FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3770, 994 aa 1>>>pF1KE3770 994 - 994 aa - 994 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4922+/-0.00104; mu= 8.0809+/- 0.063 mean_var=200.0373+/-42.462, 0's: 0 Z-trim(110.4): 8 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.090682 statistics sampled from 11582 (11586) to 11582 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16 Scan time: 4.470 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10324.1 BNC1 gene_id:646|Hs108|chr15 ( 994) 6722 892.9 0 CCDS73771.1 BNC1 gene_id:646|Hs108|chr15 ( 987) 6491 862.7 0 CCDS6482.2 BNC2 gene_id:54796|Hs108|chr9 (1099) 1762 244.1 1.2e-63 >>CCDS10324.1 BNC1 gene_id:646|Hs108|chr15 (994 aa) initn: 6722 init1: 6722 opt: 6722 Z-score: 4763.6 bits: 892.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6722; 100.0% identity (100.0% similar) in 994 aa overlap (1-994:1-994) 10 20 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CCDS64 PRLHMPMLRNNRDKDLIRATSGAATPVIASTKSNLALTSPG-RPPMGFTTPPLD----PV 500 510 520 530 540 470 480 490 500 510 pF1KE3 FPNIGQNGVLFPNLKTVQPVLPFYRSPATPAEVANTPGILPSLPLLSSS----------- . : . ..: .::::::: ::::: ::.:... : ::. :.. .: CCDS64 LQNPLPSQLVFSGLKTVQPVPPFYRSLLTPGEMVSPPTSLPTSPIIPTSGTIEQHPPPPS 550 560 570 580 590 600 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 ---IPEQLISNEMPF-DALPKKKSRKSSMPIKIEKEAVEIANEKRHNLSSDEDMPLQVVS .: ..... : : :::: ::::::.::::: .. :.: .....: : CCDS64 EPVVPAVMMATHEPSADLAPKKKPRKSSMPVKIEKEIIDTADE----FDDEDDDP----- 610 620 630 640 650 660 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 EDEQEACSPQSHRVS-EEQHVQSGGLG-KPFPEGERP-CHRESVIESSGAISQTPEQATH .: . . .:: . :. .: :.. : : . .: : .. :. . .... .. . CCDS64 NDGGAVVNDMSHDNHCHSQEEMSPGMSVKDFSKHNRTRCISRTEIRRADSMTSEDQEPER 670 680 690 700 710 720 640 650 660 pF1KE3 NSERETEQT-PALIMVPREVEDGGH---------------EHYFTPGMEPQV-------- . : :.:.. : : : .. : :.. :. . . CCDS64 DYENESESSEPKLGEESMEGDEHIHSEVSEKVLMNSERPDENHSEPSHQDVIKVKEEFTD 730 740 750 760 770 780 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 PFSDYMELQQRLLAGGLFSALSNRGMAFPC-LEDSKELEHVGQHALARQIEENRFQCDIC : :.. ..: : .: .... .: :. .. . . : . . . : .: CCDS64 PTYDMFYMSQYGLYNGGGASMAALHESFTSSLNYGSPQKFSPEGDLCSSPDPK--ICYVC 790 800 810 820 830 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 KKTFKNACSVKIHHKNMHVKEMHTCTVEGCNATFPSRRSRDRHSSNLNLHQKALSQEALE ::.::.. :::.:..:.:.::::.::: ::::.:::::::::::.:.:::.: :..: . CCDS64 KKSFKSSYSVKLHYRNVHLKEMHVCTVAGCNAAFPSRRSRDRHSANINLHRKLLTKELDD 840 850 860 870 880 890 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 SSEDHFRAAYLLKDVAKEAYQDVAFTQQASQTSVIFKGTSRMGSLVYPITQVHSASLESY . : . . : ::. : . .:. .: ..: :. ... :..: CCDS64 MGLDSSQPS-LSKDLRDEFLVKIYGAQHPMGLDVREDASSPAGT--------EDSHLNGY 900 910 920 930 940 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 NSGPLSEGTILDLSTTSSMKSESSSHSSWDSDGVSEEGTVLMEDSDGNCE-GSSLVPGE- . : . .::::::::..: :: ::: .::. :.:: .:..: :: . : : .: CCDS64 GRGMAEDYMVLDLSTTSSLQSSSSIHSSRESDAGSDEG-ILLDDIDGASDSGESAHKAEA 950 960 970 980 990 1000 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 DEYPICVLMEKADQSLASLPSGLP--ITCHLCQKTYSNKGTFRAHYKTVHLRQLHKCKVP : . : . . . : :: : :..:.: ::::::.:.::::::::..:::::: CCDS64 PALPGSLGAEVSGSLMFSSLSGSNGGIMCNICHKMYSNKGTLRVHYKTVHLREMHKCKVP 1010 1020 1030 1040 1050 1060 970 980 990 pF1KE3 GCNTMFSSVRSRNRHSQNPNLHKSLASSPSHLQ ::: :::::::::::::::::::.. CCDS64 GCNMMFSSVRSRNRHSQNPNLHKNIPFTSVD 1070 1080 1090 994 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 07:06:33 2016 done: Sun Nov 6 07:06:34 2016 Total Scan time: 4.470 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]