Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3587
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3587, 488 aa
1>>>pF1KB3587 488 - 488 aa - 488 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8869+/-0.000775; mu= 11.9877+/- 0.047
mean_var=128.9630+/-25.532, 0's: 0 Z-trim(112.6): 36 B-trim: 6 in 1/53
Lambda= 0.112938
statistics sampled from 13336 (13372) to 13336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.411), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5252.1 ZDHHC14 gene_id:79683|Hs108|chr6 ( 488) 3361 558.7 5e-159
CCDS47510.1 ZDHHC14 gene_id:79683|Hs108|chr6 ( 473) 2485 416.0 4.6e-116
CCDS30650.1 ZDHHC18 gene_id:84243|Hs108|chr1 ( 388) 1603 272.2 7.1e-73
CCDS35395.1 ZDHHC9 gene_id:51114|Hs108|chrX ( 364) 1478 251.8 9.2e-67
CCDS13776.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 ( 765) 514 95.0 3.1e-19
CCDS54502.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 ( 778) 514 95.0 3.2e-19
CCDS7965.1 ZDHHC5 gene_id:25921|Hs108|chr11 ( 715) 494 91.7 2.8e-18
CCDS45017.1 ZDHHC20 gene_id:253832|Hs108|chr13 ( 354) 346 67.4 3e-11
CCDS81758.1 ZDHHC20 gene_id:253832|Hs108|chr13 ( 365) 346 67.4 3.1e-11
CCDS73551.1 ZDHHC20 gene_id:253832|Hs108|chr13 ( 292) 340 66.3 5.1e-11
CCDS47810.1 ZDHHC2 gene_id:51201|Hs108|chr8 ( 367) 341 66.5 5.4e-11
>>CCDS5252.1 ZDHHC14 gene_id:79683|Hs108|chr6 (488 aa)
initn: 3361 init1: 3361 opt: 3361 Z-score: 2968.5 bits: 558.7 E(32554): 5e-159
Smith-Waterman score: 3361; 100.0% identity (100.0% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MPPGGGGPMKDCEYSQISTHSSSPMESPHKKKKIAARRKWEVFPGRNKFFCNGRIMMARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MPPGGGGPMKDCEYSQISTHSSSPMESPHKKKKIAARRKWEVFPGRNKFFCNGRIMMARQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITPAIPAVAGILFFFVMGTLLRTSFSDPGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITPAIPAVAGILFFFVMGTLLRTSFSDPGVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRTKEVIINGQTVKLKYCFTCKIFRPPRASH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRTKEVIINGQTVKLKYCFTCKIFRPPRASH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 CSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYMFILSLSFLTVFIFAFVITHVILRSQQTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 CSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYMFILSLSFLTVFIFAFVITHVILRSQQTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 FLNALKDSPASVLEAVVCFFSVWSIVGLSGFHTYLISSNQTTNEDIKGSWSNKRGKENYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 FLNALKDSPASVLEAVVCFFSVWSIVGLSGFHTYLISSNQTTNEDIKGSWSNKRGKENYN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PYSYGNIFTNCCVALCGPISPSLIDRRGYIQPDTPQPAAPSNGITMYGATQSQSDMCDQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PYSYGNIFTNCCVALCGPISPSLIDRRGYIQPDTPQPAAPSNGITMYGATQSQSDMCDQD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 QCIQSTKFVLQAAATPLLQSEPSLTSDELHLPGKPGLGTPCASLTLGPPTPPASMPNLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 QCIQSTKFVLQAAATPLLQSEPSLTSDELHLPGKPGLGTPCASLTLGPPTPPASMPNLAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ATLADVMPRKDEHMGHQFLTPDEAPSPPRLLAAGSPLAHSRTMHVLGLASQDSLHEDSVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 ATLADVMPRKDEHMGHQFLTPDEAPSPPRLLAAGSPLAHSRTMHVLGLASQDSLHEDSVR
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GLVKLSSV
::::::::
CCDS52 GLVKLSSV
>>CCDS47510.1 ZDHHC14 gene_id:79683|Hs108|chr6 (473 aa)
initn: 2477 init1: 2477 opt: 2485 Z-score: 2197.3 bits: 416.0 E(32554): 4.6e-116
Smith-Waterman score: 3212; 96.9% identity (96.9% similar) in 488 aa overlap (1-488:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MPPGGGGPMKDCEYSQISTHSSSPMESPHKKKKIAARRKWEVFPGRNKFFCNGRIMMARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MPPGGGGPMKDCEYSQISTHSSSPMESPHKKKKIAARRKWEVFPGRNKFFCNGRIMMARQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITPAIPAVAGILFFFVMGTLLRTSFSDPGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITPAIPAVAGILFFFVMGTLLRTSFSDPGVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRTKEVIINGQTVKLKYCFTCKIFRPPRASH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRTKEVIINGQTVKLKYCFTCKIFRPPRASH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 CSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYMFILSLSFLTVFIFAFVITHVILRSQQTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYMFILSLSFLTVFIFAFVITHVILRSQQTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 FLNALKDSPASVLEAVVCFFSVWSIVGLSGFHTYLISSNQTTNEDIKGSWSNKRGKENYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FLNALKDSPASVLEAVVCFFSVWSIVGLSGFHTYLISSNQTTNEDIKGSWSNKRGKENYN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PYSYGNIFTNCCVALCGPISPSLIDRRGYIQPDTPQPAAPSNGITMYGATQSQSDMCDQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PYSYGNIFTNCCVALCGPISPSLIDRRGYIQPDTPQPAAPSNGITMYGATQSQSDM----
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 QCIQSTKFVLQAAATPLLQSEPSLTSDELHLPGKPGLGTPCASLTLGPPTPPASMPNLAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 -----------AAATPLLQSEPSLTSDELHLPGKPGLGTPCASLTLGPPTPPASMPNLAE
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ATLADVMPRKDEHMGHQFLTPDEAPSPPRLLAAGSPLAHSRTMHVLGLASQDSLHEDSVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ATLADVMPRKDEHMGHQFLTPDEAPSPPRLLAAGSPLAHSRTMHVLGLASQDSLHEDSVR
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 GLVKLSSV
::::::::
CCDS47 GLVKLSSV
470
>>CCDS30650.1 ZDHHC18 gene_id:84243|Hs108|chr1 (388 aa)
initn: 1497 init1: 919 opt: 1603 Z-score: 1421.8 bits: 272.2 E(32554): 7.1e-73
Smith-Waterman score: 1603; 67.7% identity (84.9% similar) in 337 aa overlap (3-338:35-366)
10 20 30
pF1KB3 MPPGGGGPMKDCEYSQISTHSSSPMESPHKKK
:: . : :. :.: : .
CCDS30 EYQQISPGAAPLPASPGARRPGPAASPTPGPGPAPPAAPAPPRWSSSGSGSGSGSGSLGR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 KIAARRKWEVFPGRNKFFCNGRIMMARQTGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITP
. :::::::::::.:.:.::.:.: . ::: :::.:::.:.::::.::::::: :.:
CCDS30 R--PRRKWEVFPGRNRFYCGGRLMLAGHGGVFALTLLLILTTTGLFFVFDCPYLARKLTL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 AIPAVAGILFFFVMGTLLRTSFSDPGVLPRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRT
::: .:.:::::::. ::.:::.:::.::::: ::: ::.::: .:.:. :::::::
CCDS30 AIPIIAAILFFFVMSCLLQTSFTDPGILPRATVCEAAALEKQID---NTGSSTYRPPPRT
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 KEVIINGQTVKLKYCFTCKIFRPPRASHCSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYM
.::.:::: ::::::::::.:::::.::::.::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS30 REVLINGQMVKLKYCFTCKMFRPPRTSHCSVCDNCVERFDHHCPWVGNCVGRRNYRFFYA
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 FILSLSFLTVFIFAFVITHVILRSQQTGFLNALKDSPASVLEAVVCFFSVWSIVGLSGFH
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CCDS30 FILSLSFLTAFIFACVVTHLTLRAQGSNFLSTLKETPASVLELVICFFSIWSILGLSGFH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 TYLISSNQTTNEDIKGSWSNKRGKE-NYNPYSYGNIFTNCCVALCGPISPSLIDRRGYIQ
:::..:: :::::::::::.::: : . ::::. .:.::::..::::. ::::::::..:
CCDS30 TYLVASNLTTNEDIKGSWSSKRGGEASVNPYSHKSIITNCCAVLCGPLPPSLIDRRGFVQ
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 PDTPQPAAPSNGITMYGATQSQSDMCDQDQCIQSTKFVLQAAATPLLQSEPSLTSDELHL
:: :.
CCDS30 SDTVLPSPIRSDEPACRAKPDASMVGGHP
360 370 380
>>CCDS35395.1 ZDHHC9 gene_id:51114|Hs108|chrX (364 aa)
initn: 1541 init1: 1321 opt: 1478 Z-score: 1312.1 bits: 251.8 E(32554): 9.2e-67
Smith-Waterman score: 1478; 64.6% identity (84.9% similar) in 311 aa overlap (31-341:7-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MPPGGGGPMKDCEYSQISTHSSSPMESPHKKKKIAARRKWEVFPGRNKFFCNGRIMMARQ
.::.. :::: .:::: : :.::.:::::
CCDS35 MSVMVVRKKVT--RKWEKLPGRNTFCCDGRVMMARQ
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITPAIPAVAGILFFFVMGTLLRTSFSDPGVL
:.::::: ::: : :::::.: ::::...::::. :..::.: :.::::::::::::.
CCDS35 KGIFYLTLFLILGTCTLFFAFECRYLAVQLSPAIPVFAAMLFLFSMATLLRTSFSDPGVI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRTKEVIINGQTVKLKYCFTCKIFRPPRASH
::: ::::: .: .:. .::. : ::::: :. ::.: ::::::.::::::::::::
CCDS35 PRALPDEAAFIEMEIEATNGAVPQGQRPPPRIKNFQINNQIVKLKYCYTCKIFRPPRASH
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 CSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYMFILSLSFLTVFIFAFVITHVILRSQQTG
::.:::::::::::::::::::::::::.::.::::::.::...::: :..: :.: . :
CCDS35 CSICDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRYFYLFILSLSLLTIYVFAFNIVYVALKSLKIG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 FLNALKDSPASVLEAVVCFFSVWSIVGLSGFHTYLISSNQTTNEDIKGSWSNKRGKENYN
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CCDS35 FLETLKETPGTVLEVLICFFTLWSVVGLTGFHTFLVALNQTTNEDIKGSWTGK--NRVQN
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PYSYGNIFTNCCVALCGPISPSLIDRRGYIQPDTPQPAAPSNGITMYGATQSQSDMCDQD
:::.::: ::: .::::. ::..:::: . . ::
CCDS35 PYSHGNIVKNCCEVLCGPLPPSVLDRRGILPLEESGSRPPSTQETSSSLLPQSPAPTEHL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 QCIQSTKFVLQAAATPLLQSEPSLTSDELHLPGKPGLGTPCASLTLGPPTPPASMPNLAE
CCDS35 NSNEMPEDSSTPEEMPPPEPPEPPQEAAEAEK
340 350 360
>>CCDS13776.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 (765 aa)
initn: 747 init1: 352 opt: 514 Z-score: 458.7 bits: 95.0 E(32554): 3.1e-19
Smith-Waterman score: 706; 34.1% identity (61.3% similar) in 367 aa overlap (70-411:23-352)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WEVFPGRNKFFCNGRIMMARQTGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITPAIPAVAG
:.. .: :::.: ::.:. ..::.:. :
CCDS13 MPRSPGTRLKPAKYIPVATAAALLVGSSTLFFVFTCPWLTRAVSPAVPVYNG
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 ILFFFVMGTLLRTSFSDPGVLPRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRTKEVIING
:.:.::.... ..: ::::.::: :: ... : .: : :.: . :
CCDS13 IIFLFVLANFSMATFMDPGVFPRADEDE----DKEDD---------FRAPLY-KNVDVRG
60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 QTVKLKYCFTCKIFRPPRASHCSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYMFILSLSF
:..:.: ::...:::: ::::.:::::: ::::::::.::.:.::::.:..:.::::
CCDS13 IQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLSA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LTVFIFAFVITHVILRSQQTGFLNALKDSPASVLEAVVCFFSVW--SIVGLSGFHTYLIS
: . :: ...:. ... : . ... ::.: ... ..::.:::. :..
CCDS13 HMVGVVAFGLVYVLNHAEGLG------AAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVT
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320
pF1KB3 SNQTTNEDIKGSWSNKRGKENYNPYSYGNIFTNCCV----ALCGPISPSLID--------
..::::.. :.. :: . ::.. : :: .::.:..: .
CCDS13 RGRTTNEQVTGKF---RG--GVNPFTRG-----CCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLA
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370
pF1KB3 ---RRGYIQPDTPQPAAP------SNGITM-YGATQSQSDMCDQDQCIQSTKFVLQAAAT
. ...:. . ::: .::. : ..:.... :. . :
CCDS13 VSLKPPFLRPELLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDE----KPLDLGPPLP
270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 PLLQSEPSLTSDELHLPGKPGLGTPCASLT-LGPPTPPASMPNLAEATLADVMPRKDEHM
: . : . :..:. : .:: . :. .::::
CCDS13 PKI--EAGTFSSDLQTP-RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQ
320 330 340 350 360 370
440 450 460 470 480
pF1KB3 GHQFLTPDEAPSPPRLLAAGSPLAHSRTMHVLGLASQDSLHEDSVRGLVKLSSV
CCDS13 VPGPDSLTLGDDSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSL
380 390 400 410 420 430
>>CCDS54502.1 ZDHHC8 gene_id:29801|Hs108|chr22 (778 aa)
initn: 716 init1: 352 opt: 514 Z-score: 458.6 bits: 95.0 E(32554): 3.2e-19
Smith-Waterman score: 706; 34.1% identity (61.3% similar) in 367 aa overlap (70-411:23-352)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WEVFPGRNKFFCNGRIMMARQTGVFYLTLVLILVTSGLFFAFDCPYLAVKITPAIPAVAG
:.. .: :::.: ::.:. ..::.:. :
CCDS54 MPRSPGTRLKPAKYIPVATAAALLVGSSTLFFVFTCPWLTRAVSPAVPVYNG
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 ILFFFVMGTLLRTSFSDPGVLPRATPDEAADLERQIDIANGTSSGGYRPPPRTKEVIING
:.:.::.... ..: ::::.::: :: ... : .: : :.: . :
CCDS54 IIFLFVLANFSMATFMDPGVFPRADEDE----DKEDD---------FRAPLY-KNVDVRG
60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 QTVKLKYCFTCKIFRPPRASHCSLCDNCVERFDHHCPWVGNCVGKRNYRFFYMFILSLSF
:..:.: ::...:::: ::::.:::::: ::::::::.::.:.::::.:..:.::::
CCDS54 IQVRMKWCATCHFYRPPRCSHCSVCDNCVEDFDHHCPWVNNCIGRRNYRYFFLFLLSLSA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LTVFIFAFVITHVILRSQQTGFLNALKDSPASVLEAVVCFFSVW--SIVGLSGFHTYLIS
: . :: ...:. ... : . ... ::.: ... ..::.:::. :..
CCDS54 HMVGVVAFGLVYVLNHAEGLG------AAHTTITMAVMCVAGLFFIPVIGLTGFHVVLVT
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320
pF1KB3 SNQTTNEDIKGSWSNKRGKENYNPYSYGNIFTNCCV----ALCGPISPSLID--------
..::::.. :.. :: . ::.. : :: .::.:..: .
CCDS54 RGRTTNEQVTGKF---RG--GVNPFTRG-----CCGNVEHVLCSPLAPRYVVEPPRLPLA
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370
pF1KB3 ---RRGYIQPDTPQPAAP------SNGITM-YGATQSQSDMCDQDQCIQSTKFVLQAAAT
. ...:. . ::: .::. : ..:.... :. . :
CCDS54 VSLKPPFLRPELLDRAAPLKVKLSDNGLKAGLGRSKSKGSLDRLDE----KPLDLGPPLP
270 280 290 300 310
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 PLLQSEPSLTSDELHLPGKPGLGTPCASLT-LGPPTPPASMPNLAEATLADVMPRKDEHM
: . : . :..:. : .:: . :. .::::
CCDS54 PKI--EAGTFSSDLQTP-RPGSAESALSVQRTSPPTPAMYKFRPAFPTGPKVPFCGPGEQ
320 330 340 350 360 370
440 450 460 470 480
pF1KB3 GHQFLTPDEAPSPPRLLAAGSPLAHSRTMHVLGLASQDSLHEDSVRGLVKLSSV
CCDS54 VPGPDSLTLGDDSIRSLDFVSEPSLDLPDYGPGGLHAAYPPSPPLSASDAFSGALRSLSL
380 390 400 410 420 430
>>CCDS7965.1 ZDHHC5 gene_id:25921|Hs108|chr11 (715 aa)
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Smith-Waterman score: 688; 32.3% identity (61.4% similar) in 402 aa overlap (69-455:22-391)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]