Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0377
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0377, 494 aa
1>>>pF1KE0377 494 - 494 aa - 494 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3294+/-0.000825; mu= 17.9129+/- 0.050
mean_var=64.6978+/-13.065, 0's: 0 Z-trim(106.5): 74 B-trim: 47 in 1/51
Lambda= 0.159452
statistics sampled from 8933 (9009) to 8933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 ( 494) 3305 769.1 0
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 3109 724.1 8.7e-209
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 3033 706.6 1.6e-203
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 1867 438.3 8.8e-123
CCDS12572.1 CYP2F1 gene_id:1572|Hs108|chr19 ( 491) 1788 420.2 2.6e-117
CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 ( 490) 1746 410.5 2.1e-114
CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 490) 1709 402.0 7.7e-112
CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 490) 1702 400.4 2.3e-111
CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 ( 490) 1697 399.2 5.2e-111
CCDS12573.1 CYP2S1 gene_id:29785|Hs108|chr19 ( 504) 1642 386.6 3.4e-107
CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 ( 493) 1620 381.5 1.1e-105
CCDS73166.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 420) 1451 342.6 4.9e-94
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 1336 316.2 5.3e-86
CCDS55721.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 388) 1330 314.8 1.1e-85
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 1139 270.9 2.3e-72
CCDS5319.2 CYP2W1 gene_id:54905|Hs108|chr7 ( 490) 1116 265.6 8.9e-71
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 1105 263.1 5.2e-70
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 1036 247.2 3.4e-65
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 869 208.7 1e-53
CCDS44460.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 431) 858 206.2 5.9e-53
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 733 177.5 3.1e-44
CCDS10268.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 ( 512) 690 167.6 2.9e-41
CCDS32293.1 CYP1A2 gene_id:1544|Hs108|chr15 ( 516) 671 163.2 6.1e-40
CCDS4735.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 495) 586 143.7 4.5e-34
CCDS1793.1 CYP1B1 gene_id:1545|Hs108|chr2 ( 543) 573 140.7 3.9e-33
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 463 115.4 1.5e-25
CCDS81906.1 CYP1A1 gene_id:1543|Hs108|chr15 ( 483) 454 113.3 6.1e-25
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 448 111.9 1.6e-24
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 442 110.5 4.3e-24
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 441 110.3 5e-24
CCDS47406.1 CYP21A2 gene_id:1589|Hs108|chr6 ( 465) 432 108.2 2e-23
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 416 104.6 2.7e-22
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 416 104.6 2.9e-22
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 385 97.4 3.9e-20
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 370 94.0 4.2e-19
CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 360 91.6 1.8e-18
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 355 90.5 4.6e-18
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 352 89.8 7.3e-18
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 352 89.8 7.4e-18
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 ( 500) 350 89.4 1e-17
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 322 82.9 7.1e-16
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 320 82.4 9.3e-16
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 314 81.1 3.3e-15
CCDS7426.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10 ( 497) 298 77.4 4e-14
CCDS46616.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 448) 297 77.2 4.3e-14
CCDS6392.1 CYP11B1 gene_id:1584|Hs108|chr8 ( 503) 288 75.1 2e-13
CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 288 75.1 2e-13
CCDS6393.1 CYP11B2 gene_id:1585|Hs108|chr8 ( 503) 282 73.7 5.2e-13
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 277 72.6 1.2e-12
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 272 71.4 2.6e-12
>>CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 (494 aa)
initn: 3305 init1: 3305 opt: 3305 Z-score: 4105.6 bits: 769.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3305; 100.0% identity (100.0% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 GQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGF
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE0 ATIPRNYTMSFLPR
::::::::::::::
CCDS12 ATIPRNYTMSFLPR
490
>>CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 (494 aa)
initn: 3109 init1: 3109 opt: 3109 Z-score: 3861.9 bits: 724.1 E(32554): 8.7e-209
Smith-Waterman score: 3109; 93.5% identity (98.4% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
:::::.:::.::.:::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLASGMLLVALLVCLTVMVLMSVWQQRKSKGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::.:::
CCDS12 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVVFSN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS12 GERAKQLRRFSIATLRDFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTGGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
:::::::::::::.::::::::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::::.
CCDS12 VISSIVFGDRFDYKDKEFLSLLRMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS12 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS12 GGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYMEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK
::::..::.::.::.::::::::::::::::.:::::::::: :::::.::::::::..:
CCDS12 RFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVYPMLGSVLRDPSFFSNPQDFNPQHFLNEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 GQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGF
::::::::::::::::: :::::::::::::::::.:::::.:: :::::::::::::::
CCDS12 GQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKDIDVSPKHVGF
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE0 ATIPRNYTMSFLPR
::::::::::::::
CCDS12 ATIPRNYTMSFLPR
490
>>CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 (494 aa)
initn: 3033 init1: 3033 opt: 3033 Z-score: 3767.4 bits: 706.6 E(32554): 1.6e-203
Smith-Waterman score: 3033; 91.5% identity (97.4% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
:::::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.. .:.::
CCDS12 MLASGLLLVALLACLTVMVLMSVWQQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEHICDSIMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
.:: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS12 FSECYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVREALVDQAEEFSGRGEQATFDWVFKGYGVAFSN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
::::::: ::.::::: :::::::::::::::.::::.:.:.::::::::::::::::::
CCDS12 GERAKQLLRFAIATLRDFGVGKRGIEERIQEESGFLIEAIRSTHGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
:::::::::::::::::::::: :::: ::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLSMMLGIFQFTSTSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
::::::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::.
CCDS12 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPQDFIDSFLIHMQEEEKNPNTEFYLKNLMMSTLNLFI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::
CCDS12 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRTKMPYMEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 RFGDMLPMGLAHRVNKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPRFFSNPRDFNPQHFLDKK
::::..::.::.::.::::::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::: :
CCDS12 RFGDVIPMSLARRVKKDTKFRDFFLPKGTEVFPMLGSVLRDPSFFSNPQDFNPQHFLDDK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 GQFKKSDAFVPFSIGKRYCFGEGLARMELFLFFTTIMQNFRFKSPQSPKDIDVSPKHVGF
::::::::::::::::: :::::::::::::::::.:::::.:: ::::::::::::: :
CCDS12 GQFKKSDAFVPFSIGKRNCFGEGLARMELFLFFTTVMQNFRLKSSQSPKDIDVSPKHVVF
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE0 ATIPRNYTMSFLPR
::::::::::::::
CCDS12 ATIPRNYTMSFLPR
490
>>CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 (491 aa)
initn: 1867 init1: 1867 opt: 1867 Z-score: 2317.8 bits: 438.3 E(32554): 8.8e-123
Smith-Waterman score: 1867; 53.4% identity (84.5% similar) in 489 aa overlap (6-494:3-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
: .. .:: :: ..:. : :. ... .::::: :::..:: ::.. . . .:...
CCDS12 MELSVLLFLALLTGLLLLLVQRHPNTHDRLPPGPRPLPLLGNLLQMDRRGLLKSFLR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
. :.:: :::.::::: ::.::: .:..:::::.:: :::::. : : .:.:::: :.:
CCDS12 FREKYGDVFTVHLGPRPVVMLCGVEAIREALVDKAEAFSGRGKIAMVDPFFRGYGVIFAN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
:.: : :::::..:.: ::.:::..:::::::: ::. :: ..:: .::::... ..:
CCDS12 GNRWKVLRRFSVTTMRDFGMGKRSVEERIQEEAQCLIEELRKSKGALMDPTFLFQSITAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
.: ::::: :: :.:.:::..: .. .:.. .. :::.:.::. .:..:: ..:..:.
CCDS12 IICSIVFGKRFHYQDQEFLKMLNLFYQTFSLISSVFGQLFELFSGFLKYFPGAHRQVYKN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
:: .. .:...::....::::..:.:.::..:..:..:..: ..:: .:: ..::.:::
CCDS12 LQEINAYIGHSVEKHRETLDPSAPKDLIDTYLLHMEKEKSNAHSEFSHQNLNLNTLSLFF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
:::::.::::::::::..:.:.: .:..::..::: .: :...::::::::::::.:::
CCDS12 AGTETTSTTLRYGFLLMLKYPHVAERVYREIEQVIGPHRPPELHDRAKMPYTEAVIYEIQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
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CCDS74 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTN
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CCDS74 FSKVYGPVFTVYFGMNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSN
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CCDS74 VICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKN
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