Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6268
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6268, 772 aa
1>>>pF1KB6268 772 - 772 aa - 772 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0976+/-0.00104; mu= 3.6732+/- 0.063
mean_var=191.2426+/-38.312, 0's: 0 Z-trim(111.1): 38 B-trim: 85 in 1/50
Lambda= 0.092743
statistics sampled from 12077 (12101) to 12077 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 4.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS239.2 TCEB3 gene_id:6924|Hs108|chr1 ( 798) 5156 702.7 5.7e-202
CCDS11932.1 TCEB3B gene_id:51224|Hs108|chr18 ( 753) 1551 220.4 8.6e-57
CCDS11931.1 TCEB3C gene_id:162699|Hs108|chr18 ( 546) 878 130.3 8.4e-30
CCDS59316.1 TCEB3CL2 gene_id:100506888|Hs108|chr18 ( 546) 852 126.8 9.4e-29
>>CCDS239.2 TCEB3 gene_id:6924|Hs108|chr1 (798 aa)
initn: 5156 init1: 5156 opt: 5156 Z-score: 3739.5 bits: 702.7 E(32554): 5.7e-202
Smith-Waterman score: 5156; 100.0% identity (100.0% similar) in 772 aa overlap (1-772:27-798)
10 20 30
pF1KB6 MAAESALQVVEKLQARLAANPDPKKLLKYLKKLS
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CCDS23 MHGGRSCGPRTRREPSSGEEAAPVTAMAAESALQVVEKLQARLAANPDPKKLLKYLKKLS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 TLPITVDILAETGVGKTVNSLRKHEHVGSFARDLVAQWKKLVPVERNAEPDEQDFEKSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TLPITVDILAETGVGKTVNSLRKHEHVGSFARDLVAQWKKLVPVERNAEPDEQDFEKSNS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 RKRPRDALQKEEEMEGDYQETWKATGSRSYSPDHRQKKHRKLSELERPHKVSHGHERRDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 RKRPRDALQKEEEMEGDYQETWKATGSRSYSPDHRQKKHRKLSELERPHKVSHGHERRDE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 RKRCHRMSPTYSSDPESSDYGHVQSPPSCTSPHQMYVDHYRSLEEDQEPIVSHQKPGKGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 RKRCHRMSPTYSSDPESSDYGHVQSPPSCTSPHQMYVDHYRSLEEDQEPIVSHQKPGKGH
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 SNAFQDRLGASQERHLGEPHGKGVVSQNKEHKSSHKDKRPVDAKSDEKASVVSREKSHKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SNAFQDRLGASQERHLGEPHGKGVVSQNKEHKSSHKDKRPVDAKSDEKASVVSREKSHKA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LSKEENRRPPSGDNAREKPPSSGVKKEKDREGSSLKKKCLPPSEAASDNHLKKPKHRDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 LSKEENRRPPSGDNAREKPPSSGVKKEKDREGSSLKKKCLPPSEAASDNHLKKPKHRDPE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 KAKLDKSKQGLDSFDTGKGAGDLLPKVKEKGSNNLKTPEGKVKTNLDRKSLGSLPKVEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 KAKLDKSKQGLDSFDTGKGAGDLLPKVKEKGSNNLKTPEGKVKTNLDRKSLGSLPKVEET
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 DMEDEFEQPTMSFESYLSYDQPRKKKKKIVKTSATALGDKGLKKNDSKSTGKNLDSVQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DMEDEFEQPTMSFESYLSYDQPRKKKKKIVKTSATALGDKGLKKNDSKSTGKNLDSVQKL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 PKVNKTKSEKPAGADLAKLRKVPDVLPVLPDLPLPAIQANYRPLPSLELISSFQPKRKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 PKVNKTKSEKPAGADLAKLRKVPDVLPVLPDLPLPAIQANYRPLPSLELISSFQPKRKAF
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 SSPQEEEEAGFTGRRMNSKMQVYSGSKCAYLPKMMTLHQQCIRVLKNNIDSIFEVGGVPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SSPQEEEEAGFTGRRMNSKMQVYSGSKCAYLPKMMTLHQQCIRVLKNNIDSIFEVGGVPY
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 SVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 SVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQ
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB6 DAREQRLRVLTKNIQFAHANKPKGRQAKMAFVNSVAKPPRDVRRRQEKFGTGGAAVPEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DAREQRLRVLTKNIQFAHANKPKGRQAKMAFVNSVAKPPRDVRRRQEKFGTGGAAVPEKI
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KB6 KIKPAPYPMGSSHASASSISFNPSPEEPAYDGPSTSSAHLAPVVSSTVSYDPRKPTVKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 KIKPAPYPMGSSHASASSISFNPSPEEPAYDGPSTSSAHLAPVVSSTVSYDPRKPTVKKI
730 740 750 760 770 780
760 770
pF1KB6 APMMAKTIKAFKNRFSRR
::::::::::::::::::
CCDS23 APMMAKTIKAFKNRFSRR
790
>>CCDS11932.1 TCEB3B gene_id:51224|Hs108|chr18 (753 aa)
initn: 1853 init1: 674 opt: 1551 Z-score: 1133.0 bits: 220.4 E(32554): 8.6e-57
Smith-Waterman score: 2087; 47.7% identity (71.0% similar) in 791 aa overlap (1-772:1-753)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAAESA-LQVVEKLQARLAANPDPKKLLKYLKKLSTLPITVDILAETGVGKTVNSLRKHE
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CCDS11 MAAGSTTLHAVEKLQVRLATKTEPKKLEKYLQKLSALPMTADILAETGIRKTVKRLRKHQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 HVGSFARDLVAQWKKLVPVERNAEPDEQDFEKSNSRKRPRDALQKEEEMEGDYQETWKAT
:::.:::::.:.::::: :.::..: :: :.: ::.: .::: .:. : . :. :
CCDS11 HVGDFARDLAARWKKLVLVDRNTRPGPQDPEESASRQRFGEALQDQEKAWG-FPENATAP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GSRSYSPDHRQKKHRKLSELERPHKVSHGHERRDERKRCHRMSPTYSSDPESSDYGHVQS
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CCDS11 RSPSHSPEHRRTARRTPPGQQRPHPRSHSREPRAERK-CPRIAP--------ADSGRYRA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PPSCTSPHQMYVDHYRSLEEDQEPIVSHQKPGKGHSNAFQDRLGASQ--ERHLGEPHGKG
:. :.: .: : :: . ..::.::..: : :. :.:.::.
CCDS11 SPTRTAPLRM--------PEGPEPAAPGKQPGRGHTHAAQ---GGPLLCPGCQGQPQGKA
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VVSQNKEHKSSHKDKRPVDAKSDEKASVVSREKSHKALSKEENRRPPSGDNAREKPPSS-
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CCDS11 VVSHSKGHKSSRQEKRPLCAQGDWHSPTLIREKSCGACLREETPRMPSWASARDRQPSDF
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 GVKKEKDREGSSLKKKCLPPSEAASDNHLKKPKHRDPEKAKLDKSKQGLDSFDTGKGAGD
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CCDS11 KTDKEGGQAGSGQR---VPALEEAPDSHQKRPQH-----SHSNKKRPSLDGRDPGNGTHG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 LLPKVKEKGSNNLKTPEGKVKT-NLDRKSLGSLPKVEETDMEDEFEQPTMSFESYLSYDQ
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CCDS11 LSPEEKEQLSNDRETQEGKPPTAHLDRTSVSSLSEVEEVDMAEEFEQPTLSCEKYLTYDQ
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 PRKKKKKIVKTSATALGDKGLKKNDSKSTGKNLDSVQKLPKVNKTKSEK--PAGADLAKL
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CCDS11 LRKQKKKTGKSATTALGDKQRKANESKGTRESWDSAKKLPPVQESQSERLQAAGADSAGP
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 RKVPD-VLPVLPDLPLPAIQANYRPLPSLELISSFQPKRKAFSSPQEEEEAGFTGRRMNS
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CCDS11 KTVPSHVFSELWDLSEAWMQANYDPLSDSDSMTS-QAKPEALSSPKFREEAAFPGRRVNA
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 KMQVYSGSKCAYLPKMMTLHQQCIRVLKNNIDSIFEVGGVPYSVLEPVLERCTPDQLYRI
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CCDS11 KMPVYSGSRPACQLQVPTLRQQCAQVLRNNPDALSDVGEVPYWVLEPVLEGWRPDQLYRR
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 EEYNHVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAH
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CCDS11 KKDNHALVRETDELRRNHCFQDFKEEKPQENKTWREQYLRLPDAPEQRLRVMTTNIRSAR
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KB6 ANKPKGRQAKMAFVNSVAKPPRDVRRRQEKFGTGGAAVPEKIKIKPAPYPMGSSHASASS
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CCDS11 GNNPNGREAKMICFKSVAKTPYDTSRRQEK--SAGDADPENGEIKPASKPAGSSHTPSSQ
640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KB6 ISFNPS-----------PEEPAYDGPSTSSAHLAPVVSSTVSYDPRKPTVKKIAPMMAKT
: . . ::. : :.:. : ::.... :: ..::.::.:::.
CCDS11 SSSGGGRDSSSSILRWLPEKRANPCLSSSNEHAAPAAKT------RKQAAKKVAPLMAKA
690 700 710 720 730 740
770
pF1KB6 IKAFKNRFSRR
:. .: :::::
CCDS11 IRDYKRRFSRR
750
>>CCDS11931.1 TCEB3C gene_id:162699|Hs108|chr18 (546 aa)
initn: 1429 init1: 727 opt: 878 Z-score: 648.5 bits: 130.3 E(32554): 8.4e-30
Smith-Waterman score: 1204; 37.1% identity (54.5% similar) in 776 aa overlap (1-772:1-546)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAAESA-LQVVEKLQARLAANPDPKKLLKYLKKLSTLPITVDILAETGVGKTVNSLRKHE
::: :. :..: :::.:::.. .:::: :::.:::.::.:.:::::::. :::. ::::.
CCDS11 MAAGSTTLRAVGKLQVRLATKTEPKKLEKYLQKLSALPMTADILAETGIRKTVKRLRKHQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 HVGSFARDLVAQWKKLVPVERNAEPDEQDFEKSNSRKRPRDALQKEEEMEGDYQETWKAT
:::.:::::.:.::::: :.::. :: :: :.: ::.: .:::..:. : . :. :
CCDS11 HVGDFARDLAARWKKLVLVDRNTGPDPQDPEESASRQRFGEALQEREKAWG-FPENATAP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GSRSYSPDHRQKKHRKLSELERPHKVSHGHERRDERKRCHRMSPTYSSDPESSDYGHVQS
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CCDS11 RSPSHSPEHRRTARRTPPGQQRPHPRSPSREPRAERKR-PRMAP--------ADSGPHRD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PPSCTSPHQMYVDHYRSLEEDQEPIVSHQKPGKGHSNAFQDR--LGASQERHLGEPHGKG
::. :.: : : :: : ..::.::..: : :: . . :.:.:..
CCDS11 PPTRTAPLPM--------PEGPEPAVPGEQPGRGHAHAAQGGPLLGQGCQ---GQPQGEA
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VVSQNKEHKSSHKDKRPVDAKSDEKASVVSREKSHKALSKEENRRPPSGDNAREKPPSSG
: :..: ::::. : .:...::
CCDS11 VGSHSKGHKSSR------------------------------------GASAQKSPP---
220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 VKKEKDREGSSLKKKCLPPSEAASDNHLKKPKHRDPEKAKLDKSKQGLDSFDTGKGAGDL
CCDS11 ------------------------------------------------------------
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 LPKVKEKGSNNLKTPEGKVKTNLDRKSLGSLPKVEETDMEDEFEQPTMSFESYLSYDQPR
:.:. :. :..
CCDS11 ---VQESQSERLQA----------------------------------------------
250
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 KKKKKIVKTSATALGDKGLKKNDSKSTGKNLDSVQKLPKVNKTKSEKPAGADLAKLRKVP
:::: : . ::
CCDS11 ------------------------------------------------AGADSAGPKTVP
260
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 D-VLPVLPDLPLPAIQANYRPLPSLELISSFQPKRKAFSSPQEEEEAGFTGRRMNSKMQV
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CCDS11 SHVFSELWDPSEAWMQANYDLLSAFEAMTS-QANPEALSAPALQEEAAFPGRRVNAKMPV
270 280 290 300 310 320
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 YSGSKCAYLPKMMTLHQQCIRVLKNNIDSIFEVGGVPYSVLEPVLERCTPDQLYRIEEYN
::::. : .. ::.:::.:: .:: :.. .: :::::::::::: ::::::: :. :
CCDS11 YSGSRPACQLQVPTLRQQCLRVPRNNPDALGDVEGVPYSVLEPVLEGWTPDQLYRTEKDN
330 340 350 360 370 380
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 HVLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAHANKP
.: .:::.::..:: .:::::.:.:.:::::.::::.:::::::::.: .:. :. :::
CCDS11 AALARETDELWRIHCLQDFKEEKPQEHESWRELYLRLRDAREQRLRVVTTKIRSARENKP
390 400 410 420 430 440
660 670 680 690 700 710
pF1KB6 KGRQAKMAFVNSVAKPPRDVRRRQEKFGTGGAAVPEKIKIKPAPYPMGSSHASASSISFN
.:::.:: ::::: : :. ::::: ..::: : . ...::: : :::.: :...
CCDS11 SGRQTKMICFNSVAKTPYDASRRQEK--SAGAADPGNGEMEPAPKPAGSSQAP-SGLG--
450 460 470 480 490
720 730 740 750 760 770
pF1KB6 PSPEEPAYDGPSTSSAHLAPVVSSTVSYDPRKPTVKKIAPMMAKTIKAFKNRFSRR
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CCDS11 -DGDGGSVSGGGSSNRHAAPADKT------RKQAAKKVAPLMAKAIRDYKGRFSRR
500 510 520 530 540
>>CCDS59316.1 TCEB3CL2 gene_id:100506888|Hs108|chr18 (546 aa)
initn: 1402 init1: 700 opt: 852 Z-score: 629.7 bits: 126.8 E(32554): 9.4e-29
Smith-Waterman score: 1179; 36.5% identity (55.0% similar) in 775 aa overlap (1-772:1-546)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAAESA-LQVVEKLQARLAANPDPKKLLKYLKKLSTLPITVDILAETGVGKTVNSLRKHE
::: :. :..: :::.:::.. .:::: :::.:::.::.:.:::::::. :::. ::::.
CCDS59 MAAGSTTLRAVGKLQVRLATKTEPKKLEKYLQKLSALPMTADILAETGIRKTVKRLRKHQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 HVGSFARDLVAQWKKLVPVERNAEPDEQDFEKSNSRKRPRDALQKEEEMEGDYQETWKAT
:::.:::::.:.::::: :.::. :: :: :.: ::.: .:::..:. : . :. :
CCDS59 HVGDFARDLAARWKKLVLVDRNTGPDPQDPEESASRQRFGEALQEREKAWG-FPENATAP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GSRSYSPDHRQKKHRKLSELERPHKVSHGHERRDERKRCHRMSPTYSSDPESSDYGHVQS
: :.::.::. .: .::: : ..: : :::: ::.: .: : ..
CCDS59 RSPSHSPEHRRTARRTPPGQQRPHPRSPSREPRAERKR-PRMAP--------ADSGPHRD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 PPSCTSPHQMYVDHYRSLEEDQEPIVSHQKPGKGHSNAFQDR--LGASQERHLGEPHGKG
::. :.: : : :: : ..::.::..: : :: . . :.:.:..
CCDS59 PPTRTAPLPM--------PEGPEPAVPGEQPGRGHAHAAQGGPLLGQGCQ---GQPQGEA
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 VVSQNKEHKSSHKDKRPVDAKSDEKASVVSREKSHKALSKEENRRPPSGDNAREKPPSSG
: :..: ::::. : .:...::
CCDS59 VGSHSKGHKSSR------------------------------------GASAQKSPP---
220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 VKKEKDREGSSLKKKCLPPSEAASDNHLKKPKHRDPEKAKLDKSKQGLDSFDTGKGAGDL
CCDS59 ------------------------------------------------------------
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 LPKVKEKGSNNLKTPEGKVKTNLDRKSLGSLPKVEETDMEDEFEQPTMSFESYLSYDQPR
:.:. :. :.. . : : ::. . . .:. .:. :...
CCDS59 ---VQESQSERLQAAVAD--------SAG--PKTVPSHVFSELWDPS---EAWM------
250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 KKKKKIVKTSATALGDKGLKKNDSKSTGKNLDSVQKLPKVNKTKSEKPAGADLAKLRKVP
CCDS59 ------------------------------------------------------------
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 DVLPVLPDLPLPAIQANYRPLPSLELISSFQPKRKAFSSPQEEEEAGFTGRRMNSKMQVY
:::: : ..: ..: : . .:.:.: .:::.: :::.:.:: ::
CCDS59 --------------QANYDLLSAFEAMTS-QANPEALSAPTLQEEAAFPGRRVNAKMPVY
280 290 300 310 320
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 SGSKCAYLPKMMTLHQQCIRVLKNNIDSIFEVGGVPYSVLEPVLERCTPDQLYRIEEYNH
:::. : .. ::.:::.:: .:: :.. .: :::::.:::::: :::: :: :. :
CCDS59 SGSRPACQLQVPTLRQQCLRVPRNNPDALGDVEGVPYSALEPVLEGWTPDQPYRTEKDNA
330 340 350 360 370 380
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 VLIEETDQLWKVHCHRDFKEERPEEYESWREMYLRLQDAREQRLRVLTKNIQFAHANKPK
.: .:::.::..:: .:::::.:.:.:::::.::::.:::::::::.: .:. :. :::.
CCDS59 ALARETDELWRIHCLQDFKEEKPQEHESWRELYLRLRDAREQRLRVVTTKIRSARENKPS
390 400 410 420 430 440
660 670 680 690 700 710
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