FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5347, 435 aa 1>>>pF1KB5347 435 - 435 aa - 435 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5446+/-0.00102; mu= 15.5393+/- 0.061 mean_var=59.5763+/-11.724, 0's: 0 Z-trim(103.0): 35 B-trim: 0 in 0/46 Lambda= 0.166164 statistics sampled from 7196 (7227) to 7196 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16 Scan time: 2.850 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 ( 435) 2880 699.1 2.1e-201 CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 ( 423) 1600 392.3 4.9e-109 CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 ( 423) 1351 332.6 4.5e-91 CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 ( 425) 1327 326.8 2.5e-89 CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 433) 1078 267.2 2.3e-71 CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 435) 1072 265.7 6.3e-71 CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 460) 1014 251.8 1e-66 CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7 ( 453) 409 106.8 4.6e-23 CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10 ( 418) 273 74.2 2.8e-13 CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8 ( 418) 262 71.5 1.7e-12 >>CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 (435 aa) initn: 2880 init1: 2880 opt: 2880 Z-score: 3729.2 bits: 699.1 E(32554): 2.1e-201 Smith-Waterman score: 2880; 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CCDS45 LL------------VNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGRSKN 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSH :::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:.::::::::::::: :: CCDS45 KSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKFSH 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB5 SRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSF ::.: :.:::.:::..:.::.::: .:::.:::::.:::.:::.:.::: . ..:::::: CCDS45 SRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIKSF 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB5 PGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQALPW :::::::::::::::::: :. ::.:::.:::::::::.:::::::.::::::::::::: CCDS45 PGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQALPW 350 360 370 380 390 400 430 pF1KB5 VRYITQNGDYQLRTQ ::::::.::::::: CCDS45 VRYITQSGDYQLRTS 410 420 >>CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 (425 aa) initn: 2070 init1: 1131 opt: 1327 Z-score: 1717.4 bits: 326.8 E(32554): 2.5e-89 Smith-Waterman score: 2245; 77.1% identity (92.0% similar) in 436 aa overlap (1-434:1-424) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI ::::::..::.::: :: :::.::: ::..:::::.:...:::: :.:.:.:: :.:.:: CCDS77 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF ::.:::::::..::: .:::.:::::...:: :::::::::::::::::.:::::::::: CCDS77 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIESVN :.:::::::::::::::...::::: : : :::::::::::::::.:::::.::::::: CCDS77 GFPQTTDSKILQEYITQQSNKLETGKSRVPPTVTNAVSWRSEGIKYKKNEVFIDVIESVN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 LLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRG-- :: :.:::.:: :::::.::..:::::::::::::::.:::. :: . CCDS77 LL------------VNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLGLNDRVLFELTGLSGS 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 KSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKH :.:::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:.::::::::::::: CCDS77 KNKSVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQVKPLIWIESVIEKF 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 SHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSIK ::::.: :.:::.:::..:.::.::: .:::.:::::.:::.:::.:.::: . ..:::: CCDS77 SHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWSIK 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 SFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEKSGYQAL :::::::::::::::::::: :. ::.:::.:::::::::.:::::::.::::::::::: CCDS77 SFPGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKIIEKSGYQAL 350 360 370 380 390 400 420 430 pF1KB5 PWVRYITQNGDYQLRTQ ::::::::.::::::: CCDS77 PWVRYITQSGDYQLRTS 410 420 >>CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (433 aa) initn: 1063 init1: 365 opt: 1078 Z-score: 1394.6 bits: 267.2 E(32554): 2.3e-71 Smith-Waterman score: 1078; 39.1% identity (71.3% similar) in 442 aa overlap (6-433:5-432) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI ... . ::.::: : :: :. . :. : ... ... . ::. . . :. . CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQ-VRSPVTNIARTSFFHV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF :..:..:.:..:.:. ...:: ::::. .:.. :: .. ::.:..:::.:::::::..:: CCDS43 KRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPAT--VTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVIES ::::.... :. .:::.: : .: . : ::. ..:: ::::::.::.::::.:: CCDS43 GYPQNSETGALKTFITQQGIKSQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVLES 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 VNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRG :::: .: .:.:: ... : . :. .:::::: ..:.:::..... :.: CCDS43 VNLL------------MSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQGKG 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB5 ------KS--KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIW :: .:. ..: ::::::::.:...:.::::::::::::: :: . . . CCDS43 TADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILPFR 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 IESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVPEN . .... .....: . ::.:: :...:..::.: .... . :..:. . CCDS43 VIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASE 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 SEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKII . :::.:: . : :: . :.. : .. . : ..::::..::.: :. ::..:::::.. CCDS43 NAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVF 350 360 370 380 390 400 420 430 pF1KB5 EK----SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ : : .... ::::: ..: :. : CCDS43 EPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC 410 420 430 >>CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (435 aa) initn: 953 init1: 545 opt: 1072 Z-score: 1386.8 bits: 265.7 E(32554): 6.3e-71 Smith-Waterman score: 1072; 38.5% identity (70.9% similar) in 444 aa overlap (6-433:5-434) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI ... . ::.::: : :: :. . :. : ... ... . ::. . . :. . CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAFRVNVIHARQQ-VRSPVTNIARTSFFHV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF :..:..:.:..:.:. ...:: ::::. .:.. :: .. ::.:..:::.:::::::..:: CCDS43 KRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYITQEG----HKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKNEVFLDVI ::::.... :. .:::.: :. . . . ::. ..:: ::::::.::.::::. CCDS43 GYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIKYRRNELFLDVL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB5 ESVNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTG :::::: .: .:.:: ... : . :. .:::::: ..:.:::..... : CCDS43 ESVNLL------------MSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFGMNDKIVIEKQG 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 pF1KB5 RG------KS--KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPL .: :: .:. ..: ::::::::.:...:.::::::::::::: :: . . CCDS43 KGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKDIILP 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB5 IWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKFKTTVGSVKWVP . . .... .....: . ::.:: :...:..::.: .... . :..:. CCDS43 FRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKA 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB5 ENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLK .. :::.:: . : :: . :.. : .. . : ..::::..::.: :. ::..::::: CCDS43 SENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLK 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB5 IIEK----SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ ..: : .... ::::: ..: :. : CCDS43 VFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC 410 420 430 >>CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (460 aa) initn: 936 init1: 545 opt: 1014 Z-score: 1311.3 bits: 251.8 E(32554): 1e-66 Smith-Waterman score: 1014; 38.4% identity (70.5% similar) in 430 aa overlap (20-433:49-459) 10 20 30 40 pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPI : :. :: .:. .. ... . ::. CCDS82 VYRDDIGSRQAADSAVFSSSGPFPGEWLEANRRNAVDAFRVN----VIHARQQ--VRSPV 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 LAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVI . . :. .:..:..:.:..:.:. ...:: ::::. .:.. :: .. ::.:..:::. CCDS82 TNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVL 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 IYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEG----HKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIK :::::::..::::::.... :. .:::.: :. . . . ::. ..:: :::: CCDS82 IYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQQGIKSQHQTKEEQSQITSQVTGQIGWRREGIK 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 YRKNEVFLDVIESVNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLG ::.::.::::.:::::: .: .:.:: ... : . :. .:::::: ..: CCDS82 YRRNELFLDVLESVNLL------------MSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFG 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 pF1KB5 LNDKVLFDNTGRG------KS--KSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELM .:::..... :.: :: .:. ..: ::::::::.:...:.::::::::::::: CCDS82 MNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELM 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB5 SYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDADSPKF :: . . . . .... .....: . ::.:: :...:..::.: .... . CCDS82 RYRTTKDIILPFRVIPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQV 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 KTTVGSVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYF :..:. .. :::.:: . : :: . :.. : .. . : ..::::..::.: : CCDS82 ICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-F 370 380 390 400 410 400 410 420 430 pF1KB5 TTSGIQVRYLKIIEK----SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ . ::..:::::..: : .... ::::: ..: :. : CCDS82 APSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC 420 430 440 450 460 >>CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7 (453 aa) initn: 586 init1: 251 opt: 409 Z-score: 527.6 bits: 106.8 E(32554): 4.6e-23 Smith-Waterman score: 618; 28.1% identity (59.9% similar) in 466 aa overlap (4-433:3-452) 10 20 30 40 50 pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEV-EHFMPILMEKEEEGMLSPI-LAHGGVRFM : ..:. :: :: ...::: .: : :. : : ::. . : : .:. 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CCDS73 SYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQS-GAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGL 330 340 350 360 370 380 410 420 430 pF1KB5 QVRYLKIIEKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ .: : . .. :. . :.:.:. : .:.:: CCDS73 KVNRLDMYGEK-YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT 390 400 410 >>CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8 (418 aa) initn: 468 init1: 181 opt: 262 Z-score: 337.7 bits: 71.5 E(32554): 1.7e-12 Smith-Waterman score: 574; 25.8% identity (61.2% similar) in 446 aa overlap (5-434:4-418) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI ...... .: ... ..... :. : ..:. . : . :.. .. . CCDS61 MIHSLFLINSSGDIFLEKHWKSVVSRSVCDYFFEAQERATEAENVPPVIPTPHHYLLSV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF ......::. . .. .:. ::..::..:..:: : :.:: :..::.:.:..: CCDS61 YRHKIFFVAVIQTEVPPLFVIEFLHRVVDTFQDYFGVCSEPVIKDNVVVVYEVLEEMLDN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 pF1KB5 GYPQTTDSKILQEYI-----------TQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKN :.: .:.:.::.: : : : . ..: : . .. .: :: :.:: .: CCDS61 GFPLATESNILKELIKPPTILRTVVNTITG-STNVGDQLPTGQLS-VVPWRRTGVKYTNN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 EVFLDVIESVNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDK :...:::: .. . .. .:... .:: : : : :.:::.: :.. . 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