Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5635
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5635, 474 aa
1>>>pF1KB5635 474 - 474 aa - 474 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6749+/-0.00115; mu= 10.9319+/- 0.068
mean_var=113.5356+/-23.736, 0's: 0 Z-trim(104.1): 118 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.120367
statistics sampled from 7615 (7739) to 7615 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9120.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12 ( 474) 3208 568.7 4.6e-162
CCDS61236.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12 ( 527) 3208 568.8 5e-162
CCDS8164.1 CORO1B gene_id:57175|Hs108|chr11 ( 489) 2474 441.3 1.1e-123
CCDS11252.2 CORO6 gene_id:84940|Hs108|chr17 ( 472) 2329 416.1 4.1e-116
CCDS10673.1 CORO1A gene_id:11151|Hs108|chr16 ( 461) 2155 385.9 5e-107
CCDS53952.1 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15 ( 475) 1429 259.8 4.6e-69
CCDS10229.2 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15 ( 480) 1429 259.8 4.6e-69
CCDS6735.1 CORO2A gene_id:7464|Hs108|chr9 ( 525) 1385 252.2 9.9e-67
CCDS10513.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16 ( 925) 719 136.7 1e-31
CCDS58418.1 PAM16 gene_id:100529144|Hs108|chr16 (1048) 719 136.7 1.1e-31
CCDS58417.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16 ( 907) 619 119.3 1.7e-26
CCDS55982.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16 ( 840) 506 99.7 1.3e-20
>>CCDS9120.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12 (474 aa)
initn: 3208 init1: 3208 opt: 3208 Z-score: 3023.1 bits: 568.7 E(32554): 4.6e-162
Smith-Waterman score: 3208; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:1-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 EPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 YVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 YVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB5 DLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 DLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
430 440 450 460 470
>>CCDS61236.1 CORO1C gene_id:23603|Hs108|chr12 (527 aa)
initn: 3208 init1: 3208 opt: 3208 Z-score: 3022.4 bits: 568.8 E(32554): 5e-162
Smith-Waterman score: 3208; 100.0% identity (100.0% similar) in 474 aa overlap (1-474:54-527)
10 20 30
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IACQGSLTSARLHAPSIGERPLSHMRWKDTMRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 RVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCP
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 HNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 HNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAG
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 CDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVA
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 EKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLL
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 PFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKC
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 EIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISL
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 KHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKS
450 460 470 480 490 500
460 470
pF1KB5 IKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
510 520
>>CCDS8164.1 CORO1B gene_id:57175|Hs108|chr11 (489 aa)
initn: 2445 init1: 2445 opt: 2474 Z-score: 2334.0 bits: 441.3 E(32554): 1.1e-123
Smith-Waterman score: 2538; 73.2% identity (91.5% similar) in 481 aa overlap (2-472:4-484)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAF
:.::::::::::::: :::::::.:::::::::::.::::::.:.:.:.::::::::
CCDS81 MSFRKVVRQSKFRHVFGQPVKNDQCYEDIRVSRVTWDSTFCAVNPKFLAVIVEASGGGAF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLS
::::: :::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS81 LVLPLSKTGRIDKAYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDEVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTSP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIY
::::::.::::.:::::.:::::::::::::::::...::::::.: : ::..: :.::
CCDS81 LTEPVVVLEGHTKRVGIIAWHPTARNVLLSAGCDNVVLIWNVGTAEELYRLDSLHPDLIY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFS
:::::.::::.:.: :::.::.::::. .:::.::::::::::::::::::.:::::::
CCDS81 NVSWNHNGSLFCSACKDKSVRIIDPRRGTLVAEREKAHEGARPMRAIFLADGKVFTTGFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDE
::::::::::.:.:..::.::.:.:.:::.::::::::::..:.::::::::::::::.:
CCDS81 RMSERQLALWDPENLEEPMALQELDSSNGALLPFYDPDTSVVYVCGKGDSSIRYFEITEE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQ
::.:.::::.::::::::: ::::::.:.:::::::.::::::::::.:::::::::::
CCDS81 PPYIHFLNTFTSKEPQRGMGSMPKRGLEVSKCEIARFYKLHERKCEPIVMTVPRKSDLFQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNIL-DSKPTAN
::::::::::::::::::: :..::::::::...:.:.:.::::. ..:.: ::.:.
CCDS81 DDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGRDADPILISLREAYVPSKQRDLKISRRNVLSDSRPAMA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KB5 KKCDLISIPKKTTDTASVQ--------NEA-KLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQ
. .. : .:: .:.. .:: ::.:...:..... . .: .:: .::.:
CCDS81 PGSSHLGAPASTTTAADATPSGSLARAGEAGKLEEVMQELRALRALVKEQGDRICRLEEQ
430 440 450 460 470 480
470
pF1KB5 MAKIAA
....
CCDS81 LGRMENGDA
>>CCDS11252.2 CORO6 gene_id:84940|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 2418 init1: 2269 opt: 2329 Z-score: 2198.1 bits: 416.1 E(32554): 4.1e-116
Smith-Waterman score: 2329; 68.4% identity (89.2% similar) in 471 aa overlap (2-472:3-467)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFL
::::::::::::::::.: :: :.:::::.::::::::::::.:.:::.::.:::::.
CCDS11 MSRRVVRQSKFRHVFGQAAKADQAYEDIRVSKVTWDSSFCAVNPKFLAIIVEAGGGGAFI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 VLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSL
:::: ::::.::.:: : :::.::::::::::::.::::.:.: :.::::::. ..
CCDS11 VLPLAKTGRVDKNYPLVTGHTAPVLDIDWCPHNDNVIASASDDTTIMVWQIPDYTPMRNI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYN
:::.. ::::::::::..::::::::::::: ::.::::::::::.:..::::: :.:..
CCDS11 TEPIITLEGHSKRVGILSWHPTARNVLLSAGGDNVIIIWNVGTGEVLLSLDDMHPDVIHS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFSR
: :: ::::. :. ::: .:.::::: ..:::. :::: :::::.: .:..:::::.:
CCDS11 VCWNSNGSLLATTCKDKTLRIIDPRKGQVVAERFAAHEGMRPMRAVFTRQGHIFTTGFTR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 MSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDES
::.:.:.::.:.:..::.::.::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::
CCDS11 MSQRELGLWDPNNFEEPVALQEMDTSNGVLLPFYDPDSSIVYLCGKGDSSIRYFEITDEP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 PYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQD
:.:::::::::::::::::.::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS11 PFVHYLNTFSSKEPQRGMGFMPKRGLDVSKCEIARFYKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQD
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKK
:::::: ::: ::::.::. :..:.:.::::. ::.: :.:.:.:.:.:::: .: .. .
CCDS11 DLYPDTPGPEPALEADEWLSGQDAEPVLISLRDGYVPPKHRELRVTKRNILDVRPPSGPR
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 CDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
..... : .... :. .:.:::.... . :..::. ::... ..
CCDS11 ------RSQSASDAPLSQQHTLETLLEEIKALRERVQAQEQRITALENMLCELVDGTD
430 440 450 460 470
>>CCDS10673.1 CORO1A gene_id:11151|Hs108|chr16 (461 aa)
initn: 2122 init1: 1198 opt: 2155 Z-score: 2035.0 bits: 385.9 E(32554): 5e-107
Smith-Waterman score: 2170; 65.3% identity (88.0% similar) in 467 aa overlap (2-467:3-456)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFL
:.:::.::::::::: .: ::::.:.:::..::::.::::::.:::.: :::::::::
CCDS10 MSRQVVRSSKFRHVFGQPAKADQCYEDVRVSQTTWDSGFCAVNPKFVALICEASGGGAFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 VLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSL
:::: ::::.::. :::::::.::::: ::::::.::::::::::::::.::..:: : :
CCDS10 VLPLGKTGRVDKNAPTVCGHTAPVLDIAWCPHNDNVIASGSEDCTVMVWEIPDGGLMLPL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLD-DMHSDMIY
:::: ::::.::::::::: ::.::::::::::.:..:.:::: :...: ..: : ::
CCDS10 REPVVTLEGHTKRVGIVAWHTTAQNVLLSAGCDNVIMVWDVGTGAAMLTLGPEVHPDTIY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADGNVFTTGFS
.:.:.:.:.::::. .::.::.:.::: .::::.. :::.::.::.:...:...:::::
CCDS10 SVDWSRDGGLICTSCRDKRVRIIEPRKGTVVAEKDRPHEGTRPVRAVFVSEGKILTTGFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDE
::::::.:::. :...::..:.:.:::.::::::.::::.:.::::::::::::::::.:
CCDS10 RMSERQVALWDTKHLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGKGDSSIRYFEITSE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQ
.:..:::. ::::: ::::::::::::.:::::::::.:::::.:::: :::::::::::
CCDS10 APFLHYLSMFSSKESQRGMGYMPKRGLEVNKCEIARFYKLHERRCEPIAMTVPRKSDLFQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANK
.:::: ::::. :: ::::. :..: :.::::: ::.: :.:.:.: . :: :. .
CCDS10 EDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGRDAGPLLISLKDGYVPPKSRELRVNRG--LD---TGRR
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KCDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
. . :. .. : : . ..:.: :..... :. . ..:...::.
CCDS10 R----AAPE-ASGTPSSDAVSRLEE---EMRKLQATVQELQKRLDRLEETVQAK
420 430 440 450 460
>>CCDS53952.1 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15 (475 aa)
initn: 690 init1: 690 opt: 1429 Z-score: 1353.4 bits: 259.8 E(32554): 4.6e-69
Smith-Waterman score: 1429; 45.6% identity (73.3% similar) in 472 aa overlap (6-472:8-468)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAF
:.::::.:.:.... ..:.: : ... . :. ::::: ::.::. :..:::.:
CCDS53 MSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESAGGGSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLS
::.::..::::. .:: :::: : :::: : : :..::: ::: .: .:.:::.:: .
CCDS53 LVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEGGLKRN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIY
.:: .. :.:::.:::.: ::::. :.:.::: : ..:::. .:: ... : :.:.:
CCDS53 MTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEP-VKMIDCHTDVIL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKE-KAHEGARPMRAIFLADGN-VFTTG
.:.: .:::. :. ::::.:::.::. ... : . : : : :..::.. . ..:::
CCDS53 CMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKRLLTTG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEIT
:: . ::.:::. .... :. .:.: .:.:.:::: :: ..:: ::::..:::.::.
CCDS53 VSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIRYYEIS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERK--CEPIIMTVPRKS
:.::. :: : : ::.:.: :::.::::. ::. ::.:: : ::: : :::.:
CCDS53 TEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMIVPRRS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKP
: .:.:.:: : : : :: .::. : : ::.:.:::.:: :. . : : : ..:
CCDS53 DSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGY---KKSSKMVFKAPIKEKKS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TANKKCDLI-SIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIA
.. . ::. ..: .: . . . ::: . .:. . ..: :: .:. .. ..
CCDS53 VVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEI----RRLKEELAQKDIRIRQLQLELKNLR
420 430 440 450 460
pF1KB5 A
CCDS53 NSPKNC
470
>>CCDS10229.2 CORO2B gene_id:10391|Hs108|chr15 (480 aa)
initn: 690 init1: 690 opt: 1429 Z-score: 1353.4 bits: 259.8 E(32554): 4.6e-69
Smith-Waterman score: 1429; 45.6% identity (73.3% similar) in 472 aa overlap (6-472:13-473)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEAS
:.::::.:.:.... ..:.: : ... . :. ::::: ::.::. :..
CCDS10 MTVTKMSWRPQYRSSKFRNVYGKVANREHCFDGIPITKNVHDNHFCAVNTRFLAIVTESA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GGGAFLVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPEN
:::.:::.::..::::. .:: :::: : :::: : : :..::: ::: .: .:.:::.
CCDS10 GGGSFLVIPLEQTGRIEPNYPKVCGHQGNVLDIKWNPFIDNIIASCSEDTSVRIWEIPEG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMH
:: ..:: .. :.:::.:::.: ::::. :.:.::: : ..:::. .:: ... : :
CCDS10 GLKRNMTEALLELHGHSRRVGLVEWHPTTNNILFSAGYDYKVLIWNLDVGEP-VKMIDCH
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKE-KAHEGARPMRAIFLADGN-
.:.: .:.: .:::. :. ::::.:::.::. ... : . : : : :..::.. .
CCDS10 TDVILCMSFNTDGSLLTTTCKDKKLRVIEPRSGRVLQEANCKNH---RVNRVVFLGNMKR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIR
..::: :: . ::.:::. .... :. .:.: .:.:.:::: :: ..:: ::::..::
CCDS10 LLTTGVSRWNTRQIALWDQEDLSMPLIEEEIDGLSGLLFPFYDADTHMLYLAGKGDGNIR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB5 YFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERK--CEPIIMT
:.::. :.::. :: : : ::.:.: :::.::::. ::. ::.:: : ::: :
CCDS10 YYEISTEKPYLSYLMEFRSPAPQKGLGVMPKHGLDVSACEVFRFYKLVTLKGLIEPISMI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 VPRKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNI
:::.:: .:.:.:: : : : :: .::. : : ::.:.:::.:: :. . : : :
CCDS10 VPRRSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLKEGY---KKSSKMVFKAPI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 LDSKPTANKKCDLI-SIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQ
..: .. . ::. ..: .: . . . ::: . .:. . ..: :: .:. .
CCDS10 KEKKSVVVNGIDLLENVPPRTENELLRMFFRQQDEI----RRLKEELAQKDIRIRQLQLE
420 430 440 450 460
470
pF1KB5 MAKIAA
. ..
CCDS10 LKNLRNSPKNC
470 480
>>CCDS6735.1 CORO2A gene_id:7464|Hs108|chr9 (525 aa)
initn: 1337 init1: 646 opt: 1385 Z-score: 1311.5 bits: 252.2 E(32554): 9.9e-67
Smith-Waterman score: 1385; 49.4% identity (77.5% similar) in 395 aa overlap (6-393:8-400)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAF
:.::::::::. .....:::.. ..: . :. ::::::.:.:.. : .:::::
CCDS67 MSWHPQYRSSKFRHVFGKPASKENCYDSVPITRSVHDNHFCAVNPHFIAVVTECAGGGAF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LVLPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLS
::.:::.::..: :: :::: : :::. : : .: ::: ::: :. .:.::.. :: .
CCDS67 LVIPLHQTGKLDPHYPKVCGHRGNVLDVKWNPFDDFEIASCSEDATIKIWSIPKQLLTRN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALIN--LDDM--HS
:: : ::..:::.: ::::: :.:.::: : ..:::. : :..:. .. . :.
CCDS67 LTAYRKELVGHARRVGLVEWHPTAANILFSAGYDYKVMIWNLDTKESVITSPMSTISCHQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLAD-GNVF
:.: ..:.: ::::. :. ::.:.:::::: .. .: ...: : ...::.. ...
CCDS67 DVILSMSFNTNGSLLATTCKDRKIRVIDPRAGTVL--QEASYKGHRASKVLFLGNLKKLM
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 TTGFSRMSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYF
.:: :: ..::.:::. :.. :. ...: :.:::.:::: :::..:. ::::..:::.
CCDS67 STGTSRWNNRQVALWDQDNLSVPLMEEDLDGSSGVLFPFYDADTSMLYVVGKGDGNIRYY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKC--EPIIMTVP
:.. ..:.. ::. . : .::.:.: ::::::::..::: ::.:: : ::: : ::
CCDS67 EVSADKPHLSYLTEYRSYNPQKGIGVMPKRGLDVSSCEIFRFYKLITTKSLIEPISMIVP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RKSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILD
:.:. .:.:.:: ::: . .: :.::. : : ::::.::. :
CCDS67 RRSESYQEDIYPPTAGAQPSLTAQEWLSGMNRDPILVSLRPGSELLRPHPLPAERPIFNS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 SKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAK
CCDS67 MAPASPRLLNQTEKLAAEDGWRSSSLLEEKMPRWAAEHRLEEKKTWLTNGFDVFECPPPK
420 430 440 450 460 470
>>CCDS10513.1 CORO7 gene_id:79585|Hs108|chr16 (925 aa)
initn: 535 init1: 356 opt: 719 Z-score: 682.9 bits: 136.7 E(32554): 1e-31
Smith-Waterman score: 824; 34.7% identity (66.8% similar) in 392 aa overlap (8-391:471-858)
10 20 30
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTW---
:::::. : ... :. ... .:
CCDS10 PSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSLLGPSSKFRHAQGTVLHRDSHITNLKGLNLTTPGE
450 460 470 480 490 500
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 DSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRI-DKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHND
...::: : ::. . .::: :: :.: ::. : . ::. . . : :. : : .
CCDS10 SDGFCA-NKLRVAVPLLSSGG-QVAVLELRKPGRLPDTALPTL-QNGAAVTDLAWDPFDP
510 520 530 540 550
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 QVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDN
. .: ..:: . .:..: .:: :: : ..: ::.... . .:: : ::: :.. :
CCDS10 HRLAVAGEDARIRLWRVPAEGLEEVLTTPETVLTGHTEKICSLRFHPLAANVLASSSYDL
560 570 580 590 600 610
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKE
.. ::.. .: ..:. :.:.:....:. .:. . :. :: .::: ::. ..
CCDS10 TVRIWDLQAGADRLKLQG-HQDQIFSLAWSPDGQQLATVCKDGRVRVYRPRSGPEPLQEG
620 630 640 650 660 670
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 KAHEGARPMRAIFLADGN-VFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQE-PIALHEMDTSNGVLLP
. .:.: : ... :: ....::. .::::: :.. . . :.:. .:.. ..:::
CCDS10 PGPKGGRGARIVWVCDGRCLLVSGFDSQSERQLLLYEAEALAGGPLAVLGLDVAPSTLLP
680 690 700 710 720 730
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 FYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCE
:::::... : ::::. . .:. :::. :.:.: .:..:. .:: :: . :
CCDS10 SYDPDTGLVLLTGKGDTRVFLYELLPESPFFLECNSFTSPDPHKGLVLLPKTECDVREVE
740 750 760 770 780 790
340 350 360 370 380
pF1KB5 IARFFKLHERKCEPIIMTVPR-KSDLFQDDLYPDTAGP-EAALEAEEWFEGKNADPILIS
. : ..:.. . ::. . .:: ....::::..:::: : .: :: :..: :..: :.:
CCDS10 LMRCLRLRQSSLEPVAFRLPRVRKEFFQDDVFPDTAVIWEPVLSAEAWLQGANGQPWLLS
800 810 820 830 840 850
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 LKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIK
:.
CCDS10 LQPPDMSPVSQAPREAPARRAPSSAQYLEEKSDQQKKEELLNAMVAKLGNREDPLPQDSF
860 870 880 890 900 910
>--
initn: 535 init1: 356 opt: 719 Z-score: 682.9 bits: 136.7 E(32554): 1e-31
Smith-Waterman score: 719; 30.4% identity (64.0% similar) in 392 aa overlap (6-396:5-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLV
: :::::. .. . .. .:::.. : : .. : .... :.. .
CCDS10 MNRFRVSKFRHTEARPPRRESWISDIRAG--TAPSCRNHIKSSCSLIAFNSDRPGVLGI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLT
.::. :. . . :. : :.:. : .: ..:.:: : :: .:..: : .: .
CCDS10 VPLQGQGEDKRRVAHLGCHSDLVTDLDFSPFDDFLLATGSADRTVKLWRLPGPGQALP-S
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNV
: :.: .. : .. .:::. ..:.::. ... .:... . : .: :.:.. ..
CCDS10 APGVVLGPEDLPVEVLQFHPTSDGILVSAA-GTTVKVWDAAKQQPLTELA-AHGDLVQSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB5 SWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADG-NVFTTGFSR
:.:.:.:. :: :::..:..::: . .... .:::..: : ... .. .:::..
CCDS10 VWSRDGALVGTACKDKQLRIFDPRTKPRASQSTQAHENSRDSRLAWMGTWEHLVSTGFNQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 MSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDES
: ::.. ::. . .. .: .::: : :.:. :::.... : :::. .. .:.. ..
CCDS10 MREREVKLWDTRFFSSALASLTLDTSLGCLVPLLDPDSGLLVLAGKGERQLYCYEVVPQQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 PYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQD
: . .. . :: . .:...: : .::. : ..: . :: . ::::. :..
CCDS10 PALSPVTQCVLESVLRGAALVPRQALAVMSCEVLRVLQLSDTAIVPIGYHVPRKAVEFHE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKK
::.::::: : . . :. : : . .::. . :
CCDS10 DLFPDTAGCVPATDPHSWWAGDNQQVQKVSLNPACRPHPSFTSCLVPPAEPLPDTAQPAV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 CDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
CCDS10 METPVGDADASEGFSSPPSSLTSPSTPSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSLLGPSSKFR
420 430 440 450 460 470
>>CCDS58418.1 PAM16 gene_id:100529144|Hs108|chr16 (1048 aa)
initn: 535 init1: 356 opt: 719 Z-score: 682.2 bits: 136.7 E(32554): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 824; 34.7% identity (66.8% similar) in 392 aa overlap (8-391:471-858)
10 20 30
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTW---
:::::. : ... :. ... .:
CCDS58 PSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSLLGPSSKFRHAQGTVLHRDSHITNLKGLNLTTPGE
450 460 470 480 490 500
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 DSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLVLPLHKTGRI-DKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHND
...::: : ::. . .::: :: :.: ::. : . ::. . . : :. : : .
CCDS58 SDGFCA-NKLRVAVPLLSSGG-QVAVLELRKPGRLPDTALPTL-QNGAAVTDLAWDPFDP
510 520 530 540 550
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 QVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLTEPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDN
. .: ..:: . .:..: .:: :: : ..: ::.... . .:: : ::: :.. :
CCDS58 HRLAVAGEDARIRLWRVPAEGLEEVLTTPETVLTGHTEKICSLRFHPLAANVLASSSYDL
560 570 580 590 600 610
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 AIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNVSWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKE
.. ::.. .: ..:. :.:.:....:. .:. . :. :: .::: ::. ..
CCDS58 TVRIWDLQAGADRLKLQG-HQDQIFSLAWSPDGQQLATVCKDGRVRVYRPRSGPEPLQEG
620 630 640 650 660 670
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 KAHEGARPMRAIFLADGN-VFTTGFSRMSERQLALWNPKNMQE-PIALHEMDTSNGVLLP
. .:.: : ... :: ....::. .::::: :.. . . :.:. .:.. ..:::
CCDS58 PGPKGGRGARIVWVCDGRCLLVSGFDSQSERQLLLYEAEALAGGPLAVLGLDVAPSTLLP
680 690 700 710 720 730
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 FYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDESPYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCE
:::::... : ::::. . .:. :::. :.:.: .:..:. .:: :: . :
CCDS58 SYDPDTGLVLLTGKGDTRVFLYELLPESPFFLECNSFTSPDPHKGLVLLPKTECDVREVE
740 750 760 770 780 790
340 350 360 370 380
pF1KB5 IARFFKLHERKCEPIIMTVPR-KSDLFQDDLYPDTAGP-EAALEAEEWFEGKNADPILIS
. : ..:.. . ::. . .:: ....::::..:::: : .: :: :..: :..: :.:
CCDS58 LMRCLRLRQSSLEPVAFRLPRVRKEFFQDDVFPDTAVIWEPVLSAEAWLQGANGQPWLLS
800 810 820 830 840 850
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 LKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKKCDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIK
:.
CCDS58 LQPPDMSPVSQAPREAPARRAPSSAQYLEEKSDQQKKEELLNAMVAKLGNREDPLPQDSF
860 870 880 890 900 910
>--
initn: 535 init1: 356 opt: 719 Z-score: 682.2 bits: 136.7 E(32554): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 719; 30.4% identity (64.0% similar) in 392 aa overlap (6-396:5-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRRVVRQSKFRHVFGQAVKNDQCYDDIRVSRVTWDSSFCAVNPRFVAIIIEASGGGAFLV
: :::::. .. . .. .:::.. : : .. : .... :.. .
CCDS58 MNRFRVSKFRHTEARPPRRESWISDIRAG--TAPSCRNHIKSSCSLIAFNSDRPGVLGI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LPLHKTGRIDKSYPTVCGHTGPVLDIDWCPHNDQVIASGSEDCTVMVWQIPENGLTLSLT
.::. :. . . :. : :.:. : .: ..:.:: : :: .:..: : .: .
CCDS58 VPLQGQGEDKRRVAHLGCHSDLVTDLDFSPFDDFLLATGSADRTVKLWRLPGPGQALP-S
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EPVVILEGHSKRVGIVAWHPTARNVLLSAGCDNAIIIWNVGTGEALINLDDMHSDMIYNV
: :.: .. : .. .:::. ..:.::. ... .:... . : .: :.:.. ..
CCDS58 APGVVLGPEDLPVEVLQFHPTSDGILVSAA-GTTVKVWDAAKQQPLTELA-AHGDLVQSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB5 SWNRNGSLICTASKDKKVRVIDPRKQEIVAEKEKAHEGARPMRAIFLADG-NVFTTGFSR
:.:.:.:. :: :::..:..::: . .... .:::..: : ... .. .:::..
CCDS58 VWSRDGALVGTACKDKQLRIFDPRTKPRASQSTQAHENSRDSRLAWMGTWEHLVSTGFNQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 MSERQLALWNPKNMQEPIALHEMDTSNGVLLPFYDPDTSIIYLCGKGDSSIRYFEITDES
: ::.. ::. . .. .: .::: : :.:. :::.... : :::. .. .:.. ..
CCDS58 MREREVKLWDTRFFSSALASLTLDTSLGCLVPLLDPDSGLLVLAGKGERQLYCYEVVPQQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 PYVHYLNTFSSKEPQRGMGYMPKRGLDVNKCEIARFFKLHERKCEPIIMTVPRKSDLFQD
: . .. . :: . .:...: : .::. : ..: . :: . ::::. :..
CCDS58 PALSPVTQCVLESVLRGAALVPRQALAVMSCEVLRVLQLSDTAIVPIGYHVPRKAVEFHE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DLYPDTAGPEAALEAEEWFEGKNADPILISLKHGYIPGKNRDLKVVKKNILDSKPTANKK
::.::::: : . . :. : : . .::. . :
CCDS58 DLFPDTAGCVPATDPHSWWAGDNQQVQKVSLNPACRPHPSFTSCLVPPAEPLPDTAQPAV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 CDLISIPKKTTDTASVQNEAKLDEILKEIKSIKDTICNQDERISKLEQQMAKIAA
CCDS58 METPVGDADASEGFSSPPSSLTSPSTPSSLGPSLSSTSGIGTSPSLRSLQSLLGPSSKFR
420 430 440 450 460 470
474 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 13:09:04 2016 done: Sat Nov 5 13:09:05 2016
Total Scan time: 2.900 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]