Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7957
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7957, 261 aa
1>>>pF1KB7957 261 - 261 aa - 261 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8872+/-0.000631; mu= 12.0691+/- 0.038
mean_var=85.8386+/-17.183, 0's: 0 Z-trim(112.8): 102 B-trim: 79 in 1/51
Lambda= 0.138431
statistics sampled from 13409 (13530) to 13409 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.779), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13282.1 SLA2 gene_id:84174|Hs108|chr20 ( 261) 1739 356.5 1.1e-98
CCDS13283.1 SLA2 gene_id:84174|Hs108|chr20 ( 210) 1204 249.6 1.3e-66
CCDS47922.1 SLA gene_id:6503|Hs108|chr8 ( 293) 644 137.8 7.9e-33
CCDS47923.1 SLA gene_id:6503|Hs108|chr8 ( 316) 644 137.9 8.4e-33
CCDS6370.1 SLA gene_id:6503|Hs108|chr8 ( 276) 630 135.0 5.2e-32
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 493 107.8 1.4e-23
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 493 107.8 1.5e-23
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 481 105.4 7.8e-23
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 481 105.5 8.1e-23
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 470 103.2 3.6e-22
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 470 103.2 3.6e-22
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 470 103.3 3.7e-22
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 452 99.7 4.3e-21
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 450 99.2 5e-21
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 427 94.7 1.4e-19
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 421 93.5 3.3e-19
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 406 90.5 2.6e-18
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 405 90.3 3.1e-18
CCDS64977.1 SLA gene_id:6503|Hs108|chr8 ( 168) 366 82.2 2.6e-16
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 369 83.1 4.1e-16
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 365 82.3 7.7e-16
CCDS64978.1 SLA gene_id:6503|Hs108|chr8 ( 249) 317 72.5 3.2e-13
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 303 69.9 3.9e-12
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 296 68.5 1e-11
>>CCDS13282.1 SLA2 gene_id:84174|Hs108|chr20 (261 aa)
initn: 1739 init1: 1739 opt: 1739 Z-score: 1885.4 bits: 356.5 E(32554): 1.1e-98
Smith-Waterman score: 1739; 100.0% identity (100.0% similar) in 261 aa overlap (1-261:1-261)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTMEAERSKATAVALGSFPAGGPAELSLRLGEPLT
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CCDS13 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTMEAERSKATAVALGSFPAGGPAELSLRLGEPLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQRTPLNWKELDSSLLFSEAATGEESLLSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQRTPLNWKELDSSLLFSEAATGEESLLSEG
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KB7 LRESLSFYISLNDEAVSLDDA
:::::::::::::::::::::
CCDS13 LRESLSFYISLNDEAVSLDDA
250 260
>>CCDS13283.1 SLA2 gene_id:84174|Hs108|chr20 (210 aa)
initn: 1220 init1: 1193 opt: 1204 Z-score: 1309.4 bits: 249.6 E(32554): 1.3e-66
Smith-Waterman score: 1204; 89.4% identity (90.8% similar) in 207 aa overlap (1-200:1-207)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTMEAERSKATAVALGSFPAGGPAELSLRLGEPLT
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CCDS13 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTMEAERSKATAVALGSFPAGGPAELSLRLGEPLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 RESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSEL-
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSEGW
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ------ADDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQRTPLNWKELDSSLLFSEAATGE
: .. :.::: ::
CCDS13 PAPWQGYTPTCDCAEDTTQLERAGQLPPVF
190 200 210
>>CCDS47922.1 SLA gene_id:6503|Hs108|chr8 (293 aa)
initn: 631 init1: 334 opt: 644 Z-score: 702.8 bits: 137.8 E(32554): 7.9e-33
Smith-Waterman score: 644; 41.8% identity (67.8% similar) in 261 aa overlap (5-259:12-265)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTM-EAERSKATAVALGSFPAGGPAELS
:...: . . :. . .. :. :. : :: :...:. .
CCDS47 MLHRLWASPAAPGKKKEMGNSMKSTPAPAERPLPNPEGLDSDFLAV-LSDYPSPDISPPI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPG
.: :: : ..:..: :: ..: .::: ::.. ::.: ::::.:::.:.:::::: ::
CCDS47 FRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRESYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQAL
. :.:.::::.:..: :::::: . ..:::: : :.: :::::::: :. :
CCDS47 TKVGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQ------VKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 VDHYSELADDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQRTPLNWKE---LDSSLLFSEA
:.::::.:: .::.: ::. : .. . :::... ..:.. :. . .:
CCDS47 VNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSTAAPAVRASSSPVTLRQKTVDWRRVSRLQEDPEGTEN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB7 ATG-EESLLSEGLRESLSFYISLNDE-AVSLDDA
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CCDS47 PLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTSEDNTSFDRKKKSISLMYGGSKRKSSFFSSPPYFED
240 250 260 270 280 290
>>CCDS47923.1 SLA gene_id:6503|Hs108|chr8 (316 aa)
initn: 650 init1: 334 opt: 644 Z-score: 702.3 bits: 137.9 E(32554): 8.4e-33
Smith-Waterman score: 644; 41.8% identity (67.8% similar) in 261 aa overlap (5-259:35-288)
10 20 30
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTM-EAERS
:...: . . :. . .. :. :. :
CCDS47 LGHSPLGGLRARLTFPVCLLYHRLWASPAAPGKKKEMGNSMKSTPAPAERPLPNPEGLDS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 KATAVALGSFPAGGPAELSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHG
:: :...:. . .: :: : ..:..: :: ..: .::: ::.. ::.: ::
CCDS47 DFLAV-LSDYPSPDISPPIFRRGEKLRVISDEGGWWKAISLSTGRESYIPGICVARVYHG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 WLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCL
::.:::.:.:::::: :: . :.:.::::.:..: :::::: . ..:::: :
CCDS47 WLFEGLGRDKAEELLQLPDTKVGSFMIRESETKKGFYSLSVRHRQ------VKHYRIFRL
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 DNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQRT
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CCDS47 PNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEVADGLCCVLTTPCLTQSTAAPAVRASSSPVTLRQK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB7 PLNWKE---LDSSLLFSEAATG-EESLLSEGLRESLSFYISLNDE-AVSLDDA
..:.. :. . .: : .:::.: :::::.. :.::..: .:.:
CCDS47 TVDWRRVSRLQEDPEGTENPLGVDESLFSYGLRESIASYLSLTSEDNTSFDRKKKSISLM
240 250 260 270 280 290
CCDS47 YGGSKRKSSFFSSPPYFED
300 310
>>CCDS6370.1 SLA gene_id:6503|Hs108|chr8 (276 aa)
initn: 651 init1: 334 opt: 630 Z-score: 688.1 bits: 135.0 E(32554): 5.2e-32
Smith-Waterman score: 630; 42.8% identity (66.9% similar) in 257 aa overlap (9-259:6-248)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTM-EAERSKATAVALGSFPAGGPAELSLRLGEPL
:: :.:. . :. :. : :: :...:. . .: :: :
CCDS63 MGNSMKSTPAPA-------ERPLPNPEGLDSDFLAV-LSDYPSPDISPPIFRRGEKL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKVSHGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFL
..:..: :: ..: .::: ::.. ::.: ::::.:::.:.:::::: :: . :.:.
CCDS63 RVISDEGGWWKAISLSTGRESYIPGICVARVYHGWLFEGLGRDKAEELLQLPDTKVGSFM
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 IRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSEL
::::.:..: :::::: . ..:::: : :.: :::::::: :. ::.::::.
CCDS63 IRESETKKGFYSLSVRHRQ------VKHYRIFRLPNNWYYISPRLTFQCLEDLVNHYSEV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ADDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQRTPLNWKE---LDSSLLFSEAATG-EES
:: .::.: ::. : .. . :::... ..:.. :. . .: : .::
CCDS63 ADGLCCVLTTPCLTQSTAAPAVRASSSPVTLRQKTVDWRRVSRLQEDPEGTENPLGVDES
170 180 190 200 210 220
240 250 260
pF1KB7 LLSEGLRESLSFYISLNDE-AVSLDDA
:.: :::::.. :.::..: .:.:
CCDS63 LFSYGLRESIASYLSLTSEDNTSFDRKKKSISLMYGGSKRKSSFFSSPPYFED
230 240 250 260 270
>>CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 (491 aa)
initn: 485 init1: 356 opt: 493 Z-score: 536.6 bits: 107.8 E(32554): 1.4e-23
Smith-Waterman score: 493; 40.9% identity (66.7% similar) in 198 aa overlap (9-202:20-212)
10 20 30 40
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTMEAERSKATAVALGSFPAGGPA
:. : : :. . :: : . :.. .::: . . :
CCDS47 MGCIKSKGKDSLSDDGVDLKTQPVPE-SQLLPGQRFQTKDPEEQGDIVVALYPYDGIHPD
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ELSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKV----SHGWLYEGLSREKAE
.::.. :: . .. : :.:: . : .. .: ::: .:::. .. :... ..:. ::
CCDS47 DLSFKKGEKMKVLEEHGEWWKAKSLLTKKEGFIPSNYVAKLNTLETEEWFFKDITRKDAE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ELLLLPGNPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGWLYISPRLT
. :: ::: .::::::::.: .::.::::: :. : :.::.:. :::: :::::.:
CCDS47 RQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDFDPVHGDVIKHYKIRSLDNGGYYISPRIT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQRTPLNWKELDSSLL
:: .. .. ::.. :: .: :.. :. .: : :
CCDS47 FPCISDMIKHYQKQADGLCRRLEKACI----SPKPQKPWDKDAWEIPRESIKLVKRLGAG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260
pF1KB7 FSEAATGEESLLSEGLRESLSFYISLNDEAVSLDDA
CCDS47 QFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTREEPIY
240 250 260 270 280 290
>>CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 (512 aa)
initn: 485 init1: 356 opt: 493 Z-score: 536.3 bits: 107.8 E(32554): 1.5e-23
Smith-Waterman score: 493; 40.3% identity (66.7% similar) in 201 aa overlap (6-202:38-233)
10 20 30
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTMEAERSKA
: ... : : :. . :: : . :..
CCDS61 GKDSLSDDGVDLKTQPVRNTERTIYVRDPTSNKQQRPVPE-SQLLPGQRFQTKDPEEQGD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 TAVALGSFPAGGPAELSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKV----S
.::: . . : .::.. :: . .. : :.:: . : .. .: ::: .:::. .
CCDS61 IVVALYPYDGIHPDDLSFKKGEKMKVLEEHGEWWKAKSLLTKKEGFIPSNYVAKLNTLET
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 HGWLYEGLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIH
. :... ..:. ::. :: ::: .::::::::.: .::.::::: :. : :.::.:.
CCDS61 EEWFFKDITRKDAERQLLAPGNSAGAFLIRESETLKGSFSLSVRDFDPVHGDVIKHYKIR
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 CLDNGWLYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQ
:::: :::::.::: .. .. ::.. :: .: :.. :. .: : :
CCDS61 SLDNGGYYISPRITFPCISDMIKHYQKQADGLCRRLEKACI----SPKPQKPWDKDAWEI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB7 RTPLNWKELDSSLLFSEAATGEESLLSEGLRESLSFYISLNDEAVSLDDA
CCDS61 PRESIKLVKRLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKL
250 260 270 280 290 300
>>CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 (505 aa)
initn: 478 init1: 367 opt: 481 Z-score: 523.4 bits: 105.4 E(32554): 7.8e-23
Smith-Waterman score: 481; 42.2% identity (68.1% similar) in 185 aa overlap (12-192:40-221)
10 20 30 40
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTMEAERSKATAVALG
:.:. .: . : :: .:::
CCDS54 QVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHNS---NTPGIREAGSEDIIVVALY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB7 SFPAGGPAELSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKV----SHGWLYE
.. : .::.. :. .... :.:.:: . : .. .: ::: .::.: .. :...
CCDS54 DYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDSLETEEWFFK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 GLSREKAEELLLLPGNPGGAFLIRESQTRRGSYSLSVRLSRPASWDRIRHYRIHCLDNGW
:.::. ::. :: ::: :.:.::.:.: .:::::::: : . : ..::.:. ::::
CCDS54 GISRKDAERQLLAPGNMLGSFMIRDSETTKGSYSLSVRDYDPRQGDTVKHYKIRTLDNGG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LYISPRLTFPSLQALVDHYSELADDICCLLKEPCVLQRAGPLPGKDIPLPVTVQRTPLNW
.::::: :: .:: :::::.. : .: :. ::.
CCDS54 FYISPRSTFSTLQELVDHYKKGNDGLCQKLSVPCMSSKPQKPWEKDAWEIPRESLKLEKK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB7 KELDSSLLFSEAATGEESLLSEGLRESLSFYISLNDEAVSLDDA
CCDS54 LGAGQFGEVWMATYNKHTKVAVKTMKPGSMSVEAFLAEANVMKTLQHDKLVKLHAVVTKE
250 260 270 280 290 300
>>CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 (526 aa)
initn: 478 init1: 367 opt: 481 Z-score: 523.2 bits: 105.5 E(32554): 8.1e-23
Smith-Waterman score: 481; 42.2% identity (68.1% similar) in 185 aa overlap (12-192:61-242)
10 20 30 40
pF1KB7 MGSLPSRRKSLPSPSLSSSVQGQGPVTMEAERSKATAVALG
:.:. .: . : :: .:::
CCDS33 QVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHNS---NTPGIREAGSEDIIVVALY
40 50 60 70 80
50 60 70 80 90
pF1KB7 SFPAGGPAELSLRLGEPLTIVSEDGDWWTVLSEVSGREYNIPSVHVAKV----SHGWLYE
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