FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3580, 999 aa 1>>>pF1KE3580 999 - 999 aa - 999 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3949+/-0.00102; mu= 18.1399+/- 0.061 mean_var=183.0820+/-38.117, 0's: 0 Z-trim(110.3): 204 B-trim: 23 in 1/51 Lambda= 0.094788 statistics sampled from 11283 (11514) to 11283 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.354), width: 16 Scan time: 4.780 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS53263.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1056) 6832 948.0 0 CCDS41224.2 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1070) 6604 916.9 0 CCDS53261.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1066) 6558 910.6 0 CCDS53262.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1005) 4786 668.2 2.3e-191 CCDS53264.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 ( 753) 3659 513.9 4.7e-145 CCDS11871.1 MIB1 gene_id:57534|Hs108|chr18 (1006) 1674 242.7 2.9e-63 CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 456 76.2 4.6e-13 CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 456 76.3 5e-13 CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 425 71.9 7.8e-12 CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 425 72.1 9.4e-12 >>CCDS53263.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1056 aa) initn: 6832 init1: 6832 opt: 6832 Z-score: 5061.0 bits: 948.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6832; 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CCDS11 ---SFESPEEVVVV-WDNGTAANYRCS--GAYDLRILDSAPTGIKHDGTMCDTCRQQPII 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 GMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRIPLRGIFQG :.:::: : .::::: :: .::.: : : : : :. : : :. .: :::: : CCDS11 GIRWKCAECTNYDLCTVCYHGDKHHLRHRFYRITTPGSERVLLESRRKSKKITARGIFAG 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 AKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYRVGYKGKVD :.:::: ::.: .::::.:. :.:..:. :.. . .:.: : : .:. :.::::..: : CCDS11 ARVVRGVDWQWEDQDGGNGRRGKVTEIQDWSASSPHSAAYVLWDNGAKNLYRVGFEGMSD 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 LKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQP--FQHGDKVKCLLDTDVLREMQEG :::: .: :: .:.:: : ::. ... .: .: :: :. :: .... .:.: CCDS11 LKCVQDAKGGSFYRDHCPVLGEQ-------NGNRNPGGLQIGDLVNIDLDLEIVQSLQHG 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 pF1KE3 HGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHH------------ ::::. : : . :::: : . :. ::. .::::.:..::: . CCDS11 HGGWTDGMFETLTTTGTVCGIDEDHDIVVQYPSGNRWTFNPAVLTKANIVRSGDAAQGAE 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 pF1KE3 ----SFWVGDVVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAG .: :::.:.: ::. .: :: :::::.. : :.::.::.: ....:..:.: : : CCDS11 GGTSQFQVGDLVQVCYDLERIKLLQRGHGEWAEAMLPTLGKVGRVQQIYSDSDLKVEVCG 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 QRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVAL ::..:. : .:. ... . : :.: : :: . . . .:: .: CCDS11 TSWTYNPA---AVSKVASAGSAISNASGERLSQL---LKKLFETQESGDLNEELVKAAAN 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 GNAARALGLLRRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTAL :..:.. ::.: .:. . :.::.:.:. :.:....:::. . :. : .:. :. CCDS11 GDVAKVEDLLKRPDVDVNGQCAGHTAMQAASQNGHVDILKLLLKQNVDVEAEDKDGDRAV 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 HYAALGNQPEATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDA :.::.:.. . .:: .. .: :. ..: ::.::..: :.::..: . :: .: :. CCDS11 HHAAFGDEGAVIEVLHRGSADLNARNKRRQTPLHIAVNKGHLQVVKTLLDFGCHPSLQDS 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 HSDTPLHSAISAGTGAGGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILAR ..:::::.::: :. :: :. . ::: ::..::. ::::.:.:. :.: .:.. 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CCDS54 GHTKVVNCLIGCG-ANINHTDQDGWTALRSAAWGGHTEVVSALLYAGVKVDCADADSRTA 410 420 430 440 450 460 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 LQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDV :.:. .:.. : . : :. .:.. :.:. . . .. .: . .. : .: CCDS54 LRAAAWGGHEDIVLNLLQHGAEVNK-ADNEGRTALIAAAY-MGHREIVEHLLDHGA--EV 470 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 AERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALGLLRRRPEQVDTKNQ- .. .....:::: : : .. :.:. ...:: : .:: .. CCDS54 NHEDVDGRTALSVAA---------------LCVPASKGHAS-VVSLLIDRGAEVDHCDKD 530 540 550 560 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 GRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPEATRVLLSAGCRA : : : :::: :.:... :::.. : :: :..: : : :: .. .. .:: : . CCDS54 GMTPLLVAAYEGHVDVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAAV 570 580 590 600 610 620 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 DAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAISAGTGAGGIVEV :.:.: :.: .: .: .::::.: .:: : : : . :::: : : : : :. 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CCDS54 VVDHTCNQGATALCIAAQEGHIDVVQVLLEHGADPNHADQFGRTAMRVAAKNGHSQIIKL 860 870 880 890 900 910 >>CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429 aa) initn: 215 init1: 215 opt: 456 Z-score: 347.4 bits: 76.3 E(32554): 5e-13 Smith-Waterman score: 467; 28.8% identity (57.3% similar) in 532 aa overlap (305-826:559-1058) 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 FYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVLREMQEGHGGWNPRMAEFI : :. :.. . :....:: .: CCDS34 RTLLDNGASVNQCDSNGRTLLANAAYSGSLDVVNLLVSRGADLEIEDAHGHTPLTLAARQ 530 540 550 560 570 580 340 350 360 370 380 pF1KE3 GQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGDV----VRV-IGDLDTVKR :.: .:. . : . .. . . :: .: :. :. . :.: .: :. CCDS34 GHTKVVNCLIGCG-ANINHTDQDGWTALRSAAWGGHTEVVSALLYAGVKVDCADADSRTA 590 600 610 620 630 640 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 LQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDV :.:. .:.. : . : :. .:.. :.:. . . .. .: . .. : .: CCDS34 LRAAAWGGHEDIVLNLLQHGAEVNK-ADNEGRTALIAAAY-MGHREIVEHLLDHGA--EV 650 660 670 680 690 700 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 AERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALGLLRRRPEQVDTKNQ- .. .....:::: : : .. :.:. ...:: : .:: .. CCDS34 NHEDVDGRTALSVAA---------------LCVPASKGHAS-VVSLLIDRGAEVDHCDKD 710 720 730 740 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 GRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPEATRVLLSAGCRA : : : :::: :.:... :::.. : :: :..: : : :: .. .. .:: : . CCDS34 GMTPLLVAAYEGHVDVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAAV 750 760 770 780 790 800 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 DAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAISAGTGAGGIVEV :.:.: :.: .: .: .::::.: .:: : : : . :::: : : : : :. 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CCDS34 VVDHTCNQGATALCIAAQEGHIDVVQVLLEHGADPNHADQFGRTAMRVAAKNGHSQIIKL 1040 1050 1060 1070 1080 1090 >>CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053 aa) initn: 818 init1: 241 opt: 425 Z-score: 325.9 bits: 71.9 E(32554): 7.8e-12 Smith-Waterman score: 475; 30.4% identity (60.0% similar) in 418 aa overlap (492-877:89-488) 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 VALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALGLLRRRPEQVDTKNQG-RTALQVAAYLG :. .: .. .:...... .: :..:: CCDS46 LLILSGARVNAKDSKWLTPLHRAVASCSEEAVQVLLKHSADVNARDKNWQTPLHIAAANK 60 70 80 90 100 110 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 QVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPEATRVLLSAGCRADAINSTQSTALH :. . :. ..:.. : : ::::.::.... : ...::: : .:... . :.: CCDS46 AVKCAEALVPLLSNVNVSDRAGRTALHHAAFSGHGEMVKLLLSRGANINAFDKKDRRAIH 120 130 140 150 160 170 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 VAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAISAGTGAGGIVEVLTEVPNIDVTAT :. : .:::. : .: .:. : .: ::::.: :..: ..:. : .. ..:.. 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