Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3524
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3524, 460 aa
1>>>pF1KB3524 460 - 460 aa - 460 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2006+/-0.000402; mu= 10.3483+/- 0.025
mean_var=177.0531+/-35.985, 0's: 0 Z-trim(116.5): 36 B-trim: 289 in 2/53
Lambda= 0.096388
statistics sampled from 27708 (27743) to 27708 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16
Scan time: 9.900
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_068798 (OMIM: 300026) nucleosome assembly prote ( 460) 3078 440.6 4.2e-123
NP_001294853 (OMIM: 164060) nucleosome assembly pr ( 383) 815 125.8 2e-28
XP_011536695 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome ( 391) 795 123.0 1.4e-27
NP_001317160 (OMIM: 164060) nucleosome assembly pr ( 391) 795 123.0 1.4e-27
NP_004528 (OMIM: 164060) nucleosome assembly prote ( 391) 795 123.0 1.4e-27
XP_016874827 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome ( 391) 795 123.0 1.4e-27
NP_631946 (OMIM: 164060) nucleosome assembly prote ( 391) 795 123.0 1.4e-27
XP_016874828 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome ( 328) 782 121.2 4.3e-27
NP_001317161 (OMIM: 164060) nucleosome assembly pr ( 328) 782 121.2 4.3e-27
XP_016874829 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome ( 328) 782 121.2 4.3e-27
NP_005960 (OMIM: 601651) nucleosome assembly prote ( 375) 769 119.4 1.7e-26
NP_004529 (OMIM: 300117) nucleosome assembly prote ( 506) 607 97.0 1.2e-19
NP_715638 (OMIM: 612203) nucleosome assembly prote ( 182) 261 48.5 1.9e-05
>>NP_068798 (OMIM: 300026) nucleosome assembly protein 1 (460 aa)
initn: 3078 init1: 3078 opt: 3078 Z-score: 2331.0 bits: 440.6 E(85289): 4.2e-123
Smith-Waterman score: 3078; 100.0% identity (100.0% similar) in 460 aa overlap (1-460:1-460)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAESENRKELSESSQEEAGNQIMVEGLGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGE
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NP_068 MAESENRKELSESSQEEAGNQIMVEGLGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 NGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RAANLESKFLREFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 RAANLESKFLREFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 CHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 CHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 PDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 LLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGRDGNDDFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 VTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGRDGNDDFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB3 VREVNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 VREVNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
430 440 450 460
>>NP_001294853 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protei (383 aa)
initn: 771 init1: 665 opt: 815 Z-score: 631.3 bits: 125.8 E(85289): 2e-28
Smith-Waterman score: 1043; 46.3% identity (66.7% similar) in 402 aa overlap (57-449:23-376)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
:: :.::.: . . . .. . :
NP_001 MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
.: ::. : ..:::: :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
NP_001 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
:::..:: .::::::::::::::.: : :: .::. .:.. .
NP_001 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
:.:..:. :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
NP_001 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:. :: . :
NP_001 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
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NP_001 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
.: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .: ..: :.
NP_001 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEA-------DEG
320 330 340 350 360
440 450 460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
. .::::.: :
NP_001 YQLFEEVKSCSKLFQRWLQ
370 380
>>XP_011536695 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome asse (391 aa)
initn: 1082 init1: 656 opt: 795 Z-score: 616.1 bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
:: :.::.: . . . .. . :
XP_011 MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
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XP_011 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
:::..:: .::::::::::::::.: : :: .::. .:.. .
XP_011 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
:.:..:. :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
XP_011 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:. :: . :
XP_011 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
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XP_011 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
.: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .: ..:
XP_011 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
320 330 340 350 360 370
440 450 460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
XP_011 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ
380 390
>>NP_001317160 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protei (391 aa)
initn: 1082 init1: 656 opt: 795 Z-score: 616.1 bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
:: :.::.: . . . .. . :
NP_001 MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
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NP_001 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
:::..:: .::::::::::::::.: : :: .::. .:.. .
NP_001 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
:.:..:. :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
NP_001 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
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NP_001 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
: :::.:::..:::::::::::::::. ::.::::. .:::::::.: . .:
NP_001 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
.: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .: ..:
NP_001 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
320 330 340 350 360 370
440 450 460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
NP_001 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ
380 390
>>NP_004528 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protein 1 (391 aa)
initn: 1082 init1: 656 opt: 795 Z-score: 616.1 bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
:: :.::.: . . . .. . :
NP_004 MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
.: ::. : ..:::: :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
NP_004 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
:::..:: .::::::::::::::.: : :: .::. .:.. .
NP_004 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
:.:..:. :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
NP_004 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:. :: . :
NP_004 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
: :::.:::..:::::::::::::::. ::.::::. .:::::::.: . .:
NP_004 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
.: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .: ..:
NP_004 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
320 330 340 350 360 370
440 450 460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
NP_004 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ
380 390
>>XP_016874827 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome asse (391 aa)
initn: 1082 init1: 656 opt: 795 Z-score: 616.1 bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
:: :.::.: . . . .. . :
XP_016 MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
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XP_016 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
:::..:: .::::::::::::::.: : :: .::. .:.. .
XP_016 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
:.:..:. :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
XP_016 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:. :: . :
XP_016 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
: :::.:::..:::::::::::::::. ::.::::. .:::::::.: . .:
XP_016 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
.: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .: ..:
XP_016 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
320 330 340 350 360 370
440 450 460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
XP_016 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ
380 390
>>NP_631946 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protein 1 (391 aa)
initn: 1082 init1: 656 opt: 795 Z-score: 616.1 bits: 123.0 E(85289): 1.4e-27
Smith-Waterman score: 1023; 47.1% identity (67.6% similar) in 380 aa overlap (57-427:23-361)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 LGEHLERGEDAAAGLGDDGKCGEEAAAGLGEEGENGEDTAAGSGEDGKKGGDTDEDSEA-
:: :.::.: . . . .. . :
NP_631 MADIDNKEQSELDQDLDDVEEVEEEETGEETKLKARQLTVQMMQNPQILAAL
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 -DRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFLREFHDIERKFAEMY
.: ::. : ..:::: :: :: :::.::.. :..:.:: .: ::.:::.: .:
NP_631 QERLDGLVE--TPTGYIESLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFYEEVHDLERKYAVLY
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 QPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEEGMVHEYVDEDDGYE
:::..:: .::::::::::::::.: : :: .::. .:.. .
NP_631 QPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL-------KEKAKI-----------
120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 DYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKNVDTLTPLIKKYDEP
:.:..:. :.:::::::.:::::.:::: :. .....:::
NP_631 ------------EDEKKDE---------EKEDPKGIPEFWLTVFKNVDLLSDMVQEHDEP
160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKSKLAYYDPHPYRGTA
::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:. :: . :
NP_631 ILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRSEPDDSDPFSFDGPE
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 IEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSFFNFFSPHGITSNGR
: :::.:::..:::::::::::::::. ::.::::. .:::::::.: . .:
NP_631 IMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSFFNFFAPPEVPESGD
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430
pF1KB3 DGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVREVNDAIYDKIIYDNW
.: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .: ..:
NP_631 LDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEEGEEADEEGEEEGDE
320 330 340 350 360 370
440 450 460
pF1KB3 MAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
NP_631 ENDPDYDPKKDQNPAECKQQ
380 390
>>XP_016874828 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome asse (328 aa)
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Smith-Waterman score: 1003; 49.4% identity (70.1% similar) in 334 aa overlap (101-427:4-298)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 EDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFL
...:: :: :: :::.::.. :..:.::
XP_016 MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFY
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 REFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEE
.: ::.:::.: .::::..:: .::::::::::::::.: : :: .::.
XP_016 EEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL----------
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 GMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKN
.:. . ::. ....:.:::::::.:::::.::
XP_016 ------------------------KEKAKIEDE-----KKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKN
90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 VDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKS
:: :. .....:::::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:
XP_016 VDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRS
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSF
. :: . : : :::.:::..:::::::::::::::. ::.::::. .:::
XP_016 EPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSF
180 190 200 210 220 230
380 390 400 410 420
pF1KB3 FNFFSPHGITSNGRDGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVRE
::::.: . .: .: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .:
XP_016 FNFFAPPEVPESGDLDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEE
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460
pF1KB3 VNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
..:
XP_016 GEEADEEGEEEGDEENDPDYDPKKDQNPAECKQQ
300 310 320
>>NP_001317161 (OMIM: 164060) nucleosome assembly protei (328 aa)
initn: 1066 init1: 656 opt: 782 Z-score: 607.3 bits: 121.2 E(85289): 4.3e-27
Smith-Waterman score: 1003; 49.4% identity (70.1% similar) in 334 aa overlap (101-427:4-298)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 EDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFL
...:: :: :: :::.::.. :..:.::
NP_001 MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFY
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 REFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEE
.: ::.:::.: .::::..:: .::::::::::::::.: : :: .::.
NP_001 EEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL----------
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 GMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKN
.:. . ::. ....:.:::::::.:::::.::
NP_001 ------------------------KEKAKIEDE-----KKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKN
90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 VDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKS
:: :. .....:::::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:
NP_001 VDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRS
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSF
. :: . : : :::.:::..:::::::::::::::. ::.::::. .:::
NP_001 EPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSF
180 190 200 210 220 230
380 390 400 410 420
pF1KB3 FNFFSPHGITSNGRDGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVRE
::::.: . .: .: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .:
NP_001 FNFFAPPEVPESGDLDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEE
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460
pF1KB3 VNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
..:
NP_001 GEEADEEGEEEGDEENDPDYDPKKDQNPAECKQQ
300 310 320
>>XP_016874829 (OMIM: 164060) PREDICTED: nucleosome asse (328 aa)
initn: 1066 init1: 656 opt: 782 Z-score: 607.3 bits: 121.2 E(85289): 4.3e-27
Smith-Waterman score: 1003; 49.4% identity (70.1% similar) in 334 aa overlap (101-427:4-298)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 EDGKKGGDTDEDSEADRPKGLIGYVLDTDFVESLPVKVKYRVLALKKLQTRAANLESKFL
...:: :: :: :::.::.. :..:.::
XP_016 MADIDNLPRVVKRRVNALKNLQVKCAQIEAKFY
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 REFHDIERKFAEMYQPLLEKRRQIINAIYEPTEEECEYKSDSEDCDDEEMCHEEMYGNEE
.: ::.:::.: .::::..:: .::::::::::::::.: : :: .::.
XP_016 EEVHDLERKYAVLYQPLFDKRFEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEEL----------
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 GMVHEYVDEDDGYEDYYYDYAVEEEEEEEEEDDIEATGEENKEEEDPKGIPDFWLTVLKN
.:. . ::. ....:.:::::::.:::::.::
XP_016 ------------------------KEKAKIEDE-----KKDEEKEDPKGIPEFWLTVFKN
90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 VDTLTPLIKKYDEPILKLLTDIKVKLSDPGEPLSFTLEFHFKPNEYFKNELLTKTYVLKS
:: :. .....:::::: : :::::.:: :.:.::.:::::.::::: ::.::::: ..:
XP_016 VDLLSDMVQEHDEPILKHLKDIKVKFSDAGQPMSFVLEFHFEPNEYFTNEVLTKTYRMRS
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KLAYYDPHPYRGTAIEYSTGCEIDWNEGKNVTLKTIKKKQKHRIWGTIRTVTEDFPKDSF
. :: . : : :::.:::..:::::::::::::::. ::.::::. .:::
XP_016 EPDDSDPFSFDGPEIMGCTGCQIDWKKGKNVTLKTIKKKQKHKGRGTVRTVTKTVSNDSF
180 190 200 210 220 230
380 390 400 410 420
pF1KB3 FNFFSPHGITSNGRDGND-------DFLLGHNLRTYIIPRSVLFFSGDALESQQEGVVRE
::::.: . .: .: :: .:: :: :::::::.:.:.:.:.... .:
XP_016 FNFFAPPEVPESGDLDDDAEAILAADFEIGHFLRERIIPRSVLYFTGEAIEDDDDDYDEE
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460
pF1KB3 VNDAIYDKIIYDNWMAAIEEVKACCKNLEALVEDIDR
..:
XP_016 GEEADEEGEEEGDEENDPDYDPKKDQNPAECKQQ
300 310 320
460 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 12:16:28 2016 done: Sat Nov 5 12:16:30 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]