Result of FASTA (omim) for
pFN21AB8556
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8556, 910 aa
1>>>pF1KB8556 910 - 910 aa - 910 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9951+/-0.00046; mu= -18.4873+/- 0.029
mean_var=505.1121+/-104.582, 0's: 0 Z-trim(122.9): 69 B-trim: 140 in 2/55
Lambda= 0.057066
statistics sampled from 41830 (41914) to 41830 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.776), E-opt: 0.2 (0.491), width: 16
Scan time: 14.920
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001245303 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 910) 6062 514.3 1.1e-144
NP_067058 (OMIM: 616826) epidermal growth factor r ( 864) 5759 489.3 3.4e-137
XP_016882575 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 926) 5329 453.9 1.6e-126
XP_016882576 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 915) 5321 453.3 2.5e-126
XP_016882578 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 845) 5306 452.0 5.6e-126
XP_016882577 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 874) 5306 452.0 5.8e-126
XP_016882580 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 796) 5282 450.0 2.1e-125
XP_016882581 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 750) 4953 422.9 2.9e-117
NP_001245304 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 754) 4953 422.9 2.9e-117
XP_016882579 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 797) 4953 422.9 3e-117
NP_001245305 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 601) 3886 335.0 6.7e-91
XP_016856105 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 865) 1261 119.0 1e-25
XP_016856104 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 933) 1260 118.9 1.1e-25
XP_016856108 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 708) 1223 115.8 7.6e-25
XP_016856106 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 828) 1224 115.9 8.1e-25
XP_016856107 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 798) 1223 115.8 8.3e-25
NP_001972 (OMIM: 600051) epidermal growth factor r ( 896) 1223 115.9 9.1e-25
XP_005270675 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 866) 1222 115.8 9.4e-25
XP_016856109 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 658) 1126 107.8 1.8e-22
NP_001153441 (OMIM: 600051) epidermal growth facto ( 582) 707 73.3 4e-12
XP_011527994 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1107) 362 45.0 0.0024
XP_016883929 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1112) 362 45.1 0.0024
NP_001317941 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1178) 362 45.1 0.0025
XP_016883927 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1183) 362 45.1 0.0025
XP_016883925 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1608) 362 45.2 0.0032
XP_016883924 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1613) 362 45.2 0.0032
XP_016883919 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1679) 362 45.2 0.0033
XP_016883918 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1684) 362 45.2 0.0033
NP_055416 (OMIM: 605890) EH domain-containing prot ( 543) 344 43.4 0.0037
XP_011531108 (OMIM: 605891) PREDICTED: EH domain-c ( 322) 327 41.8 0.0065
XP_011527995 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1020) 343 43.5 0.0065
XP_016883930 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1025) 343 43.5 0.0066
NP_001317940 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1144) 343 43.5 0.0072
NP_001317937 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1149) 343 43.5 0.0072
NP_001317938 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1215) 343 43.5 0.0075
NP_001001132 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1220) 343 43.5 0.0075
XP_016883923 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1645) 343 43.6 0.0096
XP_016883922 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1650) 343 43.6 0.0096
XP_016883921 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1660) 343 43.6 0.0096
XP_016883920 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1665) 343 43.6 0.0097
NP_055415 (OMIM: 605891) EH domain-containing prot ( 535) 327 42.0 0.0097
NP_001317939 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1716) 343 43.6 0.0099
NP_003015 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform ITS (1721) 343 43.6 0.0099
XP_016883917 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1721) 343 43.6 0.0099
>>NP_001245303 (OMIM: 616826) epidermal growth factor re (910 aa)
initn: 6062 init1: 6062 opt: 6062 Z-score: 2718.6 bits: 514.3 E(85289): 1.1e-144
Smith-Waterman score: 6062; 100.0% identity (100.0% similar) in 910 aa overlap (1-910:1-910)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 ALSKADMPAA
::::::::::
NP_001 ALSKADMPAA
910
>>NP_067058 (OMIM: 616826) epidermal growth factor recep (864 aa)
initn: 5759 init1: 5759 opt: 5759 Z-score: 2584.1 bits: 489.3 E(85289): 3.4e-137
Smith-Waterman score: 5759; 100.0% identity (100.0% similar) in 862 aa overlap (1-862:1-862)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
::::::::::::::::::::::
NP_067 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSVS
850 860
>>XP_016882575 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal growt (926 aa)
initn: 5282 init1: 5282 opt: 5329 Z-score: 2392.3 bits: 453.9 E(85289): 1.6e-126
Smith-Waterman score: 6020; 98.3% identity (98.3% similar) in 926 aa overlap (1-910:1-926)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
370 380 390 400 410 420
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XP_016 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
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pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
490 500 510 520 530 540
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pF1KB8 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
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XP_016 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
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XP_016 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
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pF1KB8 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
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XP_016 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
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pF1KB8 PKKPAPPRPKPPS----------------GKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDP
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PKKPAPPRPKPPSEAMAEQKNSALYSLLGGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDP
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pF1KB8 FQSKKGFGDPFSGKDPFVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQER
:: :
XP_016 FQRCLGKSHCACYLWCYSSVEQRAGQRQCIAERH
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XP_016 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
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pF1KB8 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
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XP_016 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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Smith-Waterman score: 4953; 100.0% identity (100.0% similar) in 749 aa overlap (1-749:1-749)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
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NP_001 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
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:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKVKVHL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSK-------------------------------
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::::::::::
XP_016 ALSKADMPAA
790
910 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 16:13:03 2016 done: Sat Nov 5 16:13:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]