FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0300, 2839 aa 1>>>pF1KA0300 2839 - 2839 aa - 2839 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1311+/-0.00121; mu= 5.1301+/- 0.073 mean_var=278.9105+/-55.992, 0's: 0 Z-trim(110.8): 90 B-trim: 162 in 1/50 Lambda= 0.076797 statistics sampled from 11817 (11898) to 11817 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16 Scan time: 8.720 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34137.1 PDZD2 gene_id:23037|Hs108|chr5 (2839) 18766 2094.9 0 CCDS53966.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 (1331) 807 104.9 3.2e-21 CCDS42069.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 (1332) 807 104.9 3.2e-21 CCDS10317.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 ( 631) 688 91.5 1.7e-17 >>CCDS34137.1 PDZD2 gene_id:23037|Hs108|chr5 (2839 aa) initn: 18766 init1: 18766 opt: 18766 Z-score: 11243.3 bits: 2094.9 E(32554): 0 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 KPLLDTSRNLPATDEGDIISVQETSCLVTDKIKVTRRHYCYEQNWPHESTSFFSVKQRIK 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 pF1KA0 SFENLANADRPVAKSGASPFLSVSSKPPIGRRSSGSIVSGSLGHPGDAAARLLRRSLSSC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 SFENLANADRPVAKSGASPFLSVSSKPPIGRRSSGSIVSGSLGHPGDAAARLLRRSLSSC 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2460 pF1KA0 SENQSEAGTLLPQMAKSPSIMTLTISRQNPPETSSKGSDSELKKSLGPLGIPTPTMTLAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 SENQSEAGTLLPQMAKSPSIMTLTISRQNPPETSSKGSDSELKKSLGPLGIPTPTMTLAS 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2500 2510 2520 pF1KA0 PVKRNKSSVRHTQPSPVSRSKLQELRALSMPDLDKLCSEDYSAGPSAVLFKTELEITPRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 PVKRNKSSVRHTQPSPVSRSKLQELRALSMPDLDKLCSEDYSAGPSAVLFKTELEITPRR 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 2570 2580 pF1KA0 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CCDS53 SPDEKYPDPFEISLAQGKEGIFHSSVQLADTSEAGP---SSVPDLALASEAAQLQAAGN- 40 50 60 70 80 90 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 DEGTSSSVQRAMPGTDEPQDVCGAEESKGNLESPKQGSNKIKLKSRLSGGVHRLESVEEY :.: . : . ... ...:. :.::. :.:: . :. . . ::. : CCDS53 DRGKTCRRIFFM----KESSTASSREKPGKLEA--QSSNFLFPKACHQRARSNSTSVNPY 100 110 120 130 140 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 NELMV------RNGDPRIRMLEVSRDGRKHSLPQLLDSSSASQEYHIVKKSTRSLSTTQV . ... : :. : . ..:: : :: ... ... ::::::.:. CCDS53 CTREIDFPMTKKSAAPTDRQ-PYSLCSNRKSLSQQLDCPAGKAAG--TSRPTRSLSTAQL 150 160 170 180 190 200 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 ESPWRLIRPSVISIIGLYKEKGKGLGFSIAGGRDCIRGQMGIFVKTIFPNGSAAEDGRLK .: .. :::: : :.: ..:::::::.::.: : : .::.::::: .:.:: ::::. CCDS53 VQPSGGLQASVISNIVLMKGQAKGLGFSIVGGKDSIYGPIGIYVKTIFAGGAAAADGRLQ 210 220 230 240 250 260 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 EGDEILDVNGIPIKGLTFQEAIHTFKQIRSGLFVLTVRTKLVSPSLTPCSTPTHMSRSAS ::::::..:: . ::: :.:.. ::: ..::..:::::.:..: . :: :.: CCDS53 EGDEILELNGESMAGLTHQDALQKFKQAKKGLLTLTVRTRLTAPP-SLCS---HLSPPLC 270 280 290 300 310 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 PNFNTSGGASAGGSDEG-SSSSLGRKTPGPKDRIVMEVTLNKEPRVGLGIGACCLALENS ....: . .:. . : : .: :. ::..::.:.:: :::::: : . . CCDS53 RSLSSSTCITKDSSSFALESPSAPISTAKPNYRIMVEVSLQKEAGVGLGIGLCSVPYFQC 320 330 340 350 360 370 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 PPGIYIHSLAPGSVAKMESNLSRGDQILEVNSVNVRHAALSKVHAILSKCPPGPVRLVIG ::..:.:.:::::.... : ::.:.:... :. .:..:..:::.: :::: .... CCDS53 ISGIFVHTLSPGSVAHLDGRLRCGDEIVEISDSPVHCLTLNEVYTILSHCDPGPVPIIVS 380 390 400 410 420 430 820 830 840 850 860 pF1KA0 RHPNPKVSEQEMDEVIARSTYQES--KEANSSPGLGTPLKSPSLAKKDSLISESELSQYF :::.:.::::.. :..:... . . :: .. :. : . .: .: : .. CCDS53 RHPDPQVSEQQLKEAVAQAVENTKFGKERHQWSLEGVKRLESSWHGRPTLEKEREKNSAP 440 450 460 470 480 490 870 880 890 900 910 920 pF1KA0 AHDVPGPLSDFMVAGSEDEDH----PGS--GCSTSEEGSLPPSTSTHKEPGKPRANSLVT : . :. .: : .. ::. : ...:. : . :::. :. : : :. CCDS53 PHRRA---QKVMIRSSSDSSYMSGSPGGSPGSGSAEKPSSDVDISTHS-PSLPLAREPVV 500 510 520 530 540 550 930 940 950 960 970 980 pF1KA0 LGSHRASGLFHKQVTVARQASLPGSPQALRNPLLRQRKVGCYDANDASDEEEFDREGDCI :. ::. . .. . :: : .. .: :: .: . : . :. CCDS53 LSI--ASSRLPQE-----SPPLPESRDS--HPPLRLKK----------SFEILVRK-PMS 560 570 580 590 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KA0 SLPGALPGPIRPLSED-DPRRVSISSSKGMDVHNQEERPRKTLVSKAISAPLLGSSVDLE : : : : . .. : ::.. :. .. . . . : .. . ::: . : CCDS53 SKPK--PPPRKYFKSDSDPQK-SLEERENSSCSSGHTPPTCGQEAREL-LPLLLPQEDTA 600 610 620 630 640 650 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA0 ESIPEGMVDAASYAANLTDSAEAPKGSPGSWWKKELSGSSSAP----------KLEYTVR : . . . . . .. . .: :: :.. ....: ...:. CCDS53 GRSPSASAGCPGPGIG-PQTKSSTEGEPG--WRRASPVTQTSPIKHPLLKRQARMDYSFD 660 670 680 690 700 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 TDTQSPTNTGSPS-----SPQQKSEGLGSRHRPVARVSPHCKRSEAEA---KPSGS---- : ...: : :: . ::. : : : ..:. . .: :. .:.:. CCDS53 TTAEDPWVRISDCIKNLFSPIM-SENHG--HMP---LQPNASLNEEEGTQGHPDGTPPKL 710 720 730 740 750 760 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA0 QTVNLTGRANDPCDLDSRVQATSVKVTVAGF-QPGGAVEKESLGKLTTGDACVSTSCELA .:.: : .. : .. .. : : : : ...... : .::. : CCDS53 DTANGTPKVYKSADSSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRASDPRGLPDPALSTQPAPA 770 780 790 800 810 820 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 SALSHLDASHLTENLPKAASELGQQPMT-ELDSSSDLISSPGKKGAAHPDPSKTSVDTGQ : :: .::. . ...: . :. . : .::.: .. ... . .:. .:. CCDS53 SR-EHL-GSHIRAS--SSSSSIRQRISSFETFGSSQLPDKGAQRLSLQPS-------SGE 830 840 850 860 870 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 VSRPENPSQPASPRVAKCKARSPVRLPHEGSPSPGEKAAAPPDYSKTRSASETSTPHNTR ...: . . . .. .:. .:.. : ....: :..:. . . .: : CCDS53 AAKPLGKHEEGRFSGLLGRGAAPTLVPQQ--PEQVLSSGSPAA-SEARDPGVSESPPPGR 880 890 900 910 920 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 RVAALRGAGPGAEGMTPAGAVLPGDPLTSQEQRQGAPGNHSKALEMTGIHAPESS---QE . . :: . : .: . :: :....... .: .. :.. .. CCDS53 Q-PNQKTLPPGPD---PLLRLLSTQAEESQGPVLKMPSQRARSFPLTRSQSCETKLLDEK 930 940 950 960 970 980 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 PSLLEGADSVSSRAPQASLSMLPSTDNTKEACGHVSGHCCPGGSRESPVTDIDSFIKELD : : . .: : : . :: :::. . :... : : . ::... . : CCDS53 TSKLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSIS----CAQTP--CIPKEG-ASPTSSSNE-----D 990 1000 1010 1020 1030 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 ASAARSPSSQTGDSGSQEGSAQGHPPAGAGGGSSCRAEPVPGGQTSSPRRAWAAGAPAYP ..: : ... :.: CCDS53 SAANGSAETSALDTGFSLNLSELREYTEGLTEAKEDDDGDHSSLQSGQSVISLLSSEELK 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >-- initn: 766 init1: 309 opt: 623 Z-score: 384.2 bits: 84.5 E(32554): 4.4e-15 Smith-Waterman score: 623; 40.5% identity (70.8% similar) in 257 aa overlap (2585-2834:1070-1317) 2560 2570 2580 2590 2600 2610 pF1KA0 SSASDTGEAAQDLPFRRSWSVNLDQLLVSAGDQQRLQSVLSSVG--SKSTILTLIQEAKA ::.. ::: : .. :. . ::.:.:. CCDS53 TSALDTGFSLNLSELREYTEGLTEAKEDDDGDHSSLQSGQSVISLLSSEELKKLIEEVKV 1040 1050 1060 1070 1080 1090 2620 2630 2640 2650 2660 pF1KA0 QSENE----EDVCFIVLNRKEGSGLGFSVAGGTDVEPKSITVHRVFSQGAASQEGTMNRG .: . . .:...::.:::::.:::.:.: : ::::::: .: ::::::...: CCDS53 LDEATLKQLDGIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGADLENKVITVHRVFPNGLASQEGTIQKG 1100 1110 1120 1130 1140 1150 2670 2680 2690 2700 2710 2720 pF1KA0 DFLLSVNGASLAGLAHGNVLKVLHQAQLHKDALVVIKKGMDQPRPSARQEPPTANGKGLL . .::.:: :: : .: ..: .:.::. ..:..: .: . :. . .: . . CCDS53 NEVLSINGKSLKGTTHHDALAILRQAREPRQAVIVTRKLTPEAMPDLNSSTDSAASASAA 1160 1170 1180 1190 1200 1210 2730 2740 2750 2760 2770 2780 pF1KA0 SRKTIPLEPGIGRSVAVHDALCVEVL-KTSAGLGLSLDGGKSSVTGDGPLVIKRVYKGGA : .. ... ..:. .: : :::::.::.:::.:. :: ::.:.:..::.: CCDS53 SDVSVE---------STEATVCTVTLEKMSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGAA 1220 1230 1240 1250 1260 1270 2790 2800 2810 2820 2830 pF1KA0 AEQAGIIEAGDEILAINGKPLVGLMHFDAWNIMKSVPEGPVQLLIRKHRNSS .::. .. ::::: ..: . :: .:.::::.:..:.::: ..::. CCDS53 SEQSETVQPGDEILQLGGTAMQGLTRFEAWNIIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKETTAAGD 1280 1290 1300 1310 1320 1330 CCDS53 S >>CCDS42069.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 (1332 aa) initn: 1350 init1: 415 opt: 807 Z-score: 494.3 bits: 104.9 E(32554): 3.2e-21 Smith-Waterman score: 850; 27.1% identity (55.6% similar) in 1065 aa overlap (429-1450:66-1046) 400 410 420 430 440 450 pF1KA0 EAVAILRSATGMVQLVVASKENSAEDLLRLTSKSLPDLTSSVEDVSSWTDNEDQEADGEE ::.. : ::: :.. .. . .: :. CCDS42 SPDEKYPDPFEISLAQGKEGIFHSSVQLADTSEAGP---SSVPDLALASEAAQLQAAGN- 40 50 60 70 80 90 460 470 480 490 500 510 pF1KA0 DEGTSSSVQRAMPGTDEPQDVCGAEESKGNLESPKQGSNKIKLKSRLSGGVHRLESVEEY :.: . : . ... ...:. :.::. :.:: . :. . . ::. : CCDS42 DRGKTCRRIFFM----KESSTASSREKPGKLEA--QSSNFLFPKACHQRARSNSTSVNPY 100 110 120 130 140 520 530 540 550 560 570 pF1KA0 NELMV------RNGDPRIRMLEVSRDGRKHSLPQLLDSSSASQEYHIVKKSTRSLSTTQV . ... : :. : . ..:: : :: ... ... ::::::.:. CCDS42 CTREIDFPMTKKSAAPTDRQ-PYSLCSNRKSLSQQLDCPAGKAAG--TSRPTRSLSTAQL 150 160 170 180 190 200 580 590 600 610 620 630 pF1KA0 ESPWRLIRPSVISIIGLYKEKGKGLGFSIAGGRDCIRGQMGIFVKTIFPNGSAAEDGRLK .: .. :::: : :.: ..:::::::.::.: : : .::.::::: .:.:: ::::. CCDS42 VQPSGGLQASVISNIVLMKGQAKGLGFSIVGGKDSIYGPIGIYVKTIFAGGAAAADGRLQ 210 220 230 240 250 260 640 650 660 670 680 690 pF1KA0 EGDEILDVNGIPIKGLTFQEAIHTFKQIRSGLFVLTVRTKLVSPSLTPCSTPTHMSRSAS ::::::..:: . ::: :.:.. ::: ..::..:::::.:..: . :: :.: CCDS42 EGDEILELNGESMAGLTHQDALQKFKQAKKGLLTLTVRTRLTAPP-SLCS---HLSPPLC 270 280 290 300 310 700 710 720 730 740 750 pF1KA0 PNFNTSGGASAGGSDEG-SSSSLGRKTPGPKDRIVMEVTLNKEPRVGLGIGACCLALENS ....: . .:. . : : .: :. ::..::.:.:: :::::: : . . CCDS42 RSLSSSTCITKDSSSFALESPSAPISTAKPNYRIMVEVSLQKEAGVGLGIGLCSVPYFQC 320 330 340 350 360 370 760 770 780 790 800 810 pF1KA0 PPGIYIHSLAPGSVAKMESNLSRGDQILEVNSVNVRHAALSKVHAILSKCPPGPVRLVIG ::..:.:.:::::.... : ::.:.:... :. .:..:..:::.: :::: .... CCDS42 ISGIFVHTLSPGSVAHLDGRLRCGDEIVEISDSPVHCLTLNEVYTILSHCDPGPVPIIVS 380 390 400 410 420 430 820 830 840 850 860 pF1KA0 RHPNPKVSEQEMDEVIARSTYQES--KEANSSPGLGTPLKSPSLAKKDSLISESELSQYF :::.:.::::.. :..:... . . :: .. :. : . .: .: : .. CCDS42 RHPDPQVSEQQLKEAVAQAVENTKFGKERHQWSLEGVKRLESSWHGRPTLEKEREKNSAP 440 450 460 470 480 490 870 880 890 900 910 920 pF1KA0 AHDVPGPLSDFMVAGSEDEDH----PGS--GCSTSEEGSLPPSTSTHKEPGKPRANSLVT : . :. .: : .. ::. : ...:. : . :::. :. : : :. CCDS42 PHRRA---QKVMIRSSSDSSYMSGSPGGSPGSGSAEKPSSDVDISTHS-PSLPLAREPVV 500 510 520 530 540 550 930 940 950 960 970 980 pF1KA0 LGSHRASGLFHKQVTVARQASLPGSPQALRNPLLRQRKVGCYDANDASDEEEFDREGDCI :. ::. . .. . :: : .. .: :: .: . : . :. CCDS42 LSI--ASSRLPQE-----SPPLPESRDS--HPPLRLKK----------SFEILVRK-PMS 560 570 580 590 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KA0 SLPGALPGPIRPLSED-DPRRVSISSSKGMDVHNQEERPRKTLVSKAISAPLLGSSVDLE : : : : . .. : ::.. :. .. . . . : .. . ::: . : CCDS42 SKPK--PPPRKYFKSDSDPQK-SLEERENSSCSSGHTPPTCGQEAREL-LPLLLPQEDTA 600 610 620 630 640 650 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KA0 ESIPEGMVDAASYAANLTDSAEAPKGSPGSWWKKELSGSSSAP----------KLEYTVR : . . . . . .. . .: :: :.. ....: ...:. CCDS42 GRSPSASAGCPGPGIG-PQTKSSTEGEPG--WRRASPVTQTSPIKHPLLKRQARMDYSFD 660 670 680 690 700 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 TDTQSPTNTGSPS-----SPQQKSEGLGSRHRPVARVSPHCKRSEAEA---KPSGS---- : ...: : :: . ::. : : : ..:. . .: :. .:.:. CCDS42 TTAEDPWVRISDCIKNLFSPIM-SENHG--HMP---LQPNASLNEEEGTQGHPDGTPPKL 710 720 730 740 750 760 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA0 QTVNLTGRANDPCDLDSRVQATSVKVTVAGF-QPGGAVEKESLGKLTTGDACVSTSCELA .:.: : .. : .. .. : : : : ...... : .::. : CCDS42 DTANGTPKVYKSADSSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRASDPRGLPDPALSTQPAPA 770 780 790 800 810 820 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 SALSHLDASHLTENLPKAASELGQQPMT-ELDSSSDLISSPGKKGAAHPDPSKTSVDTGQ : :: .::. . ...: . :. . : .::.: .. ... . .:. .:. CCDS42 SR-EHL-GSHIRAS--SSSSSIRQRISSFETFGSSQLPDKGAQRLSLQPS-------SGE 830 840 850 860 870 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 VSRPENPSQPASPRVAKCKARSPVRLPHEGSPSPGEKAAAPPDYSKTRSASETSTPHNTR ...: . . . .. .:. .:.. : ....: :..:. . . .: : CCDS42 AAKPLGKHEEGRFSGLLGRGAAPTLVPQQ--PEQVLSSGSPAA-SEARDPGVSESPPPGR 880 890 900 910 920 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 RVAALRGAGPGAEGMTPAGAVLPGDPLTSQEQRQGAPGNHSKALEMTGIHAPESS---QE . . :: . : .: . :: :....... .: .. :.. .. CCDS42 Q-PNQKTLPPGPD---PLLRLLSTQAEESQGPVLKMPSQRARSFPLTRSQSCETKLLDEK 930 940 950 960 970 980 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KA0 PSLLEGADSVSSRAPQASLSMLPSTDNTKEACGHVSGHCCPGGSRESPVTDIDSFIKELD : : . .: : : . :: :::. . :... : : . ::... . : CCDS42 TSKLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSIS----CAQTP--CIPKEG-ASPTSSSNE-----D 990 1000 1010 1020 1030 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KA0 ASAARSPSSQTGDSGSQEGSAQGHPPAGAGGGSSCRAEPVPGGQTSSPRRAWAAGAPAYP ..: : ... :.: CCDS42 SAANGSAETSALDTGFSLNLSELREYTEGLTEAKEDDDGDHSSLQSGQSVISLLSSEELK 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >-- initn: 601 init1: 309 opt: 628 Z-score: 387.2 bits: 85.1 E(32554): 3e-15 Smith-Waterman score: 628; 41.0% identity (70.3% similar) in 256 aa overlap (2585-2834:1070-1318) 2560 2570 2580 2590 2600 2610 pF1KA0 SSASDTGEAAQDLPFRRSWSVNLDQLLVSAGDQQRLQSVLSSVG--SKSTILTLIQEAKA ::.. ::: : .. :. . ::.:.:. CCDS42 TSALDTGFSLNLSELREYTEGLTEAKEDDDGDHSSLQSGQSVISLLSSEELKKLIEEVKV 1040 1050 1060 1070 1080 1090 2620 2630 2640 2650 2660 pF1KA0 QSENE----EDVCFIVLNRKEGSGLGFSVAGGTDVEPKSITVHRVFSQGAASQEGTMNRG .: . . .:...::.:::::.:::.:.: : ::::::: .: ::::::...: CCDS42 LDEATLKQLDGIHVTILHKEEGAGLGFSLAGGADLENKVITVHRVFPNGLASQEGTIQKG 1100 1110 1120 1130 1140 1150 2670 2680 2690 2700 2710 2720 pF1KA0 DFLLSVNGASLAGLAHGNVLKVLHQAQLHKDALVVIKKGMDQPRPSARQEPPTANGKGLL . .::.:: :: : .: ..: .:.::. ..:..: .: . :. . .: . . CCDS42 NEVLSINGKSLKGTTHHDALAILRQAREPRQAVIVTRKLTPEAMPDLNSSTDSAASASAA 1160 1170 1180 1190 1200 1210 2730 2740 2750 2760 2770 2780 pF1KA0 SRKTIPLEPGIGRSVAVHDALCVEVLKTSAGLGLSLDGGKSSVTGDGPLVIKRVYKGGAA : .. .:.: . : . : :::::.::.:::.:. :: ::.:.:..::.:. CCDS42 SDVSV-------ESTAEATVCTVTLEKMSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGAAS 1220 1230 1240 1250 1260 1270 2790 2800 2810 2820 2830 pF1KA0 EQAGIIEAGDEILAINGKPLVGLMHFDAWNIMKSVPEGPVQLLIRKHRNSS ::. .. ::::: ..: . :: .:.::::.:..:.::: ..::. CCDS42 EQSETVQPGDEILQLGGTAMQGLTRFEAWNIIKALPDGPVTIVIRRKSLQSKETTAAGDS 1280 1290 1300 1310 1320 1330 >>CCDS10317.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 (631 aa) initn: 641 init1: 309 opt: 688 Z-score: 427.6 bits: 91.5 E(32554): 1.7e-17 Smith-Waterman score: 757; 31.1% identity (57.1% similar) in 646 aa overlap (2214-2834:24-617) 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KA0 SQGKSSLMSDSRGVPRNSIPGGPSGEDHLYFTPRPATRTYSMPAQFSSHF----GREGHP :.: . :: : .. . : .::: CCDS10 MDYSFDTTAEDPWVRISDCIKNLFSPIMSENHGHMPLQPNASLNEEEGTQGHP 10 20 30 40 50 2240 2250 2260 2270 2280 2290 pF1KA0 ---PHSLGRSRDSQVPVTSSVVPEAKASRGGLPSLANGQGIYSVKPLLDTSRNLPATDEG : .: . . : . . . . ...: : .: . . . : :: . .: CCDS10 DGTPPKLDTANGT--PKVYKSADSSTVKKG--PPVAPKPAWF--RQSLKGLRNRASDPRG 60 70 80 90 100 2300 2310 2320 2330 2340 2350 pF1KA0 DIISVQETSCLVTDKIKVTRRHYCYEQNWPHESTSFFSVKQRIKSFENLANA---DRPVA : :. ..:.: . . :.: :..:::.:::..... :. . 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