FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5004, 914 aa 1>>>pF1KE5004 914 - 914 aa - 914 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3210+/-0.000363; mu= 16.3181+/- 0.023 mean_var=79.8459+/-15.489, 0's: 0 Z-trim(114.0): 13 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.143532 statistics sampled from 23627 (23635) to 23627 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.277), width: 16 Scan time: 12.560 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001276 (OMIM: 603906) calcium-activated chlorid ( 914) 6038 1260.4 0 NP_036260 (OMIM: 616857) calcium-activated chlorid ( 919) 3726 781.6 0 XP_011539317 (OMIM: 616857) PREDICTED: calcium-act ( 868) 3536 742.3 2.5e-213 NP_006527 (OMIM: 604003) calcium-activated chlorid ( 943) 2539 535.8 3.7e-151 XP_011540750 (OMIM: 604003) PREDICTED: calcium-act ( 616) 1743 370.9 1e-101 >>NP_001276 (OMIM: 603906) calcium-activated chloride ch (914 aa) initn: 6038 init1: 6038 opt: 6038 Z-score: 6750.7 bits: 1260.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6038; 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XP_011 GGSCLSRACRIDSTTKLYGKDCQFFPDKVQTEKASIMFMQSIDSVVEFCNEKTHNQEAPS 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 KQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSLLQIGQRIVCLVLDKSGSMATGN :: :::.::::::: .:::::.: ::.: :: :.::::.:.::::::::::::::. . XP_011 LQNIKCNFRSTWEVISNSEDFKNTIPMVTPPPPPVFSLLKISQRIVCLVLDKSGSMGGKD 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 RLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNELIQINSGSDRDTLAKRLPAAASG ::::.:::.. ::::::: ::::::: :::.: . :.::::.:...:.:: ::. : XP_011 RLNRMNQAAKHFLLQTVENGSWVGMVHFDSTATIVNKLIQIKSSDERNTLMAGLPTYPLG 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 GTSICSGLRSAFTVIRKKYPT-DGSEIVLLTDGEDNTISGCFNEVKQSGAIIHTVALGPS :::::::.. :: :: . . ::::..::::::::: :.:..::::::::.: .::: . XP_011 GTSICSGIKYAFQVIGELHSQLDGSEVLLLTDGEDNTASSCIDEVKQSGAIVHFIALGRA 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 AAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSGNGAVSQRSIQLESKGLTLQNSQ : . . :.::.::: . :.::..::::::::::::.::: .::.:.:::::::::... XP_011 ADEAVIEMSKITGGSHFYVSDEAQNNGLIDAFGALTSGNTDLSQKSLQLESKGLTLNSNA 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE5 WMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQKQGGFVVDKNTKMAYLQIPGIAK ::: :::.::::::::.:::::. ::.: :::::: . .:.:: ..:::::.::: :: XP_011 WMNDTVIIDSTVGKDTFFLITWNSLPPSISLWDPSGTIMENFTVDATSKMAYLSIPGTAK 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 pF1KE5 VGTWKYSLQASS--QTLTLTVTSRASNATLPPITVTSKTNKDTSKFPSPLVVYANIRQGA :::: :.:::.. .:::.::::::.:...:::::..: :::...::::..:::.: :: XP_011 VGTWAYNLQAKANPETLTITVTSRAANSSVPPITVNAKMNKDVNSFPSPMIVYAEILQGY 520 530 540 550 560 570 620 630 640 650 660 670 pF1KE5 SPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDGVYSRYFTTYDTNGRYSVKVRAL :.: :.:::.::: ::.: .:::::::::::. :.:::::::::.: :::::.:::: XP_011 VPVLGANVTAFIESQNGHTEVLELLDNGAGADSFKNDGVYSRYFTAYTENGRYSLKVRAH 580 590 600 610 620 630 680 690 700 710 720 730 pF1KE5 GGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEINKDDVQHKQVCFSRTSSGGSFV ::.:.:: .. : . : :::::. : ::. :::::::. .:.: ::::.:::.:: XP_011 GGANTARLKLRPPLNRAAYIPGWVVNGEIEANPPRPEID-EDTQTTLEDFSRTASGGAFV 640 650 660 670 680 740 750 760 770 780 790 pF1KE5 ASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDYDHGTAHKYIIRISTSILD .:.::. :.:: .::.::::: : .: ..: ::::::::..: : ...::::::.:::: XP_011 VSQVPSLPLPDQYPPSQITDLDATVHEDKII-LTWTAPGDNFDVGKVQRYIIRISASILD 690 700 710 720 730 740 800 810 820 830 840 850 pF1KE5 LRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFENGTDLFIAIQAVDKVDLKSEISN :::.:...:::::: : ::::::.: : ::::::. ::.: .::::...:: .: :..:: XP_011 LRDSFDDALQVNTTDLSPKEANSKESFAFKPENISEENATHIFIAIKSIDKSNLTSKVSN 750 760 770 780 790 800 860 870 880 890 900 910 pF1KE5 IARVSLFIPPQTPPET-PSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILKIMWKWIGELQLSIA ::.:.:::: .: . :.: : .: :. :: :..: .. . :: XP_011 IAQVTLFIPQANPDDIDPTPTPTPTPTPDKSHNS---GVNISTLVLSVIGSVVIVNFILS 810 820 830 840 850 860 XP_011 TTI >>NP_006527 (OMIM: 604003) calcium-activated chloride ch (943 aa) initn: 2091 init1: 588 opt: 2539 Z-score: 2834.7 bits: 535.8 E(85289): 3.7e-151 Smith-Waterman score: 2630; 45.6% identity (75.9% similar) in 906 aa overlap (2-878:8-899) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MGPFKSSVFILILHLLEGALS--NSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQ ::. . :. .: : . : .. .::..:::.:...::.:.:::...::.. 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