Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9728
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9728, 444 aa
1>>>pF1KB9728 444 - 444 aa - 444 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4842+/-0.000848; mu= 1.9676+/- 0.052
mean_var=297.8910+/-60.826, 0's: 0 Z-trim(117.5): 71 B-trim: 10 in 1/52
Lambda= 0.074310
statistics sampled from 18158 (18229) to 18158 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.821), E-opt: 0.2 (0.56), width: 16
Scan time: 3.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4472.1 FOXF2 gene_id:2295|Hs108|chr6 ( 444) 3121 347.4 1.7e-95
CCDS10957.2 FOXF1 gene_id:2294|Hs108|chr16 ( 379) 972 117.0 3.3e-26
CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1 ( 495) 663 84.0 3.8e-16
CCDS75259.1 FOXD1 gene_id:2297|Hs108|chr5 ( 465) 620 79.3 8.8e-15
CCDS624.1 FOXD3 gene_id:27022|Hs108|chr1 ( 478) 575 74.5 2.5e-13
CCDS35078.1 FOXE1 gene_id:2304|Hs108|chr9 ( 373) 567 73.6 3.9e-13
CCDS4471.1 FOXQ1 gene_id:94234|Hs108|chr6 ( 403) 556 72.4 9.3e-13
CCDS3105.1 FOXL2 gene_id:668|Hs108|chr3 ( 376) 519 68.4 1.4e-11
CCDS7655.2 FOXI2 gene_id:399823|Hs108|chr10 ( 318) 516 68.0 1.5e-11
CCDS4473.1 FOXC1 gene_id:2296|Hs108|chr6 ( 553) 521 68.8 1.6e-11
CCDS13192.1 FOXS1 gene_id:2307|Hs108|chr20 ( 330) 507 67.1 3.1e-11
CCDS77433.1 FOXI3 gene_id:344167|Hs108|chr2 ( 420) 505 67.0 4.2e-11
CCDS12677.1 FOXA3 gene_id:3171|Hs108|chr19 ( 350) 500 66.4 5.4e-11
CCDS2117.1 FOXD4L1 gene_id:200350|Hs108|chr2 ( 408) 500 66.4 6e-11
>>CCDS4472.1 FOXF2 gene_id:2295|Hs108|chr6 (444 aa)
initn: 3121 init1: 3121 opt: 3121 Z-score: 1828.2 bits: 347.4 E(32554): 1.7e-95
Smith-Waterman score: 3121; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 EFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 GGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHMSPNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHMSPNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 GGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLKQPPALTPSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLKQPPALTPSSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 PAASAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PAASAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFH
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB9 PSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM
::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM
430 440
>>CCDS10957.2 FOXF1 gene_id:2294|Hs108|chr16 (379 aa)
initn: 1115 init1: 819 opt: 972 Z-score: 583.9 bits: 117.0 E(32554): 3.3e-26
Smith-Waterman score: 1300; 55.0% identity (72.4% similar) in 413 aa overlap (66-444:2-379)
40 50 60 70 80
pF1KB9 AAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGA-------
.::: ::::.:.:.:::
CCDS10 MSSAPEKQQPPHGGGGGGGGGGGAAMDPASS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 -----KKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQG
::...:.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::::::.:::
CCDS10 GPSKAKKTNAGIRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPTKRLTLSEIYQFLQSRFPFFRGSYQG
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 WKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQAL
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KB9 KPMYHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPLGC--HSQGGYGGLDMM----PAGYDAGA
:::: ...::::. ::. . ::. .. :.: .: . ::: :: :.. : :
CCDS10 KPMYS-MMNGLGFNH--LPDTYGFQGSAGG-LSCPPNSLALEGGLGMMNGHLPGNVD-GM
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB9 GAPSHAHPHHHHHHHVPHMSPNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPV
. :::. :::. : : .::..: ::...:.: : .:: :
CCDS10 ALPSHS---------VPHLPSNGGHSYMGGC------------GGAAAGEY-PHHDSS-V
210 220 230 240
320 330 340 350 360
pF1KB9 PSSPAMASA----IECHSPYTSPAAHWSSPGASP-------YLKQPPALTPSSNPAASAG
:.:: . .. .: :. :.. :: : :.:: :.:: : :.: ::::.
CCDS10 PASPLLPTGAGGVMEPHAVYSGSAAAWP-PSASAALNSGASYIKQQP-LSPC-NPAANP-
250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LHSSMSSYSLEQSYLHQNARE---DLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGI--SSFHP
: .:.:..:::: :::::... .:. :.:::. .: .::::.::..::.. ::.:
CCDS10 LSGSLSTHSLEQPYLHQNSHNAPAELQ-GIPRYHSQSPSMCDRKEFVFSFNAMASSSMHS
300 310 320 330 340 350
430 440
pF1KB9 SASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM
...:::::. : . ::::::::
CCDS10 AGGGSYYHQ--QVTYQDIKPCVM
360 370
>>CCDS30708.1 FOXD2 gene_id:2306|Hs108|chr1 (495 aa)
initn: 616 init1: 521 opt: 663 Z-score: 403.4 bits: 84.0 E(32554): 3.8e-16
Smith-Waterman score: 663; 37.7% identity (57.7% similar) in 366 aa overlap (5-355:36-386)
10 20 30
pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAA
:: :: :. .: . ::
CCDS30 CCCEIMSSESSPAALSEADADIDVVGGGSGGGELPA---RSGPRAPRDVLPHGHEPPAEE
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAP---SAACKSAGGGGAGAGSGGAKKA
: : : : :.. :.. .: ... .:..: .:: ..:.: : : ::::
CCDS30 AEADLAEDEEESGGCSDGEPRALASRGAAAAAGSPGPGAAAARGAAGPGPGPPSGGA---
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 SSGLRRPE-KPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRH
. : : ::::::::::.::: .::.:::::::: .:...:::..: . .:.::.::
CCDS30 --ATRSPLVKPPYSYIALITMAILQSPKKRLTLSEICEFISGRFPYYREKFPAWQNSIRH
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 NLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRV
:::::.::.:.:. : ::::.:::.:: : ::..::: :: . :.: : : : . .
CCDS30 NLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPESADMFDNGSFLRRRKRFKR--QPLPPPHPH-
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB9 VSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPL-GCHSQGGYG-GLDMMPAGYDAGAGAPS-HAHPHH
:: : . :.: : : . :.:: : . .: : .:. : :::
CCDS30 --PHPHPELLLRGGAAAAGDPGAFLPGFAAYGAYGYGYGLALPAYGAPPPGPAPHPHPHP
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 HHHHHVPHMSPNPGSTYM----ASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSS---
: . . : . . :. : :. : . ::.:.. .: :.:.: :.
CCDS30 HAFAFAAAAAAAPCQLSVPPGRAAAPPPGPPTASVFAGAGSAPAPAPASGSGPGPGPAGL
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370
pF1KB9 PAMASA-IECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLKQPPALTPSSNPAASAGLHSSMSSYSLEQS
::. .: . : . . :: : :.:. : ::
CCDS30 PAFLGAELGCAKAFY--AASLSPPAAGTAAGLPTALLRQGLKTDAGGGAGGGGAGAGQRP
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 YLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDI
CCDS30 SFSIDHIMGHGGGGAAPPGAGEGSPGPPFAAAAGPGGQAQVLAMLTAPALAPVAGHIRLS
420 430 440 450 460 470
>>CCDS75259.1 FOXD1 gene_id:2297|Hs108|chr5 (465 aa)
initn: 528 init1: 528 opt: 620 Z-score: 378.9 bits: 79.3 E(32554): 8.8e-15
Smith-Waterman score: 681; 40.4% identity (59.1% similar) in 369 aa overlap (58-383:83-448)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 MSPPPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGG
...: . . :: :: .:::::.:.:.::
CCDS75 RRRRRSYAGEDELEDLEEEEDDDDILLAPPAGGSPAPPGPAP-AAGAGAGGGGGGGGAGG
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 AKKASSGLRRPE-KPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKN
. .:.:: . : ::::::::::.::: .::.:::::::: .:...:::..: . .:.:
CCDS75 GGSAGSGAKNPLVKPPYSYIALITMAILQSPKKRLTLSEICEFISGRFPYYREKFPAWQN
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 SVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPM
:.:::::::.::.:.:. : ::::.:::.:: : ::..::: :: . :.:. : :
CCDS75 SIRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPESADMFDNGSFLRRRKRFKRQ-PLLPPN
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KB9 YHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQA-----PPSAPLGCHSQG-G-YG---GLDMMP-----A
. : : ::. . : : ::. : :. : : :: ::.. : :
CCDS75 AAAAESLLLRGAGAAGGAGDPAAAAALFPPAPPPPPHAYGYGPYGCGYGLQLPPYAPPSA
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300
pF1KB9 GYDAGAGAPSHA--HPHHHHHHHVPHMSPNP-GSTYMASCPVPAG---PGGVGA----AG
. :.:.: . : ::: :: . . : .. : : : :: . : ::
CCDS75 LFAAAAAAAAAAAFHPHSPPPPPPPHGAAAELARTAFGYRPHPLGAALPGPLPASAAKAG
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340
pF1KB9 GGG---------------GGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPAAHWSSPG--
: : ::. :: .... . .. : :.: :: ..: : :: :
CCDS75 GPGASALARSPFSIESIIGGSLGPAAAAAAAAQAAAAAQASPSPSPVAAPPAPGSSGGGC
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 ASPYLKQPPALTPSSNPAASAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVC
:. : : : ::.:. ::.:: : . :::
CCDS75 AAQAAVGPAAALTRSLVAAAAAAASSVSS-SAALGTLHQGTALSSVENFTARISNC
420 430 440 450 460
410 420 430 440
pF1KB9 DRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM
>>CCDS624.1 FOXD3 gene_id:27022|Hs108|chr1 (478 aa)
initn: 558 init1: 504 opt: 575 Z-score: 352.6 bits: 74.5 E(32554): 2.5e-13
Smith-Waterman score: 603; 33.4% identity (58.7% similar) in 395 aa overlap (3-381:46-417)
10 20 30
pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPP-
. .::: : .: :.: . . .::
CCDS62 TVLTAEDVDIDVVGEGDDGLEEKDSDAGCDSPAGPPELRLDEADEVPPAAPHHGQPQPPH
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KB9 ------PAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGS
: ::.:.:.: .. .. . .: .. .. .... :.:: :::.::
CCDS62 QQPLTLPKEAAGAGAGP--GGDVGAPEADGCKGGVGGEEGGA-------SGGGPGAGSGS
80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 GGAKKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWK
.:. :. ::::::::::.::: .::.:.:::: : .:.. :::..: . .:.
CCDS62 AGGLAPSKPKNSLVKPPYSYIALITMAILQSPQKKLTLSGICEFISNRFPYYREKFPAWQ
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 NSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQA-LK
::.:::::::.::.:.:. : ::::.:::.:: :: ::..::: :: . :.:. : :.
CCDS62 NSIRHNLSLNDCFVKIPREPGNPGKGNYWTLDPQSEDMFDNGSFLRRRKRFKRHQQEHLR
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 PMYHRVVSGLGFGASLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAH
. ... .::: : . .: . : : : .. :. . ::. :.:.: . .
CCDS62 EQTALMMQ--SFGAYSLAAAAGAAGPYGRPYGLHPAAAAGAYSH-PAAAAAAAAAAALQY
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 PHHHHHHHVPHMSPNPGSTYMASCPVPAGPGG-VGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAM
:. .: ..: . :: :.: .: ... :.. :: . . . :
CCDS62 PYA-----LPPVAP------VLPPAVPLLPSGELGRKAAAFGSQLGPGLQLQLNSLGAAA
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370
pF1KB9 ASAIECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLK-------QPPALTPSSNPAASAGLHSSMSSYSL
:.: . :. . : :.: : .. : : :. :. :: .. .. :
CCDS62 AAAGTAGAAGTTASLIKSEPSARPSFSIENIIGGGPAAPGGSAVGAGVAGGTGGSGGGST
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 EQSYLHQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVC
::.:
CCDS62 AQSFLRPPGTVQSAALMATHQPLSLSRTTATIAPILSVPLSGQFLQPAASAAAAAAAAAQ
420 430 440 450 460 470
>>CCDS35078.1 FOXE1 gene_id:2304|Hs108|chr9 (373 aa)
initn: 579 init1: 473 opt: 567 Z-score: 349.4 bits: 73.6 E(32554): 3.9e-13
Smith-Waterman score: 570; 35.2% identity (61.0% similar) in 318 aa overlap (70-374:25-325)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPE
.:: .. : ..: :.:: .. . :.:
CCDS35 MTAESGPPPPQPEVLATVKEERGETAAGAGVPGEATGRGAGG-RRRKRPLQRG-
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 KPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFI
::::::::::.::: .: .::::. ::.:. ::::.: . :.::.::::.::.::.
CCDS35 KPPYSYIALIAMAIAHAPERRLTLGGIYKFITERFPFYRDNPKKWQNSIRHNLTLNDCFL
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMY-HRVVSGLGFGA
:.:. ::::::.::..:: .: ::: ::: :: . :.:. . : : : .... . .:
CCDS35 KIPREAGRPGKGNYWALDPNAEDMFESGSFLRRRKRFKRSDLSTYPAYMHDAAAAAAAAA
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHMSP
. . : : ..: .. : :.. :: . :: : : .. : ::
CCDS35 AAAAAAAIF--PGAVPA---ARPPY------PGAVYAGYAPPSLAAPPPVYY---PAASP
180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 NPGSTYMASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSS---PAMASAIECHSPYTS
.: .. : .: .: : .: ::. . :...:. .. :: .. . .: .
CCDS35 GPCRVFGLVPERPLSPE-LGPAPSGPGGSCAFASAGAPATTTGYQPAGCTGARPANPSAY
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380
pF1KB9 PAAHWSSPGASPYLKQPPALT-------PSSNPA--ASAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAR
::. . :: : .. :.: :: .:.:...... :
CCDS35 AAAYAGPDGAYPQGAGSAIFAAAGRLAGPASPPAGGSSGGVETTVDFYGRTSPGQFGALG
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 EDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM
CCDS35 ACYNPGGQLGGASAGAYHARHAAAYPGGIDRFVSAM
340 350 360 370
>>CCDS4471.1 FOXQ1 gene_id:94234|Hs108|chr6 (403 aa)
initn: 497 init1: 379 opt: 556 Z-score: 342.6 bits: 72.4 E(32554): 9.3e-13
Smith-Waterman score: 565; 33.8% identity (56.5% similar) in 379 aa overlap (5-364:25-386)
10 20 30 40
pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAAAAAAAA
:. :.:: : . :. . : :...: .
CCDS44 MKLEVFVPRAAHGDKQGSDLEGAGGSDAPSPLSAAGDDSLGSDGDCAANSPAAGGGARDT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 APETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPEK
. .:.... .: : .... .. : .: .:: :..::::: . ... ::: :
CCDS44 QGDGEQSAGGGPGAEEAIPAAAAAAVVAEGAEAGAAGPGAGGAGSGEGARSKPYTRRP-K
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 PPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIK
:::::::::.:::..: . ::::.:: ..:...::::::.: ::.::::::::::.::.:
CCDS44 PPYSYIALIAMAIRDSAGGRLTLAEINEYLMGKFPFFRGSYTGWRNSVRHNLSLNDCFVK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB9 LPKGLGRP-GKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRV-VSGLGFGA
. . .:: :: .:: ..: ::. : .: :::: :.. . ::. : . :.
CCDS44 VLRDPSRPWGKDNYWMLNPNSEYTFADGVFRRR----RKR------LSHRAPVPAPGLRP
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPH--HHHHHHVPHM
: :. ::: :: . : . . . :: . : : .. .
CCDS44 EEAP-GLP-AAPPPAPAAPASPRMRSPARQEERASPAGKFSSSFAIDSILRKPFRSRRLR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB9 SPNPGSTYM---ASCP-VPAGPGGVGAA-----------GGGGGGDYGPDSSSSPVPSSP
. ::.: . : :: .:: :. . :: :.: . : . : :..:
CCDS44 DTAPGTTLQWGAAPCPPLPAFPALLPAAPCRALLPLCAYGAGEPARLGAREAEVP-PTAP
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 AMASAIECHSPYTSPAAHWSSPGASPYLKQPPALTPSSNPAASAGLHSSMSSYSLEQSYL
. : : ..:: .:.:. : :.. :::
CCDS44 PLLLA---PLPAAAPAKPLRGPAAGGAHLYCPLRLPAALQAASVRRPGPHLPYPVETLLA
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 HQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKP
>>CCDS3105.1 FOXL2 gene_id:668|Hs108|chr3 (376 aa)
initn: 474 init1: 449 opt: 519 Z-score: 321.5 bits: 68.4 E(32554): 1.4e-11
Smith-Waterman score: 571; 34.3% identity (53.4% similar) in 399 aa overlap (30-389:6-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSPPPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSASCASSS
: : ::.: ::::
CCDS31 MMASYPEPEDAAGALLAPET----------------
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLRRPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKR
. ... : . : : ::.:.:. . .: . . .::::::.:::.:::. : ::
CCDS31 --GRTVKEPEGPPPSPGKGGGGGGGTAPEKPDPA----QKPPYSYVALIAMAIRESAEKR
30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPAS
:::: :::.. :.:::.. .::.::.::::::::::::.:. : ::.:::.:::
CCDS31 LTLSGIYQYIIAKFPFYEKNKKGWQNSIRHNLSLNECFIKVPREGGGERKGNYWTLDPAC
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230
pF1KB9 EFMFEEGSFRRR---PRGFRRKCQALKP---MYHRVVSGLGFG-ASLLPQGFDFQAPP--
: :::.:..::: : :: ..: .. .. : : :. .:. . :::
CCDS31 EDMFEKGNYRRRRRMKRPFRPPPAHFQPGKGLFGAGGAAGGCGVAGAGADGYGYLAPPKY
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280
pF1KB9 --------SAPLGCH-SQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHMSPNPGS
: :: : :.. .: :. :.:.: . : : : . .:..
CCDS31 LQSGFLNNSWPLPQPPSPMPYASCQMAAAAA-AAAAAAAAAGPGSPGAAAVVKGLAGPAA
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330
pF1KB9 TY-----MASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPA
.: . : .: :: :.. .: :: .: : : : .: .:
CCDS31 SYGPYTRVQSMALP--PGVVNSYNGLGGPPAAPPPPPHPHPH-PHAHHLHAAAAPPPAPP
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370 380
pF1KB9 AHWSS---PG----ASPYLKQPPALTPSSNPAAS---------AGLHSSMSSYSLEQSYL
: .. :: ::: ::: .:.: :. . : .: :. ... . . :
CCDS31 HHGAAAPPPGQLSPASPATAAPPAPAPTSAPGLQFACARQPELAMMHCSYWDHDSKTGAL
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 HQNAREDLSVGLPRYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKP
: .: ::
CCDS31 H--SRLDL
>>CCDS7655.2 FOXI2 gene_id:399823|Hs108|chr10 (318 aa)
initn: 470 init1: 432 opt: 516 Z-score: 320.7 bits: 68.0 E(32554): 1.5e-11
Smith-Waterman score: 537; 38.2% identity (59.1% similar) in 296 aa overlap (6-281:9-292)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MTTEGGPPPAPLRRACSPVPGALQAALMSP--PPAAAAAAAAAPETTSSSSSSSSAS
:: :: :: ::. : :. .:....: .. . : :
CCDS76 MATYCDDLGPSSAP--------PGQAQATAHPPGYEPGDLGAVGGGPLLWVNAPALSPKS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 CASSSSSSNSASAPSAACKSA--GGGGAGAGSGGAKKASSG---LRRPEKPPYSYIALIV
::. . . .::: . . :. :. ::. : . :: : : .::::: :::.
CCDS76 YASGPGPAPPYAAPSYGAPGPLLGAPGGLAGADLAWLSLSGQQELLRLVRPPYSYSALIA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 MAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNECFIKLPKGLGRPGK
:::::.: ..::::.:::.. . :::.. . ::.::.:::::::.:: :.:. :::
CCDS76 MAIQSAPLRKLTLSQIYQYVAGNFPFYKRSKAGWQNSIRHNLSLNDCFKKVPRDEDDPGK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB9 GHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRVVSGLGFGASLLPQG--FDFQ
:.:::.:: : ::..:.:::. : : . .: : :.: : :.. .:.:
CCDS76 GNYWTLDPNCEKMFDNGNFRRK-RKRRAEASAAVRSGARSVGGAEAPALEPPSAACLDLQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB9 A-P-PSAPLGCHSQGGY--------GGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPH-MS
: : :::: . .:. ::: .:.: :: : .. :.:. ..
CCDS76 ASPSPSAPEAATCFSGFASAMSALAGGLGTFPGGL---AGDFSFGRRPPTVATHAPQTLN
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 PNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSPA
:.::
CCDS76 PSPGFAPGHQTAAAGFRLSHLLYSREGTEV
290 300 310
>>CCDS4473.1 FOXC1 gene_id:2296|Hs108|chr6 (553 aa)
initn: 621 init1: 481 opt: 521 Z-score: 320.5 bits: 68.8 E(32554): 1.6e-11
Smith-Waterman score: 557; 37.4% identity (56.5% similar) in 329 aa overlap (67-393:48-332)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AAAAAPETTSSSSSSSSASCASSSSSSNSASAPSAACKSAGGGGAGAGSGGAKKASSGLR
: :. : . :: . . : . . .
CCDS44 YLGGEQSYYRAAAAAAGGGYTAMPAPMSVYSHPAHAEQYPGGMARAYGPYTPQPQPKDMV
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 RPEKPPYSYIALIVMAIQSSPSKRLTLSEIYQFLQARFPFFRGAYQGWKNSVRHNLSLNE
::::::::::.::::..:.:..::. ::::.. ::::.: :::.::.::::::::
CCDS44 ---KPPYSYIALITMAIQNAPDKKITLNGIYQFIMDRFPFYRDNKQGWQNSIRHNLSLNE
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 CFIKLPKGLGRPGKGHYWTIDPASEFMFEEGSFRRRPRGFRRKCQALKPMYHRVVSGLGF
::.:.:. .:::: :::.:: : :::.::: :: : :..: .:.: .. :
CCDS44 CFVKVPRDDKKPGKGSYWTLDPDSYNMFENGSFLRRRRRFKKK-DAVKDKEEKDRLHLKE
140 150 160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 GASLLPQGFDFQAPPSAPLGCHSQGGYGGLDMMPAGYDAGAGAPSHAHPHHHHHHHVPHM
: : . :: :: : :..: .: .: : .
CCDS44 PP---PPG---RQPPPAP---------------PEQADGNAPGP---QP--------PPV
200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 SPNPGSTYMASCPVPAGPGGVGAAGGGGGGDYGPDSSSSPVPSSPAMASAIECHSPYTSP
. .: ..:: : : . .:: :.:.. : . :: :: ...:. : . :
CCDS44 RIQDIKTENGTCPSPPQPLSPAAALGSGSAAAVP-KIESPDSSSSSLSSG--SSPPGSLP
230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 AAH-WSSPGASPYLKQPPALTPSSNPAA-SAGLHSSMSSYSLEQSYLHQNAREDLSVGLP
.:. : ::. . :: .::. : : :. . ::. : :.: .:: ::
CCDS44 SARPLSLDGAD---SAPPPPAPSAPPPHHSQGFSVDNIMTSLRGS--PQSAAAELSSGLL
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440
pF1KB9 RYQHHSTPVCDRKDFVLNFNGISSFHPSASGSYYHHHHQSVCQDIKPCVM
CCDS44 ASAAASSRAGIAPPLALGAYSPGQSSLYSSPCSQTSSAGSSGGGGGGAGAAGGAGGAGTY
340 350 360 370 380 390
444 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:09:41 2016 done: Sat Nov 5 01:09:41 2016
Total Scan time: 3.320 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]