Result of FASTA (ccds) for pFN21AA0175
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0175, 651 aa
  1>>>pF1KA0175     651 - 651 aa - 651 aa
Library: human.CCDS.faa
  18921897 residues in 33420 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4886+/-0.00163; mu= 2.3588+/- 0.092
 mean_var=268.2788+/-62.079, 0's: 0 Z-trim(103.9): 731  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.078303
 statistics sampled from 6905 (7738) to 6905 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.232), width:  16
 Scan time:  1.610

The best scores are:                                      opt bits E(33420)
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9            ( 651) 4378 509.7 5.1e-144
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9           ( 619) 4067 474.6 1.9e-133
CCDS59127.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9           ( 580) 3818 446.4 5.2e-125
CCDS59128.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9           ( 520) 3490 409.3 6.9e-114
CCDS59124.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9           ( 603) 3490 409.4 7.6e-114
CCDS59125.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9           ( 580) 3336 392.0 1.3e-108
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9           ( 610) 2410 287.4 4.1e-77
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs109|chr5          ( 559)  861 112.3 1.8e-24
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs109|chr14         ( 729)  849 111.1 5.6e-24
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs109|chr1           ( 552)  845 110.5 6.4e-24
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs109|chr14         ( 713)  844 110.5 8.2e-24
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs109|chr14         ( 744)  844 110.6 8.4e-24
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs109|chr14         ( 753)  844 110.6 8.5e-24
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs109|chr1          ( 780)  844 110.6 8.7e-24
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs109|chr1          ( 795)  844 110.6 8.8e-24
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs109|chr11         ( 745)  843 110.5 9.1e-24
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs109|chr1          ( 796)  842 110.4   1e-23
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs109|chr11         ( 709)  841 110.2   1e-23
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs109|chr11         ( 719)  841 110.2   1e-23
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs109|chr11          ( 724)  841 110.2   1e-23
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs109|chr19        ( 688)  840 110.1 1.1e-23
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs109|chr11         ( 788)  841 110.3 1.1e-23
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs109|chr19        ( 752)  840 110.1 1.2e-23
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs109|chr11          (1321)  784 104.1 1.4e-21
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs109|chr19        ( 778)  776 102.9 1.8e-21
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs109|chr11          ( 926)  772 102.5 2.7e-21
CCDS82645.1 SIK1B gene_id:102724428|Hs109|chr21    ( 783)  766 101.8 3.9e-21
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs109|chr21        ( 783)  766 101.8 3.9e-21
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs109|chr11         (1261)  757 101.0 1.1e-20
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs109|chr11         ( 668)  749 99.8 1.3e-20
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs109|chr11         ( 674)  749 99.8 1.3e-20
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs109|chr11         ( 736)  749 99.8 1.4e-20
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs109|chr3          ( 765)  744 99.3 2.2e-20
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs109|chr12         ( 661)  719 96.4 1.4e-19
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs109|chr11         ( 766)  720 96.6 1.4e-19
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs109|chr21         ( 714)  690 93.2 1.4e-18
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs109|chr5         ( 436)  681 91.9 2.1e-18
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs109|chr10        ( 357)  670 90.6 4.3e-18
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs109|chr10        ( 385)  670 90.6 4.5e-18
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs109|chr11         ( 614)  667 90.5 7.7e-18
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs109|chr1          ( 672)  666 90.4 8.9e-18
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs109|chr16         ( 424)  619 84.9 2.6e-16
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs109|chrX         ( 360)  614 84.2 3.4e-16
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs109|chr3           ( 370)  613 84.1 3.8e-16
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs109|chrX         ( 426)  614 84.3 3.9e-16
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs109|chr1          ( 758)  609 84.0 8.4e-16
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs109|chr1           ( 268)  598 82.3 9.9e-16
CCDS6240.1 PSKH2 gene_id:85481|Hs109|chr8          ( 385)  594 82.0 1.7e-15
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs109|chr1         ( 476)  593 82.0 2.1e-15
CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs109|chr4        ( 766)  596 82.6 2.3e-15


>>CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9                 (651 aa)
 initn: 4378 init1: 4378 opt: 4378  Z-score: 2699.3  bits: 509.7 E(33420): 5.1e-144
Smith-Waterman score: 4378; 100.0% identity (100.0% similar) in 651 aa overlap (1-651:1-651)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 AYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 QGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 MEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 TASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 TASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 KNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 KIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 LTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650 
pF1KA0 QSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
              610       620       630       640       650 

>>CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9                (619 aa)
 initn: 4066 init1: 4066 opt: 4067  Z-score: 2509.7  bits: 474.6 E(33420): 1.9e-133
Smith-Waterman score: 4067; 99.8% identity (99.8% similar) in 606 aa overlap (47-651:14-619)

         20        30        40         50        60        70     
pF1KA0 IGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLG-SDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHV
                                     :: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS59                  MMNFSNIMNYMKLLGQSDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHV
                                10        20        30        40   

          80        90       100       110       120       130     
pF1KA0 LETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKP
            50        60        70        80        90       100   

         140       150       160       170       180       190     
pF1KA0 ENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSM
           110       120       130       140       150       160   

         200       210       220       230       240       250     
pF1KA0 GILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMK
           170       180       190       200       210       220   

         260       270       280       290       300       310     
pF1KA0 NLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 NLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTA
           230       240       250       260       270       280   

         320       330       340       350       360       370     
pF1KA0 TYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDVTASDKNYVAGLIDYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDVTASDKNYVAGLIDYD
           290       300       310       320       330       340   

         380       390       400       410       420       430     
pF1KA0 WCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKLKNKENVYTPKSAVKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKLKNKENVYTPKSAVKN
           350       360       370       380       390       400   

         440       450       460       470       480       490     
pF1KA0 EEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPIKIPVNSTGTDKLMTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPIKIPVNSTGTDKLMTG
           410       420       430       440       450       460   

         500       510       520       530       540       550     
pF1KA0 VISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITVLTRSKRKGSARDGPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITVLTRSKRKGSARDGPR
           470       480       490       500       510       520   

         560       570       580       590       600       610     
pF1KA0 RLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQTQSDFGKVTMQFELEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQTQSDFGKVTMQFELEV
           530       540       550       560       570       580   

         620       630       640       650 
pF1KA0 CQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
           590       600       610         

>>CCDS59127.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9                (580 aa)
 initn: 3818 init1: 3818 opt: 3818  Z-score: 2358.0  bits: 446.4 E(33420): 5.2e-125
Smith-Waterman score: 3818; 98.8% identity (99.5% similar) in 572 aa overlap (80-651:9-580)

      50        60        70        80        90       100         
pF1KA0 DLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEET
                                     : . .. .::::::::::::::::::::::
CCDS59                       MMNFSNIMNYMKLLGQYCPGGELFDYIISQDRLSEEET
                                     10        20        30        

     110       120       130       140       150       160         
pF1KA0 RVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCC
       40        50        60        70        80        90        

     170       180       190       200       210       220         
pF1KA0 GSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVP
      100       110       120       130       140       150        

     230       240       250       260       270       280         
pF1KA0 KWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTE
      160       170       180       190       200       210        

     290       300       310       320       330       340         
pF1KA0 LSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTD
      220       230       240       250       260       270        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 IKSNNWSLEDVTASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IKSNNWSLEDVTASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLT
      280       290       300       310       320       330        

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 PALCRTPANKLKNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PALCRTPANKLKNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSK
      340       350       360       370       380       390        

     470       480       490       500       510       520         
pF1KA0 ARNQCLKETPIKIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ARNQCLKETPIKIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGS
      400       410       420       430       440       450        

     530       540       550       560       570       580         
pF1KA0 LERGLDKVITVLTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LERGLDKVITVLTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDF
      460       470       480       490       500       510        

     590       600       610       620       630       640         
pF1KA0 VQKGYTLKCQTQSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VQKGYTLKCQTQSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSC
      520       530       540       550       560       570        

     650 
pF1KA0 KV
       ::
CCDS59 KV
      580

>>CCDS59128.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9                (520 aa)
 initn: 3490 init1: 3490 opt: 3490  Z-score: 2158.3  bits: 409.3 E(33420): 6.9e-114
Smith-Waterman score: 3490; 100.0% identity (100.0% similar) in 516 aa overlap (136-651:5-520)

         110       120       130       140       150       160     
pF1KA0 EEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59                           MVLEENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHL
                                         10        20        30    

         170       180       190       200       210       220     
pF1KA0 QTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGK
           40        50        60        70        80        90    

         230       240       250       260       270       280     
pF1KA0 YDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDD
          100       110       120       130       140       150    

         290       300       310       320       330       340     
pF1KA0 CVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CVTELSVHHRNNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASAT
          160       170       180       190       200       210    

         350       360       370       380       390       400     
pF1KA0 PFTDIKSNNWSLEDVTASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PFTDIKSNNWSLEDVTASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVES
          220       230       240       250       260       270    

         410       420       430       440       450       460     
pF1KA0 KSLTPALCRTPANKLKNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KSLTPALCRTPANKLKNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYT
          280       290       300       310       320       330    

         470       480       490       500       510       520     
pF1KA0 TPSKARNQCLKETPIKIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TPSKARNQCLKETPIKIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAK
          340       350       360       370       380       390    

         530       540       550       560       570       580     
pF1KA0 VFGSLERGLDKVITVLTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VFGSLERGLDKVITVLTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKK
          400       410       420       430       440       450    

         590       600       610       620       630       640     
pF1KA0 HVDFVQKGYTLKCQTQSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HVDFVQKGYTLKCQTQSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDI
          460       470       480       490       500       510    

         650 
pF1KA0 LSSCKV
       ::::::
CCDS59 LSSCKV
          520

>>CCDS59124.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9                (603 aa)
 initn: 4041 init1: 3490 opt: 3490  Z-score: 2157.5  bits: 409.4 E(33420): 7.6e-114
Smith-Waterman score: 3949; 92.6% identity (92.6% similar) in 651 aa overlap (1-651:1-603)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAV
       :::::::::::::::::::::::::::                                 
CCDS59 LKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLE---------------------------------
               70        80                                        

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 AYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELI
                      :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ---------------ENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELI
                       90       100       110       120       130  

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 QGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLL
            140       150       160       170       180       190  

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQT
            200       210       220       230       240       250  

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 MEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDV
            260       270       280       290       300       310  

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 TASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKL
            320       330       340       350       360       370  

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 KNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPI
            380       390       400       410       420       430  

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 KIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITV
            440       450       460       470       480       490  

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 LTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQT
            500       510       520       530       540       550  

              610       620       630       640       650 
pF1KA0 QSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
            560       570       580       590       600   

>>CCDS59125.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9                (580 aa)
 initn: 3332 init1: 3332 opt: 3336  Z-score: 2063.7  bits: 392.0 E(33420): 1.3e-108
Smith-Waterman score: 3744; 89.1% identity (89.1% similar) in 651 aa overlap (1-651:1-580)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAV
       :::::::::::::::::::::::::::                                 
CCDS59 LKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLE---------------------------------
               70        80                                        

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 AYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELI
                                             ::::::::::::::::::::::
CCDS59 --------------------------------------GNKDYHLQTCCGSLAYAAPELI
                                              90       100         

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 QGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLL
     110       120       130       140       150       160         

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQT
     170       180       190       200       210       220         

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 MEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDV
     230       240       250       260       270       280         

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 TASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKL
     290       300       310       320       330       340         

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 KNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPI
     350       360       370       380       390       400         

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 KIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITV
     410       420       430       440       450       460         

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 LTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQT
     470       480       490       500       510       520         

              610       620       630       640       650 
pF1KA0 QSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
     530       540       550       560       570       580

>>CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs109|chr9                (610 aa)
 initn: 2385 init1: 2385 opt: 2410  Z-score: 1498.1  bits: 287.4 E(33420): 4.1e-77
Smith-Waterman score: 4005; 93.7% identity (93.7% similar) in 651 aa overlap (1-651:1-610)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGSDLPRIKTEIEA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 AYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 QGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 QQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQSKNPFIHLDDDCVTELSVHHRNNRQT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 MEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIKSNNWSLEDV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::         
CCDS59 MEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFSCGQASATPFTDIK---------
              310       320       330       340       350          

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 TASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKL
                                       ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 --------------------------------FTKYWTESNGVESKSLTPALCRTPANKL
                                             360       370         

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 KNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KNKENVYTPKSAVKNEEYFMFPEPKTPVNKNQHKREILTTPNRYTTPSKARNQCLKETPI
     380       390       400       410       420       430         

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 KIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KIPVNSTGTDKLMTGVISPERRCRSVELDLNQAHMEETPKRKGAKVFGSLERGLDKVITV
     440       450       460       470       480       490         

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 LTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LTRSKRKGSARDGPRRLKLHYNVTTTRLVNPDQLLNEIMSILPKKHVDFVQKGYTLKCQT
     500       510       520       530       540       550         

              610       620       630       640       650 
pF1KA0 QSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 QSDFGKVTMQFELEVCQLQKPDVVGIRRQRLKGDAWVYKRLVEDILSSCKV
     560       570       580       590       600       610

>>CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs109|chr5               (559 aa)
 initn: 839 init1: 408 opt: 861  Z-score: 552.8  bits: 112.3 E(33420): 1.8e-24
Smith-Waterman score: 861; 43.6% identity (74.1% similar) in 321 aa overlap (10-324:26-342)

                               10        20        30        40    
pF1KA0                 MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDK
                                .: : .:.:.: :.:::.. : :::. ::.::...
CCDS39 MRRLSSWRKMATAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVKVGKHELTGHKVAVKILNR
               10        20        30        40        50        60

            50         60        70        80        90       100  
pF1KA0 NTLGS-DL-PRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQD
       . . : :.  .:. ::. :: .:: :: .::.:. : . ::::.::  :::::::: .. 
CCDS39 QKIRSLDVVGKIRREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPSDIFMVMEYVSGGELFDYICKNG
               70        80        90       100       110       120

            110       120       130       140       150       160  
pF1KA0 RLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKD
       ::.:.:.: .:.::.:.: : : .  .::::::::.:.: . . :. :::: ..  .. .
CCDS39 RLDEKESRRLFQQILSGVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGL-SNMMSDGE
              130       140       150       160       170          

            170       180       190       200       210       220  
pF1KA0 YHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIM
       . :.: :::  :::::.:.:. : : :.:.:: :..::.:.:: ::::::.: .:.::: 
CCDS39 F-LRTSCGSPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSSGVILYALLCGTLPFDDDHVPTLFKKIC
     180        190       200       210       220       230        

            230       240       250       260          270         
pF1KA0 RGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQD---YNYPVEWQSKNPF
        : . .:..:.:: : ::..:::::: :: ..:.. .: :. ::   : .: . . .. .
CCDS39 DGIFYTPQYLNPSVISLLKHMLQVDPMKRATIKDIREHEWFKQDLPKYLFPEDPSYSSTM
      240       250       260       270       280       290        

     280       290        300       310       320       330        
pF1KA0 IHLDDDCVTELSVHHR-NNRQTMEDLISLWQYDHLTATYLLLLAKKARGKPVRLRLSSFS
       :  ::. . :.  . . ......  : .  . : :...: :.. ..              
CCDS39 I--DDEALKEVCEKFECSEEEVLSCLYNRNHQDPLAVAYHLIIDNRRIMNEAKDFYLATS
        300       310       320       330       340       350      

      340       350       360       370       380       390        
pF1KA0 CGQASATPFTDIKSNNWSLEDVTASDKNYVAGLIDYDWCEDDLSTGAATPRTSQFTKYWT
                                                                   
CCDS39 PPDSFLDDHHLTRPHPERVPFLVAETPRARHTLDELNPQKSKHQGVRKAKWHLGIRSQSR
        360       370       380       390       400       410      

>>CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs109|chr14              (729 aa)
 initn: 778 init1: 384 opt: 849  Z-score: 544.1  bits: 111.1 E(33420): 5.6e-24
Smith-Waterman score: 980; 30.1% identity (64.0% similar) in 678 aa overlap (11-645:56-723)

                                   10        20        30        40
pF1KA0                     MKDYDELLKYYELHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIK
                                     :.: .::: :.::::::: :::::. ::::
CCDS41 QEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIK
          30        40        50        60        70        80     

                50        60        70        80        90         
pF1KA0 IMDKNTLG-SDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYII
       :.::. :. ..: ..  :.. .: : : .: .:..:.:: . .....::  :::.:::..
CCDS41 IIDKTQLNPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLFEVIETEKTLYLIMEYASGGEVFDYLV
          90       100       110       120       130       140     

     100       110       120       130       140       150         
pF1KA0 SQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAK-PK
       .. :..:.:.:  :::::::: : :..  .::::: ::::.:   ..:. :::.  .   
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       :.:   :.: :::  ::::::.:::.: : :.::::.:..::.:. : :::: .:.  : 
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       ....:::: .: ..: .   ::...: ..: :: .......  ::   ..        .:
CCDS41 ERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPFVEP
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        . ..:.   .. :    ... ... .:  .::..::::::: ..:.    .    :: .
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       . .  . . ...  . ...: .:...::  .  . .:  :      :..  .:.: . . 
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           .. ..  : .: ....   :. .:  : :.. :  .....     ::  :..:  .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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