FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3515, 968 aa 1>>>pF1KE3515 968 - 968 aa - 968 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4565+/-0.000859; mu= 13.3183+/- 0.052 mean_var=151.9982+/-30.303, 0's: 0 Z-trim(112.7): 17 B-trim: 180 in 2/49 Lambda= 0.104029 statistics sampled from 13429 (13442) to 13429 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16 Scan time: 4.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 ( 968) 6466 982.7 0 CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 ( 805) 2496 386.8 9.2e-107 CCDS78062.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 624) 1927 301.3 3.9e-81 CCDS43367.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 613) 1922 300.6 6.4e-81 CCDS58971.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 523) 1231 196.8 9.4e-50 CCDS58972.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 ( 602) 840 138.2 4.8e-32 CCDS14073.1 PKDREJ gene_id:10343|Hs108|chr22 (2253) 390 71.1 2.9e-11 >>CCDS3627.1 PKD2 gene_id:5311|Hs108|chr4 (968 aa) initn: 6466 init1: 6466 opt: 6466 Z-score: 5249.2 bits: 982.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6466; 100.0% identity (100.0% similar) in 968 aa overlap (1-968:1-968) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MVNSSRVQPQQPGDAKRPPAPRAPDPGRLMAGCAAVGASLAAPGGLCEQRGLEIEMQRIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 MVNSSRVQPQQPGDAKRPPAPRAPDPGRLMAGCAAVGASLAAPGGLCEQRGLEIEMQRIR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QAAARDPPAGAAASPSPPLSSCSRQAWSRDNPGFEAEEEEEEVEGEEGGMVVEMDVEWRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 QAAARDPPAGAAASPSPPLSSCSRQAWSRDNPGFEAEEEEEEVEGEEGGMVVEMDVEWRP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 GSRRSAASSAVSSVGARSRGLGGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCPSPVGGGDPLHRHLPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 GSRRSAASSAVSSVGARSRGLGGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCPSPVGGGDPLHRHLPL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 EGQPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 EGQPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 MMSSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 MMSSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 TEADNRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 TEADNRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLLQFLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLLQFLE 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 DQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 DQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFGF 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 AIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 AIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPIY 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 FTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLAQQKAEMELSDLIRKGYHKALVKLKLKKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 FTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLAQQKAEMELSDLIRKGYHKALVKLKLKKN 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 TVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEIEAIFTKYDQDGDQELTEHEHQQMRD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 TVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEIEAIFTKYDQDGDQELTEHEHQQMRD 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 DLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGSISSGVSYEEFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 DLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGSISSGVSYEEFQ 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 VLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVAEDERLGRDSEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 VLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVAEDERLGRDSEI 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 HREQMERLVREELERWESDDAASQISHGLGTPVGLNGQPRPRSSRPSSSQSTEGMEGAGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS36 HREQMERLVREELERWESDDAASQISHGLGTPVGLNGQPRPRSSRPSSSQSTEGMEGAGG 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 NGSSNVHV :::::::: CCDS36 NGSSNVHV >>CCDS7492.1 PKD2L1 gene_id:9033|Hs108|chr10 (805 aa) initn: 1314 init1: 1054 opt: 2496 Z-score: 2030.2 bits: 386.8 E(32554): 9.2e-107 Smith-Waterman score: 2582; 52.9% identity (80.5% similar) in 733 aa overlap (161-872:27-740) 140 150 160 170 180 pF1KE3 VSSVGARSRGLGGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCP---------SPVGGGDPLHRHLPLE ::: : : .: .: .. : : CCDS74 MNAVGSPEGQELQKLGSGAWDNPAYSGPPSPHGTLRVCTISSTGPLQPQPKK-P-E 10 20 30 40 50 190 200 210 220 230 pF1KE3 GQPPRVAWAER-------LVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVL .: ..:. . . .:.:::::: : :... ::: :.:..::::..:..::. . CCDS74 DEPQETAYRTQVSSCCLHICQGIRGLWGTTLTENTAENRELYIKTTLRELLVYIVFLVDI 60 70 80 90 100 110 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 CILTYGMMSSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWK :.::::: ::..::::..::.::: :: : : ..:...::: ::: :..: :::.::: CCDS74 CLLTYGMTSSSAYYYTKVMSELFLHTP-SDT-GVSFQAISSMADFWDFAQGPLLDSLYWT 120 130 140 150 160 170 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 MQPSNQTEAD-NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSE .::. . ..:::.:::.::::::.:::.::: :: . .:.:..: :::::: ..: CCDS74 KWYNNQSLGHGSHSFIYYENMLLGVPRLRQLKVRNDSCVVHEDFREDILSCYDVYSPDKE 180 190 200 210 220 230 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 DRAPFGPRNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNV .. :::: ::::: : :. .:.: :::: ...:::.:::::: .:. .: . .:.... CCDS74 EQLPFGPFNGTAWTYHSQDELGGFSHWGRLTSYSGGGYYLDLPGSRQGSAEALRALQEGL 240 250 260 270 280 290 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 WLDRGTRATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFL :::::::..::::::::::::::::.::.::::::::.:::::.. .::::::...:::. CCDS74 WLDRGTRVVFIDFSVYNANINLFCVLRLVVEFPATGGAIPSWQIRTVKLIRYVSNWDFFI 300 310 320 330 340 350 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 AACEIIFCFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVE ..::.::: ::::::::::::..::.:.:. :.:: ::.:...::.::.:..:.:: .:. CCDS74 VGCEVIFCVFIFYYVVEEILELHIHRLRYLSSIWNILDLVVILLSIVAVGFHIFRTLEVN 360 370 380 390 400 410 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 VLL-QFLEDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSR :. ..:.. ::. .:: ::.:: :.::. ::..::.:::.::.:.::.::.:::.:..: CCDS74 RLMGKLLQQPNTYADFEFLAFWQTQYNNMNAVNLFFAWIKIFKYISFNKTMTQLSSTLAR 420 430 440 450 460 470 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 CAKDLFGFAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEA ::::..:::.::::.:.:::::.::.:::::..:::: .::::::::::::... :..: CCDS74 CAKDILGFAVMFFIVFFAYAQLGYLLFGTQVENFSTFIKCIFTQFRIILGDFDYNAIDNA 480 490 500 510 520 530 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 NRVLGPIYFTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLAQQKAEMELSDLIRKGYHKAL ::.::: ::.:.:::.::.::::::::::::::::: .:: :: :..::::...::.:.: CCDS74 NRILGPAYFVTYVFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKEELAGQKDELQLSDLLKQGYNKTL 540 550 560 570 580 590 720 730 740 750 760 pF1KE3 VKLKLKKNTVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEIE---AIFTKYDQDGDQE ..:.:.:. :.:... :. : ...:... . :. ::.. :: : :::.:.::.. CCDS74 LRLRLRKERVSDVQKVLQGGEQEIQFEDFTNTLRELGHAEHEITELTATFTKFDRDGNRI 600 610 620 630 640 650 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 LTEHEHQQMRDDLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGS : :.:...::.:::.:: :. . .: : . : :.. :: . : :. CCDS74 LDEKEQEKMRQDLEEERVALNTEIEKLGRSIVSS--PQG----------KSGPEAARAGG 660 670 680 690 700 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 ISSGVSYEEFQVLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDGVA :: ::: .:.::: ..: . ..::.:::: ::...:: CCDS74 WVSG---EEFYMLTRRVLQLETVLEGVVSQIDAVGSKLKMLERKGWLAPSPGVKEQAIWK 710 720 730 740 750 890 900 910 920 930 940 pF1KE3 EDERLGRDSEIHREQMERLVREELERWESDDAASQISHGLGTPVGLNGQPRPRSSRPSSS CCDS74 HPQPAPAVTPDPWGVQGGQESEVPYKREEEALEERRLSRGEIPTLQRS 760 770 780 790 800 >>CCDS78062.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 (624 aa) initn: 1679 init1: 805 opt: 1927 Z-score: 1570.2 bits: 301.3 E(32554): 3.9e-81 Smith-Waterman score: 1941; 47.7% identity (78.1% similar) in 606 aa overlap (213-802:21-623) 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 QPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYGMM .: . ..:.::. :..::: :::::.::. CCDS78 MAEASRWHRGGASKHKLHYRKEVEITTTLQELLLYFIFLINLCILTFGMV 10 20 30 40 50 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 SSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTE . ..:: ...::.::::: : :.::::.. :. ::::: :: ::.:::: .:: CCDS78 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL 60 70 80 90 100 110 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 AD--NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP . : : :.:::.::::::.:::.:::..:.. ..... ..::: :. ..:: . :: CCDS78 YNLKNSSRIYYENILLGVPRVRQLKVRNNTCKVYSSFQSLMSECYGKYTSANEDLSNFGL 120 130 140 150 160 170 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR . .: : :.. .. :. :::....: ..:: . ::... :: . .:. : :. :::: CCDS78 QINTEWRYST-SNTNSPWHWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR 180 190 200 210 220 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF . :::::.::::.::::..::..:::::::.. :::: .::.:::. .:.:.:.::: : CCDS78 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF 230 240 250 260 270 280 490 500 510 520 530 pF1KE3 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLL-QFL :.:.: ....:. .:. : ::.:.:: :......: ::...: : . .. .:: :.: CCDS78 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLLCFVAVSFNTYYNVQIFLLLGQLL 290 300 310 320 330 340 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFG .. . . .: :: :.: .::: :.:.::.:::.::::.::.::::::.:.:::.::. : CCDS78 KSTEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKIFKFISFNKTMSQLSSTLSRCVKDIVG 350 360 370 380 390 400 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 FAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPI :::::::::.:::::..::::.:::::::::. ::.::::.:::.::: :..:: .:::: CCDS78 FAIMFFIIFFAYAQLGFLVFGSQVDDFSTFQNSIFAQFRIVLGDFNFAGIQQANPILGPI 410 420 430 440 450 460 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 YFTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLA-QQKAEMELSDLIRKGYHKALVKLKLK :: ::.::.::.:::::::::::::::::.: . .. ..::. .:...:...: :..:: CCDS78 YFITFIFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFELGKMIKQSYKNVLEKFRLK 470 480 490 500 510 520 720 730 740 750 760 pF1KE3 KNTVDDISESLRQGGGKL-------NFDELR-QDLKGKGHTDAEIEAIFTKYD-QDGDQE : :. ... .:.: : .::: . :. . . ..: . ... :: : CCDS78 KAQKDEDKKT--KGSGDLAEQARREGFDENEIQNAEQMKKWKERLEKKYYSMEIQDDYQP 530 540 550 560 570 580 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 LTEHEHQQM---RDDLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRR .:..: ... .:::: . ..: ... : .:. CCDS78 VTQEEFRELFLYAVELEKELHYINLKLNQVVRKVSAL 590 600 610 620 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 RGSISSGVSYEEFQVLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLD >>CCDS43367.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 (613 aa) initn: 1679 init1: 805 opt: 1922 Z-score: 1566.2 bits: 300.6 E(32554): 6.4e-81 Smith-Waterman score: 1922; 49.2% identity (78.8% similar) in 575 aa overlap (213-774:21-592) 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 QPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYGMM .: . ..:.::. :..::: :::::.::. CCDS43 MAEASRWHRGGASKHKLHYRKEVEITTTLQELLLYFIFLINLCILTFGMV 10 20 30 40 50 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 SSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTE . ..:: ...::.::::: : :.::::.. :. ::::: :: ::.:::: .:: CCDS43 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL 60 70 80 90 100 110 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 AD--NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP . : : :.:::.::::::.:::.:::..:.. ..... ..::: :. ..:: . :: CCDS43 YNLKNSSRIYYENILLGVPRVRQLKVRNNTCKVYSSFQSLMSECYGKYTSANEDLSNFGL 120 130 140 150 160 170 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR . .: : : : .. :. :::....: ..:: . ::... :: . .:. : :. :::: CCDS43 QINTEWRY-STSNTNSPWHWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR 180 190 200 210 220 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF . :::::.::::.::::..::..:::::::.. :::: .::.:::. .:.:.:.::: : CCDS43 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF 230 240 250 260 270 280 490 500 510 520 530 pF1KE3 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLL-QFL :.:.: ....:. .:. : ::.:.:: :......: ::...: : . .. .:: :.: CCDS43 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLLCFVAVSFNTYYNVQIFLLLGQLL 290 300 310 320 330 340 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFG .. . . .: :: :.: .::: :.:.::.:::.::::.::.::::::.:.:::.::. : CCDS43 KSTEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKIFKFISFNKTMSQLSSTLSRCVKDIVG 350 360 370 380 390 400 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 FAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPI :::::::::.:::::..::::.:::::::::. ::.::::.:::.::: :..:: .:::: CCDS43 FAIMFFIIFFAYAQLGFLVFGSQVDDFSTFQNSIFAQFRIVLGDFNFAGIQQANPILGPI 410 420 430 440 450 460 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 YFTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLA-QQKAEMELSDLIRKGYHKALVKLKLK :: ::.::.::.:::::::::::::::::.: . .. ..::. .:...:...: :..:: CCDS43 YFITFIFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFELGKMIKQSYKNVLEKFRLK 470 480 490 500 510 520 720 730 740 750 760 pF1KE3 KNTVDDISESLRQGGGKL-------NFDELR-QDLKGKGHTDAEIEAIFTKYD-QDGDQE : :. ... .:.: : .::: . :. . . ..: . ... :: : CCDS43 KAQKDEDKKT--KGSGDLAEQARREGFDENEIQNAEQMKKWKERLEKKYYSMEIQDDYQP 530 540 550 560 570 580 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 LTEHEHQQMRDDLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRRGS .:..: CCDS43 VTQEEFRDGTTTKYKMRFSECLTKRI 590 600 610 >>CCDS58971.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 (523 aa) initn: 1183 init1: 582 opt: 1231 Z-score: 1006.7 bits: 196.8 E(32554): 9.4e-50 Smith-Waterman score: 1231; 45.3% identity (77.2% similar) in 382 aa overlap (213-591:21-401) 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 QPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYGMM .: . ..:.::. :..::: :::::.::. CCDS58 MAEASRWHRGGASKHKLHYRKEVEITTTLQELLLYFIFLINLCILTFGMV 10 20 30 40 50 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 SSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTE . ..:: ...::.::::: : :.::::.. :. ::::: :: ::.:::: .:: CCDS58 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL 60 70 80 90 100 110 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 AD--NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP . : : :.:::.::::::.:::.:::..:.. ..... ..::: :. ..:: . :: CCDS58 YNLKNSSRIYYENILLGVPRVRQLKVRNNTCKVYSSFQSLMSECYGKYTSANEDLSNFGL 120 130 140 150 160 170 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR . .: : : : .. :. :::....: ..:: . ::... :: . .:. : :. :::: CCDS58 QINTEWRY-STSNTNSPWHWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR 180 190 200 210 220 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF . :::::.::::.::::..::..:::::::.. :::: .::.:::. .:.:.:.::: : CCDS58 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF 230 240 250 260 270 280 490 500 510 520 530 pF1KE3 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLL-QFL :.:.: ....:. .:. : ::.:.:: :......: ::...: : . .. .:: :.: CCDS58 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLLCFVAVSFNTYYNVQIFLLLGQLL 290 300 310 320 330 340 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 EDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFG .. . . .: :: :.: .::: :.:.::.::: . . .: :.:.... .: CCDS58 KSTEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFE 350 360 370 380 390 400 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 FAIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPI CCDS58 LGKMIKQSYKNVLEKFRLKKAQKDEDKKTKGSGDLAEQARREGFDENEIQNAEQMKKWKE 410 420 430 440 450 460 >>CCDS58972.1 PKD2L2 gene_id:27039|Hs108|chr5 (602 aa) initn: 1792 init1: 766 opt: 840 Z-score: 688.7 bits: 138.2 E(32554): 4.8e-32 Smith-Waterman score: 1858; 46.6% identity (75.7% similar) in 605 aa overlap (213-802:21-601) 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 QPPRVAWAERLVRGLRGLWGTRLMEESSTNREKYLKSVLRELVTYLLFLIVLCILTYGMM .: . ..:.::. :..::: :::::.::. CCDS58 MAEASRWHRGGASKHKLHYRKEVEITTTLQELLLYFIFLINLCILTFGMV 10 20 30 40 50 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 SSNVYYYTRMMSQLFLDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTE . ..:: ...::.::::: : :.::::.. :. ::::: :: ::.:::: .:: CCDS58 NPHMYYLNKVMSSLFLDTSVPGEERTNFKSIRSITDFWKFMEGPLLEGLYWDSWYNNQQL 60 70 80 90 100 110 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 AD--NRSFIFYENLLLGVPRIRQLRVRNGSCSIPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGP . : : :.:::.::::::.:::.:::..:.. ..... ..::: :. ..:: . :: CCDS58 YNLKNSSRIYYENILLGVPRVRQLKVRNNTCKVYSSFQSLMSECYGKYTSANEDLSNFGL 120 130 140 150 160 170 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 RNGTAWIYTSEKDLNGSSHWGIIATYSGAGYYLDLSRTREETAAQVASLKKNVWLDRGTR . .: : :.. .. :. :::....: ..:: . ::... :: . .:. : :. :::: CCDS58 QINTEWRYST-SNTNSPWHWGFLGVYRNGGYIFTLSKSKSETKNKFIDLRLNSWITRGTR 180 190 200 210 220 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 ATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACEIIF . :::::.::::.::::..::..:::::::.. :::: .::.:::. .:.:.:.::: : CCDS58 VIFIDFSLYNANVNLFCIIRLVAEFPATGGILTSWQFYSVKLLRYVSYYDYFIASCEITF 230 240 250 260 270 280 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 CFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLLQFLE :.:.: ....:. .:. : ::.:.:: :......: :. CCDS58 CIFLFVFTTQEVKKIKEFKSAYFKSIWNWLELLLLLL---------------------LK 290 300 310 320 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 DQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTVFFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAKDLFGF . . . .: :: :.: .::: :.:.::.:::.::::.::.::::::.:.:::.::. :: CCDS58 STEKYSDFYFLACWHIYYNNIIAITIFFAWIKIFKFISFNKTMSQLSSTLSRCVKDIVGF 330 340 350 360 370 380 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 AIMFFIIFLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEANRVLGPIY ::::::::.:::::..::::.:::::::::. ::.::::.:::.::: :..:: .::::: CCDS58 AIMFFIIFFAYAQLGFLVFGSQVDDFSTFQNSIFAQFRIVLGDFNFAGIQQANPILGPIY 390 400 410 420 430 440 670 680 690 700 710 pF1KE3 FTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLA-QQKAEMELSDLIRKGYHKALVKLKLKK : ::.::.::.:::::::::::::::::.: . .. ..::. .:...:...: :..::: CCDS58 FITFIFFVFFVLLNMFLAIINDTYSEVKADYSIGRRLDFELGKMIKQSYKNVLEKFRLKK 450 460 470 480 490 500 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 NTVDDISESLRQGGGKL-------NFDELR-QDLKGKGHTDAEIEAIFTKYD-QDGDQEL :. ... .:.: : .::: . :. . . ..: . ... :: : . CCDS58 AQKDEDKKT--KGSGDLAEQARREGFDENEIQNAEQMKKWKERLEKKYYSMEIQDDYQPV 510 520 530 540 550 560 780 790 800 810 820 pF1KE3 TEHEHQQM---RDDLEKEREDLDLDHSSLPRPMSSRSFPRSLDDSEEDDDEDSGHSSRRR :..: ... .:::: . ..: ... : .:. CCDS58 TQEEFRELFLYAVELEKELHYINLKLNQVVRKVSAL 570 580 590 600 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 GSISSGVSYEEFQVLVRRVDRMEHSIGSIVSKIDAVIVKLEIMERAKLKRREVLGRLLDG >>CCDS14073.1 PKDREJ gene_id:10343|Hs108|chr22 (2253 aa) initn: 162 init1: 119 opt: 390 Z-score: 315.7 bits: 71.1 E(32554): 2.9e-11 Smith-Waterman score: 464; 23.0% identity (56.7% similar) in 566 aa overlap (172-706:1661-2199) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 GGYHGAGHPSGRRRRREDQGPPCPSPVGGGDPLHRHLPLEGQPPRVAWAERLVRGLRGLW : .. : : : : :. .:: : CCDS14 ILLSGFRTNKPKYCKNLSWSTKYKYTEIRLDGMRMH-PEEMQ--RIHDQIVRIRGTRMYQ 1640 1650 1660 1670 1680 210 220 230 240 250 pF1KE3 GTRLMEESSTNREKYLKS----VLRELVTYLLFLIVLCILTYGMMSSNVYYYTRMMSQLF : .:.: .: : ..:...:: .: :: . .. .::.... . : CCDS14 PLTEDEIRIFKRKKRIKRRALLFLSYILTHFIFLALLLILIVLLRHTDCFYYNQFIRDRF 1690 1700 1710 1720 1730 1740 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 LDTPVSKTEKTNFKTLSSMEDFWKFTEGSLLDGLYWKMQPSNQTEADNRSFIFYENLLLG . .. :....::.... .. :: :. ..:. :.... .:: CCDS14 ---------SMDLATVTKLEDIYRWLNSVLLPLLHNDLNPTFLPESSSK--------ILG 1750 1760 1770 1780 1790 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 VPRIRQLRVRNGS--CS-----IPQDLRDEIKECYDVYSVSSEDRAPFGPRNGTAWIYTS .: .::.:.... : . ...: ::. :. :... :: .. . . . CCDS14 LPLMRQVRAKSSEKMCLPAEKFVQNSIRREIH-CHPKYGIDPEDTKNYSGFWNEVDKQAI 1800 1810 1820 1830 1840 380 390 400 410 pF1KE3 EKDLNG------SSHW-----GIIATYSGAGYYLDL--SRTREETAAQVASLKKNVWLDR ... :: ...: :.. ::...:: : . . : ... .. :... :::. CCDS14 DESTNGFTYKPQGTQWLYYSYGLLHTYGSGGYALYFFPEQQRFNSTLRLKELQESNWLDE 1850 1860 1870 1880 1890 1900 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 GTRATFIDFSVYNANINLFCVVRLLVEFPATGGVIPSWQFQPLKLIRYVTTFDFFLAACE : :. ......: .::::: . .. : : : : ... ..: . . . CCDS14 KTWAVVLELTTFNPDINLFCSISVIFEVSQLGVVNTSISLHSFSLADFDRKASAEIYLYV 1910 1920 1930 1940 1950 1960 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 IIFCFFIFYYVVEEILEIRIHKLHYFRSFWNCLDVVIVVLSVVAIGINIYRTSNVEVLLQ :. ::. :::.: : .. : :: .: :. .. . .: : . . . . ... CCDS14 AILIFFL-AYVVDEGCIIMQERASYVRSVYNLLNFALKCIFTVLIVLFLRKHFLATGIIR 1970 1980 1990 2000 2010 2020 540 550 560 570 580 590 pF1KE3 F-LEDQNTFPNFEHLAYWQIQFNNIAAVTV-FFVWIKLFKFINFNRTMSQLSTTMSRCAK : : . . : :. .. : ..: . . :.... ..: . ..: . .. .. CCDS14 FYLSNPEDFIPFHAVS----QVDHIMRIILGFLLFLTILKTLRYSRFFYDVRLAQRAIQA 2030 2040 2050 2060 2070 2080 600 610 620 630 640 650 pF1KE3 DLFGFAIMFFII---FLAYAQLAYLVFGTQVDDFSTFQECIFTQFRIILGDINFAEIEEA : :. : :.. :..: ..::::: . ..:.. . : : .. .. .:. . CCDS14 ALPGICHMAFVVSVYFFVYMAFGYLVFGQHEWNYSNLIHSTQTVFSYCVSAFQNTEFSN- 2090 2100 2110 2120 2130 2140 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 NRVLGPIYFTTFVFFMFFILLNMFLAIINDTYSEVKSDLAQQKA-EME-LSDLIRKGYHK ::.:: .....:.. :. .:.:.: :.: ..: :.:. . .. . :.: .. : :: CCDS14 NRILGVLFLSSFMLVMICVLINLFQAVILSAYEEMKQPVYEEPSDEVEAMTYLCRKLRTM 2150 2160 2170 2180 2190 2200 720 730 740 750 760 770 pF1KE3 ALVKLKLKKNTVDDISESLRQGGGKLNFDELRQDLKGKGHTDAEIEAIFTKYDQDGDQEL CCDS14 FSFLTSQSKAKDEPEFFIDMLYGQPEKNSHRYLGLKTRNINGKKMVYLVV 2210 2220 2230 2240 2250 968 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 16:27:54 2016 done: Mon Nov 7 16:27:55 2016 Total Scan time: 4.980 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]