Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6155
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6155, 597 aa
1>>>pF1KB6155 597 - 597 aa - 597 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2529+/-0.000805; mu= 10.4713+/- 0.049
mean_var=120.4384+/-24.154, 0's: 0 Z-trim(112.1): 14 B-trim: 122 in 2/49
Lambda= 0.116867
statistics sampled from 12919 (12932) to 12919 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.397), width: 16
Scan time: 4.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7036.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9 ( 597) 4103 702.8 3.2e-202
CCDS48062.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9 ( 590) 4030 690.5 1.6e-198
CCDS48061.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9 ( 606) 3581 614.8 1e-175
CCDS48063.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9 ( 521) 2543 439.8 4.2e-123
CCDS5579.1 POR gene_id:5447|Hs108|chr7 ( 680) 946 170.6 6e-42
CCDS11223.1 NOS2 gene_id:4843|Hs108|chr17 (1153) 676 125.1 4.8e-28
CCDS5912.1 NOS3 gene_id:4846|Hs108|chr7 (1203) 609 113.9 1.2e-24
CCDS41842.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12 (1434) 599 112.2 4.6e-24
CCDS55890.1 NOS1 gene_id:4842|Hs108|chr12 (1468) 599 112.2 4.7e-24
>>CCDS7036.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9 (597 aa)
initn: 4103 init1: 4103 opt: 4103 Z-score: 3744.1 bits: 702.8 E(32554): 3.2e-202
Smith-Waterman score: 4103; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-597)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB6 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
550 560 570 580 590
>>CCDS48062.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9 (590 aa)
initn: 2675 init1: 2675 opt: 4030 Z-score: 3677.7 bits: 690.5 E(32554): 1.6e-198
Smith-Waterman score: 4030; 98.8% identity (98.8% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS48 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLL-------ILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB6 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
540 550 560 570 580 590
>>CCDS48061.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9 (606 aa)
initn: 3581 init1: 3581 opt: 3581 Z-score: 3268.3 bits: 614.8 E(32554): 1e-175
Smith-Waterman score: 4075; 98.5% identity (98.5% similar) in 606 aa overlap (1-597:1-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
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pF1KB6 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQ---------EQKVYVQHRLREL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS48 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQPPALFSALQEQKVYVQHRLREL
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540 550 560 570 580 590
pF1KB6 GSLVWELLDRQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GSLVWELLDRQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRF
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 QTETWA
::::::
CCDS48 QTETWA
>>CCDS48063.1 NDOR1 gene_id:27158|Hs108|chr9 (521 aa)
initn: 3461 init1: 2543 opt: 2543 Z-score: 2323.5 bits: 439.8 E(32554): 4.2e-123
Smith-Waterman score: 3397; 93.7% identity (93.7% similar) in 542 aa overlap (1-542:1-508)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGCRVQALDSYPVVNLINEPLVIFVCAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALCQMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRDLWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF
::::::::::::::::: :::::::::
CCDS48 GSALLPVCLGDDQHELG----------------------------------LPSKFTLLF
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSESKPFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGI
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQVLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVS
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HYLDIASVPRRSFFELLACLSLHELEREKLLEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPRAFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSS
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WLASLDPGQGPVRVPLWVRPGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FLFFGCRWRDQDFYWEAEWQELEKRDCLTLIPAFSREQEQKVYVQHRLRELGSLVWELLD
450 460 470 480 490 500
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pF1KB6 RQGAYFYLAGNAKSMPADVSEALMSIFQEEGGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
::
CCDS48 RQATPSPCQRTSRKP
510 520
>>CCDS5579.1 POR gene_id:5447|Hs108|chr7 (680 aa)
initn: 784 init1: 311 opt: 946 Z-score: 866.6 bits: 170.6 E(32554): 6e-42
Smith-Waterman score: 1049; 33.1% identity (64.0% similar) in 614 aa overlap (6-597:83-680)
10 20 30
pF1KB6 MPSPQLLVLFGSQTGTAQDVSERLGREARRRRLGC
..:..:::::::.. ..::...:.: :
CCDS55 EVPEFTKIQTLTSSVRESSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHR--YGM
60 70 80 90 100 110
40 50 60 70 80
pF1KB6 RVQALDS--YPVVNL-----INEPLVIFVCATTGQGDPPDNMKNFWRFIFRKNLPSTALC
: .. : : ...: :.. ::.: :: :.::: :: ..:. .. . .. :
CCDS55 RGMSADPEEYDLADLSSLPEIDNALVVFCMATYGEGDPTDNAQDFYDWLQETDVD---LS
120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 QMDFAVLGLGDSSYAKFNFVAKKLHRRLLQLGGSALLPVCLGDDQHELGPDAAVDPWLRD
. :::.:::...: .:: ..: . .:: :::.. .. . ::::. .: : . : ..
CCDS55 GVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDKRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFIT--WREQ
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 LWDRVLGLYPPPPGLTEIPPGVPLPSKFTLLF---LQEAPSTGSEGQRVAHPGSQEPPSE
.: : . :. . .. :. .. : .: :. .:.:: .
CCDS55 FWPAVCEHF----GVEATGEESSI-RQYELVVHTDIDAAKVYMGEMGRLKSYENQKPPFD
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 SK-PFLAPMISNQRVTGPSHFQDVRLIEFDILGSGISFAAGDVVLIQPSNSAAHVQRFCQ
.: :::: . .:.... .. . ..: :.:: : : . .:: : . :.:..: :... .
CCDS55 AKNPFLAAVTTNRKLNQGTERHLMHL-ELDISDSKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQLGK
290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 VLGLDPDQLFMLQPREPDVSSPTRLPQPCSMRHLVSHYLDIASVPRRSFFELLACLSLHE
.:: : : .. :. . . .. .: : :.: ...::::.. :: . . :: . .
CCDS55 ILGADLDVVMSLNNLDEESNKKHPFPCPTSYRTALTYYLDITNPPRTNVLYELAQYASEP
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 LEREKL--LEFSSAQGQEELFEYCNRPRRTILEVLCDFPHTAAAIPPDYLLDLIPVIRPR
:.: : . ::..:.: . . . :: :: .: : : : :.: .:.: .. :
CCDS55 SEQELLRKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDCPSLRP--PIDHLCELLPRLQAR
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430
pF1KB6 AFSIASSLLTHPSRLQILVAVVQFQTRLKEPRRGLCSSWLASLDP-GQ--GPVRVPLWVR
.::::: .::. ..: ..::...:. . .:. ..:: . .: :. : . ::..::
CCDS55 YYSIASSSKVHPNSVHICAVVVEYETKAGRINKGVATNWLRAKEPAGENGGRALVPMFVR
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 PGSLAFPETPDTPVIMVGPGTGVAPFRAAIQERVAQGQTGN-----FLFFGCRWRDQDFY
... .: ::::::::::::::: . ::::. : :. .:..::: :.:.
CCDS55 KSQFRLPFKATTPVIMVGPGTGVAPFIGFIQERAWLRQQGKEVGETLLYYGCRRSDEDYL
520 530 540 550 560 570
500 510 520 530 540 550
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.. : .... :: : :::::: .:::::: :.. .:.:.. ::..:. :.:.
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560 570 580 590
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.: ::......: : :.. .:. :. .:. :.. ..:.
CCDS55 NMARDVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKKLMTKGRYSLDVWS
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. .. . .:. .: . . . ...: . . .. :
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: : :. . . : : ::: :::. . ....:::.. : . ... :: .. .:
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::..: : .. ... : : :.:::: .:: . . .::. .:...:: .:
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. .:: :. : :..:::::.::::. :.:. ..: . : :::: :.: ..
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CCDS11 EEMLEMAQKGVLHAVHTAYSRLPGKPKVYVQDILRQQLASEVLRVLHKEPGHLYVCGDVR
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: ::...: .. . : .. :. .:.. .:.. .
CCDS11 -MARDVAHTLKQLVAAKLKLNEEQVEDYFFQLKSQKRYHEDIFGAVFPYEAKKDRVAVQP
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CCDS11 SSLEMSAL
1150
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CCDS59 FRCP--TLLEVLEQFP--SVALPAPLLLTQLPLLQPRYYSVSSAPSTHPGEIHLTVAVLA
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..:. : . :.::.::..: ::. : :: ..: . :. .: :. : :.::::::.
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:: .. :.::: :: ::.. : ..: . ..... :.. .: ..: .... :. :: .
CCDS59 REPDNPKTYVQDILRTELAAEVHRVLCLERGHMFVCGDV-TMATNVLQTVQRILATEGDM
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.:. .. :.. .:.. .
CCDS59 ELDEAGDVIGVLRDQQRYHEDIFGLTLRTQEVTSRIRTQSFSLQERQLRGAVPWAFDPPG
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.. ::: ::.. . ..::::.. : .. .: :. : :...:: .:.. . :
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CCDS41 WKWGKNP--TIVEVLEEFP--SIQMPATLLLTQLSLLQPRYYSISSSPDMYPDEVHLTVA
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pF1KB6 GGLCSPDAAAYLARLQQTRRFQTETWA
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CCDS41 GKLSAEDAGVFISRMRDDNRYHEDIFGVTLRTYEVTNRLRSESIAFIEESKKDTDEVFSS
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CCDS55 SVFGLGSRAYPHFCAFGHAVDTLLEELGGERILKMREGDEL--CGQEEAFRTWAKKVFKA
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CCDS55 ACDVFCVGDDVNIEKANNSLISNDRSWKRNKFRLTFVAEAPEL-TQGLSNVH--------
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CCDS55 KKRVSAARLLSRQNLQSPKSSRSTIFVRLHTNGSQELQYQPGDHLGVFPGNHEDLVNALI
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CCDS55 ERLEDAPPVNQMVKVELLEERNTALGVISNWTDELRLP-PCTIFQAFKYYLDITTPPTPL
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CCDS55 QLQQFASLATSEKEKQRLLVLSKGLQEYEEWKWGKNP--TIVEVLEEFP--SIQMPATLL
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CCDS55 LTQLSLLQPRYYSISSSPDMYPDEVHLTVAIVSYRTRDGEGPIHHGVCSSWLNRI---QA
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CCDS55 DELVPCFVRGAPSFHLPRNPQVPCILVGPGTGIAPFRSFWQQRQFDIQHKGMNPCPMVLV
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CCDS55 FGCRQSKIDHIYREETLQAKNKGVFRELYTAYSREPDKPKKYVQDILQEQLAESVYRALK
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CCDS55 EQGGHIYVCGDV-TMAADVLKAIQRIMTQQGKLSAEDAGVFISRMRDDNRYHEDIFGVTL
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CCDS55 RTYEVTNRLRSESIAFIEESKKDTDEVFSS
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597 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]