Result of FASTA (ccds) for pFN21AB8556
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8556, 910 aa
  1>>>pF1KB8556 910 - 910 aa - 910 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.1066+/-0.00116; mu= -7.1676+/- 0.070
 mean_var=434.4099+/-89.696, 0's: 0 Z-trim(114.7): 39  B-trim: 128 in 1/53
 Lambda= 0.061535
 statistics sampled from 15205 (15242) to 15205 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.468), width:  16
 Scan time:  5.560

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 910) 6062 553.1 8.7e-157
CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 864) 5759 526.1 1.1e-148
CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 754) 4953 454.5 3.3e-127
CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 601) 3886 359.7 9.1e-99
CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1            ( 896) 1223 123.5 1.8e-27


>>CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19           (910 aa)
 initn: 6062 init1: 6062 opt: 6062  Z-score: 2928.3  bits: 553.1 E(32554): 8.7e-157
Smith-Waterman score: 6062; 100.0% identity (100.0% similar) in 910 aa overlap (1-910:1-910)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB8 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
              850       860       870       880       890       900

              910
pF1KB8 ALSKADMPAA
       ::::::::::
CCDS58 ALSKADMPAA
              910

>>CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19           (864 aa)
 initn: 5759 init1: 5759 opt: 5759  Z-score: 2783.2  bits: 526.1 E(32554): 1.1e-148
Smith-Waterman score: 5759; 100.0% identity (100.0% similar) in 862 aa overlap (1-862:1-862)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDMVP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKPPPSGPFTSSLGGAGFSDDPFKSKQDTPALP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PKKPAPPRPKPPSGKSTPVSQLGSADFPEAPDPFQPLGADSGDPFQSKKGFGDPFSGKDP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB8 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSFGNEEQQLAWAKRESEKAEQERLARLRRQEQEDLELAI
       ::::::::::::::::::::::                                      
CCDS32 FVPSSAAKPSKASASGFADFTSVS                                    
              850       860                                        

>>CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19           (754 aa)
 initn: 4953 init1: 4953 opt: 4953  Z-score: 2397.3  bits: 454.5 E(32554): 3.3e-127
Smith-Waterman score: 4953; 100.0% identity (100.0% similar) in 749 aa overlap (1-749:1-749)

               10        20        30        40        50        60
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CCDS58 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
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CCDS58 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DPFKESDPFRGSATDDFFKKQTKNDPFTSDPFTKNPSLPSKLDPFESSDPFSSSSVSSKG
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       :::::::::::::::::::::::::::::                               
CCDS58 SDPFGTLDPFGSGSFNSAEGFADFSQMSKVKVHL                          
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>>CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19           (601 aa)
 initn: 3886 init1: 3886 opt: 3886  Z-score: 1886.6  bits: 359.7 E(32554): 9.1e-99
Smith-Waterman score: 3886; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-597)

               10        20        30        40        50        60
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDLA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAH
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLD
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQEVK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKTSE
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pF1KB8 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMISSL
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pF1KB8 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQDEI
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pF1KB8 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMDDP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS59 NQARSKLSQLHESRQEAHRSLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAERGSFGAMVKV
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pF1KB8 FKNKALLFSNNTQELHPDPFQTEDPFKSDPFKGADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGG
                                                                   
CCDS59 E                                                           
                                                                   

>>CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1                 (896 aa)
 initn: 2090 init1: 1049 opt: 1223  Z-score: 606.7  bits: 123.5 E(32554): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 2594; 46.7% identity (70.9% similar) in 971 aa overlap (2-905:3-891)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MAAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYKQVDPAYTGRVGASEAALFLKKSGLSDIILGKIWDL
         ::  . :.: . .:: .::.::.::: . :::: ::.:: ::::::: :.::::::::
CCDS55 MAAAAQLSLTQ-LSSGNPVYEKYYRQVDTGNTGRVLASDAAAFLKKSGLPDLILGKIWDL
               10         20        30        40        50         

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pF1KB8 ADPEGKGFLDKQGFYVALRLVACAQSGHEVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSA-E
       :: .:::.:.:: :.::::::::::.: ::.::.:::..:::.::::::::...  :: :
CCDS55 ADTDGKGILNKQEFFVALRLVACAQNGLEVSLSSLNLAVPPPRFHDTSSPLLISGTSAAE
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB8 AHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSGDKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGH
         :::. :.:::.:.::.:: :.::.::::::::::.:::::.:.:::::.:::::.:: 
CCDS55 LPWAVKPEDKAKYDAIFDSLSPVNGFLSGDKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGM
     120       130       140       150       160       170         

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB8 LDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPSLIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRS
       :::::::::: ::: :::::::: .:::.:.::::::                       
CCDS55 LDRDEFAVAMFLVYCALEKEPVPMSLPPALVPPSKRK-----------------------
     180       190       200       210                             

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB8 TPSHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTVNWVVPVADKMRFDEIFLKTDLDLDGYVSGQE
                                    .:::  :.: ..:::::::: :.::.::: :
CCDS55 -----------------------------TWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLE
                                     220       230       240       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB8 VKEIFMHSGLTQNLLAHIWALADTRQTGKLSKDQFALAMYFIQQKVSKGIDPPQVLSPDM
       :.:::...:: ..::::::.: ::.. :::::::::::...:.::. ::::::.::.:.:
CCDS55 VREIFLKTGLPSTLLAHIWSLCDTKDCGKLSKDQFALAFHLISQKLIKGIDPPHVLTPEM
       250       260       270       280       290       300       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB8 VPPSERGTPGPDSSGSLGSGEFTGVKELDDISQEIAQLQREKYSLEQDIREKEEAIRQKT
       .:::.:..   .  ::   ..:...:::: ...::..::::: ..:::..:::..:.:.:
CCDS55 IPPSDRASLQKNIIGSSPVADFSAIKELDTLNNEIVDLQREKNNVEQDLKEKEDTIKQRT
       310       320       330       340       350       360       

      420       430       440       450       460       470        
pF1KB8 SEVQELQNDLDRETSSLQELEAQKQDAQDRLDEMDQQKAKLRDMLSDVRQKCQDETQMIS
       ::::.::....::...::.:.::::..:. :::.:.:::.:...:..::.:: .:.:.::
CCDS55 SEVQDLQDEVQRENTNLQKLQAQKQQVQELLDELDEQKAQLEEQLKEVRKKCAEEAQLIS
       370       380       390       400       410       420       

      480       490       500       510       520       530        
pF1KB8 SLKTQIQSQESDLKSQEDDLNRAKSELNRLQQEETQLEQSIQAGRVQLETIIKSLKSTQD
       :::... ::::.... :..: .:. ::.::::: ..::.:...:..::: . . :...:.
CCDS55 SLKAELTSQESQISTYEEELAKAREELSRLQQETAELEESVESGKAQLEPLQQHLQDSQQ
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       ::.. . :: ....   : : :        .. ...::      ..: .. :::.:   :
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CCDS55 -ASDCFFRQST--DPFATSSTDPFSAANNSSITSVETLKHNDPFAPGGTVVAASDSATDP
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CCDS55 FASV--FGNESFGG--GFADFSTLSKVNNEDPFRSATSSSVSNVVITKNVFEETSVKSED
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CCDS55 QEDLELAIALSKSEISEA
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910 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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