FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KA0213, 1558 aa 1>>>pF1KA0213 1558 - 1558 aa - 1558 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.3035+/-0.00127; mu= -7.3839+/- 0.077 mean_var=464.9617+/-98.337, 0's: 0 Z-trim(111.9): 574 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.059479 statistics sampled from 12096 (12735) to 12096 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.391), width: 16 Scan time: 5.690 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34566.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1558) 10465 914.3 0 CCDS34565.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1608) 7909 695.0 5.1e-199 CCDS75544.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1604) 7865 691.2 7e-198 CCDS82186.1 MAP3K3 gene_id:4215|Hs108|chr17 ( 622) 671 73.5 2.4e-12 CCDS32702.1 MAP3K3 gene_id:4215|Hs108|chr17 ( 626) 671 73.5 2.4e-12 CCDS32701.1 MAP3K3 gene_id:4215|Hs108|chr17 ( 657) 671 73.5 2.5e-12 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--AIHRNSPRPMKVPRCHSDPPNPHLIIPTPEGFSTRSMPSDARSHGSPAAAAAAAAAAV 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1180 1190 1200 1210 pF1KA0 ------------------------RGSSVPENDRLASIAAELQFRSLSRHSSPTEERDEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 AASRPSPSGGDSVLPKSISSAHDTRGSSVPENDRLASIAAELQFRSLSRHSSPTEERDEP 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA0 AYPRGDSSGSTRRSWELRTLISQSKDTASKLGPIEAIQKSVRLFEEKRYREMRRKNIIGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 AYPRGDSSGSTRRSWELRTLISQSKDTASKLGPIEAIQKSVRLFEEKRYREMRRKNIIGQ 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KA0 VCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQPND :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 VCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQPND 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KA0 HKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLEEVSRLGLQEHVI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 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CCDS82 PRSRHLSVSSQNPGRSSPPPGYVPERQQHIARQGSYTSINSEGEFIPETS--EQCMLDPL 160 170 180 190 200 210 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KA0 GKPHSPVTGLYLAIHRNSPRPMKVPRCHSDPPNPHLIIPTP-----EGFRGSSVPENDRL .. .. ..: .. : : .. : .: : : . .: .:.. :. CCDS82 SSAENSLSGSCQSLDSPSFRKSRMSRAQSFPDNRQEYSDRETQLYDKGVKGGTYPR---- 220 230 240 250 260 270 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KA0 ASIAAELQFRSLSRHSSPTEERDEPAYPRGDSSGSTRRSWELRTLISQSKDTASKLGPIE ... .:.. .. : ..:: :.. .: ::. .:.. ... : : CCDS82 -------RYHVSVHHKDYSDGRR--TFPR-----IRRHQGNLFTLVPSSRSLSTN-G--E 280 290 300 310 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KA0 AIQKSVRLFEEK-RYREMRRKNIIG-QVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQ . .:. .. . : : .: .. : ..: . .. ..:.::. .:.: CCDS82 NMGLAVQYLDPRGRLRSADSENALSVQERNVPTKSPSA--------PINWRRGKLLGQGA 320 330 340 350 360 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KA0 YGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQPNDHKTIKETAD---ELKIFEGIKHPNLVRYFGVEL .:.:: : .::::. .: :...:.:.. .: ::.. :........: .:.:.: CCDS82 FGRVYLCYDVDTGRELASKQVQFDPDSPETSKEVSALECEIQLLKNLQHERIVQYYGCLR 370 380 390 400 410 420 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KA0 HREE--MYIFMEYCDEGTL-EEVSRLG-LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKG : : . ::::: :.. .... : : : : : :..:: ... :: . :::::::: CCDS82 DRAEKTLTIFMEYMPGGSVKDQLKAYGALTESVTRKYTRQILEGMSYLHSNMIVHRDIKG 430 440 450 460 470 480 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KA0 ANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAA :::. :.: .:::::: : .:.. .. : . :. :: .:.::::. :::.:: : CCDS82 ANILRDSAGNVKLGDFGASKRLQTICMSGTG-MRSVTGTPYWMSPEVIS---GEGYGRKA 490 500 510 520 530 540 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KA0 DIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQIMYKVGMGHKPPIPERLSPEGKDFLSHCLESDP :.:::::.:.::.: : :: ::: :. . . .: .: ..: .:.::: . . . 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CCDS32 P------LSSAENSLSGSCQSLDRSADSPSFRKSR-MSRAQSFPDNRQEYSDRETQLYDK 220 230 240 250 260 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA0 GDSSGSTRRSWELRTLISQSKDTASKLGPIEAIQKSV-RLFEEKRYREMRRKNI--IGQV : ..:. : ... . .. .: . :. : .. : .: .:. : CCDS32 GVKGGTYPRRYHVSVHHKDYSDGRRTFPRIRRHQGNLFTLVPSSRSLSTNGENMGLAVQY 270 280 290 300 310 320 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 CDTPKSY------DNVMHVGLRKVTFK-------WQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGEL : :.. .:.. : :.: : :.::. .:.: .:.:: : .::::. 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CCDS32 P------LSSAENSLSGSCQSLDRSADSPSFRKSR-MSRAQSFPDNRQEYSDRETQLYDK 250 260 270 280 290 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KA0 GDSSGSTRRSWELRTLISQSKDTASKLGPIEAIQKSV-RLFEEKRYREMRRKNI--IGQV : ..:. : ... . .. .: . :. : .. : .: .:. : CCDS32 GVKGGTYPRRYHVSVHHKDYSDGRRTFPRIRRHQGNLFTLVPSSRSLSTNGENMGLAVQY 300 310 320 330 340 350 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 CDTPKSY------DNVMHVGLRKVTFK-------WQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGEL : :.. .:.. : :.: : :.::. .:.: .:.:: : .::::. 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CCDS32 QLMY >>CCDS46404.1 MAP3K2 gene_id:10746|Hs108|chr2 (619 aa) initn: 474 init1: 188 opt: 642 Z-score: 321.8 bits: 71.0 E(32554): 1.3e-11 Smith-Waterman score: 647; 33.1% identity (59.6% similar) in 453 aa overlap (1114-1551:202-616) 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KA0 GRGTRPRWATQGFDFLQAIEPAFISALPEDDFLSLQALMNECIGHVIGKPHSPVTGLYLA : :::.. : : . ::. : CCDS46 DELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQMLDPLSLSSPENSGSGSCPSLD-SPLDGESYP 180 190 200 210 220 230 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KA0 IHRNSPRPMKVPRCH---SDPPNPHLIIPTPEGF-RGSSVPENDRLASIAAELQFRSLSR : :: .. : : :: :: . : : .:.. : : .. . : . .: CCDS46 KSRM-PRAQSYPDNHQEFSDYDNPIF-----EKFGKGGTYP---RRYHVSYHHQEYNDGR 240 250 260 270 280 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KA0 HSSPTEERDEPAYPRGDSSGSTRRSWELRTLISQSKDTASKLGPIEAIQKSVRLFEEKRY .. : .: . . :. : : : : : ...:.. : ....: CCDS46 KTFPRARRTQGTSLRSPVSFSP-------TDHSLSTSSGSSIFTPE--------YDDSRI 290 300 310 320 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KA0 REMRRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVG--LR--KVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDT : :: :. :.: .:: .. : .. .:. :. .:.: .:.:: : .::: CCDS46 R--RR----GSDIDNPTL--TVMDISPPSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDT 330 340 350 360 370 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 GELMAMKEIRFQPNDHKTIKETAD---ELKIFEGIKHPNLVRYFGV--ELHREEMYIFME :. .:.:...:.:.. .: ::. :....... : .:.:.: . ... . :::: CCDS46 GRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFME 380 390 400 410 420 430 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KA0 YCDEGTL-EEVSRLG-LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIK : :.. .... : : :.: : :..:: ... :: . :::::::::::. :.: .: CCDS46 YMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVK 440 450 460 470 480 490 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KA0 LGDFGCSVKLKNNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEM ::::: : .:.. . : ..:. :: .:.::::. :::.:: :::::..:.:.:: CCDS46 LGDFGASKRLQTICLSGTG-MKSVTGTPYWMSPEVIS---GEGYGRKADIWSVACTVVEM 500 510 520 530 540 550 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KA0 VTGKRPWHEYEHNFQIMYKVGMGHKPPIPERLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDH .: : :: :.: :. . . .: .: ..: .:::.. . . :.: .:..:: : CCDS46 LTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKR-IFVEAKLRPSADELLRH 560 570 580 590 600 610 1550 pF1KA0 SFVKVCTDEE :: CCDS46 MFVHYH >>CCDS33293.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (510 aa) initn: 339 init1: 172 opt: 613 Z-score: 309.5 bits: 68.4 E(32554): 6.5e-11 Smith-Waterman score: 613; 38.1% identity (67.8% similar) in 270 aa overlap (1293-1552:243-507) 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KA0 RRKNIIGQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMK : .:. .:.: :: :: : .. :.:.:.: CCDS33 RIYDREEKFLISNEKKIFSENSLKSEEPILWTKGEILGKGAYGTVY-CGLTSQGQLIAVK 220 230 240 250 260 270 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KA0 EIRFQPNDH----KTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTLE .. .. ... : .. .:. .....:: :.: :.:. :... . ::::. :.. 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