Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7809
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7809, 527 aa
1>>>pF1KB7809 527 - 527 aa - 527 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1366+/-0.00142; mu= 10.3789+/- 0.084
mean_var=215.2115+/-43.817, 0's: 0 Z-trim(107.2): 941 B-trim: 35 in 2/49
Lambda= 0.087426
statistics sampled from 8413 (9430) to 8413 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2718.2 ZNF35 gene_id:7584|Hs108|chr3 ( 527) 3640 472.9 4.1e-133
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1514 204.6 2e-52
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1508 204.2 4.5e-52
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1501 203.1 7e-52
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1501 203.1 7.3e-52
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1501 203.2 7.4e-52
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1494 202.3 1.4e-51
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1494 202.3 1.4e-51
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1494 202.3 1.5e-51
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1488 201.5 2.3e-51
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1488 201.6 2.4e-51
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1488 201.6 2.4e-51
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1488 201.6 2.4e-51
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1481 200.5 3.7e-51
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1477 200.0 5.4e-51
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1477 200.2 6.4e-51
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1469 199.1 1.1e-50
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1470 199.4 1.3e-50
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1468 199.1 1.4e-50
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1468 199.1 1.4e-50
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1461 198.0 2.1e-50
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1461 198.1 2.4e-50
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1461 198.1 2.5e-50
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1460 198.0 2.6e-50
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1460 198.0 2.7e-50
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1458 197.8 3.4e-50
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1458 197.8 3.4e-50
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1457 197.7 3.7e-50
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1445 195.8 7.1e-50
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1450 196.8 7.2e-50
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1445 196.0 8.4e-50
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1445 196.0 8.6e-50
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1438 195.2 1.8e-49
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1435 194.8 2.2e-49
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1435 194.9 2.6e-49
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1435 195.0 2.7e-49
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1434 194.8 3e-49
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1434 194.8 3e-49
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 1431 194.3 3.1e-49
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1434 194.9 3.1e-49
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 1431 194.4 3.5e-49
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1431 194.4 3.5e-49
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1431 194.4 3.5e-49
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 1427 193.8 4.4e-49
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1431 194.6 4.7e-49
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1431 194.6 4.8e-49
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1426 193.7 4.9e-49
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1426 193.7 5.3e-49
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1426 193.7 5.3e-49
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1426 193.7 5.3e-49
>>CCDS2718.2 ZNF35 gene_id:7584|Hs108|chr3 (527 aa)
initn: 3640 init1: 3640 opt: 3640 Z-score: 2503.3 bits: 472.9 E(32554): 4.1e-133
Smith-Waterman score: 3640; 100.0% identity (100.0% similar) in 527 aa overlap (1-527:1-527)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTAELREAMALAPWGPVKVKKEEEEEENFPGQASSQQVHSENIKVWAPVQGLQTGLDGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MTAELREAMALAPWGPVKVKKEEEEEENFPGQASSQQVHSENIKVWAPVQGLQTGLDGSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EEEKGQNISWDMAVVLKATQEAPAASTLGSYSLPGTLAKSEILETHGTMNFLGAETKNLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 EEEKGQNISWDMAVVLKATQEAPAASTLGSYSLPGTLAKSEILETHGTMNFLGAETKNLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LLVPKTEICEEAEKPLIISERIQKADPQGPELGEACEKGNMLKRQRIKREKKDFRQVIVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LLVPKTEICEEAEKPLIISERIQKADPQGPELGEACEKGNMLKRQRIKREKKDFRQVIVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DCHLPESFKEEENQKCKKSGGKYSLNSGAVKNPKTQLGQKPFTCSVCGKGFSQSANLVVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DCHLPESFKEEENQKCKKSGGKYSLNSGAVKNPKTQLGQKPFTCSVCGKGFSQSANLVVH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 QRIHTGEKPFECHECGKAFIQSANLVVHQRIHTGQKPYVCSKCGKAFTQSSNLTVHQKIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QRIHTGEKPFECHECGKAFIQSANLVVHQRIHTGQKPYVCSKCGKAFTQSSNLTVHQKIH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SLEKTFKCNECEKAFSYSSQLARHQKVHITEKCYECNECGKTFTRSSNLIVHQRIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SLEKTFKCNECEKAFSYSSQLARHQKVHITEKCYECNECGKTFTRSSNLIVHQRIHTGEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PFACNDCGKAFTQSANLIVHQRSHTGEKPYECKECGKAFSCFSHLIVHQRIHTAEKPYDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PFACNDCGKAFTQSANLIVHQRSHTGEKPYECKECGKAFSCFSHLIVHQRIHTAEKPYDC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SECGKAFSQLSCLIVHQRIHSGDLPYVCNECGKAFTCSSYLLIHQRIHNGEKPYTCNECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SECGKAFSQLSCLIVHQRIHSGDLPYVCNECGKAFTCSSYLLIHQRIHNGEKPYTCNECG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB7 KAFRQRSSLTVHQRTHTGEKPYECEKCGAAFISNSHLMRHHRTHLVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KAFRQRSSLTVHQRTHTGEKPYECEKCGAAFISNSHLMRHHRTHLVE
490 500 510 520
>>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 (461 aa)
initn: 1514 init1: 1514 opt: 1514 Z-score: 1054.8 bits: 204.6 E(32554): 2e-52
Smith-Waterman score: 1517; 52.6% identity (75.2% similar) in 407 aa overlap (131-524:62-460)
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 EILETHGTMNFLGAETKNLQLLVPKTEICEEAEKPLIISERIQKADPQGPELGEACEKGN
.... . . .: .. . .: . : ....
CCDS44 VGVTHKETFTEMRVCGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGED---ATQNSE
40 50 60 70 80
170 180 190 200
pF1KB7 MLKRQRIKREKKDFRQVIVNDCHLPESFKE-------------EENQKCKKSGGKYSLNS
..: ::. :: .. :.: ..:.. :. ::. : .. :
CCDS44 LIKTQRMFVGKKIYE---CNQCS--KTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERS
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 GAVKNPKTQLGQKPFTCSVCGKGFSQSANLVVHQRIHTGEKPFECHECGKAFIQSANLVV
. . . . . :.::. :. :::.:::: ::.:::: ::::::..:.:::::: ....:.
CCDS44 SLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQ
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 HQRIHTGQKPYVCSKCGKAFTQSSNLTVHQKIHSLEKTFKCNECEKAFSYSSQLARHQKV
:.:::::.::: :..:::::::: ::::::. :. :: ..:::: :::: : .: ::.
CCDS44 HERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRS
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 HITEKCYECNECGKTFTRSSNLIVHQRIHTGEKPFACNDCGKAFTQSANLIVHQRSHTGE
: :: :::..:::.:..::.: .::: ::::::. :: :::.:.::. :: ::: :.:
CCDS44 HTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGV
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pF1KB7 KPYECKECGKAFSCFSHLIVHQRIHTAEKPYDCSECGKAFSQLSCLIVHQRIHSGDLPYV
::.::.::::::: : : :.::::.::::.: ::: :. : : ::: ::.:. ::
CCDS44 KPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYE
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pF1KB7 CNECGKAFTCSSYLLIHQRIHNGEKPYTCNECGKAFRQRSSLTVHQRTHTGEKPYECEKC
::::::::. :.::. :::::.::::: :..::::: . ::::::::::::::::.:..:
CCDS44 CNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNEC
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510 520
pF1KB7 GAAFISNSHLMRHHRTHLVE
: :: ...: ::.:::
CCDS44 GKAFSRSTNLTRHQRTHT
450 460
>>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 (754 aa)
initn: 1454 init1: 1454 opt: 1508 Z-score: 1048.3 bits: 204.2 E(32554): 4.5e-52
Smith-Waterman score: 1517; 50.2% identity (73.2% similar) in 436 aa overlap (111-527:288-716)
90 100 110 120 130
pF1KB7 EAPAASTLGSYSLPGTLAKSEILETHGTMNFLGAETKN-----LQLLVPKT----EICEE
: :.:..: : .:: . ..::.
CCDS27 NMMPENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQEFFKGSESSNRTSGGLFGVVPGAAETGDVCED
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140 150 160 170 180
pF1KB7 AEKPLIISERIQKADPQGPEL-GEACEKGNMLKRQRIKREKKDFRQVIVNDCHLPES---
. : : . : .: .: .: .. : . :.. : . ...: : : :
CCDS27 TFKEL----EGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRYDKYKEV---GEHPPLSSSP
320 330 340 350 360 370
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ------FKEEENQKCKKSGGKYSLNSGAVKNPKTQLGQKPFTCSVCGKGFSQSANLVVHQ
.: ... .: . : .. .: . . . . :.::. :. ::: : :...:.::
CCDS27 VEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHL
380 390 400 410 420 430
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RIHTGEKPFECHECGKAFIQSANLVVHQRIHTGQKPYVCSKCGKAFTQSSNLTVHQKIHS
: ::::::.:: :::::. .:..:. :::.:.:.::: :..:.::::::: :: ::. :.
CCDS27 RTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHT
440 450 460 470 480 490
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LEKTFKCNECEKAFSYSSQLARHQKVHITEKCYECNECGKTFTRSSNLIVHQRIHTGEKP
:: ..:::: .:: :..::::: .: .: :.:::::..: . ::: ::::::::::
CCDS27 GEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKP
500 510 520 530 540 550
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 FACNDCGKAFTQSANLIVHQRSHTGEKPYECKECGKAFSCFSHLIVHQRIHTAEKPYDCS
. :..:::::..: :: :: :::::::.:.::::::. :.:: :.::::.:::..::
CCDS27 YECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECS
560 570 580 590 600 610
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ECGKAFSQLSCLIVHQRIHSGDLPYVCNECGKAFTCSSYLLIHQRIHNGEKPYTCNECGK
::::::. .::: :::.:.:. :: ::::::.:. .:.:.::::::.::::: ::::::
CCDS27 ECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGK
620 630 640 650 660 670
490 500 510 520
pF1KB7 AFRQRSSLTVHQRTHTGEKPYECEKCGAAFISNSHLMRHHRTHLVE
.: ::: ::::::::::::.:. :: :: ..:.:. :.:.: :
CCDS27 VFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQ
680 690 700 710 720 730
CCDS27 RSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
740 750
>>CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 (568 aa)
initn: 4149 init1: 1469 opt: 1501 Z-score: 1044.9 bits: 203.1 E(32554): 7e-52
Smith-Waterman score: 1501; 58.8% identity (81.6% similar) in 337 aa overlap (190-526:229-565)
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 NMLKRQRIKREKKDFRQVIVNDCHLPESFKEEENQKCKKSGGKYSLNSGAVKNPKTQLGQ
.:.. : : .. .: . . . . :.
CCDS54 HNGVIPFDDNQCGNVFRNTQSLIQYQNVETKEKSCVCVTCGKAFAKKSQLIVHQRIHTGK
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KPFTCSVCGKGFSQSANLVVHQRIHTGEKPFECHECGKAFIQSANLVVHQRIHTGQKPYV
::. :..:::.::.. .:::::: ::::::..: :::::: :...:..:::.:::.:::
CCDS54 KPYDCGACGKAFSEKFHLVVHQRTHTGEKPYDCSECGKAFSQKSSLIIHQRVHTGEKPYE
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 CSKCGKAFTQSSNLTVHQKIHSLEKTFKCNECEKAFSYSSQLARHQKVHITEKCYECNEC
::.:::::.:.: : .::.::. :: ..: :: :::: .::: :...: :: :::.::
CCDS54 CSECGKAFSQKSPLIIHQRIHTGEKPYECRECGKAFSQKSQLIIHHRAHTGEKPYECTEC
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GKTFTRSSNLIVHQRIHTGEKPFACNDCGKAFTQSANLIVHQRSHTGEKPYECKECGKAF
::.: ..:.::.:.::::::::. : .: .::.....::.:: ::::::::: ::::.:
CCDS54 GKAFCEKSHLIIHKRIHTGEKPYKCAQCEEAFSRKTELITHQLVHTGEKPYECTECGKTF
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 SCFSHLIVHQRIHTAEKPYDCSECGKAFSQLSCLIVHQRIHSGDLPYVCNECGKAFTCSS
: :.::.::: ::.:::: :::::::: : : :: :::::.:. ::.:.::::::. .:
CCDS54 SRKSQLIIHQRTHTGEKPYKCSECGKAFCQKSHLIGHQRIHTGEKPYICTECGKAFSQKS
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 YLLIHQRIHNGEKPYTCNECGKAFRQRSSLTVHQRTHTGEKPYECEKCGAAFISNSHLMR
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pF1KB7 HHRTHLVE
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CCDS54 HQRIHTVVKS
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:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]