Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6461
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6461, 321 aa
1>>>pF1KB6461 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6128+/-0.000765; mu= 11.0436+/- 0.046
mean_var=121.5235+/-23.289, 0's: 0 Z-trim(112.8): 128 B-trim: 16 in 1/50
Lambda= 0.116344
statistics sampled from 13414 (13549) to 13414 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12184.1 FCER2 gene_id:2208|Hs108|chr19 ( 321) 2221 383.3 1.4e-106
CCDS12185.1 CLEC4G gene_id:339390|Hs108|chr19 ( 293) 438 84.0 1.6e-16
CCDS59347.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 ( 263) 399 77.4 1.4e-14
CCDS82049.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 289) 379 74.1 1.5e-13
CCDS12187.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 ( 399) 381 74.5 1.5e-13
CCDS45598.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 292) 377 73.7 1.9e-13
CCDS32544.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 311) 377 73.8 2e-13
CCDS45597.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 292) 376 73.6 2.2e-13
CCDS59344.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 268) 375 73.4 2.3e-13
CCDS56087.1 CLEC17A gene_id:388512|Hs108|chr19 ( 378) 377 73.8 2.4e-13
CCDS11088.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 ( 287) 367 72.1 6.1e-13
CCDS45952.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 312) 367 72.1 6.5e-13
CCDS56017.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17 ( 252) 363 71.3 8.8e-13
CCDS11089.1 ASGR1 gene_id:432|Hs108|chr17 ( 291) 363 71.4 9.8e-13
CCDS45949.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 360) 351 69.4 4.7e-12
CCDS45950.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 380) 351 69.5 4.9e-12
CCDS12186.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 404) 351 69.5 5.1e-12
CCDS59345.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 ( 243) 339 67.3 1.4e-11
CCDS11087.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 ( 316) 338 67.2 1.9e-11
CCDS1149.1 BCAN gene_id:63827|Hs108|chr1 ( 911) 341 68.1 3.1e-11
CCDS12397.1 NCAN gene_id:1463|Hs108|chr19 (1321) 340 68.0 4.6e-11
>>CCDS12184.1 FCER2 gene_id:2208|Hs108|chr19 (321 aa)
initn: 2221 init1: 2221 opt: 2221 Z-score: 2026.9 bits: 383.3 E(32554): 1.4e-106
Smith-Waterman score: 2221; 99.7% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 DYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS12 DYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDRLATCTPPASEGSAESM
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB6 GPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
:::::::::::::::::::::
CCDS12 GPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
310 320
>>CCDS12185.1 CLEC4G gene_id:339390|Hs108|chr19 (293 aa)
initn: 448 init1: 196 opt: 438 Z-score: 410.1 bits: 84.0 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 438; 29.7% identity (56.8% similar) in 273 aa overlap (19-288:29-293)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MEEGQYSEIEELPRRRCCRRGTQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTT
:: ..: :::..::: .:..::
CCDS12 MDTTRYSKWGGSSEEVPGGPWGRWVHWSRRPLFLALAVLVTTVLWAVILSILLSKASTER
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 QSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELS
.: . .. :.:. . : . . . .: . . .:. ::: . ... .:
CCDS12 AALLDGHDLLRTNASKQTAALGALKEEVGDCHSCCSGTQAQLQTTRAELGEAQAKLMEQE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 WNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINF
: :. ... .. :... : : : : .:: .: :. :: .:..:
CCDS12 SALRELRERVTQGLAEAGRGREDVRTELFRALEAV-----RLQNNS---CEPCPTSWLSF
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKG
. .::.:. :. :. : : ..:: . . .:: :::... : :.::: . :
CCDS12 EGSCYFFSVPKTTWAAAQDHCADASAHLVIVGGLDEQGFLTRNTRGRGYWLGLRAVRHLG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB6 E---FIWVDGSHVDYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLAT
. . :::: ...:.: :::.. :.:::: .: :::: :: . .:.:.. .
CCDS12 KVQGYQWVDGVSLSFSHWNQGEPNDAWGRENCVMMLHTGLWNDAPCDSEKDGWICEKRHN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KB6 CTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
:
CCDS12 C
>>CCDS59347.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 (263 aa)
initn: 343 init1: 169 opt: 399 Z-score: 375.3 bits: 77.4 E(32554): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 412; 33.0% identity (66.1% similar) in 230 aa overlap (64-288:51-259)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 LWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELE
::.: ..: .....: : .. ::.. .
CCDS59 TSGIRLFPRDFQFQQIHGHKSSTVPFLLGPVSKVPSSLSQEQSEQDAIYQNLTQLKAAVG
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 ELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQ
:: .:...:. :. .:. :.: .. :: :... :... .:.:.:. ..
CCDS59 EL-SEKSKLQ----EIYQELTQLKAAVG-----ELPEKSK----LQEIYQELTRLKAAVE
90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 VSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKH
.: ::. : :: .::..... ..: . ::.....::: :.. :::.:: .
CCDS59 R----LCRHCPKDWTFFQGNCYFMSNSQRNWHDSVTACQEVRAQLVVIKTAEEQNFLQLQ
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260
pF1KB6 ASHTG--SWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHVDYS---NWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRW
.:... ::.:: .:. .: . ::::: .. : : :::.. : .:::. . ::: :
CCDS59 TSRSNRFSWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLSPSFQRYWNSGEPNN-SGNEDCAEFSGSG-W
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 NDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
:: :: . :.: . :.:
CCDS59 NDNRCDVD-NYWICKKPAACFRDE
250 260
>>CCDS82049.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 (289 aa)
initn: 387 init1: 209 opt: 379 Z-score: 356.6 bits: 74.1 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 379; 31.4% identity (63.3% similar) in 210 aa overlap (86-283:74-278)
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNG
:..:. . :: : : :: : .. .
CCDS82 SLGLGLLLLVIICVVGFQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIAS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMEL-----QVSSGFVCNTCPEKWINF
:.:.. .::... ..: ...: ... :: .. ..:. .: :: .:..
CCDS82 LKAEVEGFKQERQAVHSEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNASTEGTC--CPVNWVEH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLKG
: .::.:... .:..:. :. ...:: :.: :::.:. :. . . .:.:: : .:
CCDS82 QDSCYWFSHSGMSWAEAEKYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWMGLS--DPEG
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB6 EFIWVDGSH--VDYSNWAPGEPTSRSQ-----GEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCD
. ::::. . ..:: ::.: . . ::::. .. .::::: :.: :::.
CCDS82 AWKWVDGTDYATGFQNWKPGQPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRPYH-WVCE
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320
pF1KB6 QLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
CCDS82 AGLGQTSQESH
280
>>CCDS12187.1 CLEC4M gene_id:10332|Hs108|chr19 (399 aa)
initn: 347 init1: 169 opt: 381 Z-score: 356.5 bits: 74.5 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 413; 32.6% identity (62.8% similar) in 239 aa overlap (57-288:174-395)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 LGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQST
:. ... : :.. :. . .::.
CCDS12 AAVGELPEKSKLQEIYQELTRLKAAVGELPEKSKLQEIYQELTRLKAAVGE-LPEKSKLQ
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 QISQELEELRAEQQRL--KSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREE
.: ::: ::.: .: ::. :. .:. :.: .. :: .... ... .:
CCDS12 EIYQELTELKAAVGELPEKSKLQEIYQELTQLKAAVG-----ELPDQSKQ----QQIYQE
210 220 230 240 250
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 VTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSP
.: :. .. .: ::. : :: .::..... ..: . ::.....::: :..
CCDS12 LTDLKTAFE----RLCRHCPKDWTFFQGNCYFMSNSQRNWHDSVTACQEVRAQLVVIKTA
260 270 280 290 300
210 220 230 240 250
pF1KB6 EEQDFLTKHASHTG--SWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHVDYS---NWAPGEPTSRSQGEDC
:::.:: ..:... ::.:: .:. .: . ::::: .. : : :::.. : .:::
CCDS12 EEQNFLQLQTSRSNRFSWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLSPSFQRYWNSGEPNN-SGNEDC
310 320 330 340 350 360
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 VMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPL
. . ::: ::: :: . :.: . :.:
CCDS12 AEFSGSG-WNDNRCDVD-NYWICKKPAACFRDE
370 380 390
>>CCDS45598.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 (292 aa)
initn: 362 init1: 228 opt: 377 Z-score: 354.8 bits: 73.7 E(32554): 1.9e-13
Smith-Waterman score: 377; 32.2% identity (63.0% similar) in 227 aa overlap (72-284:63-283)
50 60 70 80 90
pF1KB6 LLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQ--ISQELEELRAEQ
:.: : :. . .: . .:. .:
CCDS45 RLCSMVCFSLLALSFNILLLVVICVTGSQSEGHGGAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEV
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLR-----MELQV
: .... .. ....: : : . ..:.:. ..: :: .:.. . :: :::
CCDS45 QAISTHGGSVGDKITSLGAKLEK-QQQDLKADHDA--LLFHLKHFPVDLRFVACQMELLH
100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 SSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHA
:.: . :: .:.. : .::.:... : :..:. :. ...:: :.: ::: :...:.
CCDS45 SNGSQRTCCPVNWVEHQGSCYWFSHSGKAWAEAEKYCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHT
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260
pF1KB6 SHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV--DYSNWAPGEPTSR-----SQGEDCVMMRGSGR
. ..:::: . : : . ::::. .:.::: .: . . .:::: .. .::
CCDS45 NPFNTWIGLTDSD--GSWKWVDGTDYRHNYKNWAVTQPDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGR
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 WNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
::: :: .. :::..
CCDS45 WNDDFC-LQVYRWVCEKRRNATGEVA
270 280 290
>>CCDS32544.1 ASGR2 gene_id:433|Hs108|chr17 (311 aa)
initn: 362 init1: 228 opt: 377 Z-score: 354.4 bits: 73.8 E(32554): 2e-13
Smith-Waterman score: 377; 32.2% identity (63.0% similar) in 227 aa overlap (72-284:82-302)
50 60 70 80 90
pF1KB6 LLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQ--ISQELEELRAEQ
:.: : :. . .: . .:. .:
CCDS32 RLCSMVCFSLLALSFNILLLVVICVTGSQSEGHGGAQLQAELRSLKEAFSNFSSSTLTEV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QRLKSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLR-----MELQV
: .... .. ....: : : . ..:.:. ..: :: .:.. . :: :::
CCDS32 QAISTHGGSVGDKITSLGAKLEK-QQQDLKADHDA--LLFHLKHFPVDLRFVACQMELLH
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 SSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHA
:.: . :: .:.. : .::.:... : :..:. :. ...:: :.: ::: :...:.
CCDS32 SNGSQRTCCPVNWVEHQGSCYWFSHSGKAWAEAEKYCQLENAHLVVINSWEEQKFIVQHT
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KB6 SHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHV--DYSNWAPGEPTSR-----SQGEDCVMMRGSGR
. ..:::: . : : . ::::. .:.::: .: . . .:::: .. .::
CCDS32 NPFNTWIGLTDSD--GSWKWVDGTDYRHNYKNWAVTQPDNWHGHELGGSEDCVEVQPDGR
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 WNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
::: :: .. :::..
CCDS32 WNDDFC-LQVYRWVCEKRRNATGEVA
290 300 310
>>CCDS45597.1 CLEC10A gene_id:10462|Hs108|chr17 (292 aa)
initn: 387 init1: 209 opt: 376 Z-score: 353.8 bits: 73.6 E(32554): 2.2e-13
Smith-Waterman score: 376; 31.3% identity (63.0% similar) in 211 aa overlap (86-283:74-281)
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNG
:..:. . :: : : :: : .. .
CCDS45 SLGLGLLLLVIICVVGFQNSKFQRDLVTLRTDFSNFTSNTVAEIQALTSQGSSLEETIAS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 LQADLSSFKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQV--SSGFVCNT----CPEKWIN
:.:.. .::... ..: ...: ... :: .. . ..: .: :: .:..
CCDS45 LKAEVEGFKQERQAVHSEMLLRVQQLVQDLKKLTCQVATLNNNGEEASTEGTCCPVNWVE
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 FQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTKHASHTGSWIGLRNLDLK
: .::.:... .:..:. :. ...:: :.: :::.:. :. . . .:.:: : .
CCDS45 HQDSCYWFSHSGMSWAEAEKYCQLKNAHLVVINSREEQNFVQKYLGSAYTWMGLS--DPE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 GEFIWVDGSH--VDYSNWAPGEPTSRSQ-----GEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVC
: . ::::. . ..:: ::.: . . ::::. .. .::::: :.: :::
CCDS45 GAWKWVDGTDYATGFQNWKPGQPDDWQGHGLGGGEDCAHFHPDGRWNDDVCQRPYH-WVC
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320
pF1KB6 DQLATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
.
CCDS45 EAGLGQTSQESH
290
>>CCDS59344.1 CD209 gene_id:30835|Hs108|chr19 (268 aa)
initn: 231 init1: 161 opt: 375 Z-score: 353.5 bits: 73.4 E(32554): 2.3e-13
Smith-Waterman score: 388; 31.3% identity (61.5% similar) in 265 aa overlap (52-308:22-265)
30 40 50 60 70 80
pF1KB6 TQIVLLGLVTAALWAGLLTLLLLWHWDTTQSLKQLEERAARNVSQVSKNLESHHGDQMAQ
:..: . : . : .:.. :. ...
CCDS59 MSDSKEPRLQQLGLLVSKVPSSISQEQSRQD-AIYQNLTQLKAAVGE-LSE
10 20 30 40
90 100 110 120 130
pF1KB6 KSQSTQISQELEELRAEQQRL--KSQDLELSWNLNGLQADLSSFKSQELNERNEASDLLE
::. .: ::: .:.: .: ::. :. .:. :.: .. :: :... :.
CCDS59 KSKLQEIYQELTQLKAAVGELPEKSKLQEIYQELTRLKAAVG-----ELPEKSK----LQ
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 RLREEVTKLRMELQVSSGFVCNTCPEKWINFQRKCYYFGKGTKQWVHARYACDDMEGQLV
.. .:.: :. .. .:. :: .: :: .::..... ..: . :: .. .:::
CCDS59 EIYQELTWLKAAVER----LCHPCPWEWTFFQGNCYFMSNSQRNWHDSITACKEVGAQLV
110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 SIHSPEEQDFLTKHASHTG--SWIGLRNLDLKGEFIWVDGSHVDYS---NWAPGEPTSRS
:.: :::.:: ..:... .:.:: .:. .: . ::::: . : : :::.. .
CCDS59 VIKSAEEQNFLQLQSSRSNRFTWMGLSDLNQEGTWQWVDGSPLLPSFKQYWNRGEPNNVG
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 QGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQ-LATCTPPASEGSAESMGPDSRPDPDGRLP
. :::. . :.: ::: :. :.: . :.:. .: . : .: . :.:
CCDS59 E-EDCAEFSGNG-WNDDKCNLA-KFWICKKSAASCS--RDEEQFLSPAP-ATPNPPPA
220 230 240 250 260
320
pF1KB6 TPSAPLHS
>>CCDS56087.1 CLEC17A gene_id:388512|Hs108|chr19 (378 aa)
initn: 241 init1: 180 opt: 377 Z-score: 353.2 bits: 73.8 E(32554): 2.4e-13
Smith-Waterman score: 388; 34.5% identity (61.0% similar) in 200 aa overlap (93-288:196-378)
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 NVSQVSKNLESHHGDQMAQKSQSTQISQELEELRAEQQRLKSQDLELSWNLNGLQADLSS
.:: : . :. :.. :..:. : :..
CCDS56 QKRWMVYLCLLVVTSLFLGCLGLTVTLIKYQELMEELRMLSFQQMTWRTNMTGM-AGLAG
170 180 190 200 210 220
130 140 150 160 170
pF1KB6 FKSQELNERNEASDLLERLREEVTKLRMELQVSSGFV-CN--TCPEKWINFQRKCYYFGK
.: . . :.: .... .:: :.. : :::: :. :. :::::.
CCDS56 LKHD-----------IARVRADTNQSLVELW---GLLDCRRITCPEGWLPFEGKCYYFSP
230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GTKQWVHARYACDDMEGQLVSIHSPEEQDFLTK-HASHTGSWIGLRNLDLKGEFIWVDGS
.::.: .::. :.. ..:: :.: :..:..: :.: :.:: . .:.. :.:::
CCDS56 STKSWDEARMFCQENYSHLVIINSFAEHNFVAKAHGSPRVYWLGLNDRAQEGDWRWLDGS
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 HVDYSNWAPGEPTSRSQGEDCVMMRGSGRWNDAFCDRKLGAWVCDQLATCTPPASEGSAE
: : : : ::.. . :::. : .: ::: : : :.:.. .:
CCDS56 PVTLSFWEPEEPNN-IHDEDCATMNKGGTWNDLSC-YKTTYWICERKCSC
340 350 360 370
300 310 320
pF1KB6 SMGPDSRPDPDGRLPTPSAPLHS
321 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:13:58 2016 done: Sat Nov 5 01:13:59 2016
Total Scan time: 2.940 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]