Result of FASTA (omim) for
pFN21AB6171
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6171, 649 aa
1>>>pF1KB6171 649 - 649 aa - 649 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3870+/-0.000372; mu= 14.5780+/- 0.023
mean_var=95.0701+/-19.386, 0's: 0 Z-trim(115.7): 45 B-trim: 809 in 1/50
Lambda= 0.131538
statistics sampled from 26228 (26273) to 26228 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 10.880
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001030 (OMIM: 177200,264350,600761,613071) amil ( 649) 4462 857.4 0
NP_000327 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) amil ( 640) 1306 258.4 5.7e-68
XP_011544216 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 646) 1306 258.4 5.7e-68
XP_011544215 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 651) 1306 258.4 5.7e-68
XP_016879014 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 659) 1306 258.4 5.8e-68
NP_001029 (OMIM: 264350,600228,613021) amiloride-s ( 669) 1163 231.3 8.7e-60
NP_001153047 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 692) 1163 231.3 8.9e-60
NP_001153048 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 728) 1163 231.3 9.3e-60
XP_011540235 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638) 928 186.7 2.2e-46
XP_011540234 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638) 928 186.7 2.2e-46
XP_011540231 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 696) 928 186.7 2.4e-46
XP_011540227 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 704) 928 186.7 2.4e-46
XP_016857533 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 732) 928 186.7 2.5e-46
XP_011540222 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 736) 928 186.7 2.5e-46
XP_016857532 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 749) 928 186.7 2.5e-46
XP_016857531 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 757) 928 186.7 2.6e-46
XP_016857530 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 760) 928 186.7 2.6e-46
XP_016857529 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 764) 928 186.7 2.6e-46
XP_011540210 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 795) 928 186.8 2.7e-46
NP_001123885 (OMIM: 601328) amiloride-sensitive so ( 802) 928 186.8 2.7e-46
XP_016857528 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 810) 928 186.8 2.7e-46
XP_011540208 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 816) 928 186.8 2.7e-46
XP_011540207 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 827) 928 186.8 2.8e-46
XP_016857527 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 846) 928 186.8 2.8e-46
XP_011540204 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 851) 928 186.8 2.8e-46
XP_011540203 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 859) 928 186.8 2.8e-46
XP_016857526 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895) 928 186.8 2.9e-46
XP_011540201 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895) 928 186.8 2.9e-46
XP_016879015 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 623) 591 122.7 3.9e-27
NP_064717 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 549) 315 70.3 2e-11
NP_004760 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 531) 312 69.8 2.9e-11
NP_064718 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 543) 312 69.8 3e-11
XP_016863780 (OMIM: 616693) PREDICTED: acid-sensin ( 463) 287 65.0 7e-10
NP_059115 (OMIM: 616693) acid-sensing ion channel ( 505) 287 65.0 7.5e-10
XP_011536654 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 529) 280 63.7 2e-09
NP_001086 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel ( 528) 275 62.7 3.8e-09
NP_001243759 (OMIM: 602866) acid-sensing ion chann ( 562) 273 62.4 5.2e-09
XP_011536652 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 560) 234 55.0 8.8e-07
NP_061144 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel ( 666) 233 54.8 1.2e-06
XP_011536653 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 559) 229 54.0 1.7e-06
NP_001085 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel ( 512) 168 42.4 0.0048
NP_899233 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel ( 563) 168 42.4 0.0052
>>NP_001030 (OMIM: 177200,264350,600761,613071) amilorid (649 aa)
initn: 4462 init1: 4462 opt: 4462 Z-score: 4578.0 bits: 857.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4462; 100.0% identity (100.0% similar) in 649 aa overlap (1-649:1-649)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LTAVALILWQCALLVFSFYTVSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTAVALILWQCALLVFSFYTVSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLEQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TREALKSLYGFPESRKRREAESWNSVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKARDFFTGRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TREALKSLYGFPESRKRREAESWNSVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKARDFFTGRKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYMNIMAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYMNIMAQ
190 200 210 220 230 240
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pF1KB6 VPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETILSTSMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETILSTSMG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 GSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSIGMHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSIGMHLT
310 320 330 340 350 360
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pF1KB6 ESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIYNAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQYSQPLPPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIYNAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQYSQPLPPAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWPSVVSEKWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWPSVVSEKWL
430 440 450 460 470 480
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pF1KB6 LPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFGGQLGLWMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFGGQLGLWMS
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pF1KB6 CSVVCVIEIIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSPQGQDNPALDIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSVVCVIEIIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSPQGQDNPALDIDD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB6 DLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQMLDEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQMLDEL
610 620 630 640
>>NP_000327 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) amilorid (640 aa)
initn: 1422 init1: 546 opt: 1306 Z-score: 1341.3 bits: 258.4 E(85289): 5.7e-68
Smith-Waterman score: 1472; 36.7% identity (69.2% similar) in 627 aa overlap (19-633:17-626)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLWIGFT
:: . : :::. ::: :::::: .::. .: .. .:. .:
NP_000 MHVKKYLLKGLHRLQKGP-GYTYKELLVWYCDNTNTHGPKRIIC-EGPKKKAMWFLLT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 LTAVALILWQCALLVFSFYT--VSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLLADLE
: .::. :: .... .. . ::::..: :. .::::::::: .:.::: ..::: ::.
NP_000 LLFAALVCWQWGIFIRTYLSWEVSVSLSVGFKTMDFPAVTICNASPFKYSKIKHLLKDLD
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120 130 140 150 160 170
pF1KB6 QETREALKSLYGFPESRKRREAESWN-SVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKAR--DFF
. . .:. . . :: . ... : :. ..: ::...:. . . :.:
NP_000 ELMEAVLERILA-PELSHANATRNLNFSI-------WNHT-PLVLIDERNPHHPMVLDLF
120 130 140 150 160
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pF1KB6 TGRKRKVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYKLHYM
. . .: .::. . ....::: . ..:. .:.:. .:. ::: :.
NP_000 GDNHNGLTSS---SASEKICNAHGCKMAMRLCSLNRTQCTFRNFTSATQALTEWYILQAT
170 180 190 200 210 220
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pF1KB6 NIMAQVPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNRENETIL
::.:::: .. ..::: .:.....:.: . :. :::: . .: .:::: :: .: :
NP_000 NIFAQVPQQELVEMSYPGEQMILACLFGAEPCNYRNFTSIFYPHYGNCYIFNWGMTEKAL
230 240 250 260 270 280
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pF1KB6 STSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAMVTSI
.. :.:.::..:: :..:.: :::.:..:.....:.: :::..: : .. :::
NP_000 PSANPGTEFGLKLILDIGQEDYVPFLASTAGVRLMLHEQRSYPFIRDEGIYAMSGTETSI
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 GMHLTESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIY---NAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCGCAQY
:. . . ...:::: :: .::.::..:.: :..::.: ::.:::: .:...:.:..:
NP_000 GVLVDKLQRMGEPYSPCTVNGSEVPVQNFYSDYNTTYSIQACLRSCFQDHMIRNCNCGHY
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pF1KB6 SQPLPPAANYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSLAQWP
::: . .::: .. :.: .:: .:. . .:.: : ..:::.:. .. .: :.:.::
NP_000 LYPLPRGEKYCNNRDFPDWAHCYSDLQMSVAQRET-CIGMCKESCNDTQYKMTISMADWP
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pF1KB6 SVVSEKWLLPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLLSNFG
: .:: :.. ::. .. ...: :.. ..:: :.....: :.: :: ::.: ::::.:
NP_000 SEASEDWIFHVLSQERDQSTNITLSRKGIVKLNIYFQEFNYRTIEESAANNIVWLLSNLG
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pF1KB6 GQLGLWMSCSVVCVIE----IIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEAPRSP
::.:.::. ::.:.:: ::. .: .....: . . .. : .:: : . .
NP_000 GQFGFWMGGSVLCLIEFGEIIIDFVWITIIKLVALAKSLRQRRAQASYAGPP-PTVAELV
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pF1KB6 QGQDNPALDIDDDLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQMLDE
... : ... : : .. : . .::::::.:..:::.
NP_000 EAHTNFGFQ-PDTAPRSPNTGPYPSEQALPIPGTPPPNYDSLRLQPLDVIESDSEGDAI
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 L
>>XP_011544216 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) PREDI (646 aa)
initn: 1422 init1: 546 opt: 1306 Z-score: 1341.3 bits: 258.4 E(85289): 5.7e-68
Smith-Waterman score: 1472; 36.7% identity (69.2% similar) in 627 aa overlap (19-633:23-632)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAPGEKIKAKIKKNLPVTGPQAPTIKELMRWYCLNTNTHGCRRIVVSRGRLRRLLW
:: . : :::. ::: :::::: .::. .: .. .:
XP_011 MTVGATMHVKKYLLKGLHRLQKGP-GYTYKELLVWYCDNTNTHGPKRIIC-EGPKKKAMW
10 20 30 40 50
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pF1KB6 IGFTLTAVALILWQCALLVFSFYT--VSVSIKVHFRKLDFPAVTICNINPYKYSTVRHLL
. .:: .::. :: .... .. . ::::..: :. .::::::::: .:.::: ..:::
XP_011 FLLTLLFAALVCWQWGIFIRTYLSWEVSVSLSVGFKTMDFPAVTICNASPFKYSKIKHLL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 ADLEQETREALKSLYGFPESRKRREAESWN-SVSEGKQPRFSHRIPLLIFDQDEKGKAR-
::.. . .:. . . :: . ... : :. ..: ::...:. . .
XP_011 KDLDELMEAVLERILA-PELSHANATRNLNFSI-------WNHT-PLVLIDERNPHHPMV
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 -DFFTGRKRKVGGSIIHKASNVMHIESKQVVGFQLCSNDTSDCATYTFSSGINAIQEWYK
:.: . . .: .::. . ....::: . ..:. .:.:. .:. :::
XP_011 LDLFGDNHNGLTSS---SASEKICNAHGCKMAMRLCSLNRTQCTFRNFTSATQALTEWYI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 LHYMNIMAQVPLEKKINMSYSAEELLVTCFFDGVSCDARNFTLFHHPMHGNCYTFNNREN
:. ::.:::: .. ..::: .:.....:.: . :. :::: . .: .:::: :: .
XP_011 LQATNIFAQVPQQELVEMSYPGEQMILACLFGAEPCNYRNFTSIFYPHYGNCYIFNWGMT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 ETILSTSMGGSEYGLQVILYINEEEYNPFLVSSTGAKVIIHRQDEYPFVEDVGTEIETAM
: : .. :.:.::..:: :..:.: :::.:..:.....:.: :::..: : ..
XP_011 EKALPSANPGTEFGLKLILDIGQEDYVPFLASTAGVRLMLHEQRSYPFIRDEGIYAMSGT
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 VTSIGMHLTESFKLSEPYSQCTEDGSDVPIRNIY---NAAYSLQICLHSCFQTKMVEKCG
::::. . . ...:::: :: .::.::..:.: :..::.: ::.:::: .:...:.
XP_011 ETSIGVLVDKLQRMGEPYSPCTVNGSEVPVQNFYSDYNTTYSIQACLRSCFQDHMIRNCN
350 360 370 380 390 400
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pF1KB6 CAQYSQPLPPAANYCNYQQHPNWMYCYYQLHRAFVQEELGCQSVCKEACSFKEWTLTTSL
:..: ::: . .::: .. :.: .:: .:. . .:.: : ..:::.:. .. .: :.
XP_011 CGHYLYPLPRGEKYCNNRDFPDWAHCYSDLQMSVAQRET-CIGMCKESCNDTQYKMTISM
410 420 430 440 450 460
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pF1KB6 AQWPSVVSEKWLLPVLTWDQGRQVNKKLNKTDLAKLLIFYKDLNQRSIMESPANSIEMLL
:.::: .:: :.. ::. .. ...: :.. ..:: :.....: :.: :: ::.: ::
XP_011 ADWPSEASEDWIFHVLSQERDQSTNITLSRKGIVKLNIYFQEFNYRTIEESAANNIVWLL
470 480 490 500 510 520
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pF1KB6 SNFGGQLGLWMSCSVVCVIE----IIEVFFIDFFSIIARRQWQKAKEWWAWKQAPPCPEA
::.:::.:.::. ::.:.:: ::. .: .....: . . .. : .:: : .
XP_011 SNLGGQFGFWMGGSVLCLIEFGEIIIDFVWITIIKLVALAKSLRQRRAQASYAGPP-PTV
530 540 550 560 570 580
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pF1KB6 PRSPQGQDNPALDIDDDLPTFNSALHLPPALGTQVPGTPPPKYNTLRLERAFSNQLTDTQ
. ... : ... : : .. : . .::::::.:..:::.
XP_011 AELVEAHTNFGFQ-PDTAPRSPNTGPYPSEQALPIPGTPPPNYDSLRLQPLDVIESDSEG
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 MLDEL
XP_011 DAI
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XP_011 LDT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]