Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1081
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1081, 1493 aa
1>>>pF1KE1081 1493 - 1493 aa - 1493 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2609+/-0.00122; mu= 4.6047+/- 0.073
mean_var=227.4480+/-45.910, 0's: 0 Z-trim(108.5): 62 B-trim: 12 in 1/50
Lambda= 0.085042
statistics sampled from 10173 (10225) to 10173 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 4.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1812.1 PLEKHH2 gene_id:130271|Hs108|chr2 (1493) 9831 1220.9 0
CCDS45128.1 PLEKHH1 gene_id:57475|Hs108|chr14 (1364) 3938 497.8 9e-140
>>CCDS1812.1 PLEKHH2 gene_id:130271|Hs108|chr2 (1493 aa)
initn: 9831 init1: 9831 opt: 9831 Z-score: 6529.7 bits: 1220.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9831; 99.6% identity (99.9% similar) in 1493 aa overlap (1-1493:1-1493)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAELSEPEGPVDWKERCVALESQLMKFRVQASKIRELLAEKMQQLERQVIDAERQAEKAF
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CCDS18 MAELSEPEGPVDWKERCVALESQLMKFRVQASKIRELLAEKMQQLERQVIDAERQAEKAF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QQVQVMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QQVQVMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KIIEEKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KIIEEKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVSTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 KLSEGQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KLSEGQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVDN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QVLENNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QVLENNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RCTSTLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHKKLYSWQQEAQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RCTSTLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHKKLYSWQQEAQW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPALMPKHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPALMPKHP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 NSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISAALAKRHLSQPQLSSDRMFGTNRNAISMIR
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISVALAKRHLSQPQLSSDRMFGTNRNAISMIR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAKKVAYSKPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAKKVAYSKPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 TPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTSLIYKNMTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTSLIYKNMTTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 VYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTSESDSRSRSGPGSPRAMKRGVSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTSESDSRSRSGPGSPRAMKRGVSLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 SVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDNGKNEPLEKSGYLLKMSGKVKSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDNGKNEPLEKSGYLLKMSGKVKSW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 KRRWFVLKGCELPYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQLTTEKHTYYLTAD
::::::::: :: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KRRWFVLKGGELLYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQLTTEKHTYYLTAD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 SPNILEEWIKVLQNALRVQAANPLSLQPEGKPTMKGLLTKVKHGYSKRVWCTLIGKTLYY
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SPNILEEWIKVLQNVLRVQAANPLSLQPEGKPTMKGLLTKVKHGYSKRVWCTLIGKTLYY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 FRSQEDKFPLGQIKLWEVKVEEVDRSCDSDEDYEASGRSLLSTHYTIVIHPKDQGPTYLL
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FRSQEDKFPLGQIKLWEAKVEEVDRSCDSDEDYEASGRSLLSTHYTIVIHPKDQGPTYLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 IGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSSQIWRHPTLCHSKEGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSSQIWRHPTLCHSKEGI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 ISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQSALQICLTHPELQNEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQSALQICLTHPELQNEI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 CCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRLHLKRNADSRTEFGKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 CCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRLHLKRNADSRTEFGKY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 AIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPVHFMNGIYQVVGFDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPVHFMNGIYQVVGFDAS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE1 TTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIKICDIISKWEQASKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 TTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIKICDIISKWEQASKEQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE1 QPGKCEGTRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQIINGLFPLNKDLALEMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QPGKCEGTRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQIINGLFPLNKDLALEMA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE1 ALLSQVEIGDFERPFSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRYRDGCSEEQLRQLCQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ALLSQVEIGDFERPFSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRYRDGCSEEQLRQLCQRL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE1 STRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSLGSTFLWLAVHEDGLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 STRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSLGSTFLWLAVHEDGLSL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE1 LEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKPTEKLLFAMAKPEILEITLLI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS18 LEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKPTEKLLFAMAKPKILEITLLI
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE1 ASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLLSSSRPTKGPTLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLLSSSRPTKGPTLL
1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS45128.1 PLEKHH1 gene_id:57475|Hs108|chr14 (1364 aa)
initn: 4048 init1: 1483 opt: 3938 Z-score: 2622.8 bits: 497.8 E(32554): 9e-140
Smith-Waterman score: 4334; 48.7% identity (71.8% similar) in 1512 aa overlap (1-1493:1-1364)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAELS-EPEGPVDWKERCVALESQLMKFRVQASKIRELLAEKMQQLERQVIDAERQAEKA
::::. : . :::..::..::.::..::.::::::::::.:::.::.....::..::.:
CCDS45 MAELKVEAPASVDWQKRCLTLETQLFRFRLQASKIRELLADKMQELEQRLLEAEQRAENA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 FQQVQVMEDKLKAANIQTSESETRLYNKCQDLESLIQEKDDVIQNLELQLEEQKQIRIQE
:: :::.:.: .:... .:: :. : :.: . :. ::..:..:: :::.:::.: .:
CCDS45 ETQVGVMEEKVKLSNLKNVDSEGSLHRKYQELLKAIKGKDELISQLEAQLEKQKQMRAEE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 AKIIEEKAAKIKEWVTVKLNELELENQNLRLINQNQTEEIRTMQSKLQEVQGKKSSTVST
:: ..:::::::::::.:: .::.:::.:. :: .:.. ..:. :. .:
CCDS45 AKTVQEKAAKIKEWVTLKLAKLEMENQHLKSHNQRLVEQVGSLQDALEAIQ---------
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LKLSEGQRLSSLTFGCFLSRARSPPQVVKSEEMSKISSKEPEFTEGKDMEEMEIPEKSVD
.. ...: .: . :.... : :: .. :
CCDS45 --IAPSRKLLVPPYG--------------AAEQDSVPS-EP------GIQPM--------
180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NQVLENNRGQRTLHQTPCGSEQNRKTRTSFATDGGISQNSGAPVSDWSSDEEDGSKGRSK
:: . ::. . . .: . : :.. . ::. .: ::.:
CCDS45 --------GQDS------GSQAQGLKAAVLAPSPGALQSKDS-VSEAASPLEDSS-----
210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SRCTSTLSSHTSEEGVQCSRMGSEMYLTASDDSSSIFEEETFGIKRPEHK---KLYSWQ-
.::. :..: :. . . .. : . : :. :: ...
CCDS45 ---SSTV--HSGET-VEAKPLQPHL-----------------GRESPPHQPCMKLLTFRC
250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 QEAQWKALNSPLGKGNSELSKKEQDSSSDELNKKFQSQRLDYSSSSSEANTPSPILTPAL
. :.: :.: .:: ..
CCDS45 SSASW-------GEG------------------LVTAQR-------------------GM
280 290
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 MPKHPNSLSGKGTQLVPSSHLPPPKLRIPNVFSISAALAKRHLSQPQLSSD---RMFGTN
.: .: : :.: : ::.: :.. : ::::: ::::.. :. . .
CCDS45 LPGTKTSAREGG----PGSSLTLPKVRAPGTPRDSIQLAKRHHSQPQVGHGHFGRVVNIE
300 310 320 330 340
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 RNAISMIRPLRPQETDLDLVDGDSTEVLENMDTSCDDGLFSYDSLDSPNSDDQEHCDSAK
.:.: ..: : . . . : .: :. : . . .::.. : .
CCDS45 TEAFSALHPSGLPELESRARSREEPEKME-MEEPPPAG--KNEERESPKALGAE----LE
350 360 370 380 390 400
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 KVAY-SKPPTPPLHRFPSWESRIYAVAKSGIRMSEAFNMESVNKNSAATLSYTTSGLYTS
.: .::::::::.: :::::::::: ::.:.:. .. ... . .. : ...
CCDS45 EVELGNKPPTPPLHQFSSWESRIYAVATSGMRLSDMSPRSNTACCASSPPALVSPGSFSG
410 420 430 440 450 460
600 610 620 630 640
pF1KE1 LIYKNMTTPVYTTLKGKATQISSSPFLDDSSGSEEEDSSRSSSRTS--ESDSRSRSGPGS
:.:::.:.::::.:::.:::::. ::.:.::::... ::..: : : :.::. :: ::
CCDS45 LVYKNVTVPVYTALKGRATQISNMPFMDESSGSDDDCSSQASFRISVPSSESRKTSGLGS
470 480 490 500 510 520
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 PRAMKRGVSLSSVASESDYAIPPDAYSTDTEYSQPEQKLPKTCSSSSDN-G-KNEPLEKS
:::.:::::.::..::.:::::::: : :..::.::.:: .: : :.:. : .: ::::
CCDS45 PRAIKRGVSMSSLSSEGDYAIPPDACSLDSDYSEPEHKLQRTSSYSTDGLGLGGESLEKS
530 540 550 560 570 580
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 GYLLKMSGKVKSWKRRWFVLKGCELPYYKSPSDVIRKPQGHIELSASCSILRGDNKQTVQ
::::::...::.::::::::. .. ::::::::::::::...:.. :.:.::...:: :
CCDS45 GYLLKMGSQVKTWKRRWFVLRQGQIMYYKSPSDVIRKPQGQVDLNSRCQIVRGEGSQTFQ
590 600 610 620 630 640
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 LTTEKHTYYLTADSPNILEEWIKVLQNALRVQAANPLSLQPEG-KPTMKGLLTKVKHGYS
: .::.:::::::::..:::::.:::. :.:::..: .: : :::.:: :::::::.:
CCDS45 LISEKKTYYLTADSPSLLEEWIRVLQSLLKVQATGPPALLRGGTKPTVKGWLTKVKHGHS
650 660 670 680 690 700
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 KRVWCTLIGKTLYYFRSQEDKFPLGQIKLWEVKVEEVDRSCDSDEDYEASG-RSLLSTHY
: :::.:.:: .::.::.::: ::: . . ....:::::::::::::::.: : :::.:
CCDS45 KVVWCALVGKIFYYYRSHEDKRPLGCLPVRDAHIEEVDRSCDSDEDYEAGGTRRLLSSHC
710 720 730 740 750 760
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 TIVIHPKDQGPTYLLIGSKHEKDTWLYHLTVAAGSNNVNVGSEFEQLVCKLLNIDGEPSS
:.:::: ...:::::::.::::::::::::::::.....::. .:::. ::.. .:.:.:
CCDS45 TLVIHPTEHSPTYLLIGTKHEKDTWLYHLTVAAGGSSAKVGTAYEQLIGKLMDGEGDPDS
770 780 790 800 810 820
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 QIWRHPTLCHSKEGIISPLTTLPSEALQTEAIKLFKTCQLFINAAVDSPAIDYHISLAQS
.:::: ::.::.:. . :::::::::::::.::::.::::::. :.. ..:::.::::.
CCDS45 PLWRHPMLCYSKDGLYASLTTLPSEALQTEALKLFKSCQLFINVPVEAASVDYHVSLAQT
830 840 850 860 870 880
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KE1 ALQICLTHPELQNEICCQLIKQTRRRQPQNQPGPLQGWQLLALCVGLFLPHHPFLWLLRL
:::.::.:::::.:: :::.::: : ::. . .: :::::::. ::::.: ::: ..
CCDS45 ALQVCLVHPELQSEIYCQLMKQTSCRPPQKY-SLMQCWQLLALCAPLFLPQHHFLWYVKQ
890 900 910 920 930 940
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE1 HLKRNADSRTEFGKYAIYCQRCVERTQQNGDREARPSRMEILSTLLRNPYHHSLPFSIPV
.:.:.:: :.: :.:: :::: :::: ..:.:::::::::..: :::::.::::::::::
CCDS45 QLQRHADPRSETGQYATYCQRAVERTLRTGEREARPSRMEVVSILLRNPFHHSLPFSIPV
950 960 970 980 990 1000
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE1 HFMNGIYQVVGFDASTTVEEFLNTLNQDTGMRKPAQSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGNIK
:: :: :.:::::.:.::.:::. :::. :::::..:::::::::::::::::::::..:
CCDS45 HFTNGTYHVVGFDGSSTVDEFLQRLNQEIGMRKPSHSGFALFTDDPSGRDLEHCLQGSVK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE1 ICDIISKWEQASKEQQPGKCEG-TRTVRLTYKNRLYFSVQARGETDREKLLLMYQTNDQI
::: ::::::: :: .::: :: ::.:.: ::::::: :..::::::.::: ::. .:
CCDS45 ICDAISKWEQAMKELHPGKSEGGTRVVKLMYKNRLYFRSQVKGETDRERLLLASQTSREI
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE1 INGLFPLNKDLALEMAALLSQVEIGDFERPFSTPAGHVTNQCKVNQTLKQVIEKFYPKRY
. : ::.::.::::::::..::: ::.:.: . :. :. :... :.::...:.:.::
CCDS45 VAGRFPINKELALEMAALMAQVEYGDLEKP-ALPGPGGTSPAKAQHLLQQVLDRFHPRRY
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE1 RDGCSEEQLRQLCQRLSTRWMALRGHSAADCVRIYLTVARKWPFFGAKLFLAKPITPSSL
: : ::::.: . :.:.: .:.: : .:.:::::::::::::::::: :.: ::
CCDS45 RHGAPAEQLRHLADMLTTKWATLQGCSPPECIRIYLTVARKWPFFGAKLFAAQPAQLSSK
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE1 GSTFLWLAVHEDGLSLLEYNSMRLIVSYVYKSLMTFGGYQDDFMVVINNTHSKDKPT---
....:.::.:::.:.:..:.:.. ..: :.:. :::: .::::.:: . .:..
CCDS45 ENALVWIAVNEDGVSILDHNTMQVHITYPYSSVTTFGGCRDDFMLVIRSIPDKSSGKSHI
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE1 EKLLFAMAKPEILEITLLIASYINNFHQQKAAFHHLSAPALLSAQTRGPQARMMGSQPLL
:::.: :: :.: : :...:::.: : .. . :. . : .. : : .
CCDS45 EKLIFRMAAPKIAEATFIMASYMN--HCTTTVNPPTNPPG--ACQLW----ELDGRQFFS
1310 1320 1330 1340 1350
1490
pF1KE1 SSSRPTKGPTLL
: : :::::::
CCDS45 SVSCATKGPTLL
1360
1493 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 23:16:52 2016 done: Sat Nov 5 23:16:53 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]