Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0815
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0815, 219 aa
1>>>pF1KE0815 219 - 219 aa - 219 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0462+/-0.00106; mu= 15.2867+/- 0.063
mean_var=116.5186+/-34.602, 0's: 0 Z-trim(104.0): 351 B-trim: 461 in 1/47
Lambda= 0.118816
statistics sampled from 7313 (7694) to 7313 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 1.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 ( 345) 835 154.6 7.2e-38
CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 ( 326) 789 146.7 1.7e-35
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 778 144.8 6.1e-35
CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 ( 326) 771 143.6 1.4e-34
CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 ( 326) 769 143.2 1.8e-34
CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 ( 324) 731 136.7 1.6e-32
CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 ( 317) 614 116.6 1.7e-26
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 609 115.8 3.1e-26
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 604 114.9 5.8e-26
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 595 113.4 1.6e-25
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 582 111.2 7.8e-25
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 581 111.0 8.7e-25
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 581 111.0 8.7e-25
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 581 111.0 8.7e-25
CCDS34363.1 OR11A1 gene_id:26531|Hs108|chr6 ( 315) 579 110.6 1.1e-24
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 577 110.3 1.4e-24
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 575 109.9 1.8e-24
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 575 109.9 1.8e-24
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 574 109.8 2e-24
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 573 109.6 2.3e-24
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 571 109.3 2.8e-24
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 571 109.3 2.9e-24
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 570 109.1 3.2e-24
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 570 109.1 3.2e-24
CCDS30899.1 OR6Y1 gene_id:391112|Hs108|chr1 ( 325) 569 108.9 3.7e-24
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 568 108.8 4.2e-24
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 566 108.4 5.2e-24
CCDS7772.1 OR6A2 gene_id:8590|Hs108|chr11 ( 327) 566 108.4 5.3e-24
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 565 108.2 5.8e-24
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 565 108.2 5.8e-24
CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 ( 324) 564 108.1 6.7e-24
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 563 107.9 7.2e-24
CCDS12335.1 OR10H1 gene_id:26539|Hs108|chr19 ( 318) 562 107.7 8.4e-24
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 560 107.4 1.1e-23
CCDS32940.1 OR10H5 gene_id:284433|Hs108|chr19 ( 315) 560 107.4 1.1e-23
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 557 106.9 1.5e-23
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 556 106.7 1.7e-23
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 555 106.5 1.9e-23
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 555 106.5 1.9e-23
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 555 106.5 2e-23
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 555 106.5 2e-23
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 553 106.2 2.4e-23
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 553 106.2 2.4e-23
CCDS12333.1 OR10H2 gene_id:26538|Hs108|chr19 ( 315) 552 106.0 2.7e-23
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 552 106.0 2.7e-23
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 551 105.8 3.1e-23
CCDS30904.1 OR6K6 gene_id:128371|Hs108|chr1 ( 343) 550 105.7 3.7e-23
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 549 105.5 3.9e-23
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 548 105.3 4.4e-23
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 547 105.1 4.9e-23
>>CCDS32032.1 OR11G2 gene_id:390439|Hs108|chr14 (345 aa)
initn: 742 init1: 391 opt: 835 Z-score: 793.3 bits: 154.6 E(32554): 7.2e-38
Smith-Waterman score: 835; 56.7% identity (80.2% similar) in 217 aa overlap (1-214:97-312)
10 20
pF1KE0 MYTLLGNFSLLEICYVIAT--KLLANFLST
:: ::.:::.:::::: .: ..::::::
CCDS32 VLFTVVYLLTLMGNGSIICAVHWDQRLHAPMYILLANFSFLEICYVTSTVPSMLANFLSD
70 80 90 100 110 120
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 SKSISFMSCFAQFYFF-SLGYDEGFFLCITAFDRYLAICRPLRYPCIMTKQVCTGLIIFA
.: ::: .:: ::::: ::: : ::: . ::::::::::::::: :::...::.:..
CCDS32 TKIISFSGCFLQFYFFFSLGSTECFFLAVMAFDRYLAICRPLRYPTIMTRRLCTNLVVNC
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 WSCVFVIFLTLVILISQLSYCGPNIINHFICDPVPLKMLSCSEDIIITQLIYSTFNSVFI
: :. :: .. :::.:.:: ::.::.:::.:: :.:.. .: .:..:... . .
CCDS32 WVLGFIWFLIPIVNISQMSFCGSRIIDHFLCDPAPLLTLTCKKGPVI-ELVFSVLSPLPV
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IGTFLFILSSYALVILAIIRMPSEAGKRKAFSTCASHLAVVTLFYGSIMVMYVSPGSAHP
. ::::..:::::. :..:.:: ::.:::::::.::::::.:::::..::: :: : .
CCDS32 FMLFLFIVGSYALVVRAVLRVPSAAGRRKAFSTCGSHLAVVSLFYGSVLVMYGSPPSKNE
250 260 270 280 290 300
210
pF1KE0 VKMKKSLPCSFL
. .:..
CCDS32 AGKQKTVTLFYSVVTPLLNPVIYSLRNKDMRKALKKFWGT
310 320 330 340
>>CCDS32017.1 OR11H12 gene_id:440153|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 720 init1: 351 opt: 789 Z-score: 751.0 bits: 146.7 E(32554): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 789; 56.7% identity (79.1% similar) in 215 aa overlap (1-212:74-287)
10 20
pF1KE0 MYTLLGNFSLLEICYVIAT--KLLANFLST
:: .:::::.::: :: .: :.:.::::
CCDS32 SLFTTTYALTITGNGAIAFVLWCDWRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSE
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 SKSISFMSCFAQFYFF-SLGYDEGFFLCITAFDRYLAICRPLRYPCIMTKQVCTGLIIFA
.:.::: .:: ::::: ::: .: ..: . :::.:::::::: :: ::: ..:. :.:.
CCDS32 KKNISFAGCFLQFYFFFSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLCAKLVILC
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 WSCVFVIFLTLVILISQLSYCGPNIINHFICDPVPLKMLSCSEDIIITQLIYSTFNSVFI
: : :. :: ..::::. .::::::.: .::: : :.: : ::. :..:. :
CCDS32 WVCGFLWFLIPIVLISQMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRI-QLFCYTLSSLVI
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IGTFLFILSSYALVILAIIRMPSEAGKRKAFSTCASHLAVVTLFYGSIMVMYVSPGSAHP
.:.::::..::.::. :.. ::: .:..::::::.::::::.: :.:.:::::::: .:
CCDS32 FGNFLFIIGSYTLVLKAVLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHS
230 240 250 260 270 280
210
pF1KE0 VKMKKSLPCSFL
. :.:
CCDS32 TGMQKIETLFYAMVTPLFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
290 300 310 320
>>CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 (330 aa)
initn: 705 init1: 347 opt: 778 Z-score: 740.7 bits: 144.8 E(32554): 6.1e-35
Smith-Waterman score: 778; 56.7% identity (77.2% similar) in 215 aa overlap (1-212:77-290)
10 20
pF1KE0 MYTLLGNFSLLEICYVIAT--KLLANFLST
:: :::::..::: :. .: ..:.:.::
CCDS32 SFILVLYLLTLLGNGAIVCAVKLDRRLHTPMYILLGNFAFLEIWYISSTVPNMLVNILSE
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 SKSISFMSCFAQFYFF-SLGYDEGFFLCITAFDRYLAICRPLRYPCIMTKQVCTGLIIFA
:.::: .:: ::::: ::: : ::: . :.::::::::::.:: ::: . : :.
CCDS32 IKTISFSGCFLQFYFFFSLGTTECFFLSVMAYDRYLAICRPLHYPSIMTGKFCIILVCVC
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 WSCVFVIFLTLVILISQLSYCGPNIINHFICDPVPLKMLSCSEDIIITQLIYSTFNSVFI
: :. . . ..::::: .::::::.:..::: :: :.: . :.:: ::::..:
CCDS32 WVGGFLCYPVPIVLISQLPFCGPNIIDHLVCDPGPLFALACI-SAPSTELICYTFNSMII
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IGTFLFILSSYALVILAIIRMPSEAGKRKAFSTCASHLAVVTLFYGSIMVMYVSPGSAHP
.: :: ::.::.::: :.. .:: ::. ::::::.::: ::.::::..::::::: :..:
CCDS32 FGPFLSILGSYTLVIRAVLCIPSGAGRTKAFSTCGSHLMVVSLFYGTLMVMYVSPTSGNP
230 240 250 260 270 280
210
pF1KE0 VKMKKSLPCSFL
. :.:
CCDS32 AGMQKIITLVYTAMTPFLNPLIYSLRNKDMKDALKRVLGLTVSQN
290 300 310 320 330
>>CCDS74807.1 OR11H1 gene_id:81061|Hs108|chr22 (326 aa)
initn: 702 init1: 335 opt: 771 Z-score: 734.3 bits: 143.6 E(32554): 1.4e-34
Smith-Waterman score: 771; 56.3% identity (78.6% similar) in 215 aa overlap (1-212:74-287)
10 20
pF1KE0 MYTLLGNFSLLEICYVIAT--KLLANFLST
:: .:::::.::: :: .: :.:.::::
CCDS74 SLFTTTYALTITGNGAIAFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSE
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 SKSISFMSCFAQFYFF-SLGYDEGFFLCITAFDRYLAICRPLRYPCIMTKQVCTGLIIFA
.:.::: .:: ::::: ::: .: ..: . :::.:::::::: :: ::: .. . :.:.
CCDS74 KKNISFAGCFLQFYFFFSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILC
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 WSCVFVIFLTLVILISQLSYCGPNIINHFICDPVPLKMLSCSEDIIITQLIYSTFNSVFI
: : :. :: ..::::. .::::::.: .::: : :.: : ::. :..:. :
CCDS74 WVCGFLWFLIPIVLISQMPFCGPNIIDHVVCDPGPRFALDCVSAPRI-QLFCYTLSSLVI
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IGTFLFILSSYALVILAIIRMPSEAGKRKAFSTCASHLAVVTLFYGSIMVMYVSPGSAHP
.:.::::..::.::. :.. ::: .:..::::::.::::::.: :.:.:::::::: .:
CCDS74 FGNFLFIIGSYTLVLKAMLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSSLMVMYVSPGLGHS
230 240 250 260 270 280
210
pF1KE0 VKMKKSLPCSFL
. :.:
CCDS74 TGMQKIETLFYAMVTPLFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
290 300 310 320
>>CCDS76655.1 OR11H2 gene_id:79334|Hs108|chr14 (326 aa)
initn: 705 init1: 342 opt: 769 Z-score: 732.4 bits: 143.2 E(32554): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 769; 56.3% identity (78.1% similar) in 215 aa overlap (1-212:74-287)
10 20
pF1KE0 MYTLLGNFSLLEICYVIAT--KLLANFLST
:: .:::::.::: :: .: :.:.::::
CCDS76 SLFTTIYALTITGNGAIAFVLWCDRRLHTPMYMFLGNFSFLEIWYVSSTVPKMLVNFLSE
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 SKSISFMSCFAQFYFF-SLGYDEGFFLCITAFDRYLAICRPLRYPCIMTKQVCTGLIIFA
.:.::: .:: ::::: ::: .: ..: . :::.:::::::: :: ::: .. . :.:.
CCDS76 KKNISFAGCFLQFYFFFSLGTSECLLLTVMAFDQYLAICRPLLYPNIMTGHLYAKLVILC
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 WSCVFVIFLTLVILISQLSYCGPNIINHFICDPVPLKMLSCSEDIIITQLIYSTFNSVFI
: : :. :: ..:::: .::::::.: .::: :: :.: : ::. :..:. :
CCDS76 WVCGFLWFLIPIVLISQKPFCGPNIIDHVVCDPGPLFALDCVSAPRI-QLFCYTLSSLVI
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IGTFLFILSSYALVILAIIRMPSEAGKRKAFSTCASHLAVVTLFYGSIMVMYVSPGSAHP
.:.::::..::.::. :.. ::: .:..::::::.::::::.: :. .:::::::: .:
CCDS76 FGNFLFIIGSYTLVLKAVLGMPSSTGRHKAFSTCGSHLAVVSLCYSPLMVMYVSPGLGHS
230 240 250 260 270 280
210
pF1KE0 VKMKKSLPCSFL
. :.:
CCDS76 TGMQKIETLFYAMVTPLFNPLIYSLQNKEIKAALRKVLGSSNII
290 300 310 320
>>CCDS32034.1 OR11H4 gene_id:390442|Hs108|chr14 (324 aa)
initn: 643 init1: 333 opt: 731 Z-score: 697.3 bits: 136.7 E(32554): 1.6e-32
Smith-Waterman score: 731; 53.0% identity (75.6% similar) in 217 aa overlap (1-214:69-284)
10 20
pF1KE0 MYTLLGNFSLLEICYVIAT--KLLANFLST
:: :::::..::: :: .: ..:.:.::
CCDS32 SLFLVIYVLTLLGNGAIIYAVRCNPLLHTPMYFLLGNFAFLEIWYVSSTIPNMLVNILSK
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 SKSISFMSCFAQFYFF-SLGYDEGFFLCITAFDRYLAICRPLRYPCIMTKQVCTGLIIFA
.:.::: .:: ::::: ::: : .:: . :.:::::::.::.:: ::: . : :. :
CCDS32 TKAISFSGCFLQFYFFFSLGTTECLFLAVMAYDRYLAICHPLQYPAIMTVRFCGKLVSFC
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 WSCVFVIFLTLVILISQLSYCGPNIINHFICDPVPLKMLSCSEDIIITQLIYSTFNSVFI
: :. . .. :::: .::::::.::.:: :: :::. ::. :. : .:. .
CCDS32 WLIGFLGYPIPIFYISQLPFCGPNIIDHFLCDMDPLMALSCAP-APITECIFYTQSSLVL
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 IGTFLFILSSYALVILAIIRMPSEAGKRKAFSTCASHLAVVTLFYGSIMVMYVSPGSAHP
. : ..:: :: :.. :....:: ::.:::::::.:::.::.::::..::::::: . :
CCDS32 FFTSMYILRSYILLLTAVFQVPSAAGRRKAFSTCGSHLVVVSLFYGTVMVMYVSPTYGIP
220 230 240 250 260 270
210
pF1KE0 VKMKKSLPCSFL
. ..: :
CCDS32 TLLQKILTLVYSVTTPLFNPLIYTLRNKDMKLALRNVLFGMRIRQNS
280 290 300 310 320
>>CCDS30906.1 OR6N2 gene_id:81442|Hs108|chr1 (317 aa)
initn: 492 init1: 284 opt: 614 Z-score: 589.0 bits: 116.6 E(32554): 1.7e-26
Smith-Waterman score: 614; 44.7% identity (73.3% similar) in 217 aa overlap (1-214:59-274)
10 20
pF1KE0 MYTLLGNFSLLEICYVIAT--KLLANFLST
:: ... .:.::. :. .: :.:.:.::
CCDS30 VLLLLAYLFTICGNMLIFSVIRLDAALHTPMYHFVSVLSFLELWYTATTIPKMLSNILSE
30 40 50 60 70 80
30 40 50 60 70 80
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]