Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5777
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5777, 822 aa
1>>>pF1KB5777 822 - 822 aa - 822 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1465+/-0.000455; mu= 7.9952+/- 0.028
mean_var=153.2129+/-31.792, 0's: 0 Z-trim(114.8): 109 B-trim: 973 in 1/60
Lambda= 0.103616
statistics sampled from 24681 (24793) to 24681 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 13.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamm ( 822) 5296 804.3 0
NP_001025178 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit g ( 825) 5280 801.9 0
NP_003908 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit gamm ( 785) 2839 437.0 1.6e-121
XP_005268229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 785) 2839 437.0 1.6e-121
XP_005268230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 785) 2839 437.0 1.6e-121
XP_005268234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 2245 348.2 7.2e-95
XP_005268235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 2245 348.2 7.2e-95
XP_005268236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 656) 2245 348.2 7.2e-95
XP_016877234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 494) 2174 337.5 8.9e-92
XP_016877233 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 495) 2165 336.1 2.3e-91
XP_005268237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 640) 1997 311.1 1e-83
NP_001269404 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit g ( 713) 1997 311.1 1.1e-83
XP_016877231 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 1997 311.1 1.1e-83
XP_005268231 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 1997 311.1 1.1e-83
XP_005268232 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 713) 1997 311.1 1.1e-83
XP_016877230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 795) 1997 311.1 1.2e-83
XP_016877229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 804) 1997 311.1 1.2e-83
XP_006720364 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83
XP_005268224 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83
XP_005268226 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83
XP_005268227 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83
XP_005268225 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 842) 1997 311.1 1.3e-83
XP_005268239 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 575) 1886 294.5 9.2e-79
XP_011535585 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 807) 1668 262.0 7.9e-69
XP_016877232 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 552) 1323 210.3 1.9e-53
XP_016877237 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 1083 174.3 9.3e-43
XP_011535588 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 1083 174.3 9.3e-43
NP_001269403 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit g ( 404) 1083 174.3 9.3e-43
XP_016877235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 1083 174.3 9.3e-43
XP_016877236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 comple ( 404) 1083 174.3 9.3e-43
NP_031373 (OMIM: 184450,607244,613744) AP-4 comple (1137) 757 125.8 1e-27
NP_001239056 (OMIM: 184450,607244,613744) AP-4 com (1062) 704 117.9 2.4e-25
XP_005254321 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE (1062) 704 117.9 2.4e-25
XP_006720510 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE (1062) 704 117.9 2.4e-25
NP_570603 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 955) 559 96.2 7.3e-19
XP_011524859 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 972) 559 96.2 7.4e-19
NP_055018 (OMIM: 601026) AP-2 complex subunit alph ( 977) 548 94.6 2.3e-18
XP_011524858 (OMIM: 601026) PREDICTED: AP-2 comple ( 994) 548 94.6 2.4e-18
XP_011518231 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 comple ( 864) 524 91.0 2.5e-17
NP_036437 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit alph ( 939) 524 91.0 2.7e-17
NP_001229766 (OMIM: 607242) AP-2 complex subunit a ( 940) 524 91.0 2.7e-17
XP_011518232 (OMIM: 607242) PREDICTED: AP-2 comple ( 666) 468 82.5 6.7e-15
NP_003929 (OMIM: 607246,617050) AP-3 complex subun (1153) 434 77.6 3.6e-13
XP_006722995 (OMIM: 607246,617050) PREDICTED: AP-3 (1203) 434 77.6 3.7e-13
NP_001248755 (OMIM: 607246,617050) AP-3 complex su (1215) 434 77.6 3.8e-13
XP_016877531 (OMIM: 184450,607244,613744) PREDICTE ( 843) 390 70.9 2.6e-11
XP_016884254 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 389) 294 56.4 2.9e-07
XP_005261579 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 389) 294 56.4 2.9e-07
XP_016884253 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 479) 294 56.4 3.4e-07
XP_016884252 (OMIM: 606004) PREDICTED: ADP-ribosyl ( 502) 294 56.5 3.6e-07
>>NP_001119 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamma-1 (822 aa)
initn: 5296 init1: 5296 opt: 5296 Z-score: 4287.6 bits: 804.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5296; 99.9% identity (99.9% similar) in 822 aa overlap (1-822:1-822)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPATK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 IKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHID
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 VNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPTEIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPTEIVQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 TNGETEPAPLETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNGETEPAPLETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 GDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPHFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFT
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPPFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 FERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGTITQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGTITQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KB5 VIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFPPQSWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFPPQSWQ
790 800 810 820
>>NP_001025178 (OMIM: 603533) AP-1 complex subunit gamma (825 aa)
initn: 3888 init1: 3888 opt: 5280 Z-score: 4274.6 bits: 801.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5280; 99.5% identity (99.5% similar) in 825 aa overlap (1-822:1-825)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 YPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPATK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB5 NLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRK---LVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_001 NLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKNEKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SGISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRW
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 HIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 WCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 TCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPTE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 IVQTNGETEPAPLETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVQTNGETEPAPLETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DLLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPHFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKI
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPPFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKI
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 EFTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGT
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820
pF1KB5 ITQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFPPQSWQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFPPQSWQ
790 800 810 820
>>NP_003908 (OMIM: 603534) AP-1 complex subunit gamma-li (785 aa)
initn: 3110 init1: 2746 opt: 2839 Z-score: 2302.9 bits: 437.0 E(85289): 1.6e-121
Smith-Waterman score: 3149; 60.0% identity (81.6% similar) in 824 aa overlap (1-822:1-785)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPAP-IRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHML
: .: ..:..::. :: :.:::.:::.:::::: ::.:::. : ..: :..:::::.:::
NP_003 MVVPSLKLQDLIEEIRGAKTQAQEREVIQKECAHIRASFRDGDPVHRHRQLAKLLYVHML
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQ
::::::::.::::::::..:::::.::::::::::::.:.:::.:: :::::... : ::
NP_003 GYPAHFGQMECLKLIASSRFTDKRVGYLGAMLLLDERHDAHLLITNSIKNDLSQGIQPVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPAT
:::::::. :::.::::::: :::::: . :.:::: : :::.::::::: .:::
NP_003 GLALCTLSTMGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAILTAVHMIRKVPELSSVFLPPC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSG
.::.:..::.: ...:.::.::::: : ::::.:::::.::..:. ::: ::..::
NP_003 AQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQLVHILRTLVTMGYSTEHSISG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDI
.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::.::.:.:::.:.:::::::::
NP_003 VSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDV
.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.::.:::::: :.:.::.. :.
NP_003 RSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQSDHSAVQRHRPTVVECLRETDA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHI
:..:::.:::.::::..:.:.::.:: ::.:: :...:::::::.::::..::.:::::
NP_003 SLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWC
:::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:::.:. : ::::::::::::
NP_003 DTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWC
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 IGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTC
::::::::..:.::: ::.:: :.::: .::.:: :.:: .::::::::.::::::.
NP_003 IGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 TVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPTEIV
:::..::::::: .:::::::::::..::.::::::.:.::.::..:. .::
NP_003 DNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRAAILEKMPLVER---DGPQADE
550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QTNGETEPAPL-ETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLD
... : : : :. : :. :: .:: :::::: : . . : :: :: :.
NP_003 EAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQ-ASQLLDLLDLLDGA--SGDVQHPPHLDPSP-GGALVH
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 LLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPHFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIE
:: :. : . : :: : ::.. .. ..:....
NP_003 LL-DL-----PCVPPPPA--P------------------------IPDLKVFEREGVQLN
660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 FTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGTI
..: : ::.. .::: :.: .: :.: :. ::::::..:::: .::.. ::: . :
NP_003 LSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKSLQLQLQAPSGNTVPARGGLPI
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810 820
pF1KB5 TQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFPPQSWQ
::....:::.: ::....:::.: ...:.. ::::.: .:::
NP_003 TQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLPVESWQ
750 760 770 780
>>XP_005268229 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 complex su (785 aa)
initn: 3110 init1: 2746 opt: 2839 Z-score: 2302.9 bits: 437.0 E(85289): 1.6e-121
Smith-Waterman score: 3149; 60.0% identity (81.6% similar) in 824 aa overlap (1-822:1-785)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPAP-IRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHML
: .: ..:..::. :: :.:::.:::.:::::: ::.:::. : ..: :..:::::.:::
XP_005 MVVPSLKLQDLIEEIRGAKTQAQEREVIQKECAHIRASFRDGDPVHRHRQLAKLLYVHML
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQ
::::::::.::::::::..:::::.::::::::::::.:.:::.:: :::::... : ::
XP_005 GYPAHFGQMECLKLIASSRFTDKRVGYLGAMLLLDERHDAHLLITNSIKNDLSQGIQPVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPAT
:::::::. :::.::::::: :::::: . :.:::: : :::.::::::: .:::
XP_005 GLALCTLSTMGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAILTAVHMIRKVPELSSVFLPPC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSG
.::.:..::.: ...:.::.::::: : ::::.:::::.::..:. ::: ::..::
XP_005 AQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQLVHILRTLVTMGYSTEHSISG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDI
.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::.::.:.:::.:.:::::::::
XP_005 VSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDV
.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.::.:::::: :.:.::.. :.
XP_005 RSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQSDHSAVQRHRPTVVECLRETDA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHI
:..:::.:::.::::..:.:.::.:: ::.:: :...:::::::.::::..::.:::::
XP_005 SLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWC
:::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:::.:. : ::::::::::::
XP_005 DTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWC
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 IGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTC
::::::::..:.::: ::.:: :.::: .::.:: :.:: .::::::::.::::::.
XP_005 IGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 TVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPTEIV
:::..::::::: .:::::::::::..::.::::::.:.::.::..:. .::
XP_005 DNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRAAILEKMPLVER---DGPQADE
550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QTNGETEPAPL-ETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLD
... : : : :. : :. :: .:: :::::: : . . : :: :: :.
XP_005 EAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQ-ASQLLDLLDLLDGA--SGDVQHPPHLDPSP-GGALVH
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 LLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPHFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIE
:: :. : . : :: : ::.. .. ..:....
XP_005 LL-DL-----PCVPPPPA--P------------------------IPDLKVFEREGVQLN
660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 FTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGTI
..: : ::.. .::: :.: .: :.: :. ::::::..:::: .::.. ::: . :
XP_005 LSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKSLQLQLQAPSGNTVPARGGLPI
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810 820
pF1KB5 TQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFPPQSWQ
::....:::.: ::....:::.: ...:.. ::::.: .:::
XP_005 TQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLPVESWQ
750 760 770 780
>>XP_005268230 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 complex su (785 aa)
initn: 3110 init1: 2746 opt: 2839 Z-score: 2302.9 bits: 437.0 E(85289): 1.6e-121
Smith-Waterman score: 3149; 60.0% identity (81.6% similar) in 824 aa overlap (1-822:1-785)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPAP-IRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHML
: .: ..:..::. :: :.:::.:::.:::::: ::.:::. : ..: :..:::::.:::
XP_005 MVVPSLKLQDLIEEIRGAKTQAQEREVIQKECAHIRASFRDGDPVHRHRQLAKLLYVHML
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQ
::::::::.::::::::..:::::.::::::::::::.:.:::.:: :::::... : ::
XP_005 GYPAHFGQMECLKLIASSRFTDKRVGYLGAMLLLDERHDAHLLITNSIKNDLSQGIQPVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPAT
:::::::. :::.::::::: :::::: . :.:::: : :::.::::::: .:::
XP_005 GLALCTLSTMGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAILTAVHMIRKVPELSSVFLPPC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSG
.::.:..::.: ...:.::.::::: : ::::.:::::.::..:. ::: ::..::
XP_005 AQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQLVHILRTLVTMGYSTEHSISG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDI
.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::.::.:.:::.:.:::::::::
XP_005 VSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDV
.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.::.:::::: :.:.::.. :.
XP_005 RSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQSDHSAVQRHRPTVVECLRETDA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHI
:..:::.:::.::::..:.:.::.:: ::.:: :...:::::::.::::..::.:::::
XP_005 SLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWC
:::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:::.:. : ::::::::::::
XP_005 DTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQQPLVQVAAWC
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 IGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTC
::::::::..:.::: ::.:: :.::: .::.:: :.:: .::::::::.::::::.
XP_005 IGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMSLPATRGYALTALMKLSTRLCG
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 TVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPTEIV
:::..::::::: .:::::::::::..::.::::::.:.::.::..:. .::
XP_005 DNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRAAILEKMPLVER---DGPQADE
550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 QTNGETEPAPL-ETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDITPVIPTAPTSKPSSAGGELLD
... : : : :. : :. :: .:: :::::: : . . : :: :: :.
XP_005 EAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQ-ASQLLDLLDLLDGA--SGDVQHPPHLDPSP-GGALVH
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 LLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPHFLLDGLSSQPLFNDIAAGIPSITAYSKNGLKIE
:: :. : . : :: : ::.. .. ..:....
XP_005 LL-DL-----PCVPPPPA--P------------------------IPDLKVFEREGVQLN
660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 FTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKTFQLQLLSPSSSIVPAFNTGTI
..: : ::.. .::: :.: .: :.: :. ::::::..:::: .::.. ::: . :
XP_005 LSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKSLQLQLQAPSGNTVPARGGLPI
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810 820
pF1KB5 TQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFPPQSWQ
::....:::.: ::....:::.: ...:.. ::::.: .:::
XP_005 TQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLPVESWQ
750 760 770 780
>>XP_005268234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 complex su (656 aa)
initn: 2518 init1: 2154 opt: 2245 Z-score: 1824.2 bits: 348.2 E(85289): 7.2e-95
Smith-Waterman score: 2555; 58.1% identity (79.9% similar) in 695 aa overlap (129-822:1-656)
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 VHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAA
:::.::::::: :::::: . :.::::
XP_005 MGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAI
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 LCAVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQ
: :::.::::::: .::: .::.:..::.: ...:.::.::::: : ::::.:::
XP_005 LTAVHMIRKVPELSSVFLPPCAQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LVRILKNLIMSGYSPEHDVSGISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNT
::.::..:. ::: ::..::.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::
XP_005 LVHILRTLVTMGYSTEHSISGVSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNT
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 ETSKNVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQT
.::.:.:::.:.:::::::::.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.
XP_005 DTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQS
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 DHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKA
::.:::::: :.:.::.. :.:..:::.:::.::::..:.:.::.:: ::.:: :...:
XP_005 DHSAVQRHRPTVVECLRETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRA
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 DCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQR
::::::.::::..::.::::::::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:
XP_005 DCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRR
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 LYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMS
::.:. : ::::::::::::::::::::..:.::: ::.:: :.::: .::.:: :.::
XP_005 LYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMS
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 TSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRS
.::::::::.::::::. :::..::::::: .:::::::::::..::.::::::.
XP_005 LPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRA
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 ALLERMPVMEKVTTNGPTEIVQTNGETEPAPL-ETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDI
:.::.::..:. .:: ... : : : :. : :. :: .:: :::::: :
XP_005 AILEKMPLVER---DGPQADEEAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQ-ASQLLDLLDLLDGA--
460 470 480 490 500
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 TPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPHFLLDGLSSQPLF
. . : :: :: :. :: :. : . : :: :
XP_005 SGDVQHPPHLDPSP-GGALVHLL-DL-----PCVPPPPA--P------------------
510 520 530
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 NDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKT
::.. .. ..:......: : ::.. .::: :.: .: :.: :. ::::::.
XP_005 ------IPDLKVFEREGVQLNLSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKS
540 550 560 570 580 590
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 FQLQLLSPSSSIVPAFNTGTITQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFP
.:::: .::.. ::: . :::....:::.: ::....:::.: ...:.. ::::.:
XP_005 LQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLP
600 610 620 630 640 650
820
pF1KB5 PQSWQ
.:::
XP_005 VESWQ
>>XP_005268235 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 complex su (656 aa)
initn: 2518 init1: 2154 opt: 2245 Z-score: 1824.2 bits: 348.2 E(85289): 7.2e-95
Smith-Waterman score: 2555; 58.1% identity (79.9% similar) in 695 aa overlap (129-822:1-656)
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 VHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAA
:::.::::::: :::::: . :.::::
XP_005 MGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAI
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 LCAVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQ
: :::.::::::: .::: .::.:..::.: ...:.::.::::: : ::::.:::
XP_005 LTAVHMIRKVPELSSVFLPPCAQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LVRILKNLIMSGYSPEHDVSGISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNT
::.::..:. ::: ::..::.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::
XP_005 LVHILRTLVTMGYSTEHSISGVSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNT
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 ETSKNVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQT
.::.:.:::.:.:::::::::.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.
XP_005 DTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQS
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 DHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKA
::.:::::: :.:.::.. :.:..:::.:::.::::..:.:.::.:: ::.:: :...:
XP_005 DHSAVQRHRPTVVECLRETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRA
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 DCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQR
::::::.::::..::.::::::::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:
XP_005 DCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRR
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 LYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMS
::.:. : ::::::::::::::::::::..:.::: ::.:: :.::: .::.:: :.::
XP_005 LYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMS
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 TSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRS
.::::::::.::::::. :::..::::::: .:::::::::::..::.::::::.
XP_005 LPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRA
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 ALLERMPVMEKVTTNGPTEIVQTNGETEPAPL-ETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDI
:.::.::..:. .:: ... : : : :. : :. :: .:: :::::: :
XP_005 AILEKMPLVER---DGPQADEEAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQ-ASQLLDLLDLLDGA--
460 470 480 490 500
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 TPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPHFLLDGLSSQPLF
. . : :: :: :. :: :. : . : :: :
XP_005 SGDVQHPPHLDPSP-GGALVHLL-DL-----PCVPPPPA--P------------------
510 520 530
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 NDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKT
::.. .. ..:......: : ::.. .::: :.: .: :.: :. ::::::.
XP_005 ------IPDLKVFEREGVQLNLSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKS
540 550 560 570 580 590
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 FQLQLLSPSSSIVPAFNTGTITQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFP
.:::: .::.. ::: . :::....:::.: ::....:::.: ...:.. ::::.:
XP_005 LQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLP
600 610 620 630 640 650
820
pF1KB5 PQSWQ
.:::
XP_005 VESWQ
>>XP_005268236 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 complex su (656 aa)
initn: 2518 init1: 2154 opt: 2245 Z-score: 1824.2 bits: 348.2 E(85289): 7.2e-95
Smith-Waterman score: 2555; 58.1% identity (79.9% similar) in 695 aa overlap (129-822:1-656)
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 VHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAA
:::.::::::: :::::: . :.::::
XP_005 MGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAI
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 LCAVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQ
: :::.::::::: .::: .::.:..::.: ...:.::.::::: : ::::.:::
XP_005 LTAVHMIRKVPELSSVFLPPCAQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQ
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LVRILKNLIMSGYSPEHDVSGISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNT
::.::..:. ::: ::..::.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::
XP_005 LVHILRTLVTMGYSTEHSISGVSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNT
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 ETSKNVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQT
.::.:.:::.:.:::::::::.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.
XP_005 DTSRNAGNAVLFETVLTIMDIRSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQS
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 DHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKA
::.:::::: :.:.::.. :.:..:::.:::.::::..:.:.::.:: ::.:: :...:
XP_005 DHSAVQRHRPTVVECLRETDASLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRA
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 DCASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQR
::::::.::::..::.::::::::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:
XP_005 DCASGILLAAERFAPTKRWHIDTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRR
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 LYKAILGDYSQQPLVQVAAWCIGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMS
::.:. : ::::::::::::::::::::..:.::: ::.:: :.::: .::.:: :.::
XP_005 LYNALAEDISQQPLVQVAAWCIGEYGDLLLAGNCEEIEPLQVDEEEVLALLEKVLQSHMS
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 TSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQQRAVEYNALFKKYDHMRS
.::::::::.::::::. :::..::::::: .:::::::::::..::.::::::.
XP_005 LPATRGYALTALMKLSTRLCGDNNRIRQVVSIYGSCLDVELQQRAVEYDTLFRKYDHMRA
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 ALLERMPVMEKVTTNGPTEIVQTNGETEPAPL-ETKPPPSGPQPTSQANDLLDLLGGNDI
:.::.::..:. .:: ... : : : :. : :. :: .:: :::::: :
XP_005 AILEKMPLVER---DGPQADEEAKESKEAAQLSEAAPVPTEPQ-ASQLLDLLDLLDGA--
460 470 480 490 500
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 TPVIPTAPTSKPSSAGGELLDLLGDINLTGAPAAAPAPASVPQISQPHFLLDGLSSQPLF
. . : :: :: :. :: :. : . : :: :
XP_005 SGDVQHPPHLDPSP-GGALVHLL-DL-----PCVPPPPA--P------------------
510 520 530
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 NDIAAGIPSITAYSKNGLKIEFTFERSNTNPSVTVITIQASNSTELDMTDFVFQAAVPKT
::.. .. ..:......: : ::.. .::: :.: .: :.: :. ::::::.
XP_005 ------IPDLKVFEREGVQLNLSFIRPPENPALLLITITATNFSEGDVTHFICQAAVPKS
540 550 560 570 580 590
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 FQLQLLSPSSSIVPAFNTGTITQVIKVLNPQKQQLRMRIKLTYNHKGSAMQDLAEVNNFP
.:::: .::.. ::: . :::....:::.: ::....:::.: ...:.. ::::.:
XP_005 LQLQLQAPSGNTVPARGGLPITQLFRILNPNKAPLRLKLRLTYDHFHQSVQEIFEVNNLP
600 610 620 630 640 650
820
pF1KB5 PQSWQ
.:::
XP_005 VESWQ
>>XP_016877234 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 complex su (494 aa)
initn: 2159 init1: 2159 opt: 2174 Z-score: 1768.7 bits: 337.5 E(85289): 8.9e-92
Smith-Waterman score: 2174; 68.3% identity (89.9% similar) in 473 aa overlap (1-472:1-473)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPAP-IRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHML
: .: ..:..::. :: :.:::.:::.:::::: ::.:::. : ..: :..:::::.:::
XP_016 MVVPSLKLQDLIEEIRGAKTQAQEREVIQKECAHIRASFRDGDPVHRHRQLAKLLYVHML
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQ
::::::::.::::::::..:::::.::::::::::::.:.:::.:: :::::... : ::
XP_016 GYPAHFGQMECLKLIASSRFTDKRVGYLGAMLLLDERHDAHLLITNSIKNDLSQGIQPVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPAT
:::::::. :::.::::::: :::::: . :.:::: : :::.::::::: .:::
XP_016 GLALCTLSTMGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAILTAVHMIRKVPELSSVFLPPC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSG
.::.:..::.: ...:.::.::::: : ::::.:::::.::..:. ::: ::..::
XP_016 AQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQLVHILRTLVTMGYSTEHSISG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDI
.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::.::.:.:::.:.:::::::::
XP_016 VSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDV
.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.::.:::::: :.:.::.. :.
XP_016 RSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQSDHSAVQRHRPTVVECLRETDA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHI
:..:::.:::.::::..:.:.::.:: ::.:: :...:::::::.::::..::.:::::
XP_016 SLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWC
:::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:::.:. : :: :.
XP_016 DTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQIPIFLSRSQL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 IGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTC
XP_016 LTQCRRHLSTEPCF
490
>>XP_016877233 (OMIM: 603534) PREDICTED: AP-1 complex su (495 aa)
initn: 2163 init1: 2163 opt: 2165 Z-score: 1761.4 bits: 336.1 E(85289): 2.3e-91
Smith-Waterman score: 2165; 68.5% identity (90.0% similar) in 470 aa overlap (1-469:1-470)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPAP-IRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHML
: .: ..:..::. :: :.:::.:::.:::::: ::.:::. : ..: :..:::::.:::
XP_016 MVVPSLKLQDLIEEIRGAKTQAQEREVIQKECAHIRASFRDGDPVHRHRQLAKLLYVHML
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GYPAHFGQLECLKLIASQKFTDKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQ
::::::::.::::::::..:::::.::::::::::::.:.:::.:: :::::... : ::
XP_016 GYPAHFGQMECLKLIASSRFTDKRVGYLGAMLLLDERHDAHLLITNSIKNDLSQGIQPVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALCAVHVIRKVPELMEMFLPAT
:::::::. :::.::::::: :::::: . :.:::: : :::.::::::: .:::
XP_016 GLALCTLSTMGSAEMCRDLAPEVEKLLLQPSPYVRKKAILTAVHMIRKVPELSSVFLPPC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSG
.::.:..::.: ...:.::.::::: : ::::.:::::.::..:. ::: ::..::
XP_016 AQLLHERHHGILLGTITLITELCERSPAALRHFRKVVPQLVHILRTLVTMGYSTEHSISG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ISDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDI
.:::::::.::::::::::: ..:::.:::.::::::::.::.:.:::.:.:::::::::
XP_016 VSDPFLQVQILRLLRILGRNHEESSETMNDLLAQVATNTDTSRNAGNAVLFETVLTIMDI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KSESGLRVLAINILGRFLLNNDKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDV
.: .::::::.:::::::::.:.:::::::::::. ::.::.:::::: :.:.::.. :.
XP_016 RSAAGLRVLAVNILGRFLLNSDRNIRYVALTSLLRLVQSDHSAVQRHRPTVVECLRETDA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADCASGIFLAAEKYAPSKRWHI
:..:::.:::.::::..:.:.::.:: ::.:: :...:::::::.::::..::.:::::
XP_016 SLSRRALELSLALVNSSNVRAMMQELQAFLESCPPDLRADCASGILLAAERFAPTKRWHI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWC
:::..::::::..:::::: :: ::: .. :.:::.:.:::.:. : ::
XP_016 DTILHVLTTAGTHVRDDAVANLTQLIGGAQELHAYSVRRLYNALAEDISQVTAAYTVQKT
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 IGEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTC
XP_016 SEHRALFLRTSGLLS
490
822 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 16:19:08 2016 done: Sat Nov 5 16:19:10 2016
Total Scan time: 13.700 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]