Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7308
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7308, 822 aa
1>>>pF1KB7308 822 - 822 aa - 822 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4606+/-0.00155; mu= 2.4712+/- 0.089
mean_var=447.4666+/-97.160, 0's: 0 Z-trim(105.9): 680 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.060631
statistics sampled from 7976 (8703) to 7976 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 4.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 5324 482.0 1.7e-135
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 2741 255.7 1.3e-67
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 2721 254.3 6e-67
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 2366 223.2 1.3e-57
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 1443 142.4 2.4e-33
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 1443 142.5 2.6e-33
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 466) 926 97.0 8e-20
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 507) 926 97.0 8.4e-20
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 508) 926 97.0 8.4e-20
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 893 94.1 6.1e-19
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 877 93.2 2.6e-18
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 877 93.3 2.6e-18
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15 ( 450) 866 91.7 3e-18
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 851 90.5 8.2e-18
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 851 90.9 1.2e-17
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 851 90.9 1.2e-17
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 851 90.9 1.2e-17
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 851 90.9 1.2e-17
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 851 91.0 1.3e-17
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 851 91.0 1.3e-17
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 851 91.0 1.3e-17
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20 ( 451) 841 89.5 1.4e-17
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 801 86.1 1.6e-16
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 801 86.1 1.6e-16
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 801 86.1 1.7e-16
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 801 86.1 1.7e-16
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 797 86.2 3.2e-16
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 797 86.2 3.2e-16
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX ( 675) 786 85.0 4.8e-16
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 782 84.5 5.4e-16
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 780 84.3 6e-16
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 778 84.1 6.8e-16
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 ( 967) 783 84.9 7.1e-16
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009) 783 84.9 7.2e-16
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 770 83.4 1.1e-15
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 771 83.6 1.1e-15
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5 ( 620) 770 83.5 1.2e-15
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 766 83.1 1.4e-15
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 760 82.4 1.8e-15
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 760 82.5 2e-15
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 756 82.1 2.5e-15
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 756 82.2 2.5e-15
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 762 83.1 2.5e-15
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 659) 753 82.1 3.5e-15
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 693) 753 82.1 3.6e-15
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 746 81.3 4.6e-15
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 752 82.2 4.7e-15
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 730 79.9 1.2e-14
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 731 80.4 1.7e-14
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 727 80.0 2.1e-14
>>CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 (822 aa)
initn: 5324 init1: 5324 opt: 5324 Z-score: 2546.0 bits: 482.0 E(32554): 1.7e-135
Smith-Waterman score: 5324; 100.0% identity (100.0% similar) in 822 aa overlap (1-822:1-822)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYASTLQNLCNQVDKESTVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MGFGSDLKNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYASTLQNLCNQVDKESTVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGVHQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGVHQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 IEAEMIKVTKTELEKLKCSYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKETEKAKERYDKATMKLHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 IEAEMIKVTKTELEKLKCSYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKETEKAKERYDKATMKLHM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LHNQYVLALKGAQLHQNQYYDITLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LHNQYVLALKGAQLHQNQYYDITLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTEEI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VNVHKEIQMSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQEIEFDTSLLEENENLQANEIMWNNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VNVHKEIQMSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQEIEFDTSLLEENENLQANEIMWNNL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSETCEKKSDIVLLLSQKQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 TAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSETCEKKSDIVLLLSQKQAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EELKQSVQQLRCTEAKFSAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMERKERLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EELKQSVQQLRCTEAKFSAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMERKERLSK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 FESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKPLAEQDWYHGAIPRIEAQELLKKQGDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 FESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKPLAEQDWYHGAIPRIEAQELLKKQGDF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRFEGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVITK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRFEGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVITK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KSGVVLLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTLKDKTSVAVKTCKEDLPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KSGVVLLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTLKDKTSVAVKTCKEDLPQE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LKIKFLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYIIMELVSGGDFLTFLRRKKDELKLKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LKIKFLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYIIMELVSGGDFLTFLRRKKDELKLKQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 LVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 LVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 QIPIKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 QIPIKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KB7 APQHCPEDISKIMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTIIKRKLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 APQHCPEDISKIMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTIIKRKLT
790 800 810 820
>>CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 (453 aa)
initn: 2737 init1: 2737 opt: 2741 Z-score: 1327.5 bits: 255.7 E(32554): 1.3e-67
Smith-Waterman score: 2741; 91.7% identity (94.7% similar) in 456 aa overlap (368-822:3-453)
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 EESSETCEKKSDIVLLLSQKQALEELKQSVQQLRCTEAKFSAQKELLEQKVQENDGKEPP
:...: . : . ::. .. :
CCDS78 MEQKMKCPHCK-----DQLESGFGSQSCKTCA
10 20
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 PVVNYEEDARSV-TSMERKERLSKFESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKPLA
. . : .. : ..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LMFSSEPSTSEVHRDQERKERLSKFESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKPLA
30 40 50 60 70 80
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 EQDWYHGAIPRIEAQELLKKQGDFLVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EQDWYHGAIPRIEAQELLKKQGDFLVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRF
90 100 110 120 130 140
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 EGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVITKKSGVVLLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EGTGFSNIPQLIDHHYTTKQVITKKSGVVLLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGE
150 160 170 180 190 200
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 VYKGTLKDKTSVAVKTCKEDLPQELKIKFLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VYKGTLKDKTSVAVKTCKEDLPQELKIKFLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYII
210 220 230 240 250 260
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 MELVSGGDFLTFLRRKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MELVSGGDFLTFLRRKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENN
270 280 290 300 310 320
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 VLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VLKISDFGMSRQEDGGVYSSSGLKQIPIKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSL
330 340 350 360 370 380
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 GVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDISKIMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GVCPYPGMTNQQAREQVERGYRMSAPQHCPEDISKIMMKCWDYKPENRPKFSELQKELTI
390 400 410 420 430 440
820
pF1KB7 IKRKLT
::::::
CCDS78 IKRKLT
450
>>CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 (822 aa)
initn: 2317 init1: 883 opt: 2721 Z-score: 1315.4 bits: 254.3 E(32554): 6e-67
Smith-Waterman score: 2721; 50.8% identity (78.0% similar) in 827 aa overlap (1-820:1-820)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGFGSDL--KNSHEAVLKLQDWELRLLETVKKFMALRIKSDKEYASTLQNLCNQVDKEST
:::.:.: ..: .. ..:. :::::: ..:.:: :.:::.:::. :... : . ..
CCDS10 MGFSSELCSPQGHGVLQQMQEAELRLLEGMRKWMAQRVKSDREYAGLLHHMSLQDSGGQS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VQMNYVSNVSKSWLLMIQQTEQLSRIMKTHAEDLNSGPLHRLTMMIKDKQQVKKSYIGVH
.. : .:.:: . .::: :::... :::::::::: .:...:...::..:.:
CCDS10 RAISPDSPISQSWAEITSQTEGLSRLLRQHAEDLNSGPLSKLSLLIRERQQLRKTYSEQW
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QQIEAEMIKVTKTELEKLKCSYRQLIKEMNSAKEKYKEALAKGKETEKAKERYDKATMKL
::.. :. :. . ..:::: .:: : .. .::.::.:: .: :. .:::..: .. ::
CCDS10 QQLQQELTKTHSQDIEKLKSQYRALARDSAQAKRKYQEA-SKDKDRDKAKDKYVRSLWKL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HMLHNQYVLALKGAQLHQNQYYDITLPLLLDSLQKMQEEMIKALKGIFDEYSQITSLVTE
::.:::....::::....... :: :: ::: ..::: :: :..:: .:.::: .
CCDS10 FAHHNRYVLGVRAAQLHHQHHHQLLLPGLLRSLQDLHEEMACILKEILQEYLEISSLVQD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EIVNVHKEIQMSVEQIDPSTEYNNFIDVHRTTAAKEQEIEFDTSLLEENENLQANEIMWN
:.: .:.:. .. .:.: .::..:. . .. . :: :::::.: :. .:.. :
CCDS10 EVVAIHREMAAAAARIQPEAEYQGFLRQYGSAPDVPPCVTFDESLLEEGEPLEPGELQLN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 NLTAESLQVMLKTLAEELMQTQQMLLNKEEAVLELEKRIEESSETCEKKSDIVLLLSQKQ
.::.::.: : ....:: . .:.. ..: : .:...... :. . . . : ::...:
CCDS10 ELTVESVQHTLTSVTDELAVATEMVFRRQEMVTQLQQELRNEEENTHPR-ERVQLLGKRQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ALEELKQSVQQLRCTEAKFSAQKELLEQKVQENDGKEPPPVVNYEEDARSVTSMERKE--
.:.: :..: :..::..::.:::. :... :::::. ..: .:..: :...
CCDS10 VLQEALQGLQVALCSQAKLQAQQELLQTKLEHLGPGEPPPVLLLQDDRHSTSSSEQEREG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 -RLSKFESIRHSIAGIIRSPKSALGSSALSDMISISEKPLAEQDWYHGAIPRIEAQELLK
: .: .. :.::.: :: .: ..: .::: :: :::::::: :. :::
CCDS10 GRTPTLEILKSHISGIFR-PKFSLPPPL--QLIPEVQKPLHEQLWYHGAIPRAEVAELLV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 KQGDFLVRESHGKPGEYVLSVYSDGQRRHFIIQYVDNMYRFEGTGFSNIPQLIDHHYTTK
..::::::::.:: :::::: :: :::::: .::.::.:: :: .:: :::: .:.
CCDS10 HSGDFLVRESQGKQ-EYVLSVLWDGLPRHFIIQSLDNLYRLEGEGFPSIPLLIDHLLSTQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 QVITKKSGVVLLNPIPKDKKWILSHEDVILGELLGKGNFGEVYKGTLK-DKTSVAVKTCK
: .:::::::: .:::: :.:.:::..::: .:.::::::..: :. :.: ::::.:.
CCDS10 QPLTKKSGVVLHRAVPKDK-WVLNHEDLVLGEQIGRGNFGEVFSGRLRADNTLVAVKSCR
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 EDLPQELKIKFLQEAKILKQYDHPNIVKLIGVCTQRQPVYIIMELVSGGDFLTFLRRKKD
: :: .:: ::::::.:::::.:::::.:::::::.::.::.::::.::::::::: .
CCDS10 ETLPPDLKAKFLQEARILKQYSHPNIVRLIGVCTQKQPIYIVMELVQGGDFLTFLRTEGA
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 ELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISDFGMSRQEDGGVY
.:..: :... :::::: ::::: ::::::::::::: :.::::::::::::.: :::
CCDS10 RLRVKTLLQMVGDAAAGMEYLESKCCIHRDLAARNCLVTEKNVLKISDFGMSREEADGVY
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 SSSG-LKQIPIKWTAPEALNYGRYSSESDVWSFGILLWETFSLGVCPYPGMTNQQAREQV
..:: :.:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::. :::...:::.:: :
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CCDS42 MSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGA
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CCDS12 LPRVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEAC
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