FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5004, 914 aa 1>>>pF1KE5004 914 - 914 aa - 914 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3070+/-0.00086; mu= 16.3568+/- 0.052 mean_var=77.4589+/-15.049, 0's: 0 Z-trim(106.7): 12 B-trim: 40 in 1/52 Lambda= 0.145726 statistics sampled from 9108 (9113) to 9108 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16 Scan time: 4.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS709.1 CLCA1 gene_id:1179|Hs108|chr1 ( 914) 6031 1277.8 0 CCDS41355.1 CLCA4 gene_id:22802|Hs108|chr1 ( 919) 3726 793.2 0 CCDS708.1 CLCA2 gene_id:9635|Hs108|chr1 ( 943) 2539 543.7 6.2e-154 >>CCDS709.1 CLCA1 gene_id:1179|Hs108|chr1 (914 aa) initn: 6031 init1: 6031 opt: 6031 Z-score: 6845.1 bits: 1277.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6031; 99.9% identity (100.0% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGPFKSSVFILILHLLEGALSNSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 MGPFKSSVFILILHLLEGALSNSLIQLNNNGYEGIVVAIDPNVPEDETLIQQIKDMVTQA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 SLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTE ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 SLYLLEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPPGNDEPYTE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 RIQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMFA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 RIQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQSRQTEKASIMFA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 QHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 QHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPMTTQPPNPTFSLL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 QIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNELI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 QIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMVTFDSAAHVQNELI 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 QINSGSDRDTLAKRLPAAASGGTSICSGLRSAFTVIRKKYPTDGSEIVLLTDGEDNTISG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 QINSGSDRDTLAKRLPAAASGGTSICSGLRSAFTVIRKKYPTDGSEIVLLTDGEDNTISG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 CFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSGNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 CFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQNNGLIDAFGALSSGNG 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 AVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQKQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 AVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTMQPPQILLWDPSGQKQG 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 GFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQASSQTLTLTVTSRASNATLPPITVTSKTNKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 GFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQASSQTLTLTVTSRASNATLPPITVTSKTNKD 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE5 TSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDGVYSR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 TSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTVTLELLDNGAGADATKDDGVYSR 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE5 YFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEINKDD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 YFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAARRRVIPQQSGALYIPGWIENDEIQWNPPRPEINKDD 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE5 VQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 VQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQITDLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDY 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE5 DHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFENGTDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 DHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPKEANSEEVFLFKPENITFENGTDL 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE5 FIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLFIPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 FIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLFIPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILK 850 860 870 880 890 900 910 pF1KE5 IMWKWIGELQLSIA :::::::::::::: CCDS70 IMWKWIGELQLSIA 910 >>CCDS41355.1 CLCA4 gene_id:22802|Hs108|chr1 (919 aa) initn: 2799 init1: 1048 opt: 3726 Z-score: 4226.0 bits: 793.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3726; 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CCDS41 STYLFEATEKRFFFKNVSILIPENWKENPQYKRPKHENHKHADVIVAPPTLPGRDEPYTK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 QMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKLAEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNNDEKFYLSNG :. .:::::: ::.:::.. ::: :::: :. :::::::::::::::::.:. :: ... 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CCDS70 MTQRSIAGPICNLKFVTLLVALSSELPFLGAGVQLQDNGYNGLLIAINPQVPENQNLISN 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 IKDMVTQASLYLFEATGKRFYFKNVAILIPETWKTKADYVRPKLETYKNADVLVAESTPP ::.:.:.::.:::.:: .: .:.:. :::: :::.. . . : :.:..:.:.:.. CCDS70 IKEMITEASFYLFNATKRRVFFRNIKILIPATWKANNNS-KIKQESYEKANVIVTDWYGA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 GNDEPYTEQMGNCGEKGERIHLTPDFIAGKKL-AEYGPQGRAFVHEWAHLRWGVFDEYNN .:.::: :. .::..:. ::.::.:. . .: : :: .::.:::::::::::::::::: CCDS70 HGDDPYTLQYRGCGKEGKYIHFTPNFLLNDNLTAGYGSRGRVFVHEWAHLRWGVFDEYNN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE5 DEKFYLSNGR--IQAVRCSAGITGTNVVKKCQGGSCYTKRCTFNKVTGLYEKGCEFVLQS :. ::. ::. :...:::. ::: : :. : : . : ..: :...:: :. .: CCDS70 DKPFYI-NGQNQIKVTRCSSDITGIFV---CEKGPCPQENCIISK---LFKEGCTFIYNS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE5 RQTEKASIMFAQHVDSIVEFCTEQNHNKEAPNKQNQKCNLRSTWEVIRDSEDFKKTTPM- :. ::::: : ..:.::::. ..::.:::: ::: :.:::.:.:: :: ::... :: CCDS70 TQNATASIMFMQSLSSVVEFCNASTHNQEAPNLQNQMCSLRSAWDVITDSADFHHSFPMN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 -TTQPPNPTFSLLQIGQRIVCLVLDKSGSMATGNRLNRLNQAGQLFLLQTVELGSWVGMV : :: :::::.: :...:::::: :..:: ..:: .:.::....:.: ::. ..::.. CCDS70 GTELPPPPTFSLVQAGDKVVCLVLDVSSKMAEADRLLQLQQAAEFYLMQIVEIHTFVGIA 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 TFDSAAHVQNELIQINSGSDRDTLAKRLPAAASGGT--SICSGLRSAFTVIRK-KYPTDG .::: .... .: ::::..:: :.. ::...:. : ::::::...: :..: . . : CCDS70 SFDSKGEIRAQLHQINSNDDRKLLVSYLPTTVSAKTDISICSGLKKGFEVVEKLNGKAYG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 SEIVLLTDGEDNTISGCFNEVKQSGAIIHTVALGPSAAQELEELSKMTGGLQTYASDQVQ : ..:.:.:.:. ...:. : .::. ::..::: ::: .:::::..::::. .. : . CCDS70 SVMILVTSGDDKLLGNCLPTVLSSGSTIHSIALGSSAAPNLEELSRLTGGLKFFVPDISN 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 NNGLIDAFGALSSGNGAVSQRSIQLESKGLTLQNSQWMNGTVIVDSTVGKDTLFLITWTM .:..::::. .:::.: . :. ::::: : ... . ...:: ::.:::.::.::.:: CCDS70 SNSMIDAFSRISSGTGDIFQQHIQLESTGENVKPHHQLKNTVTVDNTVGNDTMFLVTWQA 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 pF1KE5 Q-PPQILLWDPSGQKQ--GGFVVDKNTKMAYLQIPGIAKVGTWKYSLQA---SSQTLTLT . ::.:.:.::.:.: ..:... . . : : ::: :: : : :.:. : :.: .: CCDS70 SGPPEIILFDPDGRKYYTNNFITNLTFRTASLWIPGTAKPGHWTYTLNNTHHSLQALKVT 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 VTSRASNATLPPITVTSKTNKDTSKFPSPLVVYANIRQGASPILRASVTALIESVNGKTV :::::::...:: :: . ...:. .:: :...:::..:: ::: :.::: .: .: : CCDS70 VTSRASNSAVPPATVEAFVERDSLHFPHPVMIYANVKQGFYPILNATVTATVEPETGDPV 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE5 TLELLDNGAGADATKDDGVYSRYFTTYDTNGRYSVKVRALGGVNAAR-RRVIPQQSGALY ::.:::.:::::. :.::.::::: .. .:::::.::.. . . . . :: : :.: CCDS70 TLRLLDDGAGADVIKNDGIYSRYFFSFAANGRYSLKVHVNHSPSISTPAHSIPG-SHAMY 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KE5 IPGWIENDEIQWNPPRPEINKDDVQHKQVCFSRTSSGGSFVASDVPNAPIPDLFPPGQIT .::. : .:: : :: ..... .... :::.:::::: . :: .: ::.::: .: CCDS70 VPGYTANGNIQMNAPRKSVGRNE-EERKWGFSRVSSGGSFSVLGVPAGPHPDVFPPCKII 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KE5 DLKAEIHGGSLINLTWTAPGDDYDHGTAHKYIIRISTSILDLRDKFNESLQVNTTALIPK ::.: .. ..:.:::::.:.:.: : .: ::.: :. ...: ::... :::. :. CCDS70 DLEA-VKVEEELTLSWTAPGEDFDQGQATSYEIRMSKSLQNIQDDFNNAILVNTSKRNPQ 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 pF1KE5 EANSEEVFLFKPENITFENGTD------------LFIAIQAVDKVDLKSEISNIARVSLF .:. .:.: :.:. : :: . ...::.:.:. .:.: .::::.. :: CCDS70 QAGIREIFTFSPQIST--NGPEHQPNGETHESHRIYVAIRAMDRNSLQSAVSNIAQAPLF 830 840 850 860 870 880 870 880 890 900 910 pF1KE5 IPPQTPPETPSPDETSAPCPNIHINSTIPGIHILKIMWKWIGELQLSIA :::.. : .:. : CCDS70 IPPNSDP-VPARDYLILKGVLTAMGLIGIICLIIVVTHHTLSRKKRADKKENGTKLL 890 900 910 920 930 940 914 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 04:04:17 2016 done: Tue Nov 8 04:04:18 2016 Total Scan time: 4.430 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]