FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9421, 348 aa 1>>>pF1KE9421 348 - 348 aa - 348 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1180+/-0.00113; mu= 17.5911+/- 0.067 mean_var=168.3481+/-69.610, 0's: 0 Z-trim(104.3): 297 B-trim: 981 in 2/48 Lambda= 0.098849 statistics sampled from 7240 (7847) to 7240 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16 Scan time: 2.410 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 2320 343.8 1.2e-94 CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 1690 254.0 1.4e-67 CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 ( 342) 1625 244.7 8.3e-65 CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 1052 163.0 3.3e-40 CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 983 153.2 3e-37 CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 886 139.3 4.5e-33 CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 849 134.0 1.6e-31 CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 434 75.0 1.2e-13 CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 421 73.1 4.2e-13 CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 421 73.1 4.3e-13 CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 421 73.1 4.3e-13 CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 421 73.1 4.3e-13 CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 421 73.1 4.4e-13 CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 421 73.2 4.5e-13 CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 409 71.3 1.3e-12 CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 409 71.5 1.5e-12 CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 409 71.5 1.5e-12 CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 409 71.5 1.6e-12 CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 409 71.5 1.6e-12 CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 409 71.5 1.6e-12 CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 408 71.4 1.7e-12 CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 407 71.2 1.9e-12 CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 405 70.8 2e-12 CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 405 70.8 2.1e-12 CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 401 70.3 3.2e-12 CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 386 68.1 1.4e-11 >>CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 (348 aa) initn: 2320 init1: 2320 opt: 2320 Z-score: 1812.5 bits: 343.8 E(32554): 1.2e-94 Smith-Waterman score: 2320; 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CCDS51 SSESYKARVARRERKAAKTLGVTVVAFMISWLPYSIDSLIDAFMGFITPACIYEICCWCA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD ::::::::::::.:: :: ::::.::.:.::...:.: :::::.. CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKVIVTGQVLKNSSATMNLFSEHI 310 320 330 340 >>CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6 (342 aa) initn: 1657 init1: 1596 opt: 1625 Z-score: 1276.9 bits: 244.7 E(32554): 8.3e-65 Smith-Waterman score: 1625; 67.6% identity (89.8% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-342) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF :..:::: .:.:::..:: :::.:::::: : :::....::..::.::::::: ..::: CCDS51 MTSNFSQP-VVQLCYEDVNGSCIETPYSPGSRVILYTAFSFGSLLAVFGNLLVMTSVLHF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL ::::.::::::::::::::::::::: :: ::.:::::::: ..: .:.: :..::..:. CCDS51 KQLHSPTNFLIASLACADFLVGVTVMLFSMVRTVESCWYFGAKFCTLHSCCDVAFCYSSV 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL .::: : .::::.:::::.: :::::::::::: .::.. .::: ..::::.:..:.::: CCDS51 LHLCFICIDRYIVVTDPLVYATKFTVSVSGICISVSWILPLTYSGAVFYTGVNDDGLEEL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 VVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQS : ::.:::::: ..:.:::. :::::::...:...::::::.::.:: :::.:.:...: CCDS51 VSALNCVGGCQIIVSQGWVLIDFLLFFIPTLVMIILYSKIFLIAKQQAIKIETTSSKVES 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 SSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCV :::::: ::::::::::::::... ::..::::: :: .:::.:.:.:: :.::: : . CCDS51 SSESYKIRVAKRERKAAKTLGVTVLAFVISWLPYTVDILIDAFMGFLTPAYIYEICCWSA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 pF1KE9 YYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD ::::::::::::.:: :: ::::::.:: ::...::: .:: : CCDS51 YYNSAMNPLIYALFYPWFRKAIKLILSGDVLKASSSTISLFLE 300 310 320 330 340 >>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa) initn: 1100 init1: 690 opt: 1052 Z-score: 835.4 bits: 163.0 E(32554): 3.3e-40 Smith-Waterman score: 1052; 46.2% identity (75.5% similar) in 331 aa overlap (13-343:16-337) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAI .::. :: :: .: .. : . ..: . . : .. ..::..: .:. CCDS51 MRAVFIQGAEEHPAAFCYQ-VNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 LHFKQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCF .:: ::::::::. ::: ::...:. :.:.::.:::::::.::: :..:: .:: ::. CCDS51 SYFKALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 ASLFHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGI .:.:::: ::.::. :. ::: ::.:::: :. :. .: ..:. ..:: . : . CCDS51 TSIFHLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFTVRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 EELVVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLLFFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQ . . . :::.:: ::. : : : :::.: . :. .: :::.:: .::..: .: :. CCDS51 SQWLEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLNFPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQI-TTLSK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 AQSSSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILV . ... ::.:::::::::::.. .:. :::. .:...:. ..::::: :..:.. CCDS51 SLAGA-------AKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFDIFI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 WCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD : .:.::: ::.::.: :::: ::.:: .: ::. .. :..:..: CCDS51 WFAYFNSACNPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE 300 310 320 330 >>CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 (339 aa) initn: 981 init1: 512 opt: 983 Z-score: 782.2 bits: 153.2 E(32554): 3e-37 Smith-Waterman score: 983; 42.8% identity (73.1% similar) in 334 aa overlap (13-343:4-336) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHF .:.. .: ::.:. .: :. ::... . . . :::.:...: :: CCDS51 MMPFCHNIINISCVKNNWSNDVRASLYSLMVLIILTTLVGNLIVIVSISHF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 KQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASL ::::::::.:: :.: .:::.: :::.: :::.: :::::. .::.:: : . ::. CCDS51 KQLHTPTNWLIHSMATVDFLLGCLVMPYSMVRSAEHCWYFGEVFCKIHTSTDIMLSSASI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 FHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEEL ::: ::.::: :: ::: : .:... : . : .:: ....:.... : .: ::. CCDS51 FHLSFISIDRYYAVCDPLRYKAKMNILVICVMIFISWSVPAVFAFGMIFLELNFKGAEEI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE9 VVA-LTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLL-FFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQA . : :::.. ... .: :. :.::. :. .: .:.:.::.::: : : :.: CCDS51 YYKHVHCRGGCSVFFSKISGVLTFMTSFYIPGSIMLCVYYRIYLIAKEQARLI-SDANQK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 QSSSESYKERVAK-RERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILV . . .:. ... .::::.:::::.:..::. : :... .:.: ....: :: . ..:. CCDS51 LQIGLEMKNGISQSKERKAVKTLGIVMGVFLICWCPFFICTVMDPFLHYIIPPTLNDVLI 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 WCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD : : ::..::..::::: :: ::.:... ::... ::: .:: : CCDS51 WFGYLNSTFNPMVYAFFYPWFRKALKMMLFGKIFQKDSSRCKLFLELSS 300 310 320 330 >>CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (351 aa) initn: 882 init1: 551 opt: 886 Z-score: 707.3 bits: 139.3 E(32554): 4.5e-33 Smith-Waterman score: 886; 40.2% identity (70.1% similar) in 321 aa overlap (14-333:25-337) 10 20 30 40 pF1KE9 MVNNFSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFG : . :.:: .. : : : .:. .. . .. :: CCDS34 MAVSSEQHELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 NLLVMIAILHFKQLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHT :: ..:.: .:::::::::::: :.: .:::.: :.::.: .::::.::::: ..::.. CCDS34 NLAMIISISYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYY 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 CFDTSFCFASLFHLCCISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFY :: . ..:.:::: ...::. :. :: : ::.:. : ..: : ...:.. . CCDS34 SFDLMLSITSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVF 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 TGANEEGIEELVVALTCVGGCQAPLNQNWVLLCFLL-FFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQA . : .::: . ..: ..: . .:. : :. :: :. :: ::.::: :....: CCDS34 SEAYADGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHA 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 RKIESTASQAQSSSESYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFIT . :.. :. ...: :...::::::::....::. :.: . ..: ..:: : CCDS34 HAINNL-------RENQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFST 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 PPYVYEILVWCVYYNSAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD : ... :.: :.::. :::::.::: :: .:.: :. ::.. . CCDS34 PVVLFDALTWFGYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE 300 310 320 330 340 350 >>CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 (306 aa) initn: 843 init1: 512 opt: 849 Z-score: 679.3 bits: 134.0 E(32554): 1.6e-31 Smith-Waterman score: 849; 40.7% identity (71.3% similar) in 300 aa overlap (35-333:1-292) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 FSQAEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLAAFGNLLVMIAILHFKQLH .:. .. . .. :::: ..:.: .::::: CCDS51 MYSFMAGSIFITIFGNLAMIISISYFKQLH 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 TPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASLFHLC ::::::: :.: .:::.: :.::.: .::::.::::: ..::.. :: . ..:.:::: CCDS51 TPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSITSIFHLC 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 CISVDRYIAVTDPLTYPTKFTVSVSGICIVLSWFFSVTYSFSIFYTGANEEGIEELVVAL ...::. :. :: : ::.:. : ..: : ...:.. .. : .::: . . CCDS51 SVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPVIKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFSEAYADGIEGYDILV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 TCVGGCQAPLNQNWVLLCFLL-FFIPNVAMVFIYSKIFLVAKHQARKIESTASQAQSSSE .: ..: . .:. : :. :: :. :: ::.::: :....:. :.. : CCDS51 ACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHAHAINNL-------RE 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 SYKERVAKRERKAAKTLGIAMAAFLVSWLPYLVDAVIDAYMNFITPPYVYEILVWCVYYN . ...: :...::::::::....::. :.: . ..: ..:: :: ... :.: :.: CCDS51 NQNNQV-KKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPVVLFDALTWFGYFN 210 220 230 240 250 260 310 320 330 340 pF1KE9 SAMNPLIYAFFYQWFGKAIKLIVSGKVLRTDSSTTNLFSEEVETD :. :::::.::: :: .:.: :. ::.. . CCDS51 STCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE 270 280 290 300 >>CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 (413 aa) initn: 548 init1: 328 opt: 434 Z-score: 358.3 bits: 75.0 E(32554): 1.2e-13 Smith-Waterman score: 566; 34.9% identity (66.4% similar) in 298 aa overlap (38-311:33-326) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 AEAVELCYKNVNESCIKTPYSPGPRSILYAVLGFGAVLA------AFGNLLVMIAILHFK :.:.: :.. .:::.::. :: .:. CCDS42 QPGNGSAFLLAPNGSHAPDHDVTQERDEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 QLHTPTNFLIASLACADFLVGVTVMPFSTVRSVESCWYFGDSYCKFHTCFDTSFCFASLF .:.: ::..:.::::::...:..:.::.... . . : ::. .:.: : .:. ::. 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