FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3278, 909 aa 1>>>pF1KB3278 909 - 909 aa - 909 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5923+/-0.000916; mu= 19.5297+/- 0.055 mean_var=69.5202+/-13.838, 0's: 0 Z-trim(105.5): 64 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.153822 statistics sampled from 8368 (8433) to 8368 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16 Scan time: 3.970 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 938) 5712 1277.3 0 CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 885) 5709 1276.6 0 CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 901) 5709 1276.6 0 CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 943) 4476 1003.0 0 CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 906) 4473 1002.3 0 CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043) 934 216.9 1.5e-55 CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115) 928 215.6 4e-55 CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336) 851 198.6 6.6e-50 CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 920) 835 195.0 5.6e-49 CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 908) 834 194.7 6.5e-49 CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 918) 827 193.2 1.9e-48 CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 949) 827 193.2 2e-48 CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281) 826 193.0 3e-48 CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464) 826 193.1 3.3e-48 CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 869) 822 192.1 3.9e-48 CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 892) 822 192.1 4e-48 CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12 (1484) 815 190.6 1.8e-47 CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 ( 873) 796 186.3 2.2e-46 CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 (1233) 796 186.4 2.9e-46 CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 905) 776 181.9 4.8e-45 CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1 ( 919) 773 181.2 7.8e-45 CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 934) 768 180.1 1.7e-44 CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 980) 735 172.8 2.8e-42 CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 981) 723 170.1 1.8e-41 CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11 ( 956) 708 166.8 1.8e-40 CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 (1007) 626 148.6 5.5e-35 CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 ( 912) 590 140.6 1.3e-32 CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 836) 549 131.5 6.6e-30 CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 549 131.5 6.9e-30 CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 549 131.5 6.9e-30 CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10 (1009) 547 131.1 1.1e-29 CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 826) 542 129.9 1.9e-29 CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 837) 542 129.9 1.9e-29 CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 542 129.9 2.1e-29 CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 542 129.9 2.1e-29 CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 542 129.9 2.1e-29 CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 542 129.9 2.1e-29 CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 884) 529 127.0 1.5e-28 CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 902) 529 127.0 1.5e-28 CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 362 90.0 2.2e-17 CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 362 90.0 2.2e-17 >>CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 (938 aa) initn: 5709 init1: 5709 opt: 5712 Z-score: 6841.9 bits: 1277.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5712; 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97.6% identity (97.6% similar) in 884 aa overlap (1-863:1-884) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 NATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 NATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 LTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDDHEGRAAQKRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 LTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDDHEGRAAQKRL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 ETLLEERESK---------------------AEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVI :::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 ETLLEERESKSKKRNYENLDQLSYDNKRGPKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVI 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 ILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 ILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESA 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 HISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 HISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVE 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 FNEDGDRKFANYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 FNEDGDRKFANYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLK 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KB3 IVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 IVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFC 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KB3 IDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 IDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTI 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 pF1KB3 NNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 NNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYL 550 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 pF1KB3 LDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 LDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGF 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 pF1KB3 AMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 AMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVEL 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 pF1KB3 STMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 STMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFG 730 740 750 760 770 780 760 770 780 790 800 810 pF1KB3 IGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 IGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFML 790 800 810 820 830 840 820 830 840 850 860 870 pF1KB3 VAGGIVAGIFLIFIEIAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQVGQATLRGLVPRARPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS55 VAGGIVAGIFLIFIEIAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQQYHPTDITGPLNLSDP 850 860 870 880 890 900 880 890 900 pF1KB3 HGPPPSPKAVALALALVGRTGARSHGQGQW CCDS55 SVSTVV >>CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043 aa) initn: 725 init1: 272 opt: 934 Z-score: 1110.7 bits: 216.9 E(32554): 1.5e-55 Smith-Waterman score: 938; 26.1% identity (56.8% similar) in 909 aa overlap (1-852:1-871) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVL--STRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKI : .: : :.: .. . . :. :. .. : : :.: . : . .: : . . CCDS32 MEFVRALWLGLALALGPGSAGGHPQPCGVLARLGGSVRLGALLPRAPLARARARAALARA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KB3 QLNATSVTHK---------PNA---IQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP : : . :. : : ... ..:. :. : :.:. :. CCDS32 AL-APRLPHNLSLELVVAAPPARDPASLTRGLCQALVPPGVAALLAFPEARPEL----LQ 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VSYTAGFYRIPVLGLTTRMS---IYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHI . . :. . :::.: : . . . . .::. :. . : .: ......:. . CCDS32 LHFLAAATETPVLSLLRREARAPLGAPNPFHLQ-LHWASPLETLLDVLVAVLQAHAWEDV 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KB3 ILLV--SDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAEK-VLQF---DPGTKNVTALLMEAKELEAR : . ..: : .: : : .. . ::.. : : .. : : . CCDS32 GLALCRTQDPGGLVA------LWTSRAGRPPQLVLDLSRRDTGDAGLRARLAPMAAPVGG 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 VIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYA--PDGILGLQLINGK . :. . . :: .:. . : ::.: . .:: : : :.:.: . CCDS32 EAPVPAAVLLGCDIARARRVLEAVPPGPHWLLGT-PLPPKALPTAGLPPGLLALGEVARP 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KB3 NESAHISDAVGVVAQAVH---ELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGP-----LFKRVLMS : : : : .::.:. .. :. . : .: :. . .:: .. : : . CCDS32 PLEAAIHDIVQLVARALGSAAQVQPKRALLPAPVNC-GD--LQPAGPESPGRFLARFLAN 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 SKYADGVTGRVEFNEDGDRKFA-NYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGET ... .: :: : . ... ... .... .:. : . . . . . . ::: . CCDS32 TSF-QGRTGPVWVTGSSQVHMSRHFKVWSLR-RDPRGAPAWATVGSWRDGQLDLEPGGAS 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 EKP---RGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGP--ND .: .: :. .:..::. ..:::... :: : :. . .: : :: CCDS32 ARPPPPQGAQVWPKLRVVTLLEHPFVFARDPDEDGQC---------PAGQ-LCLDPGTND 410 420 430 440 450 450 460 470 480 490 pF1KB3 TSP----------GSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVN .. :: ... .::::.::::: .::. : .:..::.:::.:. . CCDS32 SATLDALFAALANGSAPRALRKCCYGYCIDLLERLAEDTPFDFELYLVGDGKYGALR--- 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 NSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTL .:.:..:.::.:.: : :. ..::. :.: ..:..:: .: :.:. . : . CCDS32 ---DGRWTGLVGDLLAGRAHMAVTSFSINSARSQVVDFTSPFFSTSLGIMVRARDTASPI 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 DSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSW .:: :.. . :: : ..:..:..: . . ::.: . ... ... :::. . . CCDS32 GAFMWPLHWSTWLGVFAALHLTALFLTVYEWRSPYGLTPRG--RNRSTVFSYSSALNLCY 570 580 590 600 610 620 620 630 640 650 660 670 pF1KB3 GVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPR ..:. .. .:. ..:.: .:: : .....:::::::: .: :. :...::.::. CCDS32 AILFRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSYTANLAAVMVGDKTFEELSGIHDPK 630 640 650 660 670 680 680 690 700 710 720 pF1KB3 LRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAF :..:.. : ..:: .::.. :.... . :. ::..:. .. ... . .. ::.:: CCDS32 LHHPAQGFRFGTVWESSAEAYIKKS--FPDMHAHMRRHSAPTTPRGVAMLTSDPPKLNAF 690 700 710 720 730 740 730 740 750 760 770 780 pF1KB3 IWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMED : :...:..:.: : :.:.:. : :.:::. ..:: .:.: : . . .::.. CCDS32 IMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTSNLSEFISRYKSSGFIDL 750 760 770 780 790 800 790 800 810 820 830 840 pF1KB3 LDKTWVRYQECDSRSNAPAT---LTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRHKDAR : : .. : .: : . ... ..::.:.:. :. .... . : :. : : CCDS32 LHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLFVLLCLGLGSALLSSLGEHAFFRLALPR 810 820 830 840 850 860 850 860 870 880 890 900 pF1KB3 -RKQMQLAFAAVNVWRKNLQVGQATLRGLVPRARPGHGPPPSPKAVALALALVGRTGARS :: .: . CCDS32 IRKGSRLQYWLHTSQKIHRALNTEPPEGSKEETAEAEPSGPEVEQQQQQQDQPTAPEGWK 870 880 890 900 910 920 >>CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115 aa) initn: 605 init1: 244 opt: 928 Z-score: 1103.0 bits: 215.6 E(32554): 4e-55 Smith-Waterman score: 975; 27.8% identity (61.8% similar) in 821 aa overlap (77-850:183-973) 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP :::. .. . : :.: . : . .. . CCDS67 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL 160 170 180 190 200 210 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIIL :: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: .. : CCDS67 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 pF1KB3 LVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAE--KVLQFD---PGTKNVTALL---MEA-KELEA :. .: : :: . .:: . ..... :.:... ..: .:. :. CCDS67 LLC--QEDWNITDFL--LLTQNNSKFHLGSIINITANLPSTQDLLSFLQIQLESIKNSTP 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 RVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGI-LGLQLINGK :.... . .. ... ...... :..:. : :. . .:. ::: . .:: CCDS67 TVVMFGCDMESIRRIFEITTQFGVMPPELRWVLGD---SQNVEELRTEGLPLGL-IAHGK 330 340 350 360 370 280 290 300 310 320 pF1KB3 NESA----HISDAVGVVAQAVHE--LLEKENITDPPR-GC--VGNTNIWKTGPLFKRVLM . .. ...::. .::.:: ... : : .: : .::. .: ..: : CCDS67 TTQSVFEHYVQDAMELVARAVATATMIQPELALIPSTMNCMEVETTNL-TSGQYLSRFLA 380 390 400 410 420 430 330 340 350 360 370 pF1KB3 SSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFA---NYSIMNLQNRKL-----VQVGIYNGTHVIPNDRK .. . :..: .. . :. . :. : :::. . ...: ..: ... : CCDS67 NTTFR-GLSGSIRVK--GSTIVSSENNFFIWNLQHDPMGKPMWTRLGSWQGGKIV-MDYG 440 450 460 470 480 490 380 390 400 410 420 430 pF1KB3 IIWPGGETEKPRGYQMSTRL--KIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVIC : :: .. .: ..: ..::. ..:::... . ..: : . ::. . CCDS67 I-WPEQAQRHKTHFQHPSKLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAG-QLCLDPMTNDSS 500 510 520 530 540 550 440 450 460 470 480 490 pF1KB3 TGPND-TSPGSPRHTVP----QCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVN : . .: : ::: .::::.::::: :.:. ::: .....:.:::.:. . CCDS67 TLDSLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEKIAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWK--- 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 NSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTL :.. :.:..:.:: : : : :. ..::. :.: :.:..:: .: :::. . . . CCDS67 NGH---WTGLVGDLLRGTAHMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRDTAAPI 610 620 630 640 650 660 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 DSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSW .:: :.. :.:: . ...:..::.: : . :::: . . ... ....:::. . . CCDS67 GAFMWPLHWTMWLGIFVALHITAVFLTLYEWKSPFG--LTPKGRNRSKVFSFSSALNICY 670 680 690 700 710 720 620 630 640 650 660 670 pF1KB3 GVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPR ..:.. .. :. ...:.: .:: : :. ...::::::: .: .. :...::.::. CCDS67 ALLFGRTVAIKPPKCWTGRFLMNLWAIFCMFCLSTYTANLAAVMVGEKIYEELSGIHDPK 730 740 750 760 770 780 680 690 700 710 720 pF1KB3 LRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAF :..::. : ..::..::.. : :.. . :...:...: .. .... .... :: :: CCDS67 LHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQS--FPEMHEYMRRYNVPATPDGVEYLKNDPEKLDAF 790 800 810 820 830 840 730 740 750 760 770 780 pF1KB3 IWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMED : :.:.:..:.: : :.:.:. : :.:::. .:: :.: : . . .:::. CCDS67 IMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTANISELISQYKSHGFMDM 850 860 870 880 890 900 790 800 810 820 830 pF1KB3 LDKTWVRYQECDSRSNAPAT---LTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIE-IAYK----R : : : : .:: : . . .....:.:.:. :. .:. . : :.:. : CCDS67 LHDKWYRVVPCGKRSFAVTETLQMGIKHFSGLFVLLCIGFGLSILTTIGEHIVYRLLLPR 910 920 930 940 950 960 840 850 860 870 880 890 pF1KB3 HKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQVGQATLRGLVPRARPGHGPPPSPKAVALALALVGRT :. . :. : CCDS67 IKNKSKLQYWLHTSQRLHRAINTSFIEEKQQHFKTKRVEKRSNVGPRQLTVWNTSNLSHD 970 980 990 1000 1010 1020 >>CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336 aa) initn: 646 init1: 202 opt: 851 Z-score: 1009.5 bits: 198.6 E(32554): 6.6e-50 Smith-Waterman score: 1013; 26.5% identity (61.5% similar) in 854 aa overlap (74-886:99-914) 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 EAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFT ..:..:. : . .:.... .: . CCDS12 LGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLVLQLCDLLSGLRVHGVVFE-----DDSRA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 pF1KB3 PT--PV-SYTAGFYRIPVLGLTTRMS-IYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYS :. :. .. .. .:.... . . . : .::. .: .: ::... :. CCDS12 PAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAALVLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLEEYD 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 WNHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKAEK--VLQFDPGTKNVTALLMEAKELEAR :. .. ... :: . .:.: . :. .: .:::. ... : . . . :. CCDS12 WTSFVAVTTRAPGHRAFLSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAV-LSAQLRSVSAQ 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 pF1KB3 VIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPD------------- . .: ....: :.::: ..:::::::.. ...:.. :: CCDS12 IRLLFCAREEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPLPA 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB3 GILGLQLINGKNESAH-ISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRG--CVGNTNIWKTGPLF :..... . ... :. .. .:.:::.... ::. .. : : : .. : . : . CCDS12 GLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFL-PELGHDCRAQ-NRTHRGESL 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 KRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNL-QNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKII .: .:. . . ::::: . ...: ..: :: .. . . . CCDS12 HRYFMNITWDN---RDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEVVGSWEQQTL--RLKYPL 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 pF1KB3 WPG-GETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLS-DGTCKEEFTVNGDPVKKVICTG : :. .: . . .: ..:....::: :.:. .::: .. . : .. . . CCDS12 WSRYGRFLQP--VDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSV----PCRSQL-NR 420 430 440 450 460 440 450 460 470 480 490 pF1KB3 PNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEW .. : .:: .:: :::::.: .::.:..:.:...::..:: : ..... : CCDS12 THSPPPDAPRPE-KRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHG--KKIDGV----W 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 NGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPF :::.::.. .::: .. ::::.::.. ..:: :: :....: . . ..:..:. CCDS12 NGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPY 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 QSTLWLLVG-LSVHVVAVMLYLLDRFSPFG--RFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLL . ..:... . . :::: ..... .:: : : ..... ...:.....:. :.... CCDS12 SPAVWVMMFVMCLTVVAVTVFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVF 590 600 610 620 630 640 620 630 640 650 660 670 pF1KB3 NSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNP :... ::. ...:. .::: ::.:..::::::::::.. .. . ..:..: ... : CCDS12 NNSVPVENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQRP 650 660 670 680 690 700 680 690 700 710 720 730 pF1KB3 SDKFI---YATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWD .... ..:: ..:.. .: . :. .: ..: . ::. .. .:: :::.: CCDS12 QEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYP--DMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYD 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 pF1KB3 SAVLEFEASQK--CDLVT--TGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDL .:::.. : . : ::: .:..: .:.::...: : ::. ..:..:. . .: : CCDS12 AAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEML 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 pF1KB3 DKTWVR-YQECDSRSNAPATLTFENMAGVF--MLVAGGIVAGIFLIFIEIAYK-RH--KD .. :. . :. . : ..:::::: .::: :. .: . .. :: CCDS12 ERLWLSGICHNDKIEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGP 820 830 840 850 860 870 850 860 870 880 890 900 pF1KB3 ARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQVGQATLRGLVPRARPGHGPPPSPKAVALALALVGRTGAR ..: .. :::. : . .: .. : :.: :::.: CCDS12 THRMDFLLAFS-----RGMYSCCSA--EAAPPPAKPP--PPPQPLPSPAYPAPRPAPGPA 880 890 900 910 920 930 pF1KB3 SHGQGQW CCDS12 PFVPRERASVDRWRRTKGAGPPGGAGLADGFHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGR 940 950 960 970 980 990 >>CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 (920 aa) initn: 489 init1: 181 opt: 835 Z-score: 992.8 bits: 195.0 E(32554): 5.6e-49 Smith-Waterman score: 928; 26.2% identity (56.8% similar) in 912 aa overlap (5-855:15-876) 10 20 30 40 pF1KB3 MSTMRLLTLALL-FSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQM------FR : . ::: : : . :... ::... : ..: . :. CCDS82 MEHGTLLAQPGLWTRDTSWALLYFLCYIL-PQTAPQVLRIGGIFETVENEPVNVEELAFK 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 EAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFT ::.. :. . . :..:. . :.. : . . . :. :. :. . CCDS82 FAVTSINRN----RTLMPNTTLTYDIQRINLFDSFEASRRACDQLALGVAALFGPSHSSS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 PTPVSYTAGFYRIPVLGLTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHI . :. . ..: . :: . : . : .. : :. : . .... :.:. CCDS82 VSAVQSICNALEVP--HIQTRWKHPSVDNKDLFYINLYPDYAAISRAILDLVLYYNWK-T 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 ILLVSDDHEGRAAQKRLETLLEE--RESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIIL . .: .: : ::. :.. : . :. :. :.:.. :: : :. . .:. CCDS82 VTVVYEDSTGLI---RLQELIKAPSRYNIKIKIRQLPSGNKDAKPLLKEMKKGKEFYVIF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 SASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNAL---RYAPDGILGLQLINGKN-- . :.. :: . . ...: : .. .. . : ::. .. :..:.: : CCDS82 DCSHETAAEILKQILFMGMMTEYYHYFFTTLDLFALDLELYRYSGVNMTGFRLLNIDNPH 230 240 250 260 270 280 280 290 300 pF1KB3 ------------------------------ESAHISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPR :.: . ::: .:: : :. ..: CCDS82 VSSIIEKWSMERLQAPPRPETGLLDGMMTTEAALMYDAVYMVAIASHR---ASQLTVSSL 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 GCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNE-DGDRKFANYSIMNLQNRKLVQVG : . :. :: : .. ... ::.::.. ::. .: :: . .:..:... ... CCDS82 QC-HRHKPWRLGPRFMNLIKEARW-DGLTGHITFNKTNGLRKDFDLDIISLKEEGTEKAA 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 IYNGTHVIPNDRKI-IWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEF . :. .:: :: . .. :... ... . .:.. : CCDS82 GEVSKHLYKVWKKIGIWNS-----------NSGLNMTDSNKDKSSNITDSLANRTLIVT- 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 TVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKF :. .: :. . :. : :.:.::: .:. ..: :.:.:: :::. CCDS82 TILEEPY--VMYRKSDKPLYGNDRFE------GYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKY 460 470 480 490 500 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 GTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKK :.: ..: :::::. ::.. .::. ::::::. : . :.::::: :..:: .: CCDS82 GAQ-----NDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRK 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 EIPRST---LDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDAL : .: . ::..:.. .:. : :. :. .:... ::.:. .. . . . :.. CCDS82 --PNGTNPGVFSFLNPLSPDIWMYVLLACLGVSCVLFVIARFTPYEWYNPHPCNPDSDVV 560 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 pF1KB3 ----TLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVL :: ...::. :.:...: .: :...:.::.: .: :..::..::::::::::.. CCDS82 ENNFTLLNSFWFGVGALMQQG-SELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISSYTANLAAFLTV 620 630 640 650 660 670 660 670 680 690 700 710 pF1KB3 DRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELST---MYRHMEKHNY--- .: : : . .: . :. :..:...:. .:... ..:: :. : ... CCDS82 ERMESPIDSADD---LAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKS-KISTYEKMWAFMSSRQQTAL 680 690 700 710 720 730 720 730 740 750 760 770 pF1KB3 -ESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQ ... :.:: : . .:.. .:. .:. ....:.:. : :. .:.:.: ::... 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