FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5686, 480 aa 1>>>pF1KB5686 480 - 480 aa - 480 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6952+/-0.000844; mu= 16.6841+/- 0.051 mean_var=84.3434+/-16.478, 0's: 0 Z-trim(108.6): 57 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.139652 statistics sampled from 10290 (10347) to 10290 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16 Scan time: 2.330 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10515.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 480) 3231 660.8 8.9e-190 CCDS45400.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 453) 3026 619.5 2.3e-177 CCDS66930.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 ( 300) 1771 366.5 2.2e-101 CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 420) 428 96.0 8e-20 CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 462) 428 96.1 8.6e-20 CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 348) 416 93.6 3.7e-19 CCDS10726.1 DNAJA2 gene_id:10294|Hs108|chr16 ( 412) 416 93.6 4.2e-19 CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 340) 378 85.9 7.3e-17 CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 ( 337) 345 79.3 7.3e-15 CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 241) 338 77.8 1.5e-14 CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 326) 338 77.8 1.9e-14 CCDS3277.1 DNAJB11 gene_id:51726|Hs108|chr3 ( 358) 329 76.1 7.1e-14 CCDS45316.1 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 397) 327 75.7 1e-13 CCDS10299.2 DNAJA4 gene_id:55466|Hs108|chr15 ( 426) 327 75.7 1.1e-13 CCDS6533.1 DNAJA1 gene_id:3301|Hs108|chr9 ( 397) 324 75.1 1.6e-13 CCDS5752.1 DNAJB9 gene_id:4189|Hs108|chr7 ( 223) 304 70.9 1.6e-12 CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 277) 301 70.3 2.9e-12 CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 324) 301 70.4 3.3e-12 CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 ( 309) 296 69.4 6.4e-12 CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 ( 232) 287 67.5 1.8e-11 CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 ( 316) 282 66.5 4.6e-11 CCDS30606.1 DNAJC16 gene_id:23341|Hs108|chr1 ( 782) 285 67.4 6.2e-11 CCDS7316.2 DNAJB12 gene_id:54788|Hs108|chr10 ( 409) 281 66.4 6.5e-11 >>CCDS10515.1 DNAJA3 gene_id:9093|Hs108|chr16 (480 aa) initn: 3231 init1: 3231 opt: 3231 Z-score: 3520.6 bits: 660.8 E(32554): 8.9e-190 Smith-Waterman score: 3231; 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CCDS47 TAAPPLQARGAFRSFPHSWGEDFLASLMFKIQLEP-LKLRAWTLNGFVKFRNKETSAGPV 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB5 A--KEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYHPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSD : .:::.:::.: .:.. :::::: ..: ::::: ::. :.:.:::...::::.:::: CCDS47 AVMGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKE-PNAEEKFKEIAEAYDVLSD 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KB5 EVKRKQYDAYGSAGFDPG------ASGSQHSYWKGGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSFGDF :: :: :: :. : .::: : ..: ::. : ..:: .:. : : CCDS47 PKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFHG----DPHATFASFFG--GSNPFDIF 180 190 200 210 220 210 220 230 240 250 pF1KB5 --QTVFDQPQEYF----MELTFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQH--- .. .: : :.. .. :. .: : .. : . : ::: CCDS47 FASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFGFNGLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPV 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 pF1KB5 CHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSII-----ISPCVVCRGAGQAKQKKRVMIP : : : . . :. : :: . : . : :. :: :. .. .: CCDS47 VHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVRTEDKILHIVIKRGW---KEGTKITFP 290 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 VPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLGGTARAQG . :. .:. .: .... . :::::... . .::. .:: : :. CCDS47 KEG---DATPDNIPA---DIVFVLKDKPHAHFRRDGTNVLYSALISLKEALCGCTVNIPT 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 LYETI-----NVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRINSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQQS . . : .: ::: ...: : .:.. . :: ...:.: : ::: . .. CCDS47 IDGRVIPLPCNDVIKPGTV--KRLRGEGLPFPKVPTQ-RGDLIVEFKVRFPDRLTPQTRQ 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KB5 LILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAGSKARREAGEDEEGFLSKLKKMFTS .. CCDS47 ILKQHLPCS 460 >>CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (348 aa) initn: 353 init1: 162 opt: 416 Z-score: 457.4 bits: 93.6 E(32554): 3.7e-19 Smith-Waterman score: 433; 31.3% identity (54.2% similar) in 358 aa overlap (92-424:3-341) 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 TLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYH .:::.:::.: .:.. :::::: ..: ::: CCDS35 MGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYH 10 20 30 130 140 150 160 170 pF1KB5 PDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPG------ASGSQHSYWK :: ::. :.:.:::...::::.:::: :: :: :: :. : .::: : .. CCDS35 PDKNKE-PNAEEKFKEIAEAYDVLSDPKKRGLYDQYGEEGLKTGGGTSGGSSGSFHYTFH 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 pF1KB5 GGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSFGDF--QTVFDQPQEYF----MELTFNQAAKGVNKEFT : ::. : ..:: .:. : : .. .: : :.. .. :. .: CCDS35 G----DPHATFASFFG--GSNPFDIFFASSRSTRPFSGFDPDDMDVDEDEDPFGAFGRFG 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 VNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQH---CHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSII- : .. : . : ::: : : : . . :. : :: . : . CCDS35 FNGLSRGPRRAPEPLYPRRKVQDPPVVHELRVSLEEIYHGSTKRMKITRRRLNPDGRTVR 150 160 170 180 190 200 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 ----ISPCVVCRGAGQAKQKKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRR : :. :: :. .. .: : :. .:. .: .... . ::: CCDS35 TEDKILHIVIKRGW---KEGTKITFP-KEG--DATPDNIPA---DIVFVLKDKPHAHFRR 210 220 230 240 250 350 360 370 380 390 pF1KB5 DGADIHSDLFISIAQALLGGTARAQGLYETI-----NVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRI ::... . .::. .:: : :. . . : .: ::: ...: : .:.. CCDS35 DGTNVLYSALISLKEALCGCTVNIPTIDGRVIPLPCNDVIKPGTV--KRLRGEGLPFPKV 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 NSYGYGDHYIHIKIRVPKRLTSRQQSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAG . :: ...:.: : ::: . .... CCDS35 PTQ-RGDLIVEFKVRFPDRLTPQTRQILKQHLPCS 320 330 340 >>CCDS10726.1 DNAJA2 gene_id:10294|Hs108|chr16 (412 aa) initn: 341 init1: 136 opt: 416 Z-score: 456.4 bits: 93.6 E(32554): 4.2e-19 Smith-Waterman score: 509; 31.7% identity (55.8% similar) in 416 aa overlap (87-466:2-393) 60 70 80 90 100 110 pF1KB5 PRALLTLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQL : .: :.::::: .::..:.:::: .: CCDS10 MANVADTKLYDILGVPPGASENELKKAYRKL 10 20 30 120 130 140 150 160 170 pF1KB5 AKKYHPDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPGASGSQHSYWKG ::.:::: : :.: .::.... ::::::. ::. :: :: :. :..: : CCDS10 AKEYHPDKN---PNAGDKFKEISFAYEVLSNPEKRELYDRYGEQGLREGSGG-------G 40 50 60 70 80 180 190 200 210 220 pF1KB5 GPTVDPEELFRKIFGE--FS-----SSSFGDFQTVFD--QPQEYFMELTFNQAAKGVNKE : : .: .::: :. : : . . : .: . .: .: .: .. . CCDS10 GGMDD---IFSHIFGGGLFGFMGNQSRSRNGRRRGEDMMHPLKVSLEDLYN--GKTTKLQ 90 100 110 120 130 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 FTVNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQHCHYCGGSGMETI--NTGPFV---MRSTCRRCGGRG .. :.. : :.:.:.. :. ::.: : : :.. . . .: . :.:.: :.:.: CCDS10 LSKNVL--CSACSGQGGKSGA-VQKCSACRGRGVRIMIRQLAPGMVQQMQSVCSDCNGEG 140 150 160 170 180 190 290 300 310 320 330 pF1KB5 SIIISP--CVVCRGAGQAKQKKRVMIPVPAGVEDGQTV-------RMP-VGKREIFITFR .: : :.: :. : . . : :.. :: . . : : .: . .. CCDS10 EVINEKDRCKKCEGKKVIKEVKILEVHVDKGMKHGQRITFTGEADQAPGVEPGDIVLLLQ 200 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 pF1KB5 VQKSPVFRRDGADIHSDLFISIAQALLGGTARAQGLY-ETINVTIPPGTQTDQK-IRM-G .. ::.::: :.: :....:: : . : . : : ::: . .:. CCDS10 EKEHEVFQRDGNDLHMTYKIGLVEALCGFQFTFKHLDGRQIVVKYPPGKVIEPGCVRVVR 260 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 GKGIPRI-NSYGYGDHYIHIKIRVPKR------LTSRQQSLILSYAEDETDVEGTVNGVT :.:.:. : . :: ::.. .. :. :. ..:. : : .. : .. : CCDS10 GEGMPQYRNPFEKGDLYIKFDVQFPENNWINPDKLSELEDLLPSRPE-VPNIIGETEEVE 320 330 340 350 360 370 450 460 470 480 pF1KB5 LTSSGGSTMDSSAGSKA--RREAGEDEEGFLSKLKKMFTS : . .::. :: . :::: .: CCDS10 L-----QEFDSTRGSGGGQRREAYNDSSDEESSSHHGPGVQCAHQ 380 390 400 410 >>CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 (340 aa) initn: 218 init1: 148 opt: 378 Z-score: 416.2 bits: 85.9 E(32554): 7.3e-17 Smith-Waterman score: 378; 29.6% identity (56.4% similar) in 351 aa overlap (92-424:3-334) 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 TLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYH .:::: ::. :.::..:::.:: . : .:: CCDS12 MGKDYYQTLGLARGASDEEIKRAYRRQALRYH 10 20 30 130 140 150 160 170 pF1KB5 PDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYG---------SAGFDPGASGSQHS :: ::. : :.:::...::::.:::: ::. .: :: :.: ::.:.. : CCDS12 PDKNKE-PGAEEKFKEIAEAYDVLSDPRKREIFDRYGEEGLKGSGPSGGSGGGANGTSFS 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 pF1KB5 YWKGGPTVDPEELFRKIFGEFSSSSFGDFQTVFDQPQ-EYFMELT--FNQAAKGVNKEFT : : ::. .: ..:: . . :.: : : . : :.. :. :.. . CCDS12 YTFHG---DPHAMFAEFFG-----GRNPFDTFFGQRNGEEGMDIDDPFSGFPMGMGGFTN 100 110 120 130 140 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 VNIMDTCERCNGKGNEPGTKVQH---CHYCGGSGMETINTG-PFVMRSTCRRCGGRGSII ::. . : ...::. : : : : .: : .: :. . .: . :. : CCDS12 VNFGRS--R---SAQEPARKKQDPPVTHDLRVS-LEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSI 150 160 170 180 190 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 ISPCVVCRGAGQAKQKKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGAD . . . :. . : : ..:. . . .:. .. . .:.:::.: CCDS12 RNEDKILTIEVKKGWKEGTKITFP---KEGDQTSNNIPADIVFV-LKDKPHNIFKRDGSD 200 210 220 230 240 250 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 IHSDLFISIAQALLGGTARAQGLY-ETINVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRINS-YGYGD . ::. .:: : :. . : .:: :.. . .. .. :.:.: .. :: CCDS12 VIYPARISLREALCGCTVNVPTLDGRTIPVVFKDVIRPGMRRKVPGEGLPLPKTPEKRGD 260 270 280 290 300 310 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 HYIHIKIRVPKRLTSRQQSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAGSKARREA :.... :.:. . ..... CCDS12 LIIEFEVIFPERIPQTSRTVLEQVLPI 320 330 340 >>CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 (337 aa) initn: 336 init1: 155 opt: 345 Z-score: 380.3 bits: 79.3 E(32554): 7.3e-15 Smith-Waterman score: 345; 28.6% identity (53.2% similar) in 346 aa overlap (92-424:3-330) 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 TLRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYH .::: :::. ..::...::::: . : :.: CCDS68 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFH 10 20 30 130 140 150 160 170 pF1KB5 PDTNKDDPKAKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPGASGS--QHSYWKGGPT :: ::. :.:.:::...::::::::: ::. :: .: :. ::.:. : . .. CCDS68 PDKNKS-PQAEEKFKEVAEAYEVLSDPKKREIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFRYTFH 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 VDPEELFRKIFGEFSSSSFGDF--QTVFDQPQEYFMELTFNQ-AAKGVNKEFTVNIMDTC ::. : .:: .:. : : . . . ::. . .: : :..: . CCDS68 GDPHATFAAFFG--GSNPFEIFFGRRMGGGRDSEEMEIDGDPFSAFG----FSMNGYPRD 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 ERCNGKGN-EPGTKVQHCHYCGGSGMETINTG-PFVMRSTCRRCGGRGSIIISPCVVCRG . : . . : : . .: : .: :. . .: .. : : . CCDS68 RNSVGPSRLKQDPPVIHELRVS---LEEIYSGCTKRMKISRKRLNADGRSYRSEDKILTI 150 160 170 180 190 200 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 AGQAKQKKRVMIPVPAGVEDGQTVRMPVGKREIFITFRVQKSPVFRRDGADIHSDLFISI . :. . : : ..:. . . .:: .. . : :.:::..: ::. CCDS68 EIKKGWKEGTKITFP---REGDETPNSIPADIVFI-IKDKDHPKFKRDGSNIIYTAKISL 210 220 230 240 250 360 370 380 390 400 pF1KB5 AQALLG-----GTARAQGLYETINVTIPPGTQTDQKIRMGGKGIPRI-NSYGYGDHYIHI .:: : : .... ..: . :: . :. : :.: : :: :.. CCDS68 REALCGCSINVPTLDGRNIPMSVNDIVKPGMRR----RIIGYGLPFPKNPDQRGDLLIEF 260 270 280 290 300 310 410 420 430 440 450 460 pF1KB5 KIRVPKRLTSRQQSLILSYAEDETDVEGTVNGVTLTSSGGSTMDSSAGSKARREAGEDEE .. : ..: .. .. CCDS68 EVSFPDTISSSSKEVLRKHLPAS 320 330 >>CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 (241 aa) initn: 349 init1: 157 opt: 338 Z-score: 374.8 bits: 77.8 E(32554): 1.5e-14 Smith-Waterman score: 338; 48.4% identity (74.2% similar) in 124 aa overlap (93-212:3-122) 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 LRPGVSLTGTKHNPFICTASFHTSAPLAKEDYYQILGVPRNASQKEIKKAYYQLAKKYHP :::..::: :.:: ..::::: .:: :.:: CCDS47 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHP 10 20 30 130 140 150 160 170 pF1KB5 DTNKDDPK-AKEKFSQLAEAYEVLSDEVKRKQYDAYGSAGFDPGASGSQH--SYWKGGPT : : .. . :..::.:.::::::::: :: :: ::. :.. :..:..: : .. : : CCDS47 DKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAKKRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDSPFEFGFT 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 V-DPEELFRKIFGEFSSSSFGDFQTVFDQPQEYFMELTFNQAAKGVNKEFTVNIMDTCER .:...::..:: . :: :: :..: : : CCDS47 FRNPDDVFREFFGGRDPFSF-DF---FEDPFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFP 100 110 120 130 140 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 CNGKGNEPGTKVQHCHYCGGSGMETINTGPFVMRSTCRRCGGRGSIIISPCVVCRGAGQA CCDS47 SFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTSFSSTSFGGSGMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRI 150 160 170 180 190 200 480 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 04:05:03 2016 done: Mon Nov 7 04:05:04 2016 Total Scan time: 2.330 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]