Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0130
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0130, 399 aa
1>>>pF1KE0130 399 - 399 aa - 399 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1855+/-0.000779; mu= 12.7625+/- 0.047
mean_var=81.5958+/-16.258, 0's: 0 Z-trim(109.6): 20 B-trim: 10 in 1/50
Lambda= 0.141984
statistics sampled from 10964 (10979) to 10964 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 3.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14719.1 PNMA6A gene_id:84968|Hs108|chrX ( 399) 2649 552.1 3.3e-157
CCDS14718.1 PNMA5 gene_id:114824|Hs108|chrX ( 448) 923 198.6 9.8e-51
CCDS9818.1 PNMA1 gene_id:9240|Hs108|chr14 ( 353) 883 190.3 2.3e-48
CCDS65344.1 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX ( 455) 805 174.4 1.9e-43
CCDS35435.2 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX ( 463) 805 174.4 1.9e-43
CCDS34868.1 PNMA2 gene_id:10687|Hs108|chr8 ( 364) 552 122.5 6.1e-28
CCDS65304.1 ZCCHC18 gene_id:644353|Hs108|chrX ( 403) 466 104.9 1.3e-22
CCDS14574.1 ZCCHC12 gene_id:170261|Hs108|chrX ( 402) 465 104.7 1.6e-22
CCDS9908.1 MOAP1 gene_id:64112|Hs108|chr14 ( 351) 375 86.3 4.9e-17
CCDS46124.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19 ( 378) 370 85.3 1.1e-16
CCDS33059.1 PNMAL1 gene_id:55228|Hs108|chr19 ( 439) 370 85.3 1.2e-16
CCDS59400.1 PNMAL2 gene_id:57469|Hs108|chr19 ( 635) 288 68.6 1.9e-11
>>CCDS14719.1 PNMA6A gene_id:84968|Hs108|chrX (399 aa)
initn: 2649 init1: 2649 opt: 2649 Z-score: 2935.9 bits: 552.1 E(32554): 3.3e-157
Smith-Waterman score: 2649; 100.0% identity (100.0% similar) in 399 aa overlap (1-399:1-399)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
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CCDS14 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 SVAGALGVGLRRVCWLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEESFEVWLDHTTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SVAGALGVGLRRVCWLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEESFEVWLDHTTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 MLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALAQVFGDNESQAT
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CCDS14 MLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALAQVFGDNESQAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQMLTRAHLTEPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQMLTRAHLTEPLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAGAQAVARASTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAGAQAVARASTKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE0 EAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
370 380 390
>>CCDS14718.1 PNMA5 gene_id:114824|Hs108|chrX (448 aa)
initn: 893 init1: 390 opt: 923 Z-score: 1024.3 bits: 198.6 E(32554): 9.8e-51
Smith-Waterman score: 937; 40.2% identity (69.8% similar) in 410 aa overlap (1-395:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
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CCDS14 MALTLLEDWCKGMDMDPRKALLIVGIPMECSEVEIQDTVKAGLQPLCAYRVLGRMFRRED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
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CCDS14 NAKAVFIELADTVNYTTLPSHIPGKGGSWEVVVKPRNPDDEFLS--RLNYFLKDEGRSMT
70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE0 SVAGALGVGLRRVCWL--RSIGQAVQPWV---------EAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEE
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CCDS14 DVARALGC-----CSLPAESLDAEVMPQVRSPPLEPPKESMWYRKLKVFSGTASPSPGEE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALA
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CCDS14 TFEDWLEQVTEIMPIWQ-VSEVEKRRRLLESLRGPALSIMRVLQANNDSITVEQCLDALK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 QVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQM
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CCDS14 QIFGDKEDFRASQFRFLQTSPKIGEKVSTFLLRLEPLLQKAVHKSPLSVRSTDMIRLKHL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLA--RSVRAQTQEGAGAR
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CCDS14 LARVAMTPALRGKLELLDQRGCPPNFLELMKLIRDEEEWENTEAVMKNKEKPSGRGRGA-
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 AGAQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGG--QEAEELLQEGLKPVLEECDN
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CCDS14 SGRQARAEASVSA----------PQATVQARSFSDSSPQTIQGGLPPLVKRRRLLGSEST
360 370 380 390 400
CCDS14 RGEDHGQATYPKAENQTPGREGPQAAGEELGNEAGAGAMSHPKPWET
410 420 430 440
>>CCDS9818.1 PNMA1 gene_id:9240|Hs108|chr14 (353 aa)
initn: 710 init1: 309 opt: 883 Z-score: 981.7 bits: 190.3 E(32554): 2.3e-48
Smith-Waterman score: 883; 44.1% identity (72.4% similar) in 340 aa overlap (1-329:1-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
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CCDS98 MAMTLLEDWCRGMDVNSQRALLVWGIPVNCDEAEIEETLQAAM-PQVSYRMLGRMFWREE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
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CCDS98 NAKAALLELTGAVDYAAIPREMPGKGGVWKVLFKPPTSDAEFLE--RLHLFLAREGWTVQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE0 SVAGALGV-------GLRRVCWLRS--IGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEESF
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CCDS98 DVARVLGFQNPTPTPGPEMPAEMLNYILDNVIQPLVESIWYKRLTLFSGRDIPGPGEETF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 EVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALAQV
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CCDS98 DPWLEHTNEVLEEWQ-VSDVEKRRRLMESLRGPAADVIRILKSNNPAITTAECLKALEQV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQMLT
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CCDS98 FGSVESSRDAQIKFLNTYQNPGEKLSAYVIRLEPLLQKVVEKGAIDKDNVNQARLEQVIA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE0 RAHLTEPLDEALRKLRMAGR--SPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAG
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CCDS98 GANHSGAIRRQLW-LTGAGEGPAPNLFQLLVQIREEEAKEEEEEAEATLLQLGLEGHF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 AQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
>>CCDS65344.1 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX (455 aa)
initn: 1009 init1: 425 opt: 805 Z-score: 893.6 bits: 174.4 E(32554): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 993; 44.8% identity (70.1% similar) in 375 aa overlap (1-364:1-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
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CCDS65 MPLTLLQDWCRGEHLNTRRCMLILGIPEDCGEDEFEETLQEACRHLGRYRVIGRMFRREE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
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CCDS65 NAQAILLELAQDIDYALLPREIPGKGGPWEVIVKPRNSDGEFLN--RLNRFLEEERRTVS
70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE0 SVAGALGVGLR----RVC-------WLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEE
.. .:: :: : ...: :::: .: . . : :::: ::
CCDS65 DMNRVLGSDTNCSAPRVTISPEFWTWAQTLGAAVQPLLEQMLYRELRVFSGNTISIPGAL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALA
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CCDS65 AFDAWLEHTTEMLQMWQ-VPEGEKRRRLMECLRGPALQVVSGLRASNASITVEECLAALQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 QVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQM
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CCDS65 QVFGPVESHKIAQVKLCKAYQEAGEKVSSFVLRLEPLLQRAVENNVVSRRNVNQTRLKRV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAG
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CCDS65 LSGATLPDKLRDKLKLMKQRRKPPGFLALVKLLREEEEWEATLGPD-RESLE---GLEVA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 AQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
. :: : : :::
CCDS65 PRPPARI-TGVGAVPLPASGNSFDARPSQGYRRRRGRGQHRRGGVARAGSRGSRKRKRHT
360 370 380 390 400 410
>>CCDS35435.2 PNMA3 gene_id:29944|Hs108|chrX (463 aa)
initn: 1009 init1: 425 opt: 805 Z-score: 893.5 bits: 174.4 E(32554): 1.9e-43
Smith-Waterman score: 993; 44.8% identity (70.1% similar) in 375 aa overlap (1-364:1-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
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CCDS35 MPLTLLQDWCRGEHLNTRRCMLILGIPEDCGEDEFEETLQEACRHLGRYRVIGRMFRREE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
:: : :.:: ....:::.:::::: ::::.:. :: : :::. :. .: :.: . :
CCDS35 NAQAILLELAQDIDYALLPREIPGKGGPWEVIVKPRNSDGEFLN--RLNRFLEEERRTVS
70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE0 SVAGALGVGLR----RVC-------WLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPGEE
.. .:: :: : ...: :::: .: . . : :::: ::
CCDS35 DMNRVLGSDTNCSAPRVTISPEFWTWAQTLGAAVQPLLEQMLYRELRVFSGNTISIPGAL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 SFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAALA
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CCDS35 AFDAWLEHTTEMLQMWQ-VPEGEKRRRLMECLRGPALQVVSGLRASNASITVEECLAALQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 QVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLRQM
:::: ::. .:: : :..::..:.:::::: :::.:.:.....: .....::...
CCDS35 QVFGPVESHKIAQVKLCKAYQEAGEKVSSFVLRLEPLLQRAVENNVVSRRNVNQTRLKRV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 LTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGARAG
:. : : . : . :. ... . :.:: .. :.:: : :::.:. . : . . : ...
CCDS35 LSGATLPDKLRDKLKLMKQRRKPPGFLALVKLLREEEEWEATLGPD-RESLE---GLEVA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 AQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
. :: : : :::
CCDS35 PRPPARI-TGVGAVPLPASGNSFDARPSQGYRRRRGRGQHRRGGVARAGSRGSRKRKRHT
360 370 380 390 400 410
>>CCDS34868.1 PNMA2 gene_id:10687|Hs108|chr8 (364 aa)
initn: 865 init1: 382 opt: 552 Z-score: 615.1 bits: 122.5 E(32554): 6.1e-28
Smith-Waterman score: 869; 42.5% identity (70.4% similar) in 358 aa overlap (1-345:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAVTMLQDWCRWMGVNARRGLLILGIPEDCDDAEFQESLEAALRPMGHFTVLGKAFREED
::...:.:::: :.:. ...:.. ::: : ..::.:: :. .:. .:.. .::: ::...
CCDS34 MALALLEDWCRIMSVDEQKSLMVTGIPADFEEAEIQEVLQETLKSLGRYRLLGKIFRKQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NATAALVELDREVNYALVPREIPGTGGPWNVVFVPRCSGEEFLGLGRVFHFPEQEGQMVE
::.:.:.:: .... . .: :. : :: :.:.: . ::: :. : :.::: :
CCDS34 NANAVLLELLEDTDVSAIPSEVQGKGGVWKVIFKTPNQDTEFLE--RLNLFLEKEGQTVS
70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE0 SVAGALG---VGLRRV-C-----WLRSIGQAV----QPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPAPG
.. ::: :. : : . .:::. :: . .: ..: :::: :::
CCDS34 GMFRALGQEGVSPATVPCISPELLAHLLGQAMAHAPQPLLP-MRYRKLRVFSGSAVPAPE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 EESFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCLAA
::::::::...::... : :.: :..: : :.::: ::.:.: . :.::. ....:: :
CCDS34 EESFEVWLEQATEIVKEWP-VTEAEKKRWLAESLRGPALDLMHIVQADNPSISVEECLEA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 LAQVFGDNESQATIRVKCLTAQQQSGERLSAFVLRLEVLLQKAMEKEALARASADRVRLR
. ::::. ::. : .:. : . :. ::..::.:::::.::..:.::.:. : ::.:::.
CCDS34 FKQVFGSLESRRTAQVRYLKTYQEEGEKVSAYVLRLETLLRRAVEKRAIPRRIADQVRLE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 QMLTRAHLTEPLDEALRKLRMAGRSPSFLEMLGLVRESEAWEASLARSVRAQTQEGAGAR
:... : :.. : ::.:. : :::::.. ..:: : :::. . .: :
CCDS34 QVMAGATLNQMLWCRLRELKDQGPPPSFLELMKVIREEEEEEASFENESIEEPEERDGYG
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE0 AGAQAVARASTKVEAVPGGPGREPEGLLQAGGQEAEELLQEGLKPVLEECDN
CCDS34 RWNHEGDD
360
>>CCDS65304.1 ZCCHC18 gene_id:644353|Hs108|chrX (403 aa)
initn: 453 init1: 257 opt: 466 Z-score: 519.2 bits: 104.9 E(32554): 1.3e-22
Smith-Waterman score: 470; 37.6% identity (67.5% similar) in 234 aa overlap (136-357:26-258)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 GRVFHFPEQEGQMVESVAGALGVGLRRVCWLRSIGQAVQPWVEAVRCQSLGVFSGRDQPA
:::.:... : : . ... .:::: ::
CCDS65 MASITACVGNSRQQNAPLPPWAHSMLRSLGRSLCPLVVKMAERNMKLFSGRVVPA
10 20 30 40 50
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 PGEESFEVWLDHTTEMLHVWQGVSERERRRRLLEGLRGTALQLVHALLAENPARTAQDCL
:.:.:: :: ...:.: :. .::.:. .::.. ::: : .... : : :: .. : :
CCDS65 QGKETFENWLIQVNEVLPDWS-MSEEEKLKRLMKTLRGPAREVMRLLQAANPNLSVADFL
60 70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
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