Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1250
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1250, 1771 aa
1>>>pF1KA1250 1771 - 1771 aa - 1771 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2262+/-0.00132; mu= 5.3274+/- 0.079
mean_var=204.4760+/-40.989, 0's: 0 Z-trim(107.7): 223 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.089692
statistics sampled from 9518 (9755) to 9518 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 4.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42650.1 KIDINS220 gene_id:57498|Hs108|chr2 (1771) 11694 1527.7 0
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CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 654 99.2 1.5e-19
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 654 99.2 1.5e-19
CCDS34003.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2352) 639 97.3 7e-19
CCDS68721.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2490) 639 97.3 7.3e-19
CCDS34004.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2603) 639 97.3 7.6e-19
CCDS4225.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 (2542) 636 96.9 9.8e-19
CCDS4224.1 EIF4EBP3 gene_id:404734|Hs108|chr5 (2617) 636 96.9 1e-18
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 632 96.3 1.1e-18
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 632 96.3 1.1e-18
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 632 96.5 2e-18
CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 604 92.6 9.6e-18
CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 604 92.6 1.1e-17
CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 605 92.8 1.2e-17
CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 605 92.8 1.2e-17
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 605 93.0 2.5e-17
CCDS74619.1 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 993) 581 89.6 6.2e-17
CCDS43372.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 616) 568 87.8 1.3e-16
CCDS43371.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 627) 568 87.8 1.4e-16
CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 520 81.7 1.6e-14
CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 514 80.8 2e-14
CCDS11879.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 301) 502 79.1 2.8e-14
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 506 80.0 7e-14
CCDS33355.2 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 367) 489 77.4 1e-13
CCDS6746.1 INVS gene_id:27130|Hs108|chr9 (1065) 497 78.7 1.2e-13
CCDS9915.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 ( 587) 489 77.5 1.5e-13
CCDS55940.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 ( 635) 489 77.6 1.7e-13
CCDS75319.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 581) 471 75.2 7.7e-13
CCDS77164.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 268) 455 72.9 1.7e-12
CCDS44920.1 ANKRD52 gene_id:283373|Hs108|chr12 (1076) 467 74.8 1.8e-12
CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 ( 784) 456 73.3 3.8e-12
CCDS56442.1 ANKRD6 gene_id:22881|Hs108|chr6 ( 692) 448 72.3 7e-12
CCDS47460.1 ANKRD6 gene_id:22881|Hs108|chr6 ( 722) 432 70.2 3e-11
CCDS56441.1 ANKRD6 gene_id:22881|Hs108|chr6 ( 727) 432 70.2 3.1e-11
CCDS64180.1 ANKDD1B gene_id:728780|Hs108|chr5 ( 528) 424 69.1 4.8e-11
>>CCDS42650.1 KIDINS220 gene_id:57498|Hs108|chr2 (1771 aa)
initn: 11694 init1: 11694 opt: 11694 Z-score: 8185.3 bits: 1527.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11694; 100.0% identity (100.0% similar) in 1771 aa overlap (1-1771:1-1771)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEIVKELIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEIVKELIKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 GANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACYKGRTDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACYKGRTDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 ELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTPLVWAARK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTPLVWAARK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTDKDGNTAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 MIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYADIDIRGQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 DNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRNIEVVELLLDKGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRNIEVVELLLDKGAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VSAVDKKGDTPLHIAIRGRSRKLAELLLRNPKDGRLLYRPNKAGETPYNIDCSHQKSILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VSAVDKKGDTPLHIAIRGRSRKLAELLLRNPKDGRLLYRPNKAGETPYNIDCSHQKSILT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 QIFGARHLSPTETDGDMLGYDLYSSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGSGKSFLLKKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QIFGARHLSPTETDGDMLGYDLYSSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGSGKSFLLKKLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DEMKTFAGQQIEPLFQFSWLIVFLTLLLCGGLGLLFAFTVHPNLGIAVSLSFLALLYIFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DEMKTFAGQQIEPLFQFSWLIVFLTLLLCGGLGLLFAFTVHPNLGIAVSLSFLALLYIFF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 IVIYFGGRREGESWNWAWVLSTRLARHIGYLELLLKLMFVNPPELPEQTTKALPVRFLFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IVIYFGGRREGESWNWAWVLSTRLARHIGYLELLLKLMFVNPPELPEQTTKALPVRFLFT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 DYNRLSSVGGETSLAEMIATLSDACEREFGFLATRLFRVFKTEDTQGKKKWKKTCCLPSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DYNRLSSVGGETSLAEMIATLSDACEREFGFLATRLFRVFKTEDTQGKKKWKKTCCLPSF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 VIFLFIIGCIISGITLLAIFRVDPKHLTVNAVLISIASVVGLAFVLNCRTWWQVLDSLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VIFLFIIGCIISGITLLAIFRVDPKHLTVNAVLISIASVVGLAFVLNCRTWWQVLDSLLN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SQRKRLHNAASKLHKLKSEGFMKVLKCEVELMARMAKTIDSFTQNQTRLVVIIDGLDACE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SQRKRLHNAASKLHKLKSEGFMKVLKCEVELMARMAKTIDSFTQNQTRLVVIIDGLDACE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 QDKVLQMLDTVRVLFSKGPFIAIFASDPHIIIKAINQNLNSVLRDSNINGHDYMRNIVHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QDKVLQMLDTVRVLFSKGPFIAIFASDPHIIIKAINQNLNSVLRDSNINGHDYMRNIVHL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 PVFLNSRGLSNARKFLVTSATNGDVPCSDTTGIQEDADRRVSQNSLGEMTKLGSKTALNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PVFLNSRGLSNARKFLVTSATNGDVPCSDTTGIQEDADRRVSQNSLGEMTKLGSKTALNR
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pF1KA1 RDTYRRRQMQRTITRQMSFDLTKLLVTEDWFSDISPQTMRRLLNIVSVTGRLLRANQISF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RDTYRRRQMQRTITRQMSFDLTKLLVTEDWFSDISPQTMRRLLNIVSVTGRLLRANQISF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 NWDRLASWINLTEQWPYRTSWLILYLEETEGIPDQMTLKTIYERISKNIPTTKDVEPLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NWDRLASWINLTEQWPYRTSWLILYLEETEGIPDQMTLKTIYERISKNIPTTKDVEPLLE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 IDGDIRNFEVFLSSRTPVLVARDVKVFLPCTVNLDPKLREIIADVRAAREQISIGGLAYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IDGDIRNFEVFLSSRTPVLVARDVKVFLPCTVNLDPKLREIIADVRAAREQISIGGLAYP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KA1 PLPLHEGPPRAPSGYSQPPSVCSSTSFNGPFAGGVVSPQPHSSYYSGMTGPQHPFYNRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PLPLHEGPPRAPSGYSQPPSVCSSTSFNGPFAGGVVSPQPHSSYYSGMTGPQHPFYNRPF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA1 FAPYLYTPRYYPGGSQHLISRPSVKTSLPRDQNNGLEVIKEDAAEGLSSPTDSSRGSGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FAPYLYTPRYYPGGSQHLISRPSVKTSLPRDQNNGLEVIKEDAAEGLSSPTDSSRGSGPA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KA1 PGPVVLLNSLNVDAVCEKLKQIEGLDQSMLPQYCTTIKKANINGRVLAQCNIDELKKEMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PGPVVLLNSLNVDAVCEKLKQIEGLDQSMLPQYCTTIKKANINGRVLAQCNIDELKKEMN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KA1 MNFGDWHLFRSTVLEMRNAESHVVPEDPRFLSESSSGPAPHGEPARRASHNELPHTELSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MNFGDWHLFRSTVLEMRNAESHVVPEDPRFLSESSSGPAPHGEPARRASHNELPHTELSS
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pF1KA1 QTPYTLNFSFEELNTLGLDEGAPRHSNLSWQSQTRRTPSLSSLNSQDSSIEISKLTDKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QTPYTLNFSFEELNTLGLDEGAPRHSNLSWQSQTRRTPSLSSLNSQDSSIEISKLTDKVQ
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KA1 AEYRDAYREYIAQMSQLEGGPGSTTISGRSSPHSTYYMGQSSSGGSIHSNLEQEKGKDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AEYRDAYREYIAQMSQLEGGPGSTTISGRSSPHSTYYMGQSSSGGSIHSNLEQEKGKDSE
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA1 PKPDDGRKSFLMKRGDVIDYSSSGVSTNDASPLDPITEEDEKSDQSGSKLLPGKKSSERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PKPDDGRKSFLMKRGDVIDYSSSGVSTNDASPLDPITEEDEKSDQSGSKLLPGKKSSERS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA1 SLFQTDLKLKGSGLRYQKLPSDEDESGTEESDNTPLLKDDKDRKAEGKVERVPKSPEHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SLFQTDLKLKGSGLRYQKLPSDEDESGTEESDNTPLLKDDKDRKAEGKVERVPKSPEHSA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KA1 EPIRTFIKAKEYLSDALLDKKDSSDSGVRSSESSPNHSLHNEVADDSQLEKANLIELEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EPIRTFIKAKEYLSDALLDKKDSSDSGVRSSESSPNHSLHNEVADDSQLEKANLIELEDD
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KA1 SHSGKRGIPHSLSGLQDPIIARMSICSEDKKSPSECSLIASSPEENWPACQKAYNLNRTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SHSGKRGIPHSLSGLQDPIIARMSICSEDKKSPSECSLIASSPEENWPACQKAYNLNRTP
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pF1KA1 STVTLNNNSAPANRANQNFDEMEGIRETSQVILRPSSSPNPTTIQNENLKSMTHKRSQRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 STVTLNNNSAPANRANQNFDEMEGIRETSQVILRPSSSPNPTTIQNENLKSMTHKRSQRS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
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pF1KA1 SYTRLSKDPPELHAAASSESTGFGEERESIL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SYTRLSKDPPELHAAASSESTGFGEERESIL
1750 1760 1770
>>CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880 aa)
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Smith-Waterman score: 654; 33.4% identity (64.4% similar) in 410 aa overlap (24-430:192-595)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEI
::.. . : .. : ::: :::. ::..
CCDS61 HLINYGTKGKVRLPALHIAARNDDTRTAAVLLQNDPNPDVLSKTGFTPLHIAAHYENLNV
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pF1KA1 VKELIKNGANCNLEDLDNWTALISASKEGHVHIVEELLKCGVNLEHRDMGGWTALMWACY
.. :.. ::. :. .. : : ::..:.: .:. :: :...: . : : :
CCDS61 AQLLLNRGASVNFTPQNGITPLHIASRRGNVIMVRLLLDRGAQIETKTKDELTPLHCAAR
230 240 250 260 270 280
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 KGRTDVVELLLSHGANPSVTGLYSVYPIIWAAGRGHADIVHLLLQNGAKVNCSDKYGTTP
.:.. . :.::.::: .. .. :: :: : : :.:::: :... ::
CCDS61 NGHVRISEILLDHGAPIQAKTKNGLSPIHMAAQGDHLDCVRLLLQYDAEIDDITLDHLTP
290 300 310 320 330 340
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LVWAARKGHLECVKHLLAMGADVDQEGANSMTALIVAVKGGYTQSVKEILKRNPNVNLTD
: ::. :: . .: :: :: .... :..: : .: : .... .. .:: . ... .
CCDS61 LHVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTPLHIACKKNHVRVMELLLKTGASIDAVT
350 360 370 380 390 400
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 KDGNTALMIASKEGHTEIVQDLLDAGTYVNIPDRSGDTVLIGAVRGGHVEIVRALLQKYA
..: : : .:: :: ::..::. :. :. . . .: : :.:.::.:... :::. :
CCDS61 ESGLTPLHVASFMGHLPIVKNLLQRGASPNVSNVKVETPLHMAARAGHTEVAKYLLQNKA
410 420 430 440 450 460
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 DIDIRGQDNKTALYWAVEKGNATMVRDILQCNPDTEICTKDGETPLIKATKMRNIEVVEL
.. ...:..: :. :.. :...::. .:. : . .. : :.::: :.. ..:.:
CCDS61 KVNAKAKDDQTPLHCAARIGHTNMVKLLLENNANPNLATTAGHTPLHIAAREGHVETVLA
470 480 490 500 510 520
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 LLDKGAKVSAVDKKGDTPLHIAIRGRSRKLAELLLRNPKDGRLLYRPNKAGE---TPYNI
::.: :. . . ::: ::::.: . . ..:::::. .:.. :: ::. :: ..
CCDS61 LLEKEASQACMTKKGFTPLHVAAKYGKVRVAELLLE--RDAH----PNAAGKNGLTPLHV
530 540 550 560 570
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 DCSHQKSILTQIFGARHLSPTETDGDMLGYDLYSSALADILSEPTMQPPICVGLYAQWGS
:.. ..... : ::
CCDS61 AVHHNNLDIVKLLLPRGGSPHSPAWNGYTPLHIAAKQNQVEVARSLLQYGGSANAESVQG
580 590 600 610 620 630
>>CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881 aa)
initn: 2331 init1: 625 opt: 654 Z-score: 464.4 bits: 99.2 E(32554): 1.5e-19
Smith-Waterman score: 654; 33.4% identity (64.4% similar) in 410 aa overlap (24-430:192-595)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MSVLISQSVINYVEEENIPALKALLEKCKDVDERNECGQTPLMIAAEQGNLEI
::.. . : .. : ::: :::. ::..
CCDS61 HLINYGTKGKVRLPALHIAARNDDTRTAAVLLQNDPNPDVLSKTGFTPLHIAAHYENLNV
170 180 190 200 210 220
60 70 80 90 100 110
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.. ...:..: :. :.. :...::. .:. : . .. : :.::: :.. ..:.:
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CCDS34 LTPPSHDLNRAPRVPVQALPMV-VPPQEPDKPPANVATTLPIRNKAASKQKSSSHLPANS
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CCDS42 GGHLAVVELLLAHGADPTHRLKDGSTMLIEAAKGGHTNVVSYLLDYPNNVLSVPTTDVSQ
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CCDS42 ALMEACMDGHVEVARLLLDSGAQVNMPADSFESPLTLAACGGHVELAALLIERGANLEEV
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pF1KA1 DKYGTTPLVWAARKGHLECVKHLLAMGADVDQEGANSM-TALIVAVKGGYTQSVKEILKR
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CCDS42 NDEGYTPLMEAAREGHEEMVALLLAQGANINAQTEETQETALTLACCGGFSEVADFLIKA
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