Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3825
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3825, 2610 aa
  1>>>pF1KE3825 2610 - 2610 aa - 2610 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2813+/-0.00136; mu= 12.1491+/- 0.081
 mean_var=223.3157+/-45.558, 0's: 0 Z-trim(107.0): 141  B-trim: 57 in 1/50
 Lambda= 0.085825
 statistics sampled from 9184 (9320) to 9184 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.286), width:  16
 Scan time:  8.450

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41939.1 HECTD1 gene_id:25831|Hs108|chr14       (2610) 17298 2157.6       0
CCDS63145.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2         (1722)  573 86.5 1.3e-15
CCDS33391.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2         (1992)  573 86.6 1.4e-15
CCDS63146.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2         (2040)  573 86.6 1.5e-15


>>CCDS41939.1 HECTD1 gene_id:25831|Hs108|chr14            (2610 aa)
 initn: 17298 init1: 17298 opt: 17298  Z-score: 11583.4  bits: 2157.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 17298; 100.0% identity (100.0% similar) in 2610 aa overlap (1-2610:1-2610)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 FLDESAPDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FLDESAPDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 EQCVKVLELICTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EQCVKVLELICTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 DSSLEICVESLSSLLKHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DSSLEICVESLSSLLKHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 AAAGGTVSGPSSACKPGRSTTGAPSTTADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPVVTHDLLRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AAAGGTVSGPSSACKPGRSTTGAPSTTADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPVVTHDLLRS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 ELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVDLLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVDLLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 RSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVNFMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVNFMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 DVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDLRDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDLRDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQ
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 SPGDWMCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPKGDPEMAPIYLKRLLPVFAQTFQQTMLPSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SPGDWMCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPKGDPEMAPIYLKRLLPVFAQTFQQTMLPSI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 RKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDVGHNLPTILVEITATVLDQEDDDDGHLLALQII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDVGHNLPTILVEITATVLDQEDDDDGHLLALQII
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 RDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSTLAGPSSDDENEEESKPEKEDEPQEDAKELQQGKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSTLAGPSSDDENEEESKPEKEDEPQEDAKELQQGKP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 YHWRDWSIIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGSDSSES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YHWRDWSIIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGSDSSES
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 RSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSAPGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSAPGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATI
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 LKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVRTMARDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVRTMARDL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 YDDHFKAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIESENTWRDLMKTALENLIVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YDDHFKAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIESENTWRDLMKTALENLIVLL
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 KDENTISPYEMCSSGLVQALLTVLNNSMDLDMKQDCSQLVERINVFKTAFSENEDDESRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KDENTISPYEMCSSGLVQALLTVLNNSMDLDMKQDCSQLVERINVFKTAFSENEDDESRP
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 AVALIRKLIAVLESIERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AVALIRKLIAVLESIERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRML
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 KMEPLATVESLEQYLLKMVAKQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFIFRHQHDFDENGIIYWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KMEPLATVESLEQYLLKMVAKQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFIFRHQHDFDENGIIYWI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 GTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSEGRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSEGRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAID
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 LGLWVIPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQVSKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LGLWVIPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQVSKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 DPPKDEKQGWRHVRIKQMGKNASGQTHYLSLSGFELYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DPPKDEKQGWRHVRIKQMGKNASGQTHYLSLSGFELYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLR
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 RQRRLVRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGSPQGEGTVTGELHNGWIDVTWDAGGSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RQRRLVRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGSPQGEGTVTGELHNGWIDVTWDAGGSN
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 SYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVKNNCPDKTSAAAGSSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVKNNCPDKTSAAAGSSS
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 RKGSSSSVCSVASSSDISLGSTKTERRSEIVMEHSIVSGADVHEPIVVLSSAENVPQTEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RKGSSSSVCSVASSSDISLGSTKTERRSEIVMEHSIVSGADVHEPIVVLSSAENVPQTEV
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 GSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRTPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVSELTNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRTPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVSELTNK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 EAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 TNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVTSSSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVTSSSN
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 VATATTVLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VATATTVLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDED
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 LPEPDEEDDENEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRSDVTHHAVTSQLPQVPAGAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LPEPDEEDDENEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRSDVTHHAVTSQLPQVPAGAGS
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE3 RPIGEQEEEEYETKGGRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RPIGEQEEEEYETKGGRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGT
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE3 PHSELLEEVECTPSPRLALTLKVTGLGTTREVELPLTNFRSTIFYYVQKLLQLSCNGNVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PHSELLEEVECTPSPRLALTLKVTGLGTTREVELPLTNFRSTIFYYVQKLLQLSCNGNVK
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE3 SDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKEKENGKMGCWSIEHVEQYLGTDELPKNDLITYLQKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKEKENGKMGCWSIEHVEQYLGTDELPKNDLITYLQKN
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE3 ADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAAYKDFCEHGTKSGLNQGAISTLQSSDILNLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAAYKDFCEHGTKSGLNQGAISTLQSSDILNLT
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KE3 KEQPQAKAGNGQNSCGVEDVLQLLRILYIVASDPYSRISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KEQPQAKAGNGQNSCGVEDVLQLLRILYIVASDPYSRISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKK
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KE3 ITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQN
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KE3 RREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWAENVMQIHADRKSVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWAENVMQIHADRKSVLE
             2110      2120      2130      2140      2150      2160

             2170      2180      2190      2200      2210      2220
pF1KE3 VEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGAWLCDDNFPDDESRHVDLGGGLKPPGYYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGAWLCDDNFPDDESRHVDLGGGLKPPGYYV
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KE3 QRSCGLFTAPFPQDSDELERITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QRSCGLFTAPFPQDSDELERITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIK
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

             2290      2300      2310      2320      2330      2340
pF1KE3 SNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWF
             2290      2300      2310      2320      2330      2340

             2350      2360      2370      2380      2390      2400
pF1KE3 NGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQILSNKGLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQILSNKGLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSG
             2350      2360      2370      2380      2390      2400

             2410      2420      2430      2440      2450      2460
pF1KE3 PPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGEDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGEDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQK
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

             2470      2480      2490      2500      2510      2520
pF1KE3 QMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGF
             2470      2480      2490      2500      2510      2520

             2530      2540      2550      2560      2570      2580
pF1KE3 LRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVRKVDATDASYPSVNTCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVRKVDATDASYPSVNTCV
             2530      2540      2550      2560      2570      2580

             2590      2600      2610
pF1KE3 HYLKLPEYSSEEIMRERLLAATMEKGFHLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HYLKLPEYSSEEIMRERLLAATMEKGFHLN
             2590      2600      2610

>>CCDS63145.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2              (1722 aa)
 initn: 1129 init1: 394 opt: 573  Z-score: 393.8  bits: 86.5 E(32554): 1.3e-15
Smith-Waterman score: 1012; 30.4% identity (58.0% similar) in 754 aa overlap (1872-2610:1096-1722)

            1850      1860      1870      1880        1890         
pF1KE3 TIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKEKEN--GKMGCWSIEHV
                                     ..:. .. ..:  .. :  :. : :.  :.
CCDS63 NSGNVRHRLQFYIGEHLLPYNMTVYQAVRQFSIQAEDERESTDDESNPLGRAGIWTKTHT
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

    1900        1910      1920      1930      1940      1950       
pF1KE3 EQY--LGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAAYKDFCEH
         :  .  ::  ..: .   .  :..:         :. : :. .. ..:   ..:    
CCDS63 IWYKPVREDEESNKDCVGGKRGRAQTA--------PTKTSPRNAKKHDEL---WHD----
        1130      1140      1150              1160         1170    

      1960      1970      1980      1990      2000      2010       
pF1KE3 GTKSGLNQGAISTLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQNSCGVEDVLQLLRILYIVASDPYSR
       :.  ....     :  .   :.: :.:.             ::. :::.:. ..   :  
CCDS63 GVCPSVSNPLEVYLIPTPPENITFEDPSL------------DVILLLRVLHAISRYWYYL
             1180      1190                  1200      1210        

      2020      2030      2040      2050      2060      2070       
pF1KE3 ISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPF
        ..    :     .: .:: ..:.:.:  .:...::.. .: .: :  .: . :::..::
CCDS63 YDNAMCKE----IIPTSEFINSKLTAKANRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPF
     1220          1230      1240      1250      1260      1270    

      2080      2090      2100      2110      2120       2130      
pF1KE3 ETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVG-RLKHERVKVP
       .:::. :  :::  .::.  : .          :.  . ..:  . ::. :: ...  : 
CCDS63 DTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLD----------TNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVN
         1280      1290                1300      1310      1320    

       2140      2150      2160      2170      2180      2190      
pF1KE3 RGESLMEWAENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGAWLCD
       : : :.. ::.:::  .. ...::... .: ::::::::::::::. :.::.::: :   
CCDS63 R-EELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLW---
          1330      1340      1350      1360      1370      1380   

       2200      2210        2220      2230        2240      2250  
pF1KE3 DNFPDDESRHVDLGG--GLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSD--ELERITKLFHFLGIFL
             ....: :..  : .    :.:   :::. :: . .   .. ..   :.::: ..
CCDS63 ------RGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLM
                   1390      1400      1410      1420      1430    

           2260      2270      2280      2290      2300      2310  
pF1KE3 AKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHD
       :: :.: ::::::.. ::.: :                           ..:.:      
CCDS63 AKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWML--------------------------RQETS------
         1440      1450                                1460        

           2320      2330      2340      2350      2360      2370  
pF1KE3 SLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWFNGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQ
                                      :: .:.  ..:  :: . ...:.. ....
CCDS63 -------------------------------LTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKR
                                          1470      1480      1490 

           2380      2390      2400      2410      2420      2430  
pF1KE3 ILSNKGLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSG
       . ..:. ...  .  :. :....        :.:::::.: . :     ::  ..:: .:
CCDS63 LEQDKSQTKESLQYALETLTMNG-------CSVEDLGLDFTL-P-----GFPNIELKKGG
            1500      1510             1520            1530        

           2440      2450      2460      2470      2480      2490  
pF1KE3 EDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCG
       .:  .:. : :::. :.. . .. :...:...:::::..:::. .:. :  ::....:::
CCDS63 KDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCG
     1540      1550      1560      1570      1580      1590        

           2500      2510      2520      2530      2540      2550  
pF1KE3 NQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGG
       ... .: :. ...  .:  :::.:: .   . ..: ........ ::::.::   :: ::
CCDS63 SKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGG
     1600      1610      1620      1630      1640      1650        

           2560          2570      2580      2590      2600        
pF1KE3 LANLHPRLTVVRKV----DATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLAATME--KG
       . .:.: ::.:::.    .  :   ::: :::.:::::.::: :::::.:: :. :  ..
CCDS63 FRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQS
     1660      1670      1680      1690      1700      1710        

       2610
pF1KE3 FHLN
       :::.
CCDS63 FHLS
     1720  

>>CCDS33391.1 TRIP12 gene_id:9320|Hs108|chr2              (1992 aa)
 initn: 1055 init1: 394 opt: 573  Z-score: 393.0  bits: 86.6 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 1012; 30.4% identity (58.0% similar) in 754 aa overlap (1872-2610:1366-1992)

            1850      1860      1870      1880        1890         
pF1KE3 TIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKEKEN--GKMGCWSIEHV
                                     ..:. .. ..:  .. :  :. : :.  :.
CCDS33 NSGNVRHRLQFYIGEHLLPYNMTVYQAVRQFSIQAEDERESTDDESNPLGRAGIWTKTHT
        1340      1350      1360      1370      1380      1390     

    1900        1910      1920      1930      1940      1950       
pF1KE3 EQY--LGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAAYKDFCEH
         :  .  ::  ..: .   .  :..:         :. : :. .. ..:   ..:    
CCDS33 IWYKPVREDEESNKDCVGGKRGRAQTA--------PTKTSPRNAKKHDEL---WHD----
        1400      1410      1420              1430         1440    

      1960      1970      1980      1990      2000      2010       
pF1KE3 GTKSGLNQGAISTLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQNSCGVEDVLQLLRILYIVASDPYSR
       :.  ....     :  .   :.: :.:.             ::. :::.:. ..   :  
CCDS33 GVCPSVSNPLEVYLIPTPPENITFEDPSL------------DVILLLRVLHAISRYWYYL
             1450      1460                  1470      1480        

      2020      2030      2040      2050      2060      2070       
pF1KE3 ISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPF
        ..    :     .: .:: ..:.:.:  .:...::.. .: .: :  .: . :::..::
CCDS33 YDNAMCKE----IIPTSEFINSKLTAKANRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPF
     1490          1500      1510      1520      1530      1540    

      2080      2090      2100      2110      2120       2130      
pF1KE3 ETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVG-RLKHERVKVP
       .:::. :  :::  .::.  : .          :.  . ..:  . ::. :: ...  : 
CCDS33 DTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLD----------TNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVN
         1550      1560                1570      1580      1590    

       2140      2150      2160      2170      2180      2190      
pF1KE3 RGESLMEWAENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGAWLCD
       : : :.. ::.:::  .. ...::... .: ::::::::::::::. :.::.::: :   
CCDS33 R-EELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLW---
          1600      1610      1620      1630      1640      1650   

       2200      2210        2220      2230        2240      2250  
pF1KE3 DNFPDDESRHVDLGG--GLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSD--ELERITKLFHFLGIFL
             ....: :..  : .    :.:   :::. :: . .   .. ..   :.::: ..
CCDS33 ------RGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLM
                   1660      1670      1680      1690      1700    

           2260      2270      2280      2290      2300      2310  
pF1KE3 AKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHD
       :: :.: ::::::.. ::.: :                           ..:.:      
CCDS33 AKAIMDFRLVDLPLGLPFYKWML--------------------------RQETS------
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pF1KE3 SLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWFNGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQ
                                      :: .:.  ..:  :: . ...:.. ....
CCDS33 -------------------------------LTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKR
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pF1KE3 ILSNKGLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSG
       . ..:. ...  .  :. :....        :.:::::.: . :     ::  ..:: .:
CCDS33 LEQDKSQTKESLQYALETLTMNG-------CSVEDLGLDFTL-P-----GFPNIELKKGG
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pF1KE3 EDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCG
       .:  .:. : :::. :.. . .. :...:...:::::..:::. .:. :  ::....:::
CCDS33 KDIPVTIHNLEEYLRLVIFWALNEGVSRQFDSFRDGFESVFPLSHLQYFYPEELDQLLCG
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pF1KE3 NQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGG
       ... .: :. ...  .:  :::.:: .   . ..: ........ ::::.::   :: ::
CCDS33 SKADTWDAKTLMECCRPDHGYTHDSRAVKFLFEILSSFDNEQQRLFLQFVTGSPRLPVGG
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       . .:.: ::.:::.    .  :   ::: :::.:::::.::: :::::.:: :. :  ..
CCDS33 FRSLNPPLTIVRKTFESTENPDDFLPSVMTCVNYLKLPDYSSIEIMREKLLIAAREGQQS
     1930      1940      1950      1960      1970      1980        

       2610
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       :::.
CCDS33 FHLS
     1990  

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CCDS63 IWYKPVREDEESNKDCVGGKRGRAQTA--------PTKTSPRNAKKHDEL---WHD----
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pF1KE3 GTKSGLNQGAISTLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQNSCGVEDVLQLLRILYIVASDPYSR
       :.  ....     :  .   :.: :.:.             ::. :::.:. ..   :  
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        ..    :     .: .:: ..:.:.:  .:...::.. .: .: :  .: . :::..::
CCDS63 YDNAMCKE----IIPTSEFINSKLTAKANRQLQDPLVIMTGNIPTWLTELGKTCPFFFPF
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pF1KE3 ETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVG-RLKHERVKVP
       .:::. :  :::  .::.  : .          :.  . ..:  . ::. :: ...  : 
CCDS63 DTRQMLFYVTAFDRDRAMQRLLD----------TNPEINQSDSQDSRVAPRLDRKKRTVN
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       : : :.. ::.:::  .. ...::... .: ::::::::::::::. :.::.::: :   
CCDS63 R-EELLKQAESVMQDLGSSRAMLEIQYENEVGTGLGPTLEFYALVSQELQRADLGLW---
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pF1KE3 DNFPDDESRHVDLGG--GLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSD--ELERITKLFHFLGIFL
             ....: :..  : .    :.:   :::. :: . .   .. ..   :.::: ..
CCDS63 ------RGEEVTLSNPKGSQEGTKYIQNLQGLFALPFGRTAKPAHIAKVKMKFRFLGKLM
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CCDS63 -------------------------------LTSHDLFDIDPVVARSVYHLEDIVRQKKR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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