Result of FASTA (ccds) for pFN21AA0522
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0522, 1488 aa
  1>>>pF1KA0522 1488 - 1488 aa - 1488 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4933+/-0.00117; mu= -9.6086+/- 0.071
 mean_var=663.8060+/-135.614, 0's: 0 Z-trim(117.1): 71  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.049780
 statistics sampled from 17699 (17765) to 17699 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.789), E-opt: 0.2 (0.546), width:  16
 Scan time:  7.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS48130.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX        (1488) 10335 758.6 3.1e-218
CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX        ( 949) 6119 455.6 3.2e-127
CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3         (1114) 1939 155.5 8.3e-37
CCDS53728.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12      (1182) 1754 142.3 8.6e-33
CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3         ( 963) 1745 141.5 1.2e-32
CCDS31725.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12      ( 759) 1708 138.7 6.3e-32


>>CCDS48130.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX             (1488 aa)
 initn: 10335 init1: 10335 opt: 10335  Z-score: 4031.5  bits: 758.6 E(32554): 3.1e-218
Smith-Waterman score: 10335; 100.0% identity (100.0% similar) in 1488 aa overlap (1-1488:1-1488)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEAGSGPPGGPGSESPNRAVEYLLELNNIIESQQQLLETQRRRIEELEGQLDQLTQENRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MEAGSGPPGGPGSESPNRAVEYLLELNNIIESQQQLLETQRRRIEELEGQLDQLTQENRD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LREESQLHRGELHRDPHGARDSPGRESQYQNLRETQFHHRELRESQFHQAARDVGYPNRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LREESQLHRGELHRDPHGARDSPGRESQYQNLRETQFHHRELRESQFHQAARDVGYPNRE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 GAYQNREAVYRDKERDASYPLQDTTGYTARERDVAQCHLHHENPALGRERGGREAGPAHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GAYQNREAVYRDKERDASYPLQDTTGYTARERDVAQCHLHHENPALGRERGGREAGPAHP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 GREKEAGYSAAVGVGPRPPRERGQLSRGASRSSSPGAGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GREKEAGYSAAVGVGPRPPRERGQLSRGASRSSSPGAGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 NSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSHMGGPPAGVGLPWAQRARLQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSHMGGPPAGVGLPWAQRARLQP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 ASVALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ASVALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 YRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAMAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAMAG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 ARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALN
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 CHPSGPMSEEPGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPPPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CHPSGPMSEEPGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPPPQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 GRPEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GRPEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 DSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAPPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAPPG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 PLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSSRDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSSRDS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 LREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGF
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 LSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKF
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 QSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 KAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVG
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 KKPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KKPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYS
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 FRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRESI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRESI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 AEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGGAKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGGAKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRGAL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 SSSLRDLSDAGKRGRRNSVGSLDSTIEGSVISSPRPHQRMPPPPPPPPPEEYKSQRPVSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SSSLRDLSDAGKRGRRNSVGSLDSTIEGSVISSPRPHQRMPPPPPPPPPEEYKSQRPVSN
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 SSSFLGSLFGSKRGKGPFQMPPPPTGQASASSSSASSTHHHHHHHHHGHSHGGLGVLPDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SSSFLGSLFGSKRGKGPFQMPPPPTGQASASSSSASSTHHHHHHHHHGHSHGGLGVLPDG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 QSKLQALHAQYCQGPGPAPPPYLPPQQPSLPPPPQQPPPLPQLGSIPPPPASAPPVGPHR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QSKLQALHAQYCQGPGPAPPPYLPPQQPSLPPPPQQPPPLPQLGSIPPPPASAPPVGPHR
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 HFHAHGPVPGPQHYTLGRPGRAPRRGAGGHPQFAPHGRHPLHQPTSPLPLYSPAPQHPPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HFHAHGPVPGPQHYTLGRPGRAPRRGAGGHPQFAPHGRHPLHQPTSPLPLYSPAPQHPPA
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 HKQGPKHFIFSHHPQMMPAAGAAGGPGSRPPGGSYSHPHHPQSPLSPHSPIPPHPSYPPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HKQGPKHFIFSHHPQMMPAAGAAGGPGSRPPGGSYSHPHHPQSPLSPHSPIPPHPSYPPL
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480        
pF1KA0 PPPSPHTPHSPLPPTSPHGPLHASGPPGTANPPSANPKAKPSRISTVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PPPSPHTPHSPLPPTSPHGPLHASGPPGTANPPSANPKAKPSRISTVV
             1450      1460      1470      1480        

>>CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX             (949 aa)
 initn: 6113 init1: 6113 opt: 6119  Z-score: 2397.5  bits: 455.6 E(32554): 3.2e-127
Smith-Waterman score: 6119; 96.9% identity (97.9% similar) in 943 aa overlap (211-1151:6-946)

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 GREKEAGYSAAVGVGPRPPRERGQLSRGASRSSSPGAGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGE
                                     :::   :.  :.      :. .:.  .   
CCDS35                          MEPPGRSSRSTAS--HTLHQYCCPTQVLDSMKLTP
                                        10          20        30   

                250       260       270       280       290        
pF1KA0 NSRTV--SVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSHMGGPPAGVGLPWAQRARL
       ..: .  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SGRLAESSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSHMGGPPAGVGLPWAQRARL
            40        50        60        70        80        90   

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 QPASVALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QPASVALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAF
           100       110       120       130       140       150   

      360       370       380       390       400       410        
pF1KA0 RQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAM
           160       170       180       190       200       210   

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 AGARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AGARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEA
           220       230       240       250       260       270   

      480       490       500       510       520       530        
pF1KA0 LNCHPSGPMSEEPGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LNCHPSGPMSEEPGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPP
           280       290       300       310       320       330   

      540       550       560       570       580       590        
pF1KA0 PQGRPEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PQGRPEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEP
           340       350       360       370       380       390   

      600       610       620       630       640       650        
pF1KA0 PSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAP
           400       410       420       430       440       450   

      660       670       680       690       700       710        
pF1KA0 PGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSSR
           460       470       480       490       500       510   

      720       730       740       750       760       770        
pF1KA0 DSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIER
           520       530       540       550       560       570   

      780       790       800       810       820       830        
pF1KA0 GFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALR
           580       590       600       610       620       630   

      840       850       860       870       880       890        
pF1KA0 KFQSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KFQSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSP
           640       650       660       670       680       690   

      900       910       920       930       940       950        
pF1KA0 SVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMI
           700       710       720       730       740       750   

      960       970       980       990      1000      1010        
pF1KA0 VGKKPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VGKKPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVT
           760       770       780       790       800       810   

     1020      1030      1040      1050      1060      1070        
pF1KA0 YSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRE
           820       830       840       850       860       870   

     1080      1090      1100      1110      1120      1130        
pF1KA0 SIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGGAKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGGAKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRG
           880       890       900       910       920       930   

     1140      1150      1160      1170      1180      1190        
pF1KA0 ALSSSLRDLSDAGKRGRRNSVGSLDSTIEGSVISSPRPHQRMPPPPPPPPPEEYKSQRPV
       :::::::::::::                                               
CCDS35 ALSSSLRDLSDAGVCY                                            
           940                                                     

>>CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3              (1114 aa)
 initn: 2770 init1: 1406 opt: 1939  Z-score: 774.3  bits: 155.5 E(32554): 8.3e-37
Smith-Waterman score: 3723; 56.3% identity (73.3% similar) in 1159 aa overlap (243-1339:5-1107)

            220       230       240       250       260       270  
pF1KA0 SSPGAGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGENSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRL-
                                     :   :::.::.:. .:..:::.. :   : 
CCDS74                           MACRRRYFVEGEAPSSETGTSLDSPSAYPQGPLV
                                         10        20        30    

                280         290           300       310        320 
pF1KA0 --SQLPPSS-SHMGGPPAGV--GLPWAQ----RARLQPASVALRKQEEEE-IKRSKALSD
         :.: :.   : .    :.  : :  :    : .:: ..  :::: ::: ::::..::.
CCDS74 PGSSLSPDHYEHTSVGAYGLYSGPPGQQQRTRRPKLQHSTSILRKQAEEEAIKRSRSLSE
           40        50        60        70        80        90    

             330       340       350       360       370       380 
pF1KA0 SYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRMNKNFERLRSSASESRMSR
       :::::.:::::.:::::::::: ...:.::::::::::::.::::::::::: ::.::::
CCDS74 SYELSSDLQDKQVEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNKNFERLRSSMSENRMSR
          100       110       120       130       140       150    

             390       400       410        420       430       440
pF1KA0 RIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASL-DEGAMAGARSHRLERGLPYGGSCGGGI
       ::.:::::::::::  ::... .::::: .:. ..:.. ::         :    ::   
CCDS74 RIVLSNMRMQFSFEGPEKVHS-SYFEGKQVSVTNDGSQLGALVS------P---ECGDLS
          160       170        180       190                200    

               450       460       470       480       490         
pF1KA0 DGGG-SSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSGPMSEEPGSAQLEKR
       .    .: . :..:.. ::::::.::.::::::::::.::::. :    : :.    . :
CCDS74 EPTTLKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCR-SLHTEEAPALDAARAR
          210       220       230       240        250       260   

     500                510       520             530       540    
pF1KA0 ESKEQ---------QEDSSATSFSDLPLYLDDT-----VP-QQSPERLPSTEPPPQGR--
       ... :         . :  ..:.::. ::.:.      .: .:. .:  :::   . :  
CCDS74 DTEPQTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDLRLRAG
           270       280       290       300       310       320   

               550       560       570       580       590         
pF1KA0 ---PEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPP
          :..:: :             .:: .  . . :.   :: .. :::. ::::::::::
CCDS74 GAAPDYWALAH------------KEDKADTDTSCRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEPP
           330                   340       350       360       370 

     600       610       620       630       640       650         
pF1KA0 SDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPA--PA
       :::::::::::.:::..:: .:: .  . .:. :: :: . ::   .  :  : :   : 
CCDS74 SDSSVDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKH-GPHSGAP---KSLPREE-PELRPR
             380       390       400        410          420       

       660       670       680       690       700       710       
pF1KA0 PPGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSS
       :: ::    .:  . .: :.  : .: :.  . ::: ::.:..:.::::.:::::: :::
CCDS74 PPRPL----DSHLAINGSAN--RQSKSES--DYSDG-DNDSINSTSNSNDTINCSSESSS
        430           440           450        460       470       

       720       730       740       750       760       770       
pF1KA0 RDSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIE
       ::::::     : ::::..:.:.:::::::.:::...:::::::::::::::::.:::::
CCDS74 RDSLREQT---LSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIE
       480          490       500       510       520       530    

       780       790       800       810       820       830       
pF1KA0 RGFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDAL
       :::. :::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::.::
CCDS74 RGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEAL
          540       550       560       570       580       590    

       840       850       860       870       880       890       
pF1KA0 RKFQSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYS
       ::::.:::::::::::::::::::::::.:::..::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYS
          600       610       620       630       640       650    

       900       910       920       930       940       950       
pF1KA0 PSVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERM
       :.:: ::::::.::::::::::.::::::..:.:::.::. :::.::.::::::: ::..
CCDS74 PNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKL
          660       670       680       690       700       710    

       960                 970       980       990      1000       
pF1KA0 IVGKKP----------VLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVT
       ::::::          ::::::::::: :.:.::::::.::.:::::::.::::::::::
CCDS74 IVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVT
          720       730       740       750       760       770    

      1010      1020      1030      1040      1050      1060       
pF1KA0 KIFQKKKILVTYSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQ
       :::::::  ::::::::: :  :.. ::.:.::  ::.: :.:::.. :::: ::::. :
CCDS74 KIFQKKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQ
          780       790       800       810       820       830    

      1070      1080      1090      1100      1110       1120      
pF1KA0 DRLRFTSDLRESIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGG-AKDSVNGTMARSSLE
       :: .::.::::::::::::::.:.:::::::::..::. :: ..  :.: :::..:. :.
CCDS74 DRKKFTDDLRESIAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTLSRACLD
          840       850       860       870       880       890    

       1130      1140      1150      1160      1170      1180      
pF1KA0 DTYGAGDGLKRGALSSSLRDLSDAGKRGRRNSVGSLDSTIEGSVISSPRPHQRMPPPPPP
       :.:..:.::::.::::::::::.:::::::.:.:::.:..:::.::::. ..:       
CCDS74 DSYASGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEGSIISSPHMRRRATSTREC
          900       910       920       930       940       950    

       1190      1200      1210      1220      1230      1240      
pF1KA0 PPPEEYKSQRPVSNSSSFLGSLFGSKRGKGPFQMPPPPTGQASASSSSASSTHH------
       :     . .. . ::::.:::::::::::     :::   ::   :. :    :      
CCDS74 PS----RPHQTMPNSSSLLGSLFGSKRGK-----PPP---QAHLPSAPALPPPHPPVVLP
              960       970            980          990      1000  

             1250      1260      1270      1280            1290    
pF1KA0 HHHHHHHGHSHGGLGVLPDGQSKLQALHAQYCQGPGPAPPPYL------PPQQPSLPPPP
       : .:   ::  :    ::  :. ... :.:::.  .  ::::       :::. .     
CCDS74 HLQHSVAGHHLGPPEGLP--QAAMHGHHTQYCHMQN--PPPYHHHHHHHPPQHIQHAHQY
           1010      1020        1030        1040      1050        

           1300        1310      1320      1330      1340      1350
pF1KA0 QQPPP--LPQLGSIPP--PPASAPPVGPHRHFHAHGPVPGPQHYTLGRPGRAPRRGAGGH
       .. :    :  :.     ::  .  ::   : :.. :.: :   . ..:           
CCDS74 HHGPHGGHPAYGAHAHGHPPLPSAHVGHTVHHHGQPPAPPPPTSSKAKPSGISTIV    
     1060      1070      1080      1090      1100      1110        

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
pF1KA0 PQFAPHGRHPLHQPTSPLPLYSPAPQHPPAHKQGPKHFIFSHHPQMMPAAGAAGGPGSRP

>>CCDS53728.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12           (1182 aa)
 initn: 2307 init1: 1696 opt: 1754  Z-score: 702.2  bits: 142.3 E(32554): 8.6e-33
Smith-Waterman score: 2203; 38.4% identity (58.8% similar) in 1310 aa overlap (14-1292:6-1165)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MEAGSGPPGGPGSESPNRAVEYLLELNNIIESQQQLLETQRRRIEELEGQLDQLTQENRD
                    :.: ::: :: ::. :...::.:..:::.::.::: .::.:. :::.
CCDS53         MESLLENPVRAVLYLKELTAIVQNQQSLIHTQRERIDELERRLDELSAENRS
                       10        20        30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 LREESQLHRGELHRDPHGARDSPGRESQYQNLRETQFHHRELRESQFHQAARDVGYPNRE
       : :..::    :. .:      ::                 .  :.    :  .  :   
CCDS53 LWEHQQL----LQAQP-----PPGL----------------VPPSSAPLPAAPATAP--A
                 60                             70        80       

              130       140       150       160        170         
pF1KA0 GAYQNREAVYRDKERDASYPLQDTTGYTARERDVAQCHLHH-ENPALGRERGGREAGPAH
       .: . .: .  . .:.:. :      . : .:   : : .  :.:  :   :.:   :  
CCDS53 AAARAQEPLQDQGQRSAAAP------HPAPDRPPRQHHGQLLEQPQRG--PGSRAHTPQS
          90       100             110       120         130       

     180       190         200       210         220               
pF1KA0 PGREKEAGYSAAVG--VGPRPPRERGQLSRGAS-RSSSPGA-GGG------------HST
       :  .:. : ..::      :::   .  . ::  . .::.: : :            :. 
CCDS53 P--HKHLGTQGAVTDKEKERPPSCCA--AAGALLQHKSPSALGKGVLSRRPENETVLHQF
         140       150       160         170       180       190   

           230        240       250       260       270       280  
pF1KA0 STSTSPATT-LQRKSDGENSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSHMG
          .. : . :  .:::  ... .   :.  .  ..:.  :... :   .:    . .  
CCDS53 CCPAADACSDLASQSDGSCTQAGGGMEDSVVAAAAVAAGRPSAHAPK--AQAQELQEEEE
           200       210       220       230       240         250 

            290       300       310          320       330         
pF1KA0 GPPAGVGLPWAQRARLQPASVALRKQEEEEIK---RSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLER
        : ::.. :   ::  :  .   :.:         .. : :: :::: ::..:..::::.
CCDS53 RPGAGAASP---RAGPQHKASPGRQQPALATALCPHAPAASD-YELSLDLKNKQIEMLEH
             260          270       280       290        300       

     340       350       360       370       380       390         
pF1KA0 KYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEK
       :::: ..::::: :::::::::...::::..:.:  :::. ::: : ..:   :      
CCDS53 KYGGHLVSRRAACTIQTAFRQYQLSKNFEKIRNSLLESRLPRRISLRKVR---SPTAESL
       310       320       330       340       350          360    

     400       410       420       430       440       450         
pF1KA0 AQNPAYFEGKPASLDEGAMAGARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITE
       : . : .::       : .          :::              : .    :.. .::
CCDS53 AAEKALMEGY------GLV----------GLPLV-----------RSPSLPPTFAGTLTE
          370                       380                  390       

     460       470       480         490       500       510       
pF1KA0 LEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSGPMS--EEPGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLP
       :::::..::.:::.:::.::.      :   .: :. ::       .:  ..:..   : 
CCDS53 LEDSFTEQVQSLAKSIDDALSTWSLKTMCSLRESGAYQL-------HQALQAAAGPPGL-
       400       410       420       430              440          

       520       530       540       550       560       570       
pF1KA0 LYLDDTVPQQSPERLPSTEPPPQGRPEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPG
                ..  : : .  :  :       :   :  ::. :::               
CCDS53 ---------EAEGRAPESAGPGPG-----DDAAETPGLPPAHSGTLM-------------
              450       460            470       480               

       580       590       600       610       620        630      
pF1KA0 CLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYE-ADGCSPHGTLKHKG
        .  ::  .. :.  . .     .::. ::  .  :.   :   : : : . .:  . . 
CCDS53 -MAFRDVTVQIANQNISV-----SSSTALSVANCLGAQTVQAPAEPAAGKAEQGETSGRE
             490            500       510       520       530      

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pF1KA0 PPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAPPGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAA-GENSDGGD
        : .::   :.  . :       .    : ...:.:.     ..    :.. : ....::
CCDS53 AP-EAPAVGREDASAEDSCAEAAA--SGAADGATAPKTEEEEEEEETAEVGRGAEAEAGD
         540       550         560       570       580       590   

         700       710          720       730       740       750  
pF1KA0 NESLESSSNSNETINC---SSGSSSRDSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVV
        :.: :::.:... .    .:.:.:.:.:.   :  :    :. :.  :  ::....:..
CCDS53 LEQLSSSSTSTKSAKSGSEASASASKDALQ---AMILSLPRYHCENPASCKSPTLSTDTL
           600       610       620          630       640       650

            760       770       780       790       800       810  
pF1KA0 QRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQK
       ..: ::::::::: .:.::::.:: :::. :::.:::::.:.::::::::::::::: .:
CCDS53 RKRLYRIGLNLFNINPDKGIQFLISRGFIPDTPIGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNSKK
              660       670       680       690       700       710

            820       830       840       850       860       870  
pF1KA0 QFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKFQSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALV
       :::::::::::::::::::.::.::::::.:::::::::::::::::::::::.::: .:
CCDS53 QFNRDVLDCVVDEMDFSSMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCMCNPEVV
              720       730       740       750       760       770

            880       890       900       910       920       930  
pF1KA0 RQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGI
       .::.::::::::::::::::::::::..: .::: :.:::.::::::.: ::::.:.:::
CCDS53 QQFHNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNIKPDRKMMLEDFIRNLRGVDDGADIPRELVVGI
              780       790       800       810       820       830

            940       950       960       970       980       990  
pF1KA0 YQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVGKKPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGL
       :.::: .::..:.:::. :  ::. ::: : :::.:::::::: .:.:: : :. :. . 
CCDS53 YERIQQKELKSNEDHVTYVTKVEKSIVGMKTVLSVPHRRLVCCSRLFEVTDVNKLQKQAA
              840       850       860       870       880       890

           1000      1010      1020      1030      1040      1050  
pF1KA0 HQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPG
       :::::::::::::. :.  :::   ::.: .:  :. :..:::.: ::. :: :.. . :
CCDS53 HQREVFLFNDLLVILKLCPKKKSSSTYTFCKSVGLLGMQFQLFENEYYSHGITLVTPLSG
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pF1KA0 GERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRESIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGGA
       .:.: .. : : . ..  .:. ::.:::::: :.:. :.: :::::.:  .  . .: ::
CCDS53 SEKKQVLHFCALGSDEMQKFVEDLKESIAEVTELEQIRIEWELEKQQGT-KTLSFKPCGA
              960       970       980       990       1000         

           1120      1130      1140      1150       1160      1170 
pF1KA0 KDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRGALSSSLRDLSDAGKRGRRNS-VGSLDSTIEGSVI
       . . .. ..  . .   .  .   : : :.   .. .  . ...:: .:.  ..      
CCDS53 QGDPQSKQGSPTAKREAALRE---RPAESTVEVSIHNRLQTSQHNSGLGAERGAPVPPPD
    1010      1020      1030         1040      1050      1060      

            1180      1190      1200      1210      1220      1230 
pF1KA0 SSPRPHQRMPPPPPPPPPEEYKSQRPVSNSSSFLGSLFGSKRGKGPFQMPPPPTGQASAS
        .: : ... :: :::::       :        :.:   ..    . .  :  ..    
CCDS53 LQPSPPRQQTPPLPPPPPTP-----P--------GTLVQCQQIVKVIVLDKPCLARMEPL
       1070      1080                   1090      1100      1110   

            1240      1250       1260      1270       1280         
pF1KA0 SSSASSTHHHHHHHHHGHSH-GGLGVLPDGQSKLQALHAQYCQGP-GPAPPPYLPPQQPS
        :.: : .        : .  :: :      : ... :    : :  : ::::  :.:  
CCDS53 LSQALSCYTSSSSDSCGSTPLGGPG------SPVKVTH----QPPLPPPPPPYNHPHQFC
          1120      1130            1140          1150      1160   

    1290      1300      1310      1320      1330      1340         
pF1KA0 LPPPPQQPPPLPQLGSIPPPPASAPPVGPHRHFHAHGPVPGPQHYTLGRPGRAPRRGAGG
        ::                                                         
CCDS53 -PPGSLLHGHRYSSGSRSLV                                        
           1170      1180                                          

>>CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3              (963 aa)
 initn: 2687 init1: 1406 opt: 1745  Z-score: 699.8  bits: 141.5 E(32554): 1.2e-32
Smith-Waterman score: 3466; 60.8% identity (78.2% similar) in 967 aa overlap (247-1167:23-949)

        220       230       240       250       260       270      
pF1KA0 AGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGENSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRL---SQ
                                     :::.::.:. .:..:::.. :   :   :.
CCDS33         MWCLHCNSERTQSLLELELDSGVEGEAPSSETGTSLDSPSAYPQGPLVPGSS
                       10        20        30        40        50  

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pF1KA0 LPPSS-SHMGGPPAGV--GLPWAQ----RARLQPASVALRKQEEEE-IKRSKALSDSYEL
       : :.   : .    :.  : :  :    : .:: ..  :::: ::: ::::..::.::::
CCDS33 LSPDHYEHTSVGAYGLYSGPPGQQQRTRRPKLQHSTSILRKQAEEEAIKRSRSLSESYEL
             60        70        80        90       100       110  

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pF1KA0 STDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIIL
       :.:::::.:::::::::: ...:.::::::::::::.::::::::::: ::.::::::.:
CCDS33 SSDLQDKQVEMLERKYGGRLVTRHAARTIQTAFRQYQMNKNFERLRSSMSENRMSRRIVL
            120       130       140       150       160       170  

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pF1KA0 SNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASL-DEGAMAGARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGG
       ::::::::::  ::... .::::: .:. ..:.. ::           .  ::   .   
CCDS33 SNMRMQFSFEGPEKVHS-SYFEGKQVSVTNDGSQLGAL---------VSPECGDLSEPTT
            180        190       200                210       220  

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pF1KA0 -SSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSGPMSEEPGSAQLEKRESKE
        .: . :..:.. ::::::.::.::::::::::.::::. :    : :.    . :... 
CCDS33 LKSPAPSSDFADAITELEDAFSRQVKSLAESIDDALNCR-SLHTEEAPALDAARARDTEP
            230       240       250       260        270       280 

                    510       520             530       540        
pF1KA0 Q---------QEDSSATSFSDLPLYLDDT-----VP-QQSPERLPSTEPPPQGR-----P
       :         . :  ..:.::. ::.:.      .: .:. .:  :::   . :     :
CCDS33 QTALHGMDHRKLDEMTASYSDVTLYIDEEELSPPLPLSQAGDRPSSTESDLRLRAGGAAP
             290       300       310       320       330       340 

           550       560       570       580       590       600   
pF1KA0 EFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSS
       ..:: :             .:: .  . . :.   :: .. :::. ::::::::::::::
CCDS33 DYWALAH------------KEDKADTDTSCRSTPSLERQEQRLRVEHLPLLTIEPPSDSS
                         350       360       370       380         

           610       620       630       640       650         660 
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       :::::::.:::..:: .:: .  . .:. :: :: . ::   .  :  : :   : :: :
CCDS33 VDLSDRSERGSLKRQSAYERSLGGQQGSPKH-GPHSGAP---KSLPREE-PELRPRPPRP
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pF1KA0 LPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSSRDSL
       :    .:  . .: :.  : .: :.  . ::: ::.:..:.::::.:::::: :::::::
CCDS33 L----DSHLAINGSAN--RQSKSES--DYSDG-DNDSINSTSNSNDTINCSSESSSRDSL
              450         460          470       480       490     

             730       740       750       760       770       780 
pF1KA0 REPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGFL
       ::     : ::::..:.:.:::::::.:::...:::::::::::::::::.::::::::.
CCDS33 REQT---LSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPEKGVQYLIERGFV
            500       510       520       530       540       550  

             790       800       810       820       830       840 
pF1KA0 SDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKFQ
        :::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::.::::::
CCDS33 PDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSTMELDEALRKFQ
            560       570       580       590       600       610  

             850       860       870       880       890       900 
pF1KA0 SHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSVK
       .:::::::::::::::::::::::.:::..:::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS33 AHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNVK
            620       630       640       650       660       670  

             910       920       930       940       950       960 
pF1KA0 AERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVGK
        ::::::.::::::::::.::::::..:.:::.::. :::.::.::::::: ::..::::
CCDS33 PERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQVQKVEKLIVGK
            680       690       700       710       720       730  

                       970       980       990      1000      1010 
pF1KA0 KP----------VLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQ
       ::          ::::::::::: :.:.::::::.::.:::::::.::::::::::::::
CCDS33 KPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLFNDLLVVTKIFQ
            740       750       760       770       780       790  

            1020      1030      1040      1050      1060      1070 
pF1KA0 KKKILVTYSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQDRLR
       :::  ::::::::: :  :.. ::.:.::  ::.: :.:::.. :::: ::::. ::: .
CCDS33 KKKNSVTYSFRQSFSLYGMQVLLFENQYYPNGIRLTSSVPGADIKVLINFNAPNPQDRKK
            800       810       820       830       840       850  

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pF1KA0 FTSDLRESIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGG-AKDSVNGTMARSSLEDTYG
       ::.::::::::::::::.:.:::::::::..::. :: ..  :.: :::..:. :.:.:.
CCDS33 FTDDLRESIAEVQEMEKHRIESELEKQKGVVRPSMSQCSSLKKESGNGTLSRACLDDSYA
            860       870       880       890       900       910  

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pF1KA0 AGDGLKRGALSSSLRDLSDAGKRGRRNSVGSLDSTIEGSVISSPRPHQRMPPPPPPPPPE
       .:.::::.::::::::::.:::::::.:.:::.:..:                       
CCDS33 SGEGLKRSALSSSLRDLSEAGKRGRRSSAGSLESNVEFQPFEPLQPSVLCS         
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pF1KA0 EYKSQRPVSNSSSFLGSLFGSKRGKGPFQMPPPPTGQASASSSSASSTHHHHHHHHHGHS

>>CCDS31725.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12           (759 aa)
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         310       320       330       340       350       360     
pF1KA0 RKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRMNK
                                     :::.:::: ..::::: :::::::::...:
CCDS31                               MLEHKYGGHLVSRRAACTIQTAFRQYQLSK
                                             10        20        30

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pF1KA0 NFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAMAGARSHR
       :::..:.:  :::. ::: : ..:   :      : . : .::       : .       
CCDS31 NFEKIRNSLLESRLPRRISLRKVR---SPTAESLAAEKALMEGY------GLV-------
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pF1KA0 LERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSG
          :::              : .    :.. .:::::::..::.:::.:::.::.     
CCDS31 ---GLPLV-----------RSPSLPPTFAGTLTELEDSFTEQVQSLAKSIDDALSTWSLK
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pF1KA0 PMS--EEPGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPPPQGRP
        :   .: :. ::       .:  ..:..   :          ..  : : .  :  :  
CCDS31 TMCSLRESGAYQL-------HQALQAAAGPPGL----------EAEGRAPESAGPGPGD-
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pF1KA0 EFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSS
            :   :  ::. :::                .  ::  .. :.  . .     .::
CCDS31 ----DAAETPGLPPAHSGTL--------------MMAFRDVTVQIANQNISV-----SSS
                170                     180       190              

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pF1KA0 VDLSDRSDRGSVHRQLVYE-ADGCSPHGTLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAPPGPL
       . ::  .  :.   :   : : : . .:  . .  : .::   :.  . :       .  
CCDS31 TALSVANCLGAQTVQAPAEPAAGKAEQGETSGREAP-EAPAVGREDASAEDSCAEAAA--
     200       210       220       230        240       250        

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pF1KA0 PPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAA-GENSDGGDNESLESSSNSNETINC---SSGSSSR
         : ...:.:.     ..    :.. : ....:: :.: :::.:... .    .:.:.:.
CCDS31 SGAADGATAPKTEEEEEEEETAEVGRGAEAEAGDLEQLSSSSTSTKSAKSGSEASASASK
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pF1KA0 DSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIER
       :.:.   :  :    :. :.  :  ::....:....: ::::::::: .:.::::.:: :
CCDS31 DALQ---AMILSLPRYHCENPASCKSPTLSTDTLRKRLYRIGLNLFNINPDKGIQFLISR
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pF1KA0 GFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALR
       ::. :::.:::::.:.::::::::::::::: .::::::::::::::::::::.::.:::
CCDS31 GFIPDTPIGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNSKKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMELDEALR
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       :::.:::::::::::::::::::::::.::: .:.::.::::::::::::::::::::::
CCDS31 KFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCMCNPEVVQQFHNPDTIFILAFAIILLNTDMYSP
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pF1KA0 SVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMI
       ..: .::: :.:::.::::::.: ::::.:.::::.::: .::..:.:::. :  ::. :
CCDS31 NIKPDRKMMLEDFIRNLRGVDDGADIPRELVVGIYERIQQKELKSNEDHVTYVTKVEKSI
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pF1KA0 VGKKPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVT
       :: : :::.:::::::: .:.:: : :. :. . :::::::::::::. :.  :::   :
CCDS31 VGMKTVLSVPHRRLVCCSRLFEVTDVNKLQKQAAHQREVFLFNDLLVILKLCPKKKSSST
           560       570       580       590       600       610   

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pF1KA0 YSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRE
       :.: .:  :. :..:::.: ::. :: :.. . :.:.: .. : : . ..  .:. ::.:
CCDS31 YTFCKSVGLLGMQFQLFENEYYSHGITLVTPLSGSEKKQVLHFCALGSDEMQKFVEDLKE
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pF1KA0 SIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGGAKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRG
       ::::: :.:. :.: :::::.:  .  . .: ::.                         
CCDS31 SIAEVTELEQIRIEWELEKQQGT-KTLSFKPCGAQGDPQSKQGSPTAKREAALRERPAES
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CCDS31 TVEVLINASPARLTILPISRDTIKSYC                                 
            740       750                                          




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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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