score: 1373; 61.6% identity (85.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-305)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFY
       :: . :::. .:  : :. . :...: ::  . ..:.:::::: :..:::::::::::::
CCDS68 MAPL-DLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQFY
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 DLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQI
       :: ::::.::.::.:::.:::::::::.::.:::  :::::...::::::.:::::::::
CCDS68 DLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQI
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTI
       ::::::::::  :::....:::::..::.:...:.:: .:.::::::::.:.::::::::
CCDS68 TQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQIRTI
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 DRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQL
       .:.::.:: : .:::.::::::.  :..::::::.:::. :. .:   :.. .:::::::
CCDS68 ERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRAHQL
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKK
       : ::::. :.: ..::::::::::::::.:.:. . .   ..  .:.:.:.  : :: . 
CCDS68 VHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIPPRT
     240       250       260       270       280       290         

              
pF1KB6 PVADYFL
        .. :::
CCDS68 -TTPYFL
      300     

>>CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9               (342 aa)
 initn: 1344 init1: 1305 opt: 1312  Z-score: 1697.1  bits: 322.3 E(32554): 3.3e-88
Smith-Waterman score: 1312; 63.9% identity (86.8% similar) in 280 aa overlap (28-307:64-342)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB6    MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHG
                                     ::  . ..:.:::::: :..::::::::::
CCDS48 PSGCGAPAGRPFLSPGPPPVFHFLRFLKERLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHG
            40        50        60        70        80        90   

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB6 QFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHES
       ::::: ::::.::.::.:::.:::::::::.::.:::  :::::...::::::.::::::
CCDS48 QFYDLCELFRTGGQVPDTNYIFMGDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHES
           100       110       120       130       140       150   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB6 RQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQI
       :::::::::::::  :::....:::::..::.:...:.:: .:.::::::::.:.:::::
CCDS48 RQITQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQI
           160       170       180       190       200       210   

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 RTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRA
       :::.:.::.:: : .:::.::::::.  :..::::::.:::. :. .:   :.. .::::
CCDS48 RTIERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRA
           220       230       240       250       260       270   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 HQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIP
       :::: ::::. :.: ..::::::::::::::.:.:. . .   ..  .:.:.:.  : ::
CCDS48 HQLVHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIP
           280       290       300       310       320       330   

       300       
pF1KB6 SKKPVADYFL
        .  .. :::
CCDS48 PRT-TTPYFL
            340  

>>CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9               (283 aa)
 initn: 1248 init1: 1039 opt: 1046  Z-score: 1354.4  bits: 258.6 E(32554): 4e-69
Smith-Waterman score: 1197; 56.0% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-283)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFY
       :: . :::. .:  : :. . :...: ::  . ..:.:::::: :..:::::::::::  
CCDS48 MAPL-DLDKYVEIARLCKYLPENDLKRLCDYVCDLLLEESNVQPVSTPVTVCGDIHGQ--
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 DLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQI
                           :::::::.::.:::  :::::...::::::.:::::::::
CCDS48 --------------------GDFVDRGYYSLETFTYLLALKAKWPDRITLLRGNHESRQI
                            60        70        80        90       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 TQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTI
       ::::::::::  :::....:::::..::.:...:.:: .:.::::::::.:.::::::::
CCDS48 TQVYGFYDECQTKYGNANAWRYCTKVFDMLTVAALIDEQILCVHGGLSPDIKTLDQIRTI
       100       110       120       130       140       150       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 DRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQL
       .:.::.:: : .:::.::::::.  :..::::::.:::. :. .:   :.. .:::::::
CCDS48 ERNQEIPHKGAFCDLVWSDPEDVDTWAISPRGAGWLFGAKVTNEFVHINNLKLICRAHQL
       160       170       180       190       200       210       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 VMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKK
       : ::::. :.: ..::::::::::::::.:.:. . .   ..  .:.:.:.  : :: . 
CCDS48 VHEGYKFMFDEKLVTVWSAPNYCYRCGNIASIMVFKDVNTREPKLFRAVPDSERVIPPRT
       220       230       240       250       260       270       

              
pF1KB6 PVADYFL
        .. :::
CCDS48 -TTPYFL
        280   

>>CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12              (323 aa)
 initn: 879 init1: 644 opt: 994  Z-score: 1286.3  bits: 246.2 E(32554): 2.5e-65
Smith-Waterman score: 994; 47.9% identity (78.5% similar) in 284 aa overlap (20-302:30-310)

                         10        20        30        40        50
pF1KB6           MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVT
                                    ..:.:...:: :.:::.. .  . ....:. 
CCDS91 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB6 VCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITL
       .:::::::.::: .::. ::  ::.::::.::.::::  :.::. :::: :..::. . :
CCDS91 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 IRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPS
       .:::::  .:...::::::: :.: .. .:.  :. :. : ..::.: :::: ::::::.
CCDS91 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD
              130       140        150       160       170         

              180       190       200        210       220         
pF1KB6 IQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPE-DTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAAN
       .:...::: : :  .:: .: .::::::::. :. ::: . ::... ::..:::.:   .
CCDS91 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB6 DIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAA
       :.:.::::::.: .::..  .. ..:..:::::: .  :..:.. .:: :. .: :..  
CCDS91 DLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILK--
     240       250       260       270       280       290         

     290       300               
pF1KB6 PQETRGIPSKKPVADYFL        
       : : .   . .::             
CCDS91 PAEKKKPNATRPVTPPRGMITKQAKK
       300       310       320   

>>CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12             (337 aa)
 initn: 879 init1: 644 opt: 994  Z-score: 1286.0  bits: 246.2 E(32554): 2.6e-65
Smith-Waterman score: 994; 47.9% identity (78.5% similar) in 284 aa overlap (20-302:30-310)

                         10        20        30        40        50
pF1KB6           MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVT
                                    ..:.:...:: :.:::.. .  . ....:. 
CCDS58 MADLDKLNIDSIIQRLLEVRGSKPGKNVQLQENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB6 VCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITL
       .:::::::.::: .::. ::  ::.::::.::.::::  :.::. :::: :..::. . :
CCDS58 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 IRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPS
       .:::::  .:...::::::: :.: .. .:.  :. :. : ..::.: :::: ::::::.
CCDS58 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD
              130       140        150       160       170         

              180       190       200        210       220         
pF1KB6 IQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPE-DTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAAN
       .:...::: : :  .:: .: .::::::::. :. ::: . ::... ::..:::.:   .
CCDS58 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVLGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB6 DIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAA
       :.:.::::::.: .::..  .. ..:..:::::: .  :..:.. .:: :. .: :..  
CCDS58 DLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILK--
     240       250       260       270       280       290         

     290       300                             
pF1KB6 PQETRGIPSKKPVADYFL                      
       : : .   . .::                           
CCDS58 PAEKKKPNATRPVTPPRVASGLNPSIQKASNYRNNTVLYE
       300       310       320       330       

>>CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11              (330 aa)
 initn: 878 init1: 643 opt: 982  Z-score: 1270.7  bits: 243.3 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 982; 48.7% identity (79.5% similar) in 273 aa overlap (20-291:30-301)

                         10        20        30        40        50
pF1KB6           MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPVT
                                    . :.:...:: :.:::.. .  . ....:. 
CCDS81 MSDSEKLNLDSIIGRLLEVQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPLK
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB6 VCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITL
       .:::::::.::: .::. ::  ::.::::.::.::::  :.::. :::: :..::. . :
CCDS81 ICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFFL
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 IRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPS
       .:::::  .:...::::::: :.: .. .:.  :. :. : ..::.: :::: ::::::.
CCDS81 LRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSPD
              130       140        150       160       170         

              180       190       200        210       220         
pF1KB6 IQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPE-DTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAAN
       .:...::: : :  .:: .: .::::::::. :. ::: . ::... ::..:::.:   .
CCDS81 LQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHKH
     180       190       200       210       220       230         

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB6 DIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAA
       :.:.::::::.: .::..  .. ..:..:::::: .  :..:.. .:: :. .: :.. :
CCDS81 DLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKPA
     240       250       260       270       280       290         

     290       300                    
pF1KB6 PQETRGIPSKKPVADYFL             
        .                             
CCDS81 DKNKGKYGQFSGLNPGGRPITPPRNSAKAKK
     300       310       320       330

>>CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11             (341 aa)
 initn: 878 init1: 643 opt: 982  Z-score: 1270.5  bits: 243.3 E(32554): 1.9e-64
Smith-Waterman score: 982; 48.7% identity (79.5% similar) in 273 aa overlap (20-291:41-312)

                          10        20        30        40         
pF1KB6            MAEISDLDRQIEQLRRCELIKESEVKALCAKAREILVEESNVQRVDSPV
                                     . :.:...:: :.:::.. .  . ....:.
CCDS31 SIIGRLLEGSRVLTPHCAPVQGSRPGKNVQLTENEIRGLCLKSREIFLSQPILLELEAPL
               20        30        40        50        60        70

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB6 TVCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVDRGFYSVETFLLLLALKVRYPDRIT
        .:::::::.::: .::. ::  ::.::::.::.::::  :.::. :::: :..::. . 
CCDS31 KICGDIHGQYYDLLRLFEYGGFPPESNYLFLGDYVDRGKQSLETICLLLAYKIKYPENFF
               80        90       100       110       120       130

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB6 LIRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTEIFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSP
       :.:::::  .:...::::::: :.: .. .:.  :. :. : ..::.: :::: ::::::
CCDS31 LLRGNHECASINRIYGFYDECKRRY-NIKLWKTFTDCFNCLPIAAIVDEKIFCCHGGLSP
              140       150        160       170       180         

     170       180       190       200        210       220        
pF1KB6 SIQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPE-DTTGWGVSPRGAGYLFGSDVVAQFNAA
       ..:...::: : :  .:: .: .::::::::. :. ::: . ::... ::..:::.:   
CCDS31 DLQSMEQIRRIMRPTDVPDQGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDRGVSFTFGAEVVAKFLHK
     190       200       210       220       230       240         

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB6 NDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNETVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEA
       .:.:.::::::.: .::..  .. ..:..:::::: .  :..:.. .:: :. .: :.. 
CCDS31 HDLDLICRAHQVVEDGYEFFAKRQLVTLFSAPNYCGEFDNAGAMMSVDETLMCSFQILKP
     250       260       270       280       290       300         

      290       300                    
pF1KB6 APQETRGIPSKKPVADYFL             
       : .                             
CCDS31 ADKNKGKYGQFSGLNPGGRPITPPRNSAKAKK
     310       320       330       340 




307 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 20:51:42 2016 done: Fri Nov  4 20:51:42 2016
 Total Scan time:  2.340 Total Display time:  0.020

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com