Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5832
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5832, 481 aa
1>>>pF1KB5832 481 - 481 aa - 481 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7473+/-0.000993; mu= -10.2805+/- 0.059
mean_var=413.2254+/-87.762, 0's: 0 Z-trim(116.0): 32 B-trim: 176 in 1/53
Lambda= 0.063093
statistics sampled from 16599 (16628) to 16599 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.812), E-opt: 0.2 (0.511), width: 16
Scan time: 4.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5697.1 AGFG2 gene_id:3268|Hs108|chr7 ( 481) 3303 314.6 1.5e-85
CCDS46533.1 AGFG1 gene_id:3267|Hs108|chr2 ( 584) 929 98.6 1.9e-20
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CCDS2467.1 AGFG1 gene_id:3267|Hs108|chr2 ( 562) 908 96.7 7e-20
CCDS46535.1 AGFG1 gene_id:3267|Hs108|chr2 ( 522) 896 95.5 1.4e-19
>>CCDS5697.1 AGFG2 gene_id:3268|Hs108|chr7 (481 aa)
initn: 3303 init1: 3303 opt: 3303 Z-score: 1649.5 bits: 314.6 E(32554): 1.5e-85
Smith-Waterman score: 3303; 100.0% identity (100.0% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVMAAKKGPGPGGGVSGGKAEAEAASEVWCRRVRELGGCSQAGNRHCFECAQRGVTYVDI
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CCDS56 MVMAAKKGPGPGGGVSGGKAEAEAASEVWCRRVRELGGCSQAGNRHCFECAQRGVTYVDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TVGSFVCTTCSGLLRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVVFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TVGSFVCTTCSGLLRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVVFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGSASTPVQGSIPEGKPLRTLLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DPAPSLSVAASTSSQPVSQSHARTSQARSTQPPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAAPQMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DPAPSLSVAASTSSQPVSQSHARTSQARSTQPPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAAPQMA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PAFAAFPAFGGQTPSQGGFANFDAFSSGPSSSVFGSLPPAGQASFQAQPTPAGSSQGTPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GATPLAPASQPNSLADVGSFLGPGVPAAGVPSSLFGMAGQVPPLQSVTMGGGGGSSTGLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 FGAFTNPFTAPAAQSPLPSTNPFQPNGLAPGPGFGMSSAGPGFPQAVPPTGAFASSFPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FGAFTNPFTAPAAQSPLPSTNPFQPNGLAPGPGFGMSSAGPGFPQAVPPTGAFASSFPAP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LFPPQTPLVQQQNGSSFGDLGSAKLGQRPLSQPAGISTNPFMTGPSSSPFASKPPTTNPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LFPPQTPLVQQQNGSSFGDLGSAKLGQRPLSQPAGISTNPFMTGPSSSPFASKPPTTNPF
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 L
:
CCDS56 L
>>CCDS46533.1 AGFG1 gene_id:3267|Hs108|chr2 (584 aa)
initn: 1009 init1: 635 opt: 929 Z-score: 480.5 bits: 98.6 E(32554): 1.9e-20
Smith-Waterman score: 943; 40.7% identity (64.7% similar) in 484 aa overlap (31-480:15-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVMAAKKGPGPGGGVSGGKAEAEAASEVWCRRVRELGGCSQAGNRHCFECAQRGVTYVDI
. .:.. : . ::.::.: ::: :::..
CCDS46 MAASAKRKQEEKHLKMLRDMTGLPH--NRKCFDCDQRGPTYVNM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TVGSFVCTTCSGLLRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVVFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTS
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CCDS46 TVGSFVCTSCSGSLRGLNPPHRVKSISMTTFTQQEIEFLQKHGNEVCKQIWLGLFDDRSS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 LVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGS---ASTPVQGSIPEGKPLRT
.:: :::::::::::::::::::::::.:.: . ...: .:. .: :: :::..
CCDS46 AIPDFRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPEQAKVVASVHASISGSSASSTSSTPEVKPLKS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LLGDPAPSLSVAASTSSQ-PVSQSHARTSQARSTQPPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAA
:::: ::.: . .: :: :: . ::... . : . :::.:.:.: :::
CCDS46 LLGDSAPTLHLNKGTPSQSPV----VGRSQGQQQE--------KKQFDLLSDLGSDIFAA
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB5 P---QMAPA----FAAFPAFGGQTPSQGGFANFDAFSSGPSSSVFGSLPPAGQASFQAQP
: . : : :: : . ..:. ... :::::::... .:: ::..: :... :: :
CCDS46 PAPQSTATANFANFAHFNSHAAQNSANADFANFDAFGQSSGSSNFGGFPTASHSPFQPQT
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TP-----AGSSQGTPFGATPLAPASQPNSLADVGSFLG--PGVPAAGVPSSLFGMAGQVP
: .. : : .: :: :.. .: :.:.. .. . : .. :. :: .
CCDS46 TAFRMLSSSCSFGEFTSAFPLQ-ATHSGSAASVNANFAHFDNFPKSS--SADFGTFNTSQ
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PLQSVTMGGGGGSSTGLAFGAFTNPFTAPAAQSPLPSTNPFQPNGLAPGPGFGMSSAGP-
:... . . ::. : .. ..: : . . :.. .: : ::: .. .:
CCDS46 SHQTAS--AVSKVSTNKAGLQTADKYAALANLDNIFSAG----QGGDQGSGFGTTGKAPV
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KB5 GFPQAVPPTGAFASSFPAPLFPPQTPLVQQQNGS----SFGDLGSAKLGQRPL-----SQ
: .:: .. .:. : : .. . . ..: : .. .: .: :. .:
CCDS46 GSVVSVPSQSSASSDKYAALAELDSVFSSAATSSNAYTSTSNASSNVFGTVPVVASAQTQ
390 400 410 420 430 440
460 470 480
pF1KB5 PAGIST-NPFMTGPSSSPF-ASKPPT----TNPFL
::. :. :: . ::..:: :. :. ::::
CCDS46 PASSSVPAPFGATPSTNPFVAAAGPSVASSTNPFQTNARGATAATFGTASMSMPTGFGTP
450 460 470 480 490 500
CCDS46 APYSLPTSFSGSFQQPAFPAQAAFPQQTAFSQQPNGFAAFGQTKPVVTPFGQVAAAGVSS
510 520 530 540 550 560
>>CCDS46534.1 AGFG1 gene_id:3267|Hs108|chr2 (560 aa)
initn: 988 init1: 635 opt: 908 Z-score: 470.4 bits: 96.7 E(32554): 7e-20
Smith-Waterman score: 930; 40.8% identity (62.8% similar) in 478 aa overlap (31-480:15-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVMAAKKGPGPGGGVSGGKAEAEAASEVWCRRVRELGGCSQAGNRHCFECAQRGVTYVDI
. .:.. : . ::.::.: ::: :::..
CCDS46 MAASAKRKQEEKHLKMLRDMTGLPH--NRKCFDCDQRGPTYVNM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TVGSFVCTTCSGLLRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVVFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTS
::::::::.::: :::::::::::::::::::. :. :::..:::::..::::::: :.:
CCDS46 TVGSFVCTSCSGSLRGLNPPHRVKSISMTTFTQQEIEFLQKHGNEVCKQIWLGLFDDRSS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 LVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGS---ASTPVQGSIPEGKPLRT
.:: :::::::::::::::::::::::.:.: . ...: .:. .: :: :::..
CCDS46 AIPDFRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPEQAKVVASVHASISGSSASSTSSTPEVKPLKS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LLGDPAPSLSVAASTSSQ-PVSQSHARTSQARSTQPPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAA
:::: ::.: . .: :: :: . ::... . : . :::.:.:.: :::
CCDS46 LLGDSAPTLHLNKGTPSQSPV----VGRSQGQQQE--------KKQFDLLSDLGSDIFAA
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB5 P---QMAPA----FAAFPAFGGQTPSQGGFANFDAFSSGPSSSVFGSLPPAGQASFQAQP
: . : : :: : . ..:. ... :::::::... .:: ::..: :... :: :
CCDS46 PAPQSTATANFANFAHFNSHAAQNSANADFANFDAFGQSSGSSNFGGFPTASHSPFQPQT
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TP-AGSSQGTPFGATPLAPASQPNSLADVGSFLGPGVPAAGVPSSLFGMAGQVPPLQSVT
: ...: .. :. : : : :: :.: :. :. : . :..
CCDS46 TGGSAASVNANFAHFDNFPKS---SSADFGTF---------NTSQSHQTASAVSKV-STN
280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 MGGGGGSSTGLAFGAFTNPFTAPAAQSPLPSTNPFQPNGLAPGPGFGMSSAGP-GFPQAV
.: .. :.. . : :.: .: : ::: .. .: : .:
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320 330 340 350 360
410 420 430 440 450
pF1KB5 PPTGAFASSFPAPLFPPQTPLVQQQNGS----SFGDLGSAKLGQRPL-----SQPAGIST
: .. .:. : : .. . . ..: : .. .: .: :. .:::. :.
CCDS46 PSQSSASSDKYAALAELDSVFSSAATSSNAYTSTSNASSNVFGTVPVVASAQTQPASSSV
370 380 390 400 410 420
460 470 480
pF1KB5 -NPFMTGPSSSPF-ASKPPT----TNPFL
:: . ::..:: :. :. ::::
CCDS46 PAPFGATPSTNPFVAAAGPSVASSTNPFQTNARGATAATFGTASMSMPTGFGTPAPYSLP
430 440 450 460 470 480
>>CCDS2467.1 AGFG1 gene_id:3267|Hs108|chr2 (562 aa)
initn: 986 init1: 635 opt: 908 Z-score: 470.4 bits: 96.7 E(32554): 7e-20
Smith-Waterman score: 930; 40.8% identity (62.8% similar) in 478 aa overlap (31-480:15-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVMAAKKGPGPGGGVSGGKAEAEAASEVWCRRVRELGGCSQAGNRHCFECAQRGVTYVDI
. .:.. : . ::.::.: ::: :::..
CCDS24 MAASAKRKQEEKHLKMLRDMTGLPH--NRKCFDCDQRGPTYVNM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TVGSFVCTTCSGLLRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVVFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTS
::::::::.::: :::::::::::::::::::. :. :::..:::::..::::::: :.:
CCDS24 TVGSFVCTSCSGSLRGLNPPHRVKSISMTTFTQQEIEFLQKHGNEVCKQIWLGLFDDRSS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 LVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGS---ASTPVQGSIPEGKPLRT
.:: :::::::::::::::::::::::.:.: . ...: .:. .: :: :::..
CCDS24 AIPDFRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPEQAKVVASVHASISGSSASSTSSTPEVKPLKS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LLGDPAPSLSVAASTSSQ-PVSQSHARTSQARSTQPPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAA
:::: ::.: . .: :: :: . ::... . : . :::.:.:.: :::
CCDS24 LLGDSAPTLHLNKGTPSQSPV----VGRSQGQQQE--------KKQFDLLSDLGSDIFAA
170 180 190 200 210
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pF1KB5 P---QMAPA----FAAFPAFGGQTPSQGGFANFDAFSSGPSSSVFGSLPPAGQASFQAQP
: . : : :: : . ..:. ... :::::::... .:: ::..: :... :: :
CCDS24 PAPQSTATANFANFAHFNSHAAQNSANADFANFDAFGQSSGSSNFGGFPTASHSPFQPQT
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290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TP-AGSSQGTPFGATPLAPASQPNSLADVGSFLGPGVPAAGVPSSLFGMAGQVPPLQSVT
: ...: .. :. : : : :: :.: :. :. : . :..
CCDS24 TGGSAASVNANFAHFDNFPKS---SSADFGTF---------NTSQSHQTASAVSKV-STN
280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 MGGGGGSSTGLAFGAFTNPFTAPAAQSPLPSTNPFQPNGLAPGPGFGMSSAGP-GFPQAV
.: .. :.. . : :.: .: : ::: .. .: : .:
CCDS24 KAGLQTADKYAALANLDNIFSAG--------------QGGDQGSGFGTTGKAPVGSVVSV
320 330 340 350 360
410 420 430 440 450
pF1KB5 PPTGAFASSFPAPLFPPQTPLVQQQNGS----SFGDLGSAKLGQRPL-----SQPAGIST
: .. .:. : : .. . . ..: : .. .: .: :. .:::. :.
CCDS24 PSQSSASSDKYAALAELDSVFSSAATSSNAYTSTSNASSNVFGTVPVVASAQTQPASSSV
370 380 390 400 410 420
460 470 480
pF1KB5 -NPFMTGPSSSPF-ASKPPT----TNPFL
:: . ::..:: :. :. ::::
CCDS24 PAPFGATPSTNPFVAAAGPSVASSTNPFQTNARGATAATFGTASMSMPTGFGTPAPYSLP
430 440 450 460 470 480
>>CCDS46535.1 AGFG1 gene_id:3267|Hs108|chr2 (522 aa)
initn: 953 init1: 635 opt: 896 Z-score: 464.9 bits: 95.5 E(32554): 1.4e-19
Smith-Waterman score: 961; 41.8% identity (63.2% similar) in 495 aa overlap (31-454:15-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVMAAKKGPGPGGGVSGGKAEAEAASEVWCRRVRELGGCSQAGNRHCFECAQRGVTYVDI
. .:.. : . ::.::.: ::: :::..
CCDS46 MAASAKRKQEEKHLKMLRDMTGLPH--NRKCFDCDQRGPTYVNM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TVGSFVCTTCSGLLRGLNPPHRVKSISMTTFTEPEVVFLQSRGNEVCRKIWLGLFDARTS
::::::::.::: :::::::::::::::::::. :. :::..:::::..::::::: :.:
CCDS46 TVGSFVCTSCSGSLRGLNPPHRVKSISMTTFTQQEIEFLQKHGNEVCKQIWLGLFDDRSS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB5 LVPDSRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPDQVKGPTYTKGS---ASTPVQGSIPEGKPLRT
.:: :::::::::::::::::::::::.:.: . ...: .:. .: :: :::..
CCDS46 AIPDFRDPQKVKEFLQEKYEKKRWYVPPEQAKVVASVHASISGSSASSTSSTPEVKPLKS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LLGDPAPSLSVAASTSSQ-PVSQSHARTSQARSTQPPPHSSVKKASTDLLADIGGDPFAA
:::: ::.: . .: :: :: . ::... . : . :::.:.:.: :::
CCDS46 LLGDSAPTLHLNKGTPSQSPV----VGRSQGQQQE--------KKQFDLLSDLGSDIFAA
170 180 190 200 210
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pF1KB5 P---QMAPA-FAAFPAF----GGQTPS-QGGFANFDAFSSGPSSSVFGSLPPA-------
: . : : :: : : ::.. : ...::.:: : .. ::. ::.. .
CCDS46 PAPQSTATANFANFAHFNSHAGGSAASVNANFAHFDNFPKS-SSADFGTFNTSQSHQTAS
220 230 240 250 260
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pF1KB5 -------GQASFQAQPTPA-------------GSSQGTPFGATPLAPA----SQPN----
..:..:. : :..::. ::.: ::. : :.
CCDS46 AVSKVSTNKAGLQTADKYAALANLDNIFSAGQGGDQGSGFGTTGKAPVGSVVSVPSQSSA
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360
pF1KB5 ------SLADVGSFLGPGVPAAGVPSSLFGMA----GQVPPLQSVTMGGGGGSSTGLAFG
.::.. : .. .. .... .: . . : :: . :. . ..::. ::
CCDS46 SSDKYAALAELDSVFSSAATSSNAYTSTSNASSNVFGTVPVVASA-QTQPASSSVPAPFG
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410
pF1KB5 AF--TNPFTAPAAQSPLPSTNPFQPNGL-APGPGFGMSSAG-P-GF----PQAVPPT--G
: ::::.: :. : :::::: :. : . :: .: . : :: : ..: . :
CCDS46 ATPSTNPFVAAAGPSVASSTNPFQTNARGATAATFGTASMSMPTGFGTPAPYSLPTSFSG
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460
pF1KB5 AFAS-SFPAPL-FPPQTPLVQQQNGSSFGDLGSAKLGQRPLSQPAGISTNPFMTGPSSSP
.: . .::: :: :: . :: ::..:. .:..: :..: :
CCDS46 SFQQPAFPAQAAFPQQTAFSQQPNGAGFAAFGQTKPVVTPFGQVAAAGVSSNPFMTGAPT
450 460 470 480 490 500
470 480
pF1KB5 FASKPPTTNPFL
CCDS46 GQFPTGSSSTNPFL
510 520
481 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 15:05:19 2016 done: Sat Nov 5 15:05:19 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]