Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB0948
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0948, 402 aa
1>>>pF1KB0948 402 - 402 aa - 402 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8542+/-0.00219; mu= 16.9099+/- 0.131
mean_var=307.7495+/-55.388, 0's: 0 Z-trim(104.6): 940 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.073110
statistics sampled from 6934 (7972) to 6934 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.561), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 2.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42640.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19 ( 402) 2829 313.1 3e-85
CCDS56108.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19 ( 359) 2556 284.2 1.3e-76
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1407 163.4 5.1e-40
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1407 163.5 5.2e-40
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1407 163.5 5.3e-40
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1407 163.5 5.3e-40
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1378 160.4 4.4e-39
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1378 160.4 4.4e-39
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1366 159.1 1e-38
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1365 159.1 1.1e-38
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1357 157.9 1.8e-38
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1357 158.2 2e-38
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1357 158.2 2e-38
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1357 158.3 2.1e-38
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1343 156.5 5e-38
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1342 156.7 6.3e-38
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1341 156.6 6.9e-38
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1338 155.9 7e-38
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1336 155.9 8.9e-38
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1336 155.9 9.1e-38
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1336 156.0 9.2e-38
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1336 156.0 9.5e-38
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1336 156.0 9.5e-38
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1336 156.0 9.6e-38
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 1333 155.5 1.1e-37
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1335 156.1 1.1e-37
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1336 156.4 1.2e-37
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1336 156.4 1.2e-37
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 1333 155.7 1.2e-37
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1332 155.4 1.2e-37
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1332 155.4 1.2e-37
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1332 155.5 1.2e-37
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1332 155.6 1.3e-37
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1332 155.6 1.3e-37
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 1329 155.0 1.4e-37
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 1329 155.0 1.4e-37
CCDS54328.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 497) 1329 155.0 1.4e-37
CCDS54327.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 498) 1329 155.0 1.4e-37
CCDS54326.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 510) 1329 155.1 1.4e-37
CCDS54325.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 511) 1329 155.1 1.4e-37
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1316 154.0 4.3e-37
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1313 153.4 4.7e-37
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19 ( 594) 1312 153.4 5.2e-37
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1308 153.4 9e-37
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 1301 152.1 1.1e-36
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1297 151.8 1.6e-36
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1297 151.8 1.6e-36
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1297 151.9 1.6e-36
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1296 151.8 1.8e-36
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1293 151.2 1.9e-36
>>CCDS42640.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19 (402 aa)
initn: 2829 init1: 2829 opt: 2829 Z-score: 1643.9 bits: 313.1 E(32554): 3e-85
Smith-Waterman score: 2829; 100.0% identity (100.0% similar) in 402 aa overlap (1-402:1-402)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAAAALRAPAQSSVTFEDVAVNFSLEEWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAAAAALRAPAQSSVTFEDVAVNFSLEEWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 EDEAAPSKQSTCIHIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDEAAPSKQSTCIHIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 PYECSKYGKLFHQKPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PYECSKYGKLFHQKPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYEC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 IECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IECGKAFAEKSSLINHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LRSNLIHHQRVHTGERHECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRSNLIHHQRVHTGERHECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB0 IKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IKHLRVHTGERPYECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
370 380 390 400
>>CCDS56108.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19 (359 aa)
initn: 2556 init1: 2556 opt: 2556 Z-score: 1488.7 bits: 284.2 E(32554): 1.3e-76
Smith-Waterman score: 2556; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (44-402:1-359)
20 30 40 50 60 70
pF1KB0 SVTFEDVAVNFSLEEWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCI
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB0 HIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HIYKDQGGHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQ
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB0 KPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KPTLHIHERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB0 INHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 INHRKVHSGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 RVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RVHTGERPYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHT
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 GERHECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GERHECGQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPY
280 290 300 310 320 330
380 390 400
pF1KB0 ECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ECIDCGKSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
340 350
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 940 init1: 940 opt: 1407 Z-score: 831.9 bits: 163.4 E(32554): 5.1e-40
Smith-Waterman score: 1407; 53.3% identity (78.5% similar) in 353 aa overlap (58-402:222-565)
30 40 50 60 70 80
pF1KB0 EWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIY-------KDQG
: :: : : . : . . . :
CCDS74 RTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK---PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQR
200 210 220 230 240
90 100 110 120 130 140
pF1KB0 GHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIH
:.::.::::.: : :. .: ... .: : :::.:::::. :: :.:. : :
CCDS74 THTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTH------TGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQH
250 260 270 280 290 300
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 ERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVH
:.:::.: :.:.::::.: .:::: ..: .:: :.:::: ::::::.. . ::.:...:
CCDS74 LRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTH
310 320 330 340 350 360
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 SGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGER
.: : :::.::::.:. .. : .::::::::.:: :.:::..:...::: .: :.::::.
CCDS74 TGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEK
370 380 390 400 410 420
270 280 290 300 310
pF1KB0 PYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HEC
:::: .:::.::.:. : ::::.:: :.::::..:::.:: :.: .:::.::::. .::
CCDS74 PYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
430 440 450 460 470 480
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 GQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCG
.:::..::. . :: : :.::::.::::..::..:...: ::.: :.:: :.:: : .::
CCDS74 NQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECG
490 500 510 520 530 540
380 390 400
pF1KB0 KSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
::: ::::. .:.:.::: .::.
CCDS74 KSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFT
550 560 570 580 590 600
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 940 init1: 940 opt: 1407 Z-score: 831.7 bits: 163.5 E(32554): 5.2e-40
Smith-Waterman score: 1407; 53.3% identity (78.5% similar) in 353 aa overlap (58-402:264-607)
30 40 50 60 70 80
pF1KB0 EWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIY-------KDQG
: :: : : . : . . . :
CCDS74 RTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK---PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQR
240 250 260 270 280 290
90 100 110 120 130 140
pF1KB0 GHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIH
:.::.::::.: : :. .: ... .: : :::.:::::. :: :.:. : :
CCDS74 THTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTH------TGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQH
300 310 320 330 340
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 ERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVH
:.:::.: :.:.::::.: .:::: ..: .:: :.:::: ::::::.. . ::.:...:
CCDS74 LRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTH
350 360 370 380 390 400
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 SGAKRYECNECGKSFAYTSSLIKHRRIHTGERPYECSECGRSFAENSSLIKHLRVHTGER
.: : :::.::::.:. .. : .::::::::.:: :.:::..:...::: .: :.::::.
CCDS74 TGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEK
410 420 430 440 450 460
270 280 290 300 310
pF1KB0 PYECVECGKSFRRSSSLLQHQRVHTRERPYECSECGKSFSLRSNLIHHQRVHTGER-HEC
:::: .:::.::.:. : ::::.:: :.::::..:::.:: :.: .:::.::::. .::
CCDS74 PYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
470 480 490 500 510 520
320 330 340 350 360 370
pF1KB0 GQCGKSFSRKSSLIIHLRVHTGERPYECSDCGKSFAENSSLIKHLRVHTGERPYECIDCG
.:::..::. . :: : :.::::.::::..::..:...: ::.: :.:: :.:: : .::
CCDS74 NQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECG
530 540 550 560 570 580
380 390 400
pF1KB0 KSFRHSSSFRRHQRVHTGMRPYK
::: ::::. .:.:.::: .::.
CCDS74 KSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFT
590 600 610 620 630 640
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 940 init1: 940 opt: 1407 Z-score: 831.7 bits: 163.5 E(32554): 5.3e-40
Smith-Waterman score: 1407; 53.3% identity (78.5% similar) in 353 aa overlap (58-402:276-619)
30 40 50 60 70 80
pF1KB0 EWSLLNEAQRCLYRDVMLETLTLISSLGCWHGGEDEAAPSKQSTCIHIY-------KDQG
: :: : : . : . . . :
CCDS12 RTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK---PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQR
250 260 270 280 290 300
90 100 110 120 130 140
pF1KB0 GHSGERPYECGEYRKLFKNKSCLTEPRRDHKHRNVRTGERPYECSKYGKLFHQKPTLHIH
:.::.::::.: : :. .: ... .: : :::.:::::. :: :.:. : :
CCDS12 THTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTH------TGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQH
310 320 330 340 350
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 ERFHTGQKTYECSECGKSFHQSSSLLQRQTLHTRERPYECIECGKAFAEKSSLINHRKVH
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CCDS12 LRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTH
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CCDS12 SECGKAFSCNIYLIHHQRFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQRVHTGERPYECSECG
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CCDS12 RKTHLIRHQTVHTNERPYECDECGKSYSQSSALLQHRRVHTGERPYECRECGKSFTRKNH
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CCDS64 HTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGE
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.:: : .:::.:...: ::.: .:::::::.: .:::.: . : . .:::.:::..::
CCDS64 KPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYD
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CCDS64 CAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
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CCDS64 GVPEGRRLPQSLSQEGDFTPAAMGLLRGPLGEKDLDCNGFDSRFSLSPNLMACQEIPTEE
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::. . :.:: .. .: : : :.: : : ::::.:. . .:.:.: ::: : .
CCDS64 RPHPYDMGGQSFQHSVDLTGHEGVPTAESPLICNECGKTFQGNPDLIQRQIVHTGEASFM
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